|
Summary |   |
Top model | |||||||||||||||||
|
Sequence analysis |   |
Secondary structure and disorder prediction |   |
  |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | M | A | D | S | V | K | T | F | L | Q | D | L | A | R | G | I | K | D | S | I | W | G | I | C | T | I | S | K | L | D | A | R | I | Q | Q | K | R | E | E | Q | R | R | R | R | A | S | S | V | L | A | Q | R | R | A | Q | S | I | E | R | K | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | Q | E | S | E | P | R | I | V | S | R | I | F | Q | C | C | A | W | N | G | G | V | F | W | F | S | L | L | L | F | Y | R | V | F | I | P | V | L | Q | S | V | T | A | R | I | I | G | D | P | S | L | H | G | D | V | W | S | W | L | E | F | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | F | L | T | S | I | F | S | A | L | W | V | L | P | L | F | V | L | S | K | V | V | N | A | I | W | F | Q | D | I | A | D | L | A | F | E | V | S | G | R | K | P | H | P | F | P | S | V | S | K | I | I | A | D | M | L | F | N | L | L | L | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | Q | A | L | F | L | I | Q | G | M | F | V | S | L | F | P | I | H | L | V | G | Q | L | V | S | L | L | H | M | S | L | L | Y | S | L | Y | C | F | E | Y | R | W | F | N | K | G | I | E | M | H | Q | R | L | S | N | I | E | R | N | W | P | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | Y | Y | F | G | F | G | L | P | L | A | F | L | T | A | M | Q | S | S | Y | I | I | S | G | C | L | F | S | I | L | F | P | L | F | I | I | S | A | N | E | A | K | T | P | G | K | A | Y | L | F | Q | L | R | L | F | S | L | V | V | F | L | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |   | S | N | R | L | F | H | K | T | V | Y | L | Q | S | A | L | S | S | S | T | S | A | E | K | F | P | S | P | H | P | S | P | A | K | L | K | A | T | A | G | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Confidence Key | |||||||||||
High(9) |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   | Low (0) |
? | Disordered |
Alpha helix | |
Beta strand |
Domain analysis |   |
Hover over an aligned region to see model and summary info
Please note, only up to the top 20 hits are modelled to reduce computer load
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Detailed template information |   |
Binding site prediction |   |
Due to computational demand, binding site predictions are not run for batch jobs
If you want to predict binding sites, please manually submit your model of choice to 3DLigandSite