Job Description E6N0W0 Confidence 94.38% Date Sat Apr 13 12:48:06 BST 2013
Rank 249 Aligned Residues 153
% Identity 13% Template c2efrB_
PDB info
PDB header: contractile proteinChain: B: PDB Molecule: general control protein gcn4 and tropomyosin 1 alpha chain;
PDBTitle: crystal structure of the c-terminal tropomyosin fragment with n- and2 c-terminal extensions of the leucine zipper at 1.8 angstroms3 resolution
Resolution 1.80 Å
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135 . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
V K Q M Q N Q K Q Q E N E R L A Q R Q Q R E K T L Q F Q L Q A L D E K V I D V E V D I G K A K E A V A E V T G F I E R M R S T R D E K V A R I K E L Q E T N Q K
Query Conservation  
                                                                                                                                                             
Alig confidence  
Template Conservation  
                                                                                                                                                     
Template Sequence  
M K Q L E D K V E E L L S K N Y H L E N E V A R L K K L L E R A E E R A E L S E G K S A E L E E E L K T V T N N L K S L E A Q A E K Y S Q K E D K Y E E E I K V
Template Known Secondary structure  
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
148 . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . .
 
   
215 . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
T A I E S Q E L G H Q L L Q K Q S A H K E T T Q R K S E L E A L R R K R D A I R K A I E D A A L E L S T E K E K S Y N Q T E I L K T N K E K Y K T
Query Conservation  
                                                                                                                                                 
Alig confidence  
Template Conservation  
                                                                                                                               
Template Sequence  
L S D K L K E A E T R A E F A E R S V T K L E K S I D D L E D E L Y A Q K L K Y K A I S E E M K Q L E D K V E E L L S K N Y H L E N E V A R L K K
Template Known Secondary structure  
T T
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
228 . 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]
 
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