Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0JP43 Date Tue Jul 30 13:08:59 BST 2013 Unique Job ID efd0ea767581ce5d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	M	Q	V	E	K	K	K	L	L	S	Q	A	D	I	P	T	K	F	D	P	I	N	Y	L	G	E	Y	L	M	R	H	N	T	H	Y	I	K	D	P	G	V	S	G	Y	Q	R	V	M	K	E	I	T	E	E	L	K	T	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?					?	?	?	?																								?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	P	D	T	I	N	N	R	I	S	K	M	K	E	K	V	K	E	K	R	E	Q	R	E	Y	I	S	T	V	K	V	K	V	A	G	M	R	K	Q	A	L	E	E	Q	F	N	E	W	V	L	N	P	K	G	M	I	P	I	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?																																																?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	I	S	S	Y	I	T	D	L	K	S	E	V	F	E	E	F	L	K	H	L	C	H	S	A	E	E	F	R	E	I	I	L	T	D	M	R	R	Q	M	F	A	E	L	F	L	Q	C	D	S	G	K	V	M	A	L	D	R	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	L	A	L	L	E	A	F	Y	D	Q	C	S	S	T	T	R	S	L	L	R	N	P	R	Q	W	P	F	V	E	F	E	E	I	E	L	I	E	F	W	G	D	M	D	I	K	K	H	I	Y	E	D	F	D	A	L	L	L	K	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?																?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	M	L	V	A	E	K	L	A	G	K	L	A	E	N	K	D	L	P	Q	Q	Q	R	D	Q	E	L	S	S	D	S	T	T	E	P	E	T	A	T	Q	L	T	S	Q	Q	R	S	R	R	V	S	L	T	G	Q	G	Q	G	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	R	K	T	S	A	S	K	Q	G	A	S	R	G	S	V	A	E	Q	G	S	R	R	S	S	G	V	N	Q	T	Q	Q	R	G	S	V	A	E	Q	G	S	R	R	S	S	A	V	E	Q	T	Q	Q	R	G	S	V	A	E	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?								?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	R	R	S	S	T	V	E	Q	T	R	Q	R	G	S	V	A	E	Q	G	S	R	R	S	S	T	V	E	Q	T	Q	R	R	G	S	V	A	E	Q	G	S	R	R	S	S	G	V	N	Q	T	Q	Q	R	G	S	V	A	E	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	R	R	S	S	A	V	E	Q	T	Q	Q	R	G	S	V	A	E	Q	G	S	R	R	S	S	A	M	E	Q	E	P	Q	T	A	Q	D	P	N	S	D	S	L	P	E	Q	E	S	H	R	G	S	I	T	E	G	S	H	R	G	S
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?																	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	S	E	P	G	Q	R	R	A	S	V	T	G	Q	R	R	K	S	S	V	D	D	S	G	S	A	G	S	R	R	G	S	G	T	D	Q	G	Q	H	R	G	S	V	G	Q	R	K	G	S	G	E	R	K	M	S	A	S	E	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?						?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	H	Q	E	S	I	T	E	E	P	L	T	A	S	E	P	G	P	Q	I	D	T	I	Q	E	L	D	E	D	S	T	P	Q	L	E	D	D	S	A	L	K	E	S	K	T	S	E	L	T	K	I	E	T	Q	E	E	K	P	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		L	I	N	E	E	Q	V	P	R	D	S	K	Q	P	E	V	P	T	S	S	K	K	E	R	P	S	G	S	P	K	K	G	R	L	S	G	T	S	K	R	D	S	Q	K	D	K	A	C	E	P	K	P	Q	H	V	E	G	K	K	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		S	G	E	F	L	I	C	D	W	K	I	K	H	V	K	S	E	E	E	E	Q	A	K	L	I	C	D	D	T	R	F	T	D	L	H	A	T	I	R	N	F	Q	T	Y	K	G	I	K	G	R	S	A	F	N	G	V	S	L	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		L	Q	F	V	Q	L	L	E	T	F	V	G	E	D	T	S	F	S	L	S	K	D	L	A	S	F	F	Q	K	N	Y	S	E	T	K	Q	E	K	I	K	A	L	E	Q	A	R	Q	N	S	S	R	I	R	R	R	I	L	L	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?																?	?	?	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		I	F	E	K	W	D	N	D	G	S	G	F	L	D	L	N	E	V	D	D	L	L	Y	T	Y	K	E	G	M	E	R	E	S	M	K	K	A	K	L	H	I	N	F	P	E	P	S	P	G	H	E	V	K	L	S	S	K	Q	F	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?	?															?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		R	Y	I	E	L	V	V	S	E	L	R	G	N	E	D	E	V	L	E	S	V	V	E	F	L	M	G	S	L	E	R	S	H	V	E	G	L	R	N	C	A	R	R	K	W	L	H	Q	I	Q	Y	A	A	E	T	S	G	V	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																																								?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		E	P	V	Y	T	E	T	F	R	V	L	T	Q	D	A	E	A	H	G	N	K	K	I	S	A	H	I	S	L	L	E	E	N	V	F	L	P	E	R	G	H	V	L	L	R	N	V	A	C	T	L	D	D	A	P	F	V	L	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		V	L	Y	R	D	M	K	G	I	S	F	T	V	V	D	E	G	K	P	I	H	V	P	Q	V	Q	H	H	G	N	I	F	F	W	N	S	F	R	S	K	N	E	Y	N	G	S	F	L	A	L	P	L	Q	D	A	Y	M	R	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		G	V	L	A	V	D	T	L	R	D	P	H	E	I	N	I	F	L	P	H	E	I	K	F	Y	Q	G	V	A	N	A	F	S	T	A	Y	H	H	V	H	S	R	E	H	V	L	H	S	V	M	T	G	I	R	W	L	F	S	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		S	G	I	T	T	I	T	T	C	F	I	E	P	S	S	E	Q	E	D	Y	V	L	R	N	M	M	V	T	D	C	L	G	L	A	E	I	H	T	D	P	P	T	I	T	R	N	A	C	I	F	R	D	F	L	F	K	C	T	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?									?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		S	E	V	I	L	A	S	S	G	G	E	T	H	I	A	I	P	L	R	Q	R	T	K	E	A	M	G	I	L	D	V	N	I	G	R	S	R	M	L	L	Y	Q	E	Y	K	D	L	Q	K	M	V	K	M	I	Q	N	V	S	Y	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		I	L	G	E	F	S	G	E	I	E	K	T	M	V	I	E	M	E	S	A	G	E	V	K	R	A	G	I	L	F	F	R	T	M	L	Q	E	L	Q	E	C	L	C	L	L	D	S	M	D	F	V	S	L	L	L	Y	E	H	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?		?		?	?								?	?	?	?	?	?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		H	V	D	S	I	L	Q	D	I	T	L	Q	E	V	E	A	N	V	A	L	V	H	D	V	L	K	G	V	I	L	F	S	Q	R	E	K	D	S	L	S	D	L	E	E	W	E	K	W	K	F	H	I	N	K	Y	L	V	E	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?		?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		C	V	L	D	P	T	A	S	N	V	E	V	N	V	E	L	V	T	S	Y	I	Q	A	H	S	R	T	E	V	W	N	F	R	N	I	V	I	E	L	L	Y	H	W	I	N	I	C	L	T	L	I	E	L	N	M	R	Q	D	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?																																												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	I	P	P	L	P	K	K	S	A	T	S	I	Y	A	I	S	S	E	R	S	I	R	E	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence