Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A2A4P0 Date Wed Jul 10 14:06:11 BST 2013 Unique Job ID df13e67bc2946f07

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	V	A	V	A	A	A	G	V	L	M	G	S	E	P	G	P	A	E	E	L	A	K	L	E	Y	L	S	L	V	S	K	V	C	T	E	L	D	N	H	L	G	I	N	D	K	D	L	A	E	F	V	I	S	L	A	E	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	T	F	D	T	F	K	A	S	L	V	K	N	G	A	E	F	T	D	S	L	I	S	N	L	L	R	L	I	Q	T	M	R	P	P	A	K	P	S	T	S	K	D	P	V	V	K	P	K	T	E	K	E	K	L	R	E	L	F	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?											?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	L	C	Q	P	D	N	P	S	A	R	T	M	L	D	E	E	D	V	K	V	A	V	D	V	L	K	E	L	E	A	L	M	P	S	A	A	G	Q	E	K	Q	R	D	P	E	H	R	D	R	T	K	K	K	K	R	S	R	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		D	R	D	R	D	R	D	R	D	R	D	R	D	R	D	R	D	R	D	R	D	K	D	R	E	R	D	R	D	R	E	R	D	R	E	R	D	R	E	R	D	H	K	R	R	H	R	S	R	S	R	S	H	S	R	T	R	E	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	G	K	S	R	Y	R	S	R	S	R	S	Q	S	P	F	K	D	R	K	D	R	E	K	Y	G	E	R	N	L	D	R	W	R	D	K	H	V	D	R	P	P	P	E	E	P	A	I	G	D	I	Y	N	G	K	V	T	S	I	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	F	G	C	F	V	Q	L	E	G	L	R	K	R	W	E	G	L	V	H	I	S	E	L	R	R	E	G	R	V	A	N	V	A	D	V	V	S	K	G	Q	R	V	K	V	K	V	L	S	F	T	G	T	K	T	S	L	S	M	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?						?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	V	D	Q	E	T	G	E	D	L	N	P	N	R	R	R	N	L	V	G	E	T	N	E	E	T	S	M	R	N	P	D	R	P	T	H	L	S	L	V	S	A	P	E	V	E	D	D	S	L	E	R	K	R	L	T	R	I	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	E	K	W	E	I	K	Q	M	I	A	A	N	V	L	S	K	E	E	F	P	D	F	D	E	E	T	G	I	L	P	K	V	D	D	E	E	D	E	D	L	E	I	E	L	V	E	E	E	P	P	F	L	R	G	H	T	K	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		M	D	M	S	P	I	K	I	V	K	N	P	D	G	S	L	S	Q	A	A	M	M	Q	S	A	L	A	K	E	R	R	E	L	K	Q	A	Q	R	E	A	E	M	D	S	I	P	M	G	L	N	K	H	W	V	D	P	L	P	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?								?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	G	R	Q	I	A	A	N	M	R	G	I	G	M	M	P	N	D	I	P	E	W	K	K	H	A	F	G	G	N	K	A	S	Y	G	K	K	T	Q	M	S	I	L	E	Q	R	E	S	L	P	I	Y	K	L	K	E	Q	L	V	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	V	H	D	N	Q	I	L	I	V	I	G	E	T	G	S	G	K	T	T	Q	I	T	Q	Y	L	A	E	A	G	Y	T	S	R	G	K	I	G	C	T	Q	P	R	R	V	A	A	M	S	V	A	K	R	V	S	E	E	F	G	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		C	L	G	Q	E	V	G	Y	T	I	R	F	E	D	C	T	S	P	E	T	V	I	K	Y	M	T	D	G	M	L	L	R	E	C	L	I	D	P	D	L	T	Q	Y	A	I	I	M	L	D	E	A	H	E	R	T	I	H	T	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		L	F	G	L	L	K	K	T	V	Q	K	R	Q	D	M	K	L	I	V	T	S	A	T	L	D	A	V	K	F	S	Q	Y	F	Y	E	A	P	I	F	T	I	P	G	R	T	Y	P	V	E	I	L	Y	T	K	E	P	E	T	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		L	D	A	S	L	I	T	V	M	Q	I	H	L	T	E	P	P	G	D	I	L	V	F	L	T	G	Q	E	E	I	D	T	A	C	E	I	L	Y	E	R	M	K	S	L	G	P	D	V	P	E	L	I	I	L	P	V	Y	S	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		P	S	E	M	Q	T	R	I	F	D	P	A	P	P	G	S	R	K	V	V	I	A	T	N	I	A	E	T	S	L	T	I	D	G	I	Y	Y	V	V	D	P	G	F	V	K	Q	K	V	Y	N	S	K	T	G	I	D	Q	L	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?																																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		T	P	I	S	Q	A	Q	A	K	Q	R	A	G	R	A	G	R	T	G	P	G	K	C	Y	R	L	Y	T	E	R	A	Y	R	D	E	M	L	T	T	N	V	P	E	I	Q	R	T	N	L	A	S	T	V	L	S	L	K	A	M	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?		?																					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		I	N	D	L	L	S	F	D	F	M	D	A	P	P	M	E	T	L	I	T	A	M	E	Q	L	Y	T	L	G	A	L	D	D	E	G	L	L	T	R	L	G	R	R	M	A	E	F	P	L	E	P	M	L	C	K	M	L	I	M	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		V	H	L	G	C	S	E	E	M	L	T	I	V	S	M	L	S	V	Q	N	V	F	Y	R	P	K	D	K	Q	A	L	A	D	Q	K	K	A	K	F	H	Q	T	E	G	D	H	L	T	L	L	A	V	Y	N	S	W	K	N	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?		?	?													?	?																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		F	S	N	P	W	C	Y	E	N	F	I	Q	A	R	S	L	R	R	A	Q	D	I	R	K	Q	M	L	G	I	M	D	R	H	K	L	D	V	V	S	C	G	K	S	T	V	R	V	Q	K	A	I	C	S	G	F	F	R	N	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																		?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		K	K	D	P	Q	E	G	Y	R	T	L	I	D	Q	Q	V	V	Y	I	H	P	S	S	A	L	F	N	R	Q	P	E	W	V	V	Y	H	E	L	V	L	T	T	K	E	Y	M	R	E	V	T	T	I	D	P	R	W	L	V	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?									?													?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.
Sequence		A	P	A	F	F	K	V	S	D	P	T	K	L	S	K	Q	K	K	Q	Q	R	L	E	P	L	Y	N	R	Y	E	E	P	N	A	W	R	I	S	R	A	F	R	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?									?		?						?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
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