Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A2A5X5 Date Tue Jul 30 12:57:36 BST 2013 Unique Job ID 6d16f69d7886b479

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	G	C	C	C	S	R	K	C	P	S	L	P	A	I	S	L	C	S	T	E	V	S	C	G	G	P	V	C	L	P	S	S	C	R	S	Q	T	W	Q	L	V	T	C	E	D	S	C	G	S	S	G	C	G	S	Q	C	C	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?				?	?	?	?		?	?	?																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	S	C	S	V	S	S	C	C	Q	P	V	C	C	E	A	T	I	C	E	P	S	C	S	V	S	S	C	A	Q	P	V	C	C	E	A	T	I	C	E	P	S	C	S	M	G	S	C	C	Q	P	V	C	C	E	A	T	I	C	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?										?									?	?										?									?	?									?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	S	C	S	V	S	T	C	A	Q	P	V	C	C	E	A	T	M	C	Q	P	S	C	S	V	S	S	C	Q	P	V	C	C	E	T	S	S	C	Q	P	V	L	C	L	P	A	T	C	Q	P	V	I	C	K	P	C	C	C	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?																							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	I	C	E	P	S	C	C	S	A	V	C	A	V	P	A	S	C	Q	P	M	I	C	E	P	V	V	C	E	P	A	C	C	Q	P	V	C	P	T	P	S	C	C	P	S	V	C	S	A	A	S	S	C	Q	P	V	G	C	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?	?			?						?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	P	C	E	P	P	C	S	E	A	S	A	C	Q	P	S	A	C	M	A	L	V	C	E	P	V	C	L	R	P	V	C	C	V	Q	G	P	C	E	P	P	C	V	S	S	S	C	Q	D	S	S	C	C	V	S	S	I	C	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?			?										?															?											?	?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	C	P	E	P	S	P	C	L	P	S	V	C	V	P	T	P	C	Q	P	S	C	Y	I	V	K	R	C	R	S	V	S	C	E	P	I	S	C	P	S	P	S	C	Q	P	A	C	C	R	P	G	S	S	A	S	A	I	C	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?					?	?																													?	?	?		?	?					?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	C	P	P	R	T	F	Y	I	P	S	S	C	K	P	P	C	S	P	V	S	C	R	P	I	C	R	P	I	C	S	G	P	I	T	F	R	Q	P	Y	V	T	S	I	T	Y	R	P	A	C	Y	R	S	C	Y	S	I	L	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?			?	?	?						?		?						?																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	T	C	L	A	S	Y	S	Y	R	P	V	C	S	R	Q	P	C	T	D	S	D	N	D	K	C	D	S	K	K	P	T	S	S	Q	P	D	C	A	D	S	T	P	V	K	T	E	V	S	D	E	T	P	C	Q	P	S	E	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?										?	?															?																			?									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Sequence		P	A	S	P	I	T	R	E	A	A	A	P	Q	P	A	A	S	K	P	A	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand