Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0FGR9 Date Thu Apr 26 09:38:06 BST 2012 Unique Job ID 4f054448a9455fdf

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	A	E	E	P	C	A	P	G	A	P	S	A	L	G	A	Q	R	T	P	G	P	E	L	R	L	S	S	Q	L	L	P	E	L	C	T	F	V	V	R	V	L	F	Y	L	G	P	V	Y	L	A	G	Y	L	G	L	S	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	L	L	L	G	A	L	L	W	M	W	W	R	R	N	R	R	G	K	L	G	R	L	A	A	A	F	E	F	L	D	N	E	R	E	F	I	S	R	E	L	R	G	Q	H	L	P	A	W	I	H	F	P	D	V	E	R	V	E	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?																								?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	N	K	I	I	S	Q	T	W	P	Y	L	S	M	I	M	E	S	K	F	R	E	K	L	E	P	K	I	R	E	K	S	I	H	L	R	T	F	T	F	T	K	L	Y	F	G	Q	K	C	P	R	V	N	G	V	K	A	H	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	C	N	R	R	R	V	T	V	D	L	Q	I	C	Y	I	G	D	C	E	I	S	V	E	L	Q	K	I	Q	A	G	V	N	G	I	Q	L	Q	G	T	L	R	V	I	L	E	P	L	L	V	D	K	P	F	V	G	A	V	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																										?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	F	L	Q	K	P	H	L	Q	I	N	W	T	G	L	T	N	L	L	D	A	P	G	I	N	D	V	S	D	S	L	L	E	D	L	I	A	T	H	L	V	L	P	N	R	V	T	V	P	V	K	K	G	L	D	L	T	N	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?																						?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	P	L	P	C	G	V	I	R	V	H	L	L	E	A	E	Q	L	A	Q	K	D	N	F	L	G	L	R	G	K	S	D	P	Y	A	K	V	S	I	G	L	Q	H	F	R	S	R	T	I	Y	R	N	L	N	P	T	W	N	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	E	F	M	V	Y	E	V	P	G	Q	D	L	E	V	D	L	Y	D	E	D	T	D	R	D	D	F	L	G	S	L	Q	I	C	L	G	D	V	M	T	N	R	V	V	D	E	W	F	V	L	N	D	T	T	S	G	R	L	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?																	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	L	E	W	L	S	L	L	T	D	Q	E	V	L	T	E	D	H	G	G	L	S	T	A	I	L	V	V	F	L	E	S	A	C	N	L	P	R	N	P	F	D	Y	L	N	G	E	Y	R	A	K	K	L	S	R	F	A	R	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?		?		?	?	?	?				?		?	?	?	?										?	?	?	?			?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	S	K	D	P	S	S	Y	V	K	L	S	V	G	K	K	T	H	T	S	K	T	C	P	H	N	K	D	P	V	W	S	Q	V	F	S	F	F	V	H	N	V	A	T	E	R	L	H	L	K	V	L	D	D	D	Q	E	C	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	M	L	E	V	P	L	C	Q	I	L	P	Y	A	D	L	T	L	E	Q	R	F	Q	L	D	H	S	G	L	D	S	L	I	S	M	R	L	V	L	R	F	L	Q	V	E	E	R	E	L	G	S	P	Y	T	G	P	E	A	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?										?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		K	G	P	L	L	I	K	K	V	A	T	N	Q	G	P	K	A	Q	P	Q	E	E	G	P	T	D	L	P	C	P	P	D	P	A	S	D	T	K	D	V	S	R	S	T	T	T	T	T	S	A	T	T	V	A	T	E	P	T	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	T	G	P	E	P	K	G	K	D	S	A	K	R	F	C	E	P	I	G	E	K	K	S	P	A	T	I	F	L	T	V	P	G	P	H	S	P	G	P	I	K	S	P	R	P	M	K	C	P	A	S	P	F	A	W	P	P	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		L	A	P	S	M	S	S	L	N	S	L	A	S	S	C	F	D	L	A	D	I	S	L	N	I	E	G	G	D	L	R	R	R	Q	L	G	E	I	Q	L	T	V	R	Y	V	C	L	R	R	C	L	S	V	L	I	N	G	C	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		L	T	P	C	T	S	S	G	A	D	P	Y	V	R	V	Y	L	L	P	E	R	K	W	A	C	R	K	K	T	S	V	K	R	K	T	L	E	P	L	F	D	E	T	F	E	F	F	V	P	M	E	E	V	K	K	R	S	L	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	V	K	N	S	R	P	L	G	S	H	R	R	K	E	L	G	K	V	L	I	D	L	S	K	E	D	L	I	K	G	F	S	Q	W	Y	E	L	T	P	N	G	Q	P	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?		?	?	?																?	?			?						?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence