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PFD predicts the function of your protein using 3 sources of information: All this information is then processed by a Support Vector Machine trained to discriminate |
Amino Acid Sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Index | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | |||||||||||||||||
Query Sequence | V | F | G | R | C | E | L | A | A | A | M | K | R | H | G | L | D | N | Y | R | G | Y | S | L | G | N | W | V | C | A | A | K | F | E | S | N | F | N | T | Q | A | T | N | R | N | T | D | G | S | T | D | Y | G | I | L | Q | I | N | S | R | W | W | C | N | D | G | R | T | P | G | S | R | N | L | C | N | I | P | C | S | A | L | |||||||||||||||||
Predicted Site 1 |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   | |||||||||||||||||
Predicted Site 2 |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   | |||||||||||||||||
Index | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence | L | S | S | D | I | T | A | S | V | N | C | A | K | K | I | V | S | D | G | N | G | M | N | A | W | V | A | W | R | N | R | C | K | G | T | D | V | Q | A | W | I | R | G | C | R | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Site 1 |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Site 2 |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   |
Summary Function Prediction |
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Detailed Breakdown of Hits from Each Information Source |
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London |   |
Lawrence Kelley |   |
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