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ANALYSIS FOR POTASSIUM PENTAFLUORO OXYURANATE (VI) [UXG]
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Formula : K3,U1,O2,F5
Solution chemistry: [U1,O2]1,F5 -3
All distances below are to the element U [ uranium ]
| PROTEIN: 1AZU AZURIN (PSEUDOMONAS AERUGINASA)
|
Bound Ligands : CU COPPER ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 3.200 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M ACETATE
Addict & conc.: 0.560 M LITHIUM NITRATE
Comments : 4 MOLS IN AU
Reference : ADMAN et.al. 1978 :
pH 5.5 Soak time = Hours Reference number = 21.00
Site 1: 98 ASP OD1 4.21 ( 5.75) . . .
: 101 LYS CE 5.05 ( 6.94) . . .
| PROTEIN: 1CCR CYTOCHROME C (RICE)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINS FE(III): TML METHYL PART OF EPS-N-TRIMETHYLLYSINE 80:
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 90.000 % AMMONIUM SULHPATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : OCHI et.al. 1983 :
pH 6.0 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 58.00
Site 1: 21 LYS NZ 4.26 (10.01) . . T
: 92 GLY O 5.79 ( 8.01) . . T
: 93 LEU CD2 4.81 ( 5.11) . . T
: 94 LYS CG 5.32 ( 5.22) . . T [Het: TML CH3 - NZ 1.50]
: 95 LYS CG 4.92 ( 5.63) . . H
: 98 GLU OE1 2.54 ( 6.55) . . H
| PROTEIN: 1CHG CHYMOTRYPSINOGEN
|
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 10.000 % ETHANOL/WATER
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M DIPHENYLCARBAMYL FLUORIDE/METHANOL
Comments :
Reference : FREER et.al. 1970 :KRAUT et.al. 1962 :
pH 6.3 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 140.01
Site 1: 49 GLU OE1 5.77 (10.08) . . E
Site 2: 129 ASP OD1 2.11 ( 5.04) . . .
: 130 PHE O 4.48 ( 4.33) . . .
: 131 ALA O 5.61 ( 3.23) . . .
: 132 ALA N 5.07 ( 6.49) . . .
: 134 THR OG1 5.99 ( 8.09) . . E
Site 4: 51 TRP CH2 5.36 ( 9.87) . . E
: 107 LYS NZ 5.50 ( 8.04) . . E
: 242 LEU O 5.27 ( 6.70) . . H
: 244 ALA O 2.51 ( 4.65) . . H
: 245 ASN OD1 5.23 ( 2.79) . . H
| PROTEIN: 1CYC CYTOCHROME C (BONITO, HEART)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINS FE(II):
Hev Atom conc.: 45.000 mM
Precip & conc.: 86.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.: ASCORBIC ACID
Comments : ASCORBIC ACID: PREVENTS XL AUTOXIDATION
Reference : ASHIDA et.al. 1971 :1973 :TANAKA et.al. 1975 :
pH 6.0 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 256.00
Site 1: 3 VAL A CG1 5.67 ( 6.39) . . T
: 96 ALA A O 3.50 ( 5.91) . . T
: 97 TYR A OH 5.55 ( 4.09) . . T
: 98 LEU A CD2 5.22 ( 3.98) . . T
: 99 LYS A O 3.95 ( 4.27) . . T
: 100 SER A OG 3.99 ( 2.42) . . T
: 101 ALA A O 4.64 ( 2.77) . . T
: 102 THR A CB 5.70 ( 5.20) . . T
: 103 SER A N 5.68 ( 6.83) . . T
Site 2: 86 LYS A NZ 5.97 (11.70) . . T
: 36 PHE CE1 5.65 ( 9.73) . . .
: 95 VAL O 5.49 ( 7.65) . . H
: 96 ALA O 3.38 ( 5.68) . . H
: 97 TYR CE1 5.91 ( 4.42) . . H
: 98 LEU CD2 4.93 ( 3.15) . . H
: 99 LYS CG 5.42 ( 3.00) . . H
: 100 SER OG 4.94 ( 2.70) . . H
: 101 ALA O 4.72 ( 3.44) . . H
: 102 THR OG1 5.51 ( 4.60) . . H
: 103 SER OG 5.28 ( 6.12) . . H
| PROTEIN: 1HIP HIGH POTENTIAL IRON PROTEIN
|
Bound Ligands : FES IRON/SULFUR CLUSTER:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.: 3.200 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : CARTER et.al. 1974 :KRAUT et.al. 1968 :
pH 6.5 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 125.00
Site 1: 1 SER O 5.65 ( 5.87) . . .
: 2 ALA N 5.64 ( 5.89) . . .
: 59 GLU OE1 2.48 ( 6.75) . . E
: 60 TRP NE1 4.45 ( 8.47) . . E
: 72 ASN ND2 5.14 ( 8.26) . . E
: 53 HOH O 2.82 (-1.00) . . .
: 78 HOH O 5.18 (-1.00) . . .
: 27 GLU OE1 2.89 ( 6.42) . . .
: 23 HOH O 5.93 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 5.23 (-1.00) . . .
: 52 HOH O 2.84 (-1.00) . . .
: 70 HOH O 2.88 (-1.00) . . .
: 106 HOH O 3.16 (-1.00) . . .
Site 2: 51 ALA O 5.95 ( 8.03) . . .
: 52 ASP OD1 3.58 ( 6.14) . . .
: 48 PHE CZ 5.62 (10.62) . . E [Het: FES S2 - C 4.40]
: 74 HOH O 4.47 (-1.00) . . .
: 36 LEU CD1 4.10 ( 7.13) . . .
: 37 PRO CD 4.76 ( 6.50) . . .
: 40 GLU OE1 2.67 ( 6.38) . . .
: 132 HOH O 4.45 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1LYZ LYSOZYME (HEN EGG-WHITE W2)
|
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.850 M SODIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : BLAKE et.al. 1962 :1965 :
pH 4.7 Soak time = Hours Reference number = 111.02
Site 1: 121 GLN OE1 2.39 ( 4.73) . . T
: 8A HOH O 4.74 (-1.00) . . .
: 12 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 1.42 (-1.00) . . .
: 14 HOH O 2.93 (-1.00) . . .
: 23 HOH O 5.91 (-1.00) . . .
: 24 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
: 18 HOH O 5.77 (-1.00) . . .
: 62 TRP CH2 2.43 ( 8.38) . . T
: 73 ARG NH1 4.57 ( 9.83) . . T
: 93 HOH O 4.24 (-1.00) . . .
: 94 HOH O 4.78 (-1.00) . . .
: 95 HOH O 4.11 (-1.00) . . .
Site 2: 97 HOH O 5.36 (-1.00) . . .
: 4 HOH O 5.84 (-1.00) . . .
: 15 HIS NE2 4.64 ( 8.53) . . T
: 87 ASP OD1 3.96 ( 6.83) . . T
: 88 ILE C 5.86 ( 6.98) . . T
: 89 THR OG1 2.09 ( 3.97) . . T
: 90 ALA N 5.00 ( 6.63) . . T
: 93 ASN ND2 5.42 ( 8.26) . . T
: 41 HOH O 5.00 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 5.23 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 3.03 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1LZ1 LYSOZYME (HUMAN)
|
Hev Atom conc.: 3.000 mM
Precip & conc.: 3.000 M SODIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 0.020 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : SWAN et.al. 1971 :
pH 4.5 Soak time = Hours Reference number = 127.01
Site 1: 35 GLU OE1 2.24 ( 5.19) . s H
: 53 ASP OD2 5.35 ( 7.58) . s E
: 57 PHE O 5.80 ( 7.70) . . T
: 58 GLN OE1 5.90 ( 5.85) . . T
: 109 TRP NE1 5.80 ( 5.69) . . T
: 110 VAL N 5.32 ( 6.03) . . H
: 111 ALA CB 4.16 ( 5.07) . . H
Site 2: 117 GLN OE1 4.36 ( 8.63) . . T
: 118 ASN OD1 5.77 ( 8.72) . . T
: 130 VAL OXT 5.29 ( 7.37) . . T
| PROTEIN: 1LZH LYSOZYME (HEN-WHITE, MONOCLINIC)
|
Hev Atom conc.: 15.000 mM
Precip & conc.: SODIUM NITRATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : ARTYMIUK et.al. 1982 :
pH 4.5 Soak time = Hours Reference number = 249.00
Site 1: 33 LYS A CA 5.99 ( 5.99) . . .
: 37 ASN A CA 4.34 ( 4.34) . . .
: 38 PHE A CA 5.71 ( 5.71) . . .
Site 2: 4 GLY B CA 3.60 ( 3.60) . . .
: 5 ARG B CA 3.05 ( 3.05) . . .
: 70 PRO A CA 4.90 ( 4.90) . . .
Site 3: 22 GLY B CA 4.05 ( 4.05) . . .
: 43 THR A CA 5.40 ( 5.40) . . .
Site 4: 81 SER B CA 5.49 ( 5.49) . . .
: 18 ASP A CA 5.03 ( 5.03) . . .
: 19 ASN A CA 2.07 ( 2.07) . . .
: 20 TYR A CA 5.66 ( 5.66) . . .
: 22 GLY A CA 4.59 ( 4.59) . . .
: 23 TYR A CA 5.11 ( 5.11) . . .
: 24 SER A CA 4.56 ( 4.56) . . .
Site 5: 117 GLY A CA 4.44 ( 4.44) . . .
: 118 THR A CA 4.54 ( 4.54) . . .
: 119 ASP A CA 5.84 ( 5.84) . . .
: 89 THR B CA 4.43 ( 4.43) . . .
: 90 ALA B CA 2.58 ( 2.58) . . .
: 93 ASN B CA 5.63 ( 5.63) . . .
Site 6: 117 GLY B CA 5.01 ( 5.01) . . .
: 90 ALA A CA 5.65 ( 5.65) . . .
| PROTEIN: 1PGI GLUCOSE-6-PHOSPHATE ISOMERASE
|
Hev Atom conc.: 20.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.030 M IMIDAZOLE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MUIRHEAD et.al. 1977 :
pH 7.0 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 69.00
Site 1: 161 UNK CA 5.22 ( 5.22) . . .
| PROTEIN: 1PTE D-ALANYL-CARBOXYPEPTIDASE-TRANSPEPTIDASE
|
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 30.000 % PEG 8000
Buffer & conc.: 0.050 M PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : KELLY et.al. 1982 :1985 :
pH 6.8 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 95.01
Site 1: 54A SER CA 4.93 ( 4.93) . . .
Site 2: 67 GLY CA 5.20 ( 5.20) . . .
: 70 GLY CA 4.40 ( 4.40) . . .
: 71 ARG CA 5.88 ( 5.88) . . .
: 73 GLY CA 5.98 ( 5.98) . . .
: 26 GLY CA 5.48 ( 5.48) . . .
: 27 ALA CA 2.31 ( 2.31) . . .
: 28 SER CA 1.92 ( 1.92) . . .
: 29 ALA CA 5.73 ( 5.73) . . .
Site 3: 167 SER CA 5.39 ( 5.39) . . .
: 168 GLY CA 5.66 ( 5.66) . . .
: 169 ASN CA 5.85 ( 5.85) . . .
: 170 GLY CA 5.61 ( 5.61) . . .
| PROTEIN: 1PYP INORGANIC PYROPHOSPHATASE
|
Hev Atom conc.: 0.100 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.:
Addict & conc.: 0.000 M MAGNESIUM NITRATE
Comments :
Reference : MAKHALDIANI et.al. 1980 :SMIRNOVA et.al. 1980 :
pH 6.0 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 86.03
Site 1: 209 LYS CG 5.09 ( 6.88) . . E
: 212 LYS O 4.28 ( 5.43) . . T
: 213 TYR OH 4.27 ( 3.22) . . T
: 214 ALA N 5.58 ( 6.88) . . T
: 216 ASP OD2 4.45 ( 6.17) . . T
: 172 ASP A O 5.51 ( 7.54) . . T
: 173 VAL A O 5.57 ( 7.09) . . T
: 174 GLU A OE1 4.85 ( 3.86) . . T
: 175 LYS A CE 5.19 ( 3.74) . . T
: 178 PRO A CD 5.96 ( 5.14) . . T
Site 3: 108 GLU OE1 4.72 ( 6.66) . . T
: 204 PHE CE1 4.01 ( 4.31) . . T
: 205 SER N 5.90 ( 7.03) . . T
: 207 GLU OE1 5.78 ( 7.16) . . T
: 209 LYS NZ 3.87 ( 7.98) . . E
: 213 TYR OH 5.62 (10.42) . . T
: 175 LYS A NZ 5.54 (10.87) . . T
Site 4: 232 LYS NZ 5.30 ( 6.01) . . T
Site 5: 186 GLU A OE1 3.12 ( 5.67) . . T
: 189 ARG A NH1 3.66 ( 5.14) . . T
: 190 ILE A N 5.52 ( 6.49) . . T
: 193 ILE A CD1 5.71 ( 9.08) . . T
: 199 GLU A OE1 3.50 ( 4.88) . . T
: 200 ASN A N 5.39 ( 6.58) . . T
: 227 GLN CD 4.22 ( 5.51) . . T
| PROTEIN: 2APR ACID PROTEINASE (RHIZOPUS CHINENSIS)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : SUBRAMANIAN et.al. 1976 :
pH Soak time = Hours Reference number = 56.00
Site 1: 17 TYR CD1 5.20 ( 6.07) . . E
: 33 ASP OD2 5.28 ( 7.27) . . E
: 34 PHE O 3.08 ( 5.17) . . E
: 35 ASP C 5.76 ( 5.15) . s E
: 36 THR OG1 5.54 ( 6.32) . . T
: 156 VAL CG1 5.32 ( 7.81) . . E
: 158 LEU CD1 4.20 ( 7.30) . . E
: 169 TYR OH 2.78 ( 9.04) . . E
: 218 ASP O 5.44 ( 6.39) . s T
: 219 THR OG1 2.30 ( 2.69) . . T
: 220 GLY N 4.03 ( 5.00) . . T
: 301 ASP OD1 5.36 ( 6.83) . . H
: 304 LEU CD1 5.39 ( 7.85) . . H
: 513 HOH O 3.76 (-1.00) . . .
: 515 HOH O 2.16 (-1.00) . . .
Site 2: 8 MET CE 4.79 ( 8.77) . . E
: 17 TYR O 4.59 ( 6.58) . . E
: 32 LEU O 5.59 ( 7.36) . . E
: 33 ASP OD2 4.45 ( 4.85) . . E
: 34 PHE CE1 5.13 ( 1.38) . . E
: 35 ASP O 5.47 ( 3.77) . s E
: 36 THR N 4.98 ( 6.22) . . T
: 123 LEU O 4.62 ( 6.24) . . E
: 125 LEU CD1 4.23 ( 6.94) . . T
: 169 TYR OH 3.11 ( 8.18) . . E
: 219 THR OG1 3.82 ( 5.91) . . T
: 513 HOH O 5.02 (-1.00) . . .
: 515 HOH O 3.01 (-1.00) . . .
Site 3: 663 HOH O 5.32 (-1.00) . . .
: 752 HOH O 3.39 (-1.00) . . .
Site 4: 4 GLY O 4.87 ( 6.83) . . T
: 153 ILE O 4.51 ( 6.39) . . E
: 154 PHE CE2 5.59 ( 2.94) . . E
: 155 GLY O 3.69 ( 4.45) . . E
: 156 VAL N 5.54 ( 6.15) . . E
: 169 TYR CE2 5.85 ( 4.27) . . E
: 170 ILE CG1 5.32 ( 2.98) . . E
: 171 PHE CE1 4.05 ( 2.96) . . E
: 172 GLY N 4.44 ( 5.83) . . T
: 173 GLY O 4.66 ( 6.30) . . T
| PROTEIN: 2CDV CYTOCHROME C3 (DESULFOVIBRIO VULGARIS)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX, WITH FE:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 70.000 % ETHANOL
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS/HCL
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : HIGUCHI et.al. 1984 :
pH 7.3 Soak time = Hours Reference number = 43.01
Site 1: 35 HIS CE1 5.88 ( 8.72) . . T [Het: HEMFE - CD2 3.10]
: 36 PRO O 4.57 ( 6.75) . . T
: 37 VAL CG1 4.95 ( 4.47) . . T [Het: HEM CBC - CG1 4.20]
: 38 ASN OD1 5.48 ( 5.58) . . T
: 75 LYS NZ 5.31 ( 9.73) . . T [Het: HEM CAA - N 3.60]
: 2 HEM O1D 2.77 (-1.00) . . .
: 25 HOH O 3.19 (-1.00) . . .
: 15 LYS CE 5.16 ( 8.21) . . T
: 38 HOH O 4.54 (-1.00) . . .
Site 2: 77 LYS NZ 3.84 ( 9.18) . . T [Het: HEM CMC - O 3.80]
: 85 GLU OE1 4.06 ( 6.51) . . T
: 9 HOH O 1.43 (-1.00) . . .
: 90 ASP OD1 5.73 ( 8.44) . . T
: 92 ALA O 5.00 ( 5.60) . . T
: 93 LYS NZ 3.40 ( 4.91) . . H [Het: HEM CGD - NZ 3.70]
: 96 GLU OE1 3.88 ( 6.70) . . H [Het: HEM O2D - OE1 3.80]
Site 3: 10 LYS O 5.11 ( 7.06) . . E
: 12 ASP OD1 2.03 ( 4.99) . . . [Het: HEM CGD - N 3.70]
: 13 LYS NZ 4.71 ( 5.88) . . . [Het: HEM CGD - N 3.40]
: 45 LYS NZ 5.68 ( 9.51) . . T [Het: HEM CMC - O 3.50]
: 42 HOH O 3.56 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2MHR MYOHEMERYTHRIN
|
Bound Ligands : FEO IRON CENTER: AZI AZIDE ION, N3 -: SO4 SULFATE ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 80.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : HENDRICKSON et.al. 1975 :SHERIFF et.al. 1987 :
pH 6.7 Soak time = Hours Reference number = 67.02
Site 1: 108 LYS O 5.53 ( 7.26) . . T [Het: SO4 S - NZ 3.30]
: 112 PHE CE2 5.35 ( 6.43) . . T
: 115 LYS NZ 5.77 ( 9.15) . . T
: 129 HOH O 3.03 (-1.00) . . .
: 174 HOH O 4.05 (-1.00) . . .
: 264 HOH O 1.78 (-1.00) . . .
: 272 HOH O 4.65 (-1.00) . . .
: 15 ARG NH1A 4.57 ( 9.39) . . T
: 19 GLU OE1 3.61 ( 5.82) . . T
: 22 ASP CB 5.49 ( 6.36) . . T
: 23 GLU OE1A 4.46 ( 5.57) . . T
: 26 LYS NZ 3.38 ( 8.51) . . T
: 190 HOH O 5.46 (-1.00) . . .
: 218 HOH O 1.98 (-1.00) . . .
: 224 HOH O 5.06 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3APP ACID PROTEINASE (PENICILLUM JANTHINELLUM)
|
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 2.500 M LITHIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : DELBAERE et.al. 1977 :HSU et.al. 1976 :1977 :SIELECKI et.al. 1988 :
pH 4.4 Soak time = 504.00 Hours Reference number = 75.06
Site 1: 16 GLU OE1 5.99 (10.14) . . E
: 40 TRP CH2 4.29 ( 9.37) . . E
: 42 PHE CE1 3.93 ( 8.02) . . E
: 54 HIS CE1 5.46 ( 9.46) . . .
: 111 GLN O 5.59 ( 7.36) . . .
: 112 PHE CE1 5.91 ( 4.09) . . .
: 113 GLN N 5.81 ( 6.78) . . .
: 115 ASP OD1 5.68 ( 5.52) . . .
: 118 ASN OD1 2.51 ( 5.23) . . .
: 119 ASP C 5.48 ( 5.71) . . E
: 120 GLY O 5.34 ( 5.01) . . E
: 121 LEU CD1 5.98 ( 7.04) . . E
: 67 HOH O 1.34 (-1.00) . . .
Site 2: 36 SER OG 4.85 ( 5.19) . . E
: 37 ALA O 3.99 ( 4.09) . . .
: 38 ASP OD1 2.55 ( 2.91) . . E
: 39 LEU N 5.23 ( 6.57) . . E
: 73 ILE CD1 4.08 ( 6.86) . . E
: 103 GLN OE1 4.93 ( 8.77) . . E
: 129 ILE O 4.18 ( 6.39) . . .
: 130 ASN OD1 5.84 ( 4.23) . . .
: 131 THR OG1 4.18 ( 4.79) . . .
: 17 HOH O 2.25 (-1.00) . . .
: 70 HOH O 4.72 (-1.00) . . .
: 223 HOH O 3.76 (-1.00) . . .
Site 3: 184 VAL O 5.20 ( 7.15) . . E
: 185 ASP OD1 5.60 ( 5.20) . . .
: 140 HOH O 4.59 (-1.00) . . .
: 220 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
: 318 HOH O 5.83 (-1.00) . . .
Site 4: 240 SER OG 5.97 ( 5.18) . . E
: 241 ASN OD1 4.73 ( 3.12) . . .
: 242 ALA O 5.30 ( 5.14) . . .
: 243 GLY N 5.18 ( 5.70) . . E
: 310 HOH O 5.25 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3PGM PHOSPHOGLYCERATE MUTASE
|
Bound Ligands : SO1 ACTIVE SITE SULFATE: MP3 3-PHOSPHOGLYCERATE:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 53.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : CAMPBELL et.al. 1972 :1974 :
pH 6.7 Soak time = Hours Reference number = 93.00
Site 1: 7 ARG A NH1 5.84 ( 6.47) . . T
: 8 HIS A NE2 3.93 ( 6.68) . . T [Het: SO1 S - NE2 3.80]
: 9 GLY A O 5.92 ( 7.46) . . T
: 15 GLU A OE1 5.24 ( 9.47) . . T [Het: SO1 S - CD 3.00]
: 86 GLU A OE1 5.28 ( 5.86) . . T [Het: SO2 OS1 - N 3.60]
: 179 HIS A NE2 0.51 ( 4.50) . . T [Het: SO1 OS1 - NE2 3.80]
: 180 GLY A O 4.91 ( 2.70) . . T
: 181 ASN A N 4.80 ( 6.21) . . T
: 1 SO1 A S 4.69 (-1.00) . . .
: 2 SO2 A S 4.63 (-1.00) . . .
: 3 MP3 A PC 3.63 (-1.00) . . .
Site 2: 7 ARG A NH2 5.63 ( 7.59) . . T
: 8 HIS A NE2 4.04 ( 7.32) . . T [Het: SO1 S - NE2 3.80]
: 11 SER A OG 5.89 ( 7.54) . . T [Het: SO1 S - CB 3.70]
: 15 GLU A OE1 5.02 ( 8.99) . . T [Het: SO1 S - CD 3.00]
: 86 GLU A OE1 4.92 ( 5.25) . . T [Het: SO2 OS1 - N 3.60]
: 179 HIS A NE2 1.63 ( 5.35) . . T [Het: SO1 OS1 - NE2 3.80]
: 180 GLY A O 5.83 ( 3.72) . . T
: 181 ASN A N 5.47 ( 6.82) . . T
: 1 SO1 A S 3.83 (-1.00) . . .
: 2 SO2 A S 4.17 (-1.00) . . .
: 3 MP3 A PC 2.81 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4INS INSULIN (PORCINE 2-ZN)
|
Bound Ligands : ZN ZINC ION ON 3-FOLD CRYSTAL AXIS:
Hev Atom conc.: 20.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: ZINC ACETATE
Comments :
Reference : ADAMS et.al. 1969 :DODSON et.al. 1989 :SCHLICHTKRULL et.al. 1956a:1956b:
pH 6.3 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 278.02
Site 1: 9 SER B OG 4.64 ( 6.52) . . .
: 10 HIS B ND1 5.82 ( 6.96) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 13 GLU B OE2 4.59 ( 7.95) . s .
: 13 GLU D OE1 3.62 ( 6.79) . s T
: 18 HOH O 1.70 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 5.43 (-1.00) . . .
: 41 HOH O 5.68 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 1.05 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 3.29 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 2.77 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 2.31 (-1.00) . . .
: 75 HOH O 5.98 (-1.00) . . .
: 10 HIS B CE1 5.72 ( 8.59) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 18 HOH O 3.11 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 3.41 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 5.95 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 5.21 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 2.31 (-1.00) . . .
: 10 HIS B NE2 5.57 ( 6.03) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 13 GLU B OE1 5.06 ( 6.80) . s .
: 13 GLU D OE1 5.92 ( 8.68) . s T
: 18 HOH O 3.53 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 4.04 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 3.58 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 2.31 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 652 HOH O 5.38 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.23 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 3.84 (-1.00) . . .
: 702 HOH O 3.75 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
Site 1: 672 HOH O 5.58 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 5.45 (-1.00) . . .
Site 2: 18 HOH O 3.58 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 5.36 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 4.64 (-1.00) . . .
: 13 GLU B OE1 3.40 ( 6.23) . s .
: 9 SER D OG 4.49 ( 6.18) . . T
: 10 HIS D ND1 5.89 ( 6.90) . . T [Het: ZNZN - CD2 3.10]
: 13 GLU D OE1 5.72 ( 7.50) . s T
: 18 HOH O 3.28 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 4.94 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 4.64 (-1.00) . . .
: 13 GLU B OE2 4.86 ( 9.11) . s .
: 10 HIS D NE2 5.92 ( 6.35) . . T [Het: ZNZN - CD2 3.10]
: 13 GLU D OE1 4.84 ( 6.94) . s T
: 18 HOH O 1.36 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 5.29 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 3.39 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 5.41 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 4.64 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 2.79 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.15 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 4.97 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 2.79 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 2.26 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 3.68 (-1.00) . . .
: 702 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
: 601 HOH O 5.94 (-1.00) . . .
: 642 HOH O 5.80 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 2.79 (-1.00) . . .
: 652 HOH O 3.19 (-1.00) . . .
Site 2: 653 HOH O 4.03 (-1.00) . . .
: 671 HOH O 5.59 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 1.77 (-1.00) . . .
: 702 HOH O 3.01 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4SBV VIRUS COAT PROTEIN (SOUTHERN BEAN MOSAIC)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 20.700 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : ASAD-ZATERO et.al. 1981 :HERMODSON et.al. 1982 :SUCK et.al. 1978 :
pH Soak time = 168.00 Hours Reference number = 263.03
Site 3: 74 LEU C CD1 5.76 ( 8.20) . . .
: 76 THR C O 5.73 ( 7.88) . . .
: 77 GLU C CG 5.01 ( 5.83) . . .
: 120 LEU C O 4.36 ( 6.00) . . .
: 121 PRO C O 5.78 ( 6.45) . . .
: 122 SER C OG 4.73 ( 6.17) . . .
: 239 THR C O 5.94 ( 7.45) . . .
: 240 GLY C O 3.79 ( 4.37) . . .
: 241 ARG C NH1 2.14 ( 3.26) . . .
: 242 LEU C N 5.15 ( 6.25) . . .
: 243 TYR C OH 4.98 ( 8.42) . . .
Site 7: 74 LEU C CD1 5.76 ( 8.20) . . .
: 76 THR C O 5.73 ( 7.88) . . .
: 77 GLU C CG 5.01 ( 5.83) . . .
: 120 LEU C O 4.36 ( 6.00) . . .
: 121 PRO C O 5.78 ( 6.45) . . .
: 122 SER C OG 4.73 ( 6.17) . . .
: 239 THR C O 5.94 ( 7.45) . . .
: 240 GLY C O 3.79 ( 4.37) . . .
: 241 ARG C NH1 2.14 ( 3.26) . . .
: 242 LEU C N 5.15 ( 6.25) . . .
: 243 TYR C OH 4.98 ( 8.42) . . .
Site 9: 98 THR B CG2 5.83 ( 7.05) . . .
: 101 ARG B NH2 5.48 ( 6.87) . . .
: 102 GLY B N 5.93 ( 6.03) . . .
: 105 GLN B NE2 4.81 ( 9.11) . . .
: 105 GLN A OE1 5.71 ( 8.49) . . .
: 256 ALA A O 5.11 ( 4.99) . . .
: 257 ALA A O 5.53 ( 3.71) . . .
Site A: 71 HIS A CE1 5.71 ( 8.20) . . .
: 72 CYS A O 5.29 ( 6.64) . . .
: 171 VAL A O 5.07 ( 6.70) . . .
: 172 ASN A O 5.75 ( 6.00) . . .
: 19 HOH A O 2.95 (-1.00) . . .
: 193 SER A CB 5.89 ( 7.01) . . .
: 194 GLU A OE1 4.25 ( 6.52) . . .
: 217 ASN A O 4.64 ( 6.10) . . .
: 218 ILE A CD1 3.77 ( 4.18) . . .
: 194 GLU B OE1 4.74 ( 6.83) . . .
: 217 ASN B O 5.94 ( 7.01) . . .
: 218 ILE B CD1 3.93 ( 3.86) . . .
: 219 LEU B N 5.97 ( 7.00) . . .
: 194 GLU C OE1 5.39 ( 7.98) . . .
: 218 ILE C CD1 5.00 ( 6.50) . . .
Site B: 74 LEU C CD1 5.76 ( 8.20) . . .
: 76 THR C O 5.73 ( 7.88) . . .
: 77 GLU C CG 5.01 ( 5.83) . . .
: 120 LEU C O 4.36 ( 6.00) . . .
: 121 PRO C O 5.78 ( 6.45) . . .
: 122 SER C OG 4.73 ( 6.17) . . .
: 239 THR C O 5.94 ( 7.45) . . .
: 240 GLY C O 3.79 ( 4.37) . . .
: 241 ARG C NH1 2.14 ( 3.26) . . .
: 242 LEU C N 5.15 ( 6.25) . . .
: 243 TYR C OH 4.98 ( 8.42) . . .
Site C: 62 SER A OG 3.03 ( 3.90) . . .
: 63 SER A N 5.82 ( 7.25) . . .
: 64 MET A CE 4.89 ( 8.77) . . .
Site D: 190 ASN A O 4.64 ( 6.16) . . .
: 191 GLU A OE1 3.16 ( 4.32) . . .
: 66 VAL B CG1 5.92 ( 7.63) . . .
: 111 ALA B CB 5.94 ( 7.26) . . .
: 196 ARG B NH1 1.50 ( 7.08) . . .
: 249 ARG B NH1 4.18 ( 7.49) . . .
: 251 ILE B CD1 3.54 ( 7.06) . . .
: 68 ILE A CD1 5.42 ( 6.53) . . .
: 69 LEU A O 4.93 ( 6.17) . . .
: 70 SER A OG 3.43 ( 5.35) . . .
: 113 VAL A CG1 4.02 ( 5.38) . . .
: 114 ALA A N 5.47 ( 6.07) . . .
: 246 TYR A O 5.52 ( 6.76) . . .
: 247 THR A OG1 2.58 ( 3.40) . . .
: 248 ILE A O 5.60 ( 5.69) . . .
| PROTEIN: 5TNC TROPONIN-C (TURKEY)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION IN BINDING SITE III:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 39.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 3.000 % PEG 200/CALCIUM CHLORIDE
Comments :
Reference : HERZBERG et.al. 1987 :1989 :JAMES et.al. 1985a:1985b:1986 :1988 :
pH 5.0 Soak time = 19.00 Hours Reference number = 9.09
Site 1: 46 MET CE 5.13 ( 7.82) . . H
: 51 GLN OE1 5.69 ( 4.66) . . .
: 52 ASN O 4.68 ( 5.02) . . .
: 53 PRO CD 4.92 ( 4.62) . . .
: 57 GLU OE2 4.45 ( 8.47) . . H
: 81 MET O 5.66 ( 7.94) . . H
: 82 MET O 5.51 ( 6.69) . . H
: 84 ARG O 5.28 ( 6.55) . . H
: 85 GLN OE1 2.64 ( 2.81) . . H
: 86 MET C 5.75 ( 5.06) . . H
: 88 GLU OE1 5.39 ( 5.89) . . H
: 89 ASP OD1 3.15 ( 5.34) . . H
: 15 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 42 HOH O 5.90 (-1.00) . . .
: 54 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
: 55 HOH O 5.06 (-1.00) . . .
: 13 PHE CE1 5.98 ( 9.46) . . .
: 90 ALA CB 4.70 ( 6.15) . . H
: 72 HOH O 5.35 (-1.00) . . .
: 104 HOH O 3.89 (-1.00) . . .
Site 2: 2 SER OG 2.23 ( 2.64) . . .
: 3 MET N 4.83 ( 6.05) . . .
: 4 THR N 5.95 ( 6.57) . . .
: 5 ASP OD1 1.71 ( 4.73) . . .
: 6 GLN N 5.88 ( 7.12) . . .
Site 3: 5 ASP OD2 5.50 ( 7.03) . . .
: 44 HOH O 5.40 (-1.00) . . .
: 88 HOH O 5.17 (-1.00) . . .
: 28 MET CE 5.50 ( 9.54) . . H
: 132 GLU O 5.79 ( 7.49) . . H
: 135 GLU O 4.67 ( 6.24) . . H
: 136 ASP OD1 2.66 ( 4.11) . . H
: 139 LYS NZ 3.69 ( 5.73) . . H
: 97 HOH O 5.31 (-1.00) . . .
: 145 HOH O 5.95 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 9WGA AGGLUTININ (WHEAT GERM, ISOLECTIN 2)
|
Hev Atom conc.: 37.000 mM
Precip & conc.: 0.010 M SODIUM CHLORIDE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : WRIGHT et.al. 1974 :1977 :
pH 6.5 Soak time = 288.00 Hours Reference number = 89.05
Site 1: 113 GLY A C 5.61 ( 5.58) . . H
: 114 SER A OG 5.91 ( 5.36) . . H
: 115 GLU A OE1 2.82 ( 5.96) . . H
: 190 HOH A O 5.11 (-1.00) . . .
: 62 SER A OG 5.73 ( 7.21) . . T
: 64 TYR A CD1 5.75 ( 7.44) . . T
: 66 HIS A ND1 5.67 ( 6.43) . . T
: 72 GLU A CG 5.81 ( 6.40) . . H
: 73 TYR A OH 2.45 ( 7.02) . . H
: 180 HOH A O 3.84 (-1.00) . . .
: 249 HOH A O 2.85 (-1.00) . . .
: 257 HOH A O 3.19 (-1.00) . . .
Site 2: 113 GLY B C 5.92 ( 5.90) . . H
: 114 SER B OG 4.49 ( 5.90) . . H
: 115 GLU B OE1 3.00 ( 5.99) . . H
: 257 HOH B O 5.94 (-1.00) . . .
: 62 SER B OG 5.28 ( 7.05) . . T
: 64 TYR B CE1 5.94 ( 7.43) . . T
: 66 HIS B CD2 5.31 ( 6.56) . . T
: 72 GLU B CG 5.46 ( 6.26) . . H
: 73 TYR B OH 2.76 ( 6.98) . . H
: 181 HOH B O 4.35 (-1.00) . . .
: 199 HOH B O 4.63 (-1.00) . . .
: 218 HOH B O 2.66 (-1.00) . . .
: 234 HOH B O 2.93 (-1.00) . . .
: 277 HOH B O 5.58 (-1.00) . . .
Site 3: 156 GLY A O 5.14 ( 5.83) . . H
: 157 PRO A CD 4.97 ( 4.12) . . H
: 160 CYS A SG 5.69 ( 5.20) d . H
: 161 GLY A N 4.87 ( 5.14) . . T
: 170 ASP A OD1 1.49 ( 4.85) . . T
: 171 ALA A N 5.98 ( 7.17) . . T
Site 4: 156 GLY B O 5.46 ( 6.47) . . H
: 157 PRO B CD 5.76 ( 4.59) . . H
: 160 CYS B O 5.30 ( 5.81) d . H
: 161 GLY B N 5.23 ( 5.28) . . T
: 170 ASP B OD1 2.06 ( 5.37) . . T
: 267 HOH B O 2.15 (-1.00) . . .
: 280 HOH B O 4.89 (-1.00) . . .
: 64 TYR B OH 5.67 ( 9.43) . . T
: 186 HOH B O 5.89 (-1.00) . . .
Site 5: 159 TYR A OH 4.46 ( 8.38) . . H
: 186 HOH A O 3.82 (-1.00) . . .
: 217 HOH A O 5.51 (-1.00) . . .
: 228 HOH A O 3.73 (-1.00) . . .
: 28 GLY A C 5.55 ( 6.15) . . T
: 29 ASP A OD1 3.30 ( 4.74) . . T
: 76 ALA A CB 5.61 ( 6.40) . . T
: 273 HOH A O 5.53 (-1.00) . . .
: 255 HOH A O 5.53 (-1.00) . . .
Site 6: 159 TYR B OH 5.15 ( 8.62) . . H
: 179 HOH B O 4.72 (-1.00) . . .
: 185 HOH B O 1.44 (-1.00) . . .
: 233 HOH B O 5.74 (-1.00) . . .
: 262 HOH B O 5.21 (-1.00) . . .
: 290 HOH B O 4.90 (-1.00) . . .
: 76 ALA B CB 4.43 ( 5.36) . . T
: 206 HOH B O 4.73 (-1.00) . . .
: 29 ASP B OD1 2.77 ( 5.13) . . H
Site 7: 129 ASP A OD1 1.49 ( 5.09) . . T
: 152 SER A OG 4.06 ( 6.35) . . T
: 228 HOH A O 4.30 (-1.00) . . .
: 229 HOH A O 4.32 (-1.00) . . .
: 28 GLY A C 5.76 ( 4.74) . . T
: 41 TRP A CH2 4.72 (10.73) . . T
: 252 HOH A O 5.17 (-1.00) . . .
Site 8: 129 ASP B OD1 2.43 ( 6.00) . . T
: 152 SER B OG 3.82 ( 6.03) . . T
: 159 TYR B OH 5.99 (11.21) . . H
: 262 HOH B O 5.26 (-1.00) . . .
: 271 HOH B O 5.99 (-1.00) . . .
: 272 HOH B O 4.49 (-1.00) . . .
: 28 GLY B C 5.92 ( 4.95) . . H
: 41 TRP B CH2 5.78 (11.73) . . T