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ANALYSIS FOR URANIUM (VI) OXYACETATE [UXC]
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Formula :
Solution chemistry: [U1,O2]1 +2
All distances below are to the element U [ uranium ]
| PROTEIN: 1CSE SUBTILISIN CARLSBERG / EGIN COMPLEX
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ++ ION:
Hev Atom conc.: 20.000 mM
Precip & conc.: 15.000 % PEG 6000
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : BODE et.al. 1987 :1986 :
pH 5.0 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 302.00
Site 1: 784 HOH O 4.41 (-1.00) . . .
: 876 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 883 HOH O 3.52 (-1.00) . . .
: 136 LYS E NZ 5.09 ( 6.42) . . T
: 140 ASP E OD1 2.77 ( 5.15) . . T
: 172 ASP E OD1 5.65 ( 5.57) . . T
: 173 SER E OG 4.85 ( 5.74) . . T
: 477 HOH O 1.34 (-1.00) . . .
: 480 HOH O 2.74 (-1.00) . . .
: 500 HOH O 5.67 (-1.00) . . .
: 764 HOH O 4.65 (-1.00) . . .
: 790 HOH O 4.32 (-1.00) . . .
: 791 HOH O 3.58 (-1.00) . . .
: 881 HOH O 3.87 (-1.00) . . .
Site 2: 474 HOH O 4.33 (-1.00) . . .
: 768 HOH O 5.76 (-1.00) . . .
: 769 HOH O 5.89 (-1.00) . . .
: 784 HOH O 4.79 (-1.00) . . .
: 876 HOH O 2.46 (-1.00) . . .
: 883 HOH O 2.52 (-1.00) . . .
: 136 LYS E NZ 4.81 ( 8.15) . . T
: 140 ASP E OD2 4.83 ( 8.42) . . T
: 477 HOH O 3.82 (-1.00) . . .
: 764 HOH O 5.74 (-1.00) . . .
Site 3: 2 GLN E NE2 5.46 ( 9.76) . . . [Het: CACA - CG 3.90]
: 17 GLN E OE1 4.79 ( 7.12) . . T
: 22 LYS E NZ 4.95 ( 9.15) . . T
: 76 ASP E OD1 2.47 ( 5.84) . . T
: 82 LEU E CD1 5.32 ( 8.13) . . T
: 440 HOH O 2.48 (-1.00) . . .
: 628 HOH O 4.41 (-1.00) . . .
: 630 HOH O 5.10 (-1.00) . . .
: 638 HOH O 3.78 (-1.00) . . .
: 834 HOH O 5.44 (-1.00) . . .
: 12 GLU I CG 5.62 ( 5.54) . . T
: 16 LYS I NZ 5.58 ( 9.52) . . T
: 449 HOH O 5.44 (-1.00) . . .
: 450 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
: 451 HOH O 4.54 (-1.00) . . .
Site 4: 517 HOH O 5.83 (-1.00) . . .
: 794 HOH O 5.41 (-1.00) . . .
: 808 HOH O 5.66 (-1.00) . . .
: 108 VAL E CG1 5.13 ( 6.90) . . T
: 109 SER E OG 5.15 ( 5.53) . . T
: 112 GLU E OE1 3.36 ( 6.64) . . T
: 490 HOH O 5.23 (-1.00) . . .
: 495 HOH O 4.46 (-1.00) . . .
: 496 HOH O 4.67 (-1.00) . . .
: 528 HOH O 5.62 (-1.00) . . .
Site 5: 98 SER E O 5.35 ( 7.20) . . T
: 99 SER E OG 5.35 ( 5.10) . . T
: 33 ASN I OD1 2.33 ( 5.80) . . E
: 35 TYR I OH 1.99 ( 8.17) . . E
: 492 HOH O 4.91 (-1.00) . . .
: 788 HOH O 4.68 (-1.00) . . .
: 795 HOH O 3.45 (-1.00) . . .
: 882 HOH O 4.92 (-1.00) . . .
: 256 TYR E CE2 5.20 ( 6.82) . . T
: 265 LYS E CD 5.85 ( 6.19) . . E
: 475 HOH O 4.34 (-1.00) . . .
: 503 HOH O 4.45 (-1.00) . . .
: 504 HOH O 4.38 (-1.00) . . .
: 505 HOH O 4.33 (-1.00) . . .
: 792 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1GCR GAMMA II CRYSTALLIN (CALF)
|
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS/ACETATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : PRE SOAK:X-LINK 3%(V/V) GLUTALDYHYDE IN .05 PHOSPH
Reference : WISTOW et.al. 1983a:1983b:
pH 7.0 Soak time = Hours Reference number = 15.04
Site 1: 84 HIS NE2 5.61 ( 9.60) . . T
: 85 THR O 5.78 ( 8.04) . . T
: 86 GLY C 5.10 ( 4.98) . . T
: 87 THR OG1 4.26 ( 4.83) . . T
: 89 ARG NH2 5.60 ( 8.58) . . E
: 128 GLU OE1 5.32 ( 7.50) . . E
: 306 HOH O 3.49 (-1.00) . . .
: 408 HOH O 4.44 (-1.00) . . .
: 120 GLU OE1 3.16 ( 7.98) . . E
: 163 LYS NZ 5.26 ( 7.97) . . E
Site 2: 264 HOH O 5.10 (-1.00) . . .
: 7 GLU OE1 3.65 ( 7.34) . . E
: 14 HIS ND1 5.58 ( 6.75) . . E
: 30 SER OG 4.72 ( 5.36) . . T
: 31 ARG NH1 4.13 ( 7.78) . . T
: 223 HOH O 4.71 (-1.00) . . .
: 315 HOH O 1.17 (-1.00) . . .
: 323 HOH O 2.28 (-1.00) . . .
: 49 ASN OD1 3.44 ( 5.14) . . T
: 51 GLN NE2 5.82 ( 8.86) . . E
Site 3: 264 HOH O 4.45 (-1.00) . . .
: 426 HOH O 5.41 (-1.00) . . .
: 110 PRO CD 5.74 ( 7.10) . . E
: 217 HOH O 5.31 (-1.00) . . .
: 249 HOH O 5.21 (-1.00) . . .
: 223 HOH O 5.84 (-1.00) . . .
: 322 HOH O 5.63 (-1.00) . . .
: 323 HOH O 4.64 (-1.00) . . .
: 48 PRO CB 5.98 ( 7.34) . . T
: 49 ASN OD1 5.49 ( 7.10) . . T
: 285 HOH O 4.83 (-1.00) . . .
: 327 HOH O 3.28 (-1.00) . . .
: 328 HOH O 5.18 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1I1B INTERLEUKIN - 1 BETA (RECOMBINANT HUMAN)
|
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 2.200 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M PIPES
Addict & conc.: 0.001 M DITHIOTHREITOL
Comments :
Reference : FINZEL et.al. 1989 :
pH 7.0 Soak time = 7924.00 Hours Reference number = 351.02
Site 1: 32 GLN O 4.64 ( 7.02) . . T
: 33 GLY C 5.82 ( 5.61) . . T
: 34 GLN NE2 4.54 ( 5.94) . . T
: 35 ASP OD1 3.65 ( 4.42) . . T
: 63 LYS NZ 5.95 ( 7.05) . . T
: 64 GLU OE1A 2.22 (-1.00) . . T
: 233 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
: 270 HOH O 5.80 (-1.00) . . .
Site 2: 106 ILE CD1 5.26 ( 6.59) . . E
: 111 GLU OE1 4.29 ( 6.71) . . E
: 138 LYS NZ 4.61 ( 6.99) . . T
: 144 THR OG1 4.63 ( 6.29) . . E
: 145 ASP OD1 2.57 ( 5.52) . . E
: 258 HOH O 5.06 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1PAZ PSEUDOAZURIN (ALCALIGENES FAECALIS)
|
Bound Ligands : CU COPPER ION:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.: 3.200 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M AMMONIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : PETRATOS et.al. 1987a:1987b:1984 :
pH 5.7 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 260.00
Site 1: 51 GLU CG 5.88 ( 6.98) . . T
: 97 ALA CB 5.10 ( 6.57) . . T
: 16 HOH O 5.17 (-1.00) . . .
: 20 HOH O 4.73 (-1.00) . . .
: 2 ASN OD1 5.13 ( 6.90) . . E
: 4 GLU OE1 3.64 ( 5.77) . . E
: 32 THR OG1 4.52 ( 6.07) . . E
: 34 ILE CD1 5.21 ( 8.43) . . E
: 49 HOH O 3.89 (-1.00) . . .
: 58 HOH O 4.37 (-1.00) . . .
: 86 HOH O 3.81 (-1.00) . . .
: 89 HOH O 3.89 (-1.00) . . .
: 83 ALA O 5.39 ( 5.91) . . T
Site 2: 109 LYS CE 5.64 ( 7.68) . . T
: 116 GLU OE2 5.86 ( 9.94) . . T
| PROTEIN: 1PCY PLASTOCYANIN (POPLAR, CU2+)
|
Bound Ligands : CU COPPER ION:
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 2.600 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments : 3 FRESH EXCHANGES BUFFER PHOSPHATE TO ACETATE BEFO
Reference : COLMAN et.al. 1978 :FREEMAN et.al. 1983 :
pH 6.0 Soak time = 23.00 Hours Reference number = 31.00
Site 1: 1 ILE CD1 5.57 ( 5.65) . . E
: 20 SER O 4.24 ( 6.61) . . E
: 21 ILE CG2 4.39 ( 4.56) . . E
: 22 SER N 5.21 ( 6.40) . . T
: 25 GLU OE1 2.16 ( 6.70) . . T
: 29 HOH O 3.69 (-1.00) . . .
: 41 HOH O 1.77 (-1.00) . . .
: 60 GLU OE1 4.12 ( 6.62) . . E
: 76 ASN OD1 5.61 ( 5.95) . . T
: 77 LYS CG 4.97 ( 5.81) . . T
: 4 HOH O 2.73 (-1.00) . . .
Site 2: 43 GLU OE1 5.90 ( 6.20) . . E
: 44 ASP OD1 5.07 ( 4.38) . . E
: 13 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
: 32 HOH O 5.74 (-1.00) . . .
: 33 HOH O 5.13 (-1.00) . . .
: 26 LYS NZ 5.41 ( 7.94) . . E
: 28 VAL CG2 5.24 ( 7.41) . . E
: 71 GLU OE1 3.29 ( 6.26) . . E
: 35 PHE O 5.69 ( 7.70) . . T
: 36 PRO CD 4.33 ( 6.61) . . T [Het: CUCU - O 3.80]
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 2.600 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments : 3 FRESH EXCHANGE BUFFER PHOSPHATE TO ACETATE BEFOR
Reference : COLMAN et.al. 1978 :FREEMAN et.al. 1983 :
pH 6.0 Soak time = 240.00 Hours Reference number = 31.01
Site A: 1 ILE CD1 5.64 ( 5.74) . . E
: 20 SER O 4.20 ( 6.55) . . E
: 21 ILE CG2 4.35 ( 4.46) . . E
: 22 SER OG 5.91 ( 6.28) . . T
: 25 GLU OE1 2.18 ( 6.65) . . T
: 29 HOH O 3.59 (-1.00) . . .
: 41 HOH O 1.85 (-1.00) . . .
: 60 GLU OE1 4.12 ( 6.56) . . E
: 76 ASN OD1 5.59 ( 5.94) . . T
: 77 LYS CG 4.99 ( 5.77) . . T
: 4 HOH O 2.76 (-1.00) . . .
Site B: 43 GLU OE1 5.93 ( 6.27) . . E
: 44 ASP OD1 5.04 ( 4.40) . . E
: 13 HOH O 5.42 (-1.00) . . .
: 32 HOH O 5.83 (-1.00) . . .
: 33 HOH O 5.22 (-1.00) . . .
: 26 LYS NZ 5.35 ( 7.89) . . E
: 28 VAL CG2 5.18 ( 7.33) . . E
: 71 GLU OE1 3.21 ( 6.16) . . E
: 35 PHE O 5.66 ( 7.69) . . T
: 36 PRO CD 4.32 ( 6.62) . . T [Het: CUCU - O 3.80]
| PROTEIN: 1RHD RHODANESE (BOVINE LIVER)
|
Hev Atom conc.: 2.200 mM
Precip & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : HOL et.al. 1987 :LIJK et.al. 1983 :1984 :PLOEGMAN et.al. 1978 :
pH 7.3 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 36.05
Site 1: 217 THR CG2 5.33 ( 7.41) . . T
: 223 LYS CE 5.93 ( 5.39) . . T
: 224 SER OG 4.14 ( 6.06) . . H
: 227 GLU OE1 3.33 ( 7.06) . . H
Site 2: 37 SER OG 4.86 ( 6.17) . . T
: 38 PRO CD 5.50 ( 6.69) . . T
: 40 THR OG1 5.98 ( 7.90) . . T
: 194 PRO CG 5.01 ( 4.61) . . T
: 195 ASP OD1 2.71 ( 5.24) . . T
Site 3: 217 THR CG2 5.57 ( 5.26) . . T
: 218 GLU N 5.43 ( 6.44) . . T
: 223 LYS NZ 5.24 ( 8.15) . . T
: 227 GLU OE1 5.82 (10.02) . . H
: 148 GLU OE2 5.85 ( 9.50) . . T
Site 4: 171 LEU O 4.67 ( 6.42) . . H
: 172 GLU OE1 2.77 ( 4.31) . . H
: 205 ARG NH1 5.96 (10.40) . . T
Site 5: 213 MET O 5.60 ( 5.96) . . T
: 214 ASP OD1 2.81 ( 4.86) . . T
| PROTEIN: 1RNS RIBONUCLEASE S
|
Hev Atom conc.: 3.000 mM
Precip & conc.: 3.200 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : WYCKOFF et.al. 1967 :
pH 5.5 Soak time = Hours Reference number = 130.00
Site 1: 2 GLU S OE1 4.59 ( 5.35) . . .
: 10 ARG S NH1 3.52 ( 8.80) . . .
: 34 ASN AD1 4.85 ( 7.82) . . H
: 17 THR S CG2 5.21 ( 7.67) . . .
: 50 SER OG 4.32 ( 5.83) . . H
: 53 ASP OD1 3.29 ( 5.48) . . H
Site 2: 69 GLN AE1 5.64 (10.12) . . T
: 71 ASN CG 5.74 ( 8.38) . . E
: 111 GLU OE1 2.87 ( 6.55) . . E
: 111 GLU OE1 5.28 ( 7.41) . . E
Site 3: 2 GLU S OE1 4.70 ( 5.68) . . .
: 7 LYS S NZ 4.03 ( 7.17) . . .
: 10 ARG S NH1 3.85 (10.16) . . .
: 17 THR S CG2 5.87 ( 8.42) . . .
: 53 ASP OD2 5.65 ( 8.72) . . H
Site 4: 1 LYS S NZ 5.68 ( 2.54) . . .
: 2 GLU S OE1 5.58 ( 1.63) . . .
: 3 THR S CG2 5.58 ( 5.04) . . .
: 6 ALA S CB 5.82 ( 7.19) . . .
: 17 THR S OG1 5.82 ( 5.86) . . .
: 18 SER S N 5.77 ( 6.71) . . .
: 49 GLU OE2 4.06 ( 6.73) . . .
: 53 ASP OD2 4.18 ( 7.93) . . H
Site 5: 50 SER OG 4.97 ( 5.54) . . H
: 51 LEU CD1 2.22 ( 1.96) . . H
: 52 ALA O 4.99 ( 3.16) . . H
: 53 ASP N 4.80 ( 5.98) . . H
: 54 VAL CB 5.77 ( 5.95) . . H
: 55 GLN CD 3.56 ( 5.55) . . H
Site 6: 5 ALA S O 5.00 ( 5.18) . . .
: 6 ALA S O 5.91 ( 4.41) . . .
: 9 GLU S OE1 2.89 ( 6.79) . . .
: 76 TYR O 3.77 ( 5.34) . . T
: 77 SER OG 2.86 ( 2.93) . . T
: 78 THR CG2 5.04 ( 5.71) . . T
: 105 HIS AD1 5.80 ( 8.14) . . E
Site 7: 56 ALA O 2.86 ( 4.58) . . H
: 57 VAL O 5.41 ( 5.24) . . T
: 58 CYS O 5.88 ( 5.77) d . T
: 59 SER OG 0.89 ( 3.17) . . T
: 60 GLN CD 5.12 ( 4.14) . . T
: 10 ARG S O 5.72 ( 6.44) . . .
: 13 MET S O 5.93 ( 8.29) . . .
: 29 MET SD 5.11 ( 6.61) . . H
: 32 SER OG 3.69 ( 5.89) . . H
: 33 ARG NH1 3.86 ( 4.89) . . H
| PROTEIN: 256B CYTOCHROME B562 (E.COLI, OXIDIZED)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX, CONTAINS FE3+: SO4 SULFATE:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.: 100.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.200 M TRIS/MALEATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MATHEWS et.al. 1979 :
pH 7.5 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 53.00
Site 1: 21 ASP A OD1 3.09 ( 4.74) . . .
: 22 ASN A ND2 5.23 ( 6.80) . . .
: 25 GLN A OE1 5.34 ( 9.21) . . .
: 1 ALA B CB 5.37 ( 5.09) . . T
: 2 ASP B OD1 3.42 ( 5.04) . . T
: 5 ASP B OD1 5.01 ( 6.55) . . T
Site 2: 4 GLU B OE1 2.28 ( 4.67) . . T [Het: HEM CGA - CG 3.50]
: 1 HEM B O1D 4.04 (-1.00) . . .
: 737 HOH O 5.52 (-1.00) . . .
Site 3: 4 GLU A OE1 4.21 ( 5.40) . . . [Het: HEM CGA - O 3.50]
: 1 HEM A O1D 3.82 (-1.00) . . .
: 733 HOH O 5.92 (-1.00) . . .
Site 4: 21 ASP A OD1 4.18 ( 7.38) . . .
: 25 GLN A NE2 5.35 (10.27) . . .
: 2 ASP B OD1 5.01 ( 7.76) . . T
: 81 GLU B OE2 5.77 ( 9.77) . . T
: 83 LYS B CE 5.88 (10.85) . . T
Site 5: 1 ALA A O 5.93 ( 4.36) . . .
: 2 ASP A OD1 4.68 ( 5.02) . . .
: 5 ASP A OD1 4.63 ( 5.57) . . .
: 21 ASP B OD1 5.25 ( 6.78) . . T
: 25 GLN B OE1 5.97 ( 9.44) . . T
: 729 HOH O 4.18 (-1.00) . . .
: 732 HOH O 4.56 (-1.00) . . .
Bound Ligands : CYA TWO OXYGEN ATOMS BOUND TO SG OF CYS-25.: NH4 AMMONIUM ION:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 25.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments : TEMP 4 C
Reference : BAKER et.al. 1976 :1977 :
pH 5.5 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 42.00
Site 1: 138 ASP OD1 2.23 ( 5.63) . . T
: 140 ALA CB 5.00 ( 6.25) . . T
: 156 CYS C 5.86 ( 6.51) d . T
: 157 GLY O 5.49 ( 4.22) . . T
: 158 THR C 5.53 ( 5.78) . . T
: 159 ALA O 4.17 ( 4.73) . . T
: 161 ASP OD2 5.88 ( 8.08) . . T
: 22 HOH O 4.25 (-1.00) . . .
: 33 HOH O 5.41 (-1.00) . . .
: 45 HOH O 4.65 (-1.00) . . .
: 59 HOH O 3.88 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 2.85 (-1.00) . . .
: 157 HOH O 4.66 (-1.00) . . .
: 238 HOH O 4.99 (-1.00) . . .
: 250 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
: 262 HOH O 5.78 (-1.00) . . .
: 263 HOH O 3.91 (-1.00) . . .
: 264 HOH O 0.51 (-1.00) . . .
: 15 ASP OD1 2.52 ( 5.28) . . T
: 37 HOH O 5.24 (-1.00) . . .
: 41 HOH O 5.58 (-1.00) . . .
Site 2: 138 ASP OD1 4.71 ( 5.88) . . T
: 140 ALA CB 4.23 ( 5.57) . . T
: 159 ALA O 3.63 ( 5.39) . . T
: 160 VAL O 5.18 ( 5.92) . s T
: 161 ASP OD1 4.91 ( 5.31) . . T
: 33 HOH O 3.91 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 1.55 (-1.00) . . .
: 153 HOH O 5.59 (-1.00) . . .
: 157 HOH O 1.41 (-1.00) . . .
: 250 HOH O 2.65 (-1.00) . . .
: 251 HOH O 4.96 (-1.00) . . .
: 252 HOH O 4.57 (-1.00) . . .
: 263 HOH O 4.83 (-1.00) . . .
: 264 HOH O 4.55 (-1.00) . . .
: 15 ASP OD1 4.54 ( 6.09) . . T
Site 3: 164 HOH O 5.79 (-1.00) . . .
: 165 HOH O 3.37 (-1.00) . . .
: 170 HOH O 4.97 (-1.00) . . .
: 171 HOH O 5.06 (-1.00) . . .
: 4 TYR OH 2.72 ( 8.39) . . .
: 6 ASP OD1 2.34 ( 5.20) . . E
: 8 ARG NH2 4.39 ( 6.55) . . T
: 9 SER OG A 5.57 ( 5.96) . . T
: 179 ILE CD1 5.58 ( 9.20) . . E
: 116 HOH O 4.67 (-1.00) . . .
: 122 HOH O 2.61 (-1.00) . . .
: 156 HOH O 5.50 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2APR ACID PROTEINASE (RHIZOPUS CHINENSIS)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : SUBRAMANIAN et.al. 1976 :
pH Soak time = Hours Reference number = 56.05
Site 1: 581 HOH O 2.86 (-1.00) . . .
: 610 HOH O 4.98 (-1.00) . . .
: 648 HOH O 5.54 (-1.00) . . .
Site 2: 752 HOH O 4.48 (-1.00) . . .
Site 3: 140 MET SD 5.92 ( 9.23) . . H
: 151 ARG O 5.79 ( 7.66) . . T
: 152 PRO C 5.74 ( 6.78) . . T
: 153 ILE CD1 4.80 ( 3.62) . . E
: 154 PHE CE1 5.88 ( 1.58) . . E
: 155 GLY O 5.25 ( 4.42) . . E
: 170 ILE CG2 5.33 ( 4.80) . . E
: 171 PHE CE2 5.73 ( 3.46) . . E
: 172 GLY O 5.33 ( 3.93) . . T
: 173 GLY O 3.39 ( 4.56) . . T
: 174 TYR N 5.61 ( 6.15) . . T
: 310 VAL CG1 5.69 ( 6.54) . . E
: 311 PHE O 5.07 ( 6.54) . . E
Site 4: 33 ASP OD2 5.56 ( 5.30) . . E
: 34 PHE CE1 5.45 ( 2.19) . . E
: 35 ASP OD1 5.90 ( 2.99) . s E
: 36 THR CG2 5.91 ( 5.53) . . T
: 122 LEU C 5.29 ( 5.86) . . E
: 123 LEU CD1 4.03 ( 3.78) . . E
: 124 GLY O 5.18 ( 4.22) . . E
: 125 LEU CD1 3.66 ( 4.96) . . T
: 169 TYR OH 5.52 ( 9.93) . . E
: 219 THR OG1 5.14 ( 7.46) . . T
: 515 HOH O 5.81 (-1.00) . . .
Site 5: 583 HOH O 3.34 (-1.00) . . .
Site 6: 656 HOH O 4.70 (-1.00) . . .
: 785 HOH O 4.92 (-1.00) . . .
: 201 ARG NE 5.07 ( 7.97) . . E
: 203 THR CG2 5.11 ( 7.44) . . E
: 206 THR O 5.52 ( 7.37) . . T
: 208 THR OG1 2.78 ( 5.18) . . E
: 561 HOH O 3.23 (-1.00) . . .
: 630 HOH O 1.45 (-1.00) . . .
: 686 HOH O 5.61 (-1.00) . . .
: 826 HOH O 5.09 (-1.00) . . .
: 831 HOH O 4.69 (-1.00) . . .
Site 7: 17 TYR CD1 5.80 ( 6.71) . . E
: 34 PHE O 3.36 ( 5.31) . . E
: 35 ASP C 5.73 ( 5.31) . s E
: 36 THR OG1 5.17 ( 6.03) . . T
: 156 VAL CG1 4.57 ( 7.04) . . E
: 158 LEU CD1 4.21 ( 7.19) . . E
: 169 TYR OH 2.20 ( 8.46) . . E
: 218 ASP O 5.67 ( 6.36) . s T
: 219 THR OG1 2.25 ( 2.90) . . T
: 220 GLY N 4.55 ( 5.64) . . T
: 301 ASP OD2 4.73 ( 7.18) . . H
: 304 LEU CD1 5.13 ( 7.65) . . H
: 513 HOH O 4.65 (-1.00) . . .
: 515 HOH O 2.57 (-1.00) . . .
Site 8: 4 GLY O 4.65 ( 6.07) . . T
: 5 THR OG1 5.92 ( 6.15) . . E
: 153 ILE O 4.80 ( 6.66) . . E
: 154 PHE O 5.77 ( 4.32) . . E
: 155 GLY O 4.72 ( 4.67) . . E
: 169 TYR O 5.13 ( 5.79) . . E
: 170 ILE CD1 4.47 ( 2.30) . . E
: 171 PHE CD1 5.60 ( 3.26) . . E
: 172 GLY O 5.06 ( 4.33) . . T
: 173 GLY O 2.42 ( 3.46) . . T
: 174 TYR CB 5.56 ( 4.66) . . T
| PROTEIN: 2AZA AZURIN (ALCALIGENES DENITRIFICANS)
|
Bound Ligands : CU COPPER ION: SO4 SULFATE ION:
Hev Atom conc.: 5.150 mM
Precip & conc.: 75.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M AMMONIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : BAKER et.al. 1988 :NORRIS et.al. 1983 :
pH 5.5 Soak time = 1176.00 Hours Reference number = 20.01
Site 1: 41 LYS A NZ 4.23 ( 7.24) . . T [Het: SO4 S - N 3.80]
: 136 SO4 A S 4.19 (-1.00) . . .
: 142 HOH A O 4.25 (-1.00) . . .
: 267 HOH A O 4.78 (-1.00) . . .
: 41 LYS A NZ 2.49 ( 6.90) . . T [Het: SO4 S - N 3.80]
: 88 GLY A N 5.45 ( 5.83) . . T
: 91 GLU A OE1 3.15 ( 7.18) . . E
: 136 SO4 A S 4.19 (-1.00) . . .
: 213 HOH A O 5.70 (-1.00) . . .
: 27 LYS B NZ 5.39 ( 8.01) . . E
: 214 HOH B O 3.55 (-1.00) . . .
: 27 LYS B NZ 4.74 (10.06) . . E
Site 2: 105 GLY A O 4.93 ( 6.82) . . T
: 106 GLU A OE1 4.66 ( 4.38) . . T
: 107 ALA A N 5.21 ( 6.42) . . T
| PROTEIN: 2CHY CHE Y (SALMONELLA TYPHIMURIUM)
|
Hev Atom conc.: 0.500 mM
Precip & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments : DIRECT SITE MUTAGENESIS +54; SER ____ CYS, (S 56C)
Reference : MOTTONEN et.al. 1989 :STOCK et.al. 1989 :
pH 5.0 Soak time = 5.00 Hours Reference number = 326.01
Site 1: 12 ASP CA 5.12 ( 5.12) . . E
: 13 ASP CA 4.69 ( 4.69) . . .
: 14 PHE CA 5.84 ( 5.84) . . .
: 59 ASN CA 4.96 ( 4.96) . . .
: 60 MET CA 5.35 ( 5.35) . . .
Site 2: 36 ALA CA 5.08 ( 5.08) . . E
: 37 GLU CA 5.57 ( 5.57) . . E
: 41 ASP CA 5.45 ( 5.45) . . .
| PROTEIN: 2GBP D-GALACTOSE-BINDING PROTEIN (ESCHERICHIA COLI)
|
Bound Ligands : GLC BETA-D-GLUCOSE: CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 28.000 % PEG 6000
Buffer & conc.: 0.010 M SODIUM CITRATE
Addict & conc.: 0.020 % SODIUM AZIDE
Comments :
Reference : PFLUGRATH et.al. 1980 :
pH 5.1 Soak time = 288.00 Hours Reference number = 172.01
Site 1: 280 ASP OD1 5.40 ( 6.71) . . T
: 373 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
Site 2: 22 LYS NZ 4.01 (10.08) . . T
: 352 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
: 449 HOH O 5.15 (-1.00) . . .
: 450 HOH O 2.21 (-1.00) . . .
: 451 HOH O 2.40 (-1.00) . . .
Site 3: 294 PRO CD 5.64 ( 7.79) . . T
: 423 HOH O 4.94 (-1.00) . . .
: 424 HOH O 5.32 (-1.00) . . .
: 433 HOH O 4.72 (-1.00) . . .
Site 4: 113 LYS NZ 5.61 ( 9.71) . . H
: 383 HOH O 5.27 (-1.00) . . .
Site 5: 283 ASN OD1 5.76 ( 7.71) . . T
: 523 HOH O 3.23 (-1.00) . . .
: 106 TYR OH 5.53 ( 7.00) . . E
: 286 ILE CD1 5.95 ( 5.77) . . T
: 287 ASP O 4.99 ( 5.40) . . T
: 288 ASN OD1 4.43 ( 3.30) . . T
: 289 LYS CE 4.71 ( 2.60) . . E
: 290 VAL N 4.58 ( 6.03) . . E
: 373 HOH O 4.03 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2RSP ROUS SARCOMA VIRUS (RSV) PROTEASE
|
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 10.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MILLER et.al. 1989b:1989a:
pH 5.4 Soak time = 22.00 Hours Reference number = 322.00
Site 1: 35 LEU A CD2 5.94 ( 8.97) . . E
: 37 ASP A OD1 2.67 ( 5.20) . s E
: 38 SER A N 5.71 ( 6.47) . s .
: 39 GLY A O 4.47 ( 4.06) . s .
: 40 ALA A CB 5.12 ( 5.19) . . .
: 37 ASP B OD1 2.33 ( 5.10) . s E
: 38 SER B N 5.55 ( 6.18) . s .
: 39 GLY B O 4.48 ( 3.56) . s .
: 40 ALA B CB 5.16 ( 5.31) . . .
: 226 HOH B O 0.26 (-1.00) . . .
: 273 HOH B O 5.81 (-1.00) . . .
: 349 HOH B O 3.92 (-1.00) . . .
: 351 HOH B O 5.64 (-1.00) . . .
: 431 HOH B O 5.03 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2TBV VIRUS (TOMATO BUSHY STUNT)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 1.000 M SODIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE (DROP)
Comments : AMMONIUM SULPHATE HELPS STABILIZE CRYSTAL.
Reference : CAMPBELL et.al. 1990 :HARRISON et.al. 1978 :HOGLE et.al. 1983 :JACK et.al. 1975 :OLSON et.al. 1983 :WINKLER et.al. 1977 :
pH 5.0 Soak time = Hours Reference number = 81.01
Site 1: 152 PHE A O 5.70 ( 6.38) . . .
: 153 ASP A OD1 5.07 ( 5.25) . . .
: 225 ASP A OD2 5.23 ( 7.15) . . .
: 265 PHE A O 5.70 ( 7.60) . . .
: 267 GLN A OE1 1.93 ( 5.60) . . .
: 268 PRO A CD 4.97 ( 6.33) . . .
: 181 ASP C OD1 3.26 ( 4.82) . . E
: 182 LYS C C 5.97 ( 5.97) . . .
: 183 ASP C OD2 5.87 ( 5.51) . . .
: 186 ASP C OD1 4.08 ( 5.83) . . .
: 198 PHE C CE1 4.37 ( 7.47) . . H
: 1 CA GCA 4.18 (-1.00) . . .
: 1 CA UCA 0.47 (-1.00) . . .
Site 2: 181 ASP A OD1 3.43 ( 5.12) . . E
: 182 LYS A C 5.96 ( 5.99) . . .
: 183 ASP A OD2 5.67 ( 5.47) . . .
: 186 ASP A OD1 3.82 ( 5.88) . . .
: 198 PHE A CE1 4.78 ( 7.74) . . H
: 152 PHE B O 5.52 ( 6.30) . . H
: 153 ASP B OD1 5.20 ( 5.13) . . .
: 225 ASP B OD1 5.85 ( 6.99) . . .
: 265 PHE B O 5.92 ( 7.80) . . .
: 266 PRO B O 5.75 ( 7.17) . . .
: 267 GLN B OE1 3.16 ( 4.45) . . .
: 268 PRO B CD 4.26 ( 6.45) . . .
: 3 CA GCA 3.70 (-1.00) . . .
: 3 CA UCA 0.85 (-1.00) . . .
Site 3: 181 ASP B OD1 3.62 ( 5.15) . . E
: 182 LYS B N 5.42 ( 6.18) . . .
: 183 ASP B OD2 5.93 ( 5.73) . . .
: 186 ASP B OD1 4.05 ( 6.03) . . .
: 198 PHE B CE1 4.62 ( 7.34) . . H
: 153 ASP C OD1 5.39 ( 5.76) . . .
: 265 PHE C O 5.35 ( 7.45) . . .
: 267 GLN C OE1 2.13 ( 4.64) . . .
: 268 PRO C CD 4.85 ( 6.47) . . .
: 2 CA GCA 5.15 (-1.00) . . .
: 2 CA UCA 1.35 (-1.00) . . .
Site 4: 133 GLN A OE1 3.11 ( 5.41) . . .
: 135 ASN A ND2 4.75 ( 5.87) . . .
: 137 SER A O 5.73 ( 7.34) . . .
: 138 ASN A ND2 5.23 ( 6.60) . . .
: 184 SER A OG 4.62 ( 7.03) . . .
: 224 ASN A OD1 3.90 ( 6.70) . . .
: 231 GLN A NE2 4.74 ( 5.19) . . .
: 235 ASP A OD1 2.65 ( 5.60) . . .
Site 5: 133 GLN B OE1 2.73 ( 5.58) . . .
: 135 ASN B ND2 4.62 ( 5.63) . . .
: 138 ASN B ND2 5.70 ( 6.90) . . .
: 184 SER B OG 4.38 ( 6.78) . . .
: 224 ASN B OD1 4.00 ( 6.85) . . .
: 231 GLN B NE2 4.86 ( 5.08) . . .
: 235 ASP B OD1 2.46 ( 5.35) . . .
Site 6: 133 GLN C OE1 3.76 ( 5.88) . . .
: 135 ASN C OD1 5.68 ( 5.53) . . .
: 138 ASN C ND2 5.95 ( 7.07) . . .
: 184 SER C OG 4.56 ( 6.96) . . .
: 224 ASN C OD1 3.27 ( 6.30) . . .
: 231 GLN C NE2 5.17 ( 4.70) . . .
: 234 ILE C CG2 5.49 ( 6.47) . . .
: 235 ASP C OD1 2.26 ( 4.97) . . .
Site 7: 186 ASP B OD1 3.34 ( 5.15) . . .
: 187 PRO B CD 4.05 ( 6.46) . . .
: 225 ASP C OD1 4.81 ( 4.77) . . .
: 226 SER C OG 5.59 ( 6.00) . . .
: 267 GLN C OE1 5.54 ( 8.26) . . .
: 268 PRO C O 5.69 ( 7.55) . . .
: 269 THR C C 5.93 ( 6.92) . . .
: 270 ASN C OD1 4.07 ( 4.36) . . .
: 271 THR C N 5.42 ( 6.75) . . .
: 2 CA UCA 5.95 (-1.00) . . .
: 380 ARG C NH1 3.57 ( 7.39) . . .
| PROTEIN: 2TS1 TYROSYL TRANSFER RNA SYNTHETASE (BACILLUS STEAROTH
|
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 2.400 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: TRIS/ACETATE
Addict & conc.: 0.010 M MAGNESIUM IONS
Comments :
Reference : BRICK et.al. 1987 :IRWIN et.al. 1976 :
pH 7.0 Soak time = 720.00 Hours Reference number = 41.00
Site 1: 134 THR OG1 5.57 ( 5.35) . . .
: 137 ARG NH1 5.67 ( 6.36) . . .
: 138 ASP OD1 2.49 ( 5.25) . . .
: 286 ARG CD 5.34 ( 6.70) . . .
: 287 GLU CG 5.39 ( 5.68) . . .
Site 2: 131 ASP OD1 3.04 ( 5.69) . . .
: 133 ILE CD1 4.94 ( 5.60) . . .
: 134 THR OG1 4.51 ( 6.22) . . .
: 75 LEU CD1 5.96 ( 9.32) . . .
: 124 TYR OH 2.85 ( 8.01) . . .
: 127 ILE O 5.85 ( 7.68) . . .
: 128 GLY O 3.65 ( 4.42) . . .
: 129 PRO N 5.60 ( 6.24) . . .
: 362 HOH O 4.17 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3APP ACID PROTEINASE (PENICILLUM JANTHINELLUM)
|
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 2.500 M LITHIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : DELBAERE et.al. 1977 :HSU et.al. 1976 :1977 :SIELECKI et.al. 1988 :
pH 4.4 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 75.02
Site 1: 16 GLU OE1 5.97 (10.11) . . E
: 40 TRP CH2 4.28 ( 9.34) . . E
: 42 PHE CE1 3.95 ( 8.03) . . E
: 54 HIS CE1 5.50 ( 9.48) . . .
: 111 GLN O 5.62 ( 7.39) . . .
: 112 PHE CE1 5.91 ( 4.13) . . .
: 113 GLN N 5.85 ( 6.82) . . .
: 115 ASP OD1 5.70 ( 5.55) . . .
: 118 ASN OD1 2.49 ( 5.23) . . .
: 119 ASP C 5.47 ( 5.70) . . E
: 120 GLY O 5.30 ( 4.98) . . E
: 121 LEU CD1 5.94 ( 7.00) . . E
: 67 HOH O 1.38 (-1.00) . . .
Site 2: 36 SER OG 4.85 ( 5.17) . . E
: 37 ALA O 3.96 ( 4.05) . . .
: 38 ASP OD1 2.58 ( 2.91) . . E
: 39 LEU N 5.23 ( 6.58) . . E
: 73 ILE CD1 4.13 ( 6.90) . . E
: 103 GLN OE1 4.93 ( 8.79) . . E
: 129 ILE O 4.15 ( 6.35) . . .
: 130 ASN OD1 5.81 ( 4.20) . . .
: 131 THR OG1 4.20 ( 4.79) . . .
: 17 HOH O 2.23 (-1.00) . . .
: 70 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
: 223 HOH O 3.77 (-1.00) . . .
Site 3: 184 VAL O 5.28 ( 7.23) . . E
: 185 ASP OD1 5.63 ( 5.27) . . .
: 140 HOH O 4.66 (-1.00) . . .
: 220 HOH O 5.37 (-1.00) . . .
: 318 HOH O 5.86 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3B5C CYTOCHROME B5 (OXIDIZED)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX, CONTAINS FE3+:
Hev Atom conc.: 100.000 mM
Precip & conc.: 4.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M TRIS
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MATHEWS et.al. 1972 :
pH 7.5 Soak time = Hours Reference number = 133.00
Site 1: 64 SER OG 5.36 ( 6.99) . . T [Het: HEM CGA - OG 3.40]
: 66 ASP OD1 4.06 ( 5.41) . . T
: 557 HOH O 4.87 (-1.00) . . .
: 587 HOH O 3.75 (-1.00) . . .
: 581 HOH O 5.11 (-1.00) . . .
: 591 HOH O 5.55 (-1.00) . . .
Site 2: 4 VAL CG1 5.25 ( 7.05) . . .
: 6 TYR OH 5.09 ( 9.12) . . E
: 78 GLU OE1 2.50 ( 6.70) . . E
: 84 ARG NH1 5.01 (11.61) . . T
: 518 HOH O 2.74 (-1.00) . . .
: 519 HOH O 2.09 (-1.00) . . .
: 575 HOH O 2.18 (-1.00) . . .
: 26 HIS ND1 5.62 ( 7.95) . . T
: 55 THR CG2 4.77 ( 6.76) . . T
: 56 GLU OE1 5.72 ( 5.91) . . T
: 59 GLU CD 5.91 ( 6.84) . . T
: 529 HOH O 5.91 (-1.00) . . .
: 546 HOH O 5.75 (-1.00) . . .
: 547 HOH O 5.92 (-1.00) . . .
: 566 HOH O 4.45 (-1.00) . . .
Site 3: 45 VAL CG2 4.83 ( 7.30) . . T [Het: HEM CHD - CG1 3.50]
: 61 VAL CG1 5.80 ( 6.54) . . T [Het: HEM CHD - CG1 4.00]
: 201 HEM CHD 5.73 (-1.00) . . .
: 520 HOH O 5.46 (-1.00) . . .
: 527 HOH O 4.05 (-1.00) . . .
: 564 HOH O 4.43 (-1.00) . . .
: 573 HOH O 0.84 (-1.00) . . .
: 577 HOH O 4.07 (-1.00) . . .
: 11 GLU OE1 2.55 ( 5.58) . . .
: 14 LYS NZ 3.00 ( 6.89) . . .
: 15 HIS NE2 4.94 ( 8.44) . . .
: 591 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
Site 4: 8 THR OG1 5.38 ( 5.41) . . .
: 9 LEU CD2 5.72 ( 5.06) . . .
: 10 GLU OE1 5.15 ( 4.94) . . .
: 83 ASP OD1 2.69 ( 5.51) . . T
: 86 LYS NZ 2.63 ( 8.40) . . T
: 510 HOH O 3.69 (-1.00) . . .
: 523 HOH O 5.75 (-1.00) . . .
: 37 GLU O 5.08 ( 6.83) . . T
: 38 GLU OE1 2.46 ( 5.35) . . T
: 501 HOH O 1.41 (-1.00) . . .
: 502 HOH O 2.82 (-1.00) . . .
: 545 HOH O 3.06 (-1.00) . . .
: 568 HOH O 3.70 (-1.00) . . .
Site 5: 18 SER OG 5.63 ( 7.24) . . T
: 36 LEU CD1 5.62 ( 6.26) . . T
: 37 GLU OE1 4.74 ( 5.53) . . T
: 43 GLU OE1 2.33 ( 6.48) . . T
: 47 ARG NH1 3.94 ( 9.51) . . T
: 535 HOH O 5.97 (-1.00) . . .
: 554 HOH O 5.91 (-1.00) . . .
: 589 HOH O 4.09 (-1.00) . . .
Site 6: 44 GLU CD 5.97 ( 5.65) . . T
: 47 ARG CD 4.94 ( 5.63) . . T
: 48 GLU CG 5.21 ( 5.61) . . T
: 550 HOH O 5.61 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3FXC FERREDOXIN (SPIRULINA PLATENSIS)
|
Bound Ligands : FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 85.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M TRIS/HCL
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : TEMP 2 TO 4 C
Reference : TSUKIHARA et.al. 1981 :
pH 7.5 Soak time = Hours Reference number = 90.00
Site 1: 60 GLN OE1 5.37 ( 8.96) . . .
: 2 THR CG2 4.94 ( 7.09) . . .
: 3 TYR OH 2.84 ( 6.00) . . .
: 58 ILE CG2 5.47 ( 7.13) . . .
: 60 GLN NE2 5.75 ( 9.10) . . .
: 84 THR OG1 5.39 ( 4.26) . . .
: 85 SER OG 3.78 ( 2.71) . . .
: 86 ASP N 4.32 ( 5.81) . . .
| PROTEIN: 4APE ACID PROTEINASE (ENDOTHIA PARASITICA)
|
Hev Atom conc.: 100.000 mM
Precip & conc.: 2.700 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 10.000 % ACETONE
Comments :
Reference : JENKINS et.al. 1975 :1979 :
pH Soak time = Hours Reference number = 72.02
Site 1: 153 ALA O 2.54 ( 4.84) . . E
: 154 ASP OD1 4.97 ( 2.88) . . E
: 155 LEU O 5.17 ( 5.39) . . E
: 307 LEU O 4.22 ( 6.34) . . H
: 308 LYS CA 5.95 ( 5.95) . . H
: 309 ALA C 5.87 ( 6.67) . . T
: 310 ALA O 2.17 ( 4.33) . . E
: 311 PHE CE1 5.05 ( 2.42) . . E
: 312 VAL CG2 4.65 ( 4.55) . . E
: 324 ALA O 5.70 ( 7.28) . . E
: 326 LYS NZ 2.83 ( 6.93) . . E
: 138 HOH O 2.76 (-1.00) . . .
: 174 HOH O 5.71 (-1.00) . . .
Site 2: 48 SER O 5.32 ( 7.31) . . T
: 112 THR CG2 4.29 ( 6.10) . . H
: 113 GLU N 5.84 ( 6.01) . . H
: 165 HOH O 3.16 (-1.00) . . .
: 351 HOH O 4.85 (-1.00) . . .
: 352 HOH O 3.71 (-1.00) . . .
: 353 HOH O 5.52 (-1.00) . . .
: 144 ALA O 4.82 ( 4.67) . . T
: 170 HOH O 3.99 (-1.00) . . .
Site 3: 184A SER OG 5.88 ( 6.80) . . E
: 187 GLN OE1 5.58 ( 7.35) . . T
: 189 PHE CD1 4.95 ( 5.24) . . E
: 190 TRP O 4.26 ( 5.46) . . E
: 191 GLU OE1 3.40 ( 2.51) . . E
: 192 TRP O 4.89 ( 5.09) . . E
: 211 ASP OD1 4.17 ( 6.15) . . E
: 212 GLY O 2.93 ( 4.26) . . E
: 213 ILE CD1 5.41 ( 3.43) . . E
: 214 ALA N 5.34 ( 6.78) . . E
: 299 ILE CD1 4.09 ( 7.46) . . E
: 300 ASN O 5.59 ( 7.49) . . E
: 87 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
: 219 HOH O 5.89 (-1.00) . . .
Site 4: 356 HOH O 5.53 (-1.00) . . .
: 357 HOH O 4.73 (-1.00) . . .
: 358 HOH O 5.32 (-1.00) . . .
: 359 HOH O 4.05 (-1.00) . . .
: 62 THR O 5.28 ( 6.54) . . T
: 63 THR C 5.85 ( 6.61) . . T
: 63A ALA O 3.07 ( 5.37) . . T
: 64 LYS NZ 4.19 ( 4.03) . . T
: 65 LEU N 5.52 ( 6.87) . . T
: 158 HOH O 4.47 (-1.00) . . .
: 237 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
Site 5: 172 THR O 4.31 ( 5.92) . . E
: 173 THR O 5.05 ( 5.14) . . T
: 174 ALA O 5.19 ( 5.33) . . T
: 175 TYR CE1 5.36 ( 3.42) . . T
: 176 THR OG1 4.12 ( 2.97) . . T
: 177 GLY O 5.32 ( 5.46) . . T
: 325 SER O 5.77 ( 7.74) . . E
: 66 HOH O 4.20 (-1.00) . . .
: 361 HOH O 1.97 (-1.00) . . .
: 384 HOH O 5.09 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4INS INSULIN (PORCINE 2-ZN)
|
Bound Ligands : ZN ZINC ION ON 3-FOLD CRYSTAL AXIS:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 0.010 M ZINC ACETATE
Comments : TEMP 18C SOAK=3.,4. :TEMP 4C SOAK=72.,96.
Reference : ADAMS et.al. 1969 :DODSON et.al. 1989 :SCHLICHTKRULL et.al. 1956a:1956b:
pH 6.3 Soak time = 3.00 Hours Reference number = 278.03
Site 1: 9 SER B OG 4.95 ( 6.58) . . .
: 13 GLU B OE1 5.78 ( 7.46) . s .
: 13 GLU D OE1 3.14 ( 6.02) . s T
: 18 HOH O 1.40 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 5.16 (-1.00) . . .
: 41 HOH O 5.43 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 1.91 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 3.61 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 3.03 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.18 (-1.00) . . .
: 18 HOH O 2.88 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 3.65 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 5.81 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.18 (-1.00) . . .
: 10 HIS B ND1 5.20 ( 6.77) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 13 GLU B OE1 4.77 ( 6.93) . s .
: 13 GLU D OE2 4.84 ( 9.06) . s T
: 18 HOH O 3.73 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 4.76 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 4.51 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.18 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 652 HOH O 4.62 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 4.34 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 2.94 (-1.00) . . .
: 702 HOH O 3.12 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 5.12 (-1.00) . . .
: 702 HOH O 6.00 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 4.65 (-1.00) . . .
Site 1: 672 HOH O 5.39 (-1.00) . . .
Site 2: 29 LYS B NZ 3.46 ( 7.46) . . T
: 30 ALA B O 5.20 ( 6.98) . . T
: 344 HOH O 4.14 (-1.00) . . .
: 368 HOH O 4.16 (-1.00) . . .
: 376 HOH O 5.38 (-1.00) . . .
: 374 HOH O 3.17 (-1.00) . . .
: 402 HOH O 1.89 (-1.00) . . .
: 403 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 461 HOH O 5.16 (-1.00) . . .
: 491 HOH O 5.52 (-1.00) . . .
: 531 HOH O 5.75 (-1.00) . . .
: 541 HOH O 5.87 (-1.00) . . .
: 17 GLU A OE1 4.75 ( 6.33) . . .
: 22 ARG B NH1A 4.50 ( 9.54) . . T
: 1 GLY C O 5.92 ( 3.77) . s T
: 2 ILE C N 5.99 ( 7.44) . . T
: 4 GLU C OE2 4.79 ( 8.15) . s T
: 28 PRO D O 5.80 ( 7.43) . . T
: 29 LYS D O 4.32 ( 6.03) . . T
: 30 ALA D OXT 1.11 ( 3.17) . . T
Site 3: 30 ALA B O 5.35 ( 7.52) . . T
: 374 HOH O 5.51 (-1.00) . . .
: 381 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 402 HOH O 3.61 (-1.00) . . .
: 403 HOH O 2.83 (-1.00) . . .
: 447 HOH O 2.26 (-1.00) . . .
: 491 HOH O 2.61 (-1.00) . . .
: 541 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
: 14 TYR A OH 5.99 ( 7.01) . s .
: 17 GLU A OE1 3.19 ( 7.42) . . .
: 1 GLY C O 5.21 ( 4.27) . s T
: 2 ILE C N 5.87 ( 6.94) . . T
: 5 GLN C OE1 5.63 ( 7.48) . s T
: 19 TYR C OH 5.21 (10.74) . s T
: 30 ALA D OXT 5.94 ( 7.46) . . T
Site 4: 29 LYS B CG 5.66 ( 6.44) . . T
: 30 ALA B OXT 4.97 ( 4.35) . . T
: 288 HOH O 4.96 (-1.00) . . .
: 322 HOH O 5.80 (-1.00) . . .
: 344 HOH O 2.74 (-1.00) . . .
: 368 HOH O 5.05 (-1.00) . . .
: 374 HOH O 2.97 (-1.00) . . .
: 402 HOH O 2.91 (-1.00) . . .
: 403 HOH O 4.36 (-1.00) . . .
: 17 GLU A OE2 4.69 ( 8.74) . . .
: 22 ARG B NH2A 4.75 ( 8.81) . . T
: 1 GLY C N 5.26 ( 6.27) . s T
: 30 ALA D OXT 5.23 ( 7.44) . . T
| PROTEIN: 4MDH MALATE DEHYDROGENASE
|
Bound Ligands : NAD NAD CO-ENZYME: SUL SULFATE:
Hev Atom conc.: 3.000 mM
Precip & conc.: 70.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.010 M ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : BIRKTOFT et.al. 1989 :TSERNOGLOU et.al. 1972 :
pH 5.0 Soak time = Hours Reference number = 115.02
Site 1: 79 ASP A OD1 4.03 ( 4.84) . . T
: 119 ALA A O 5.45 ( 6.45) . . H
: 120 LYS A NZ 4.93 ( 4.05) . . T
: 121 LYS A N 5.52 ( 6.89) . . T
: 324 GLU B OE1 4.68 ( 6.99) . . H
: 327 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
: 329 HOH O 5.79 (-1.00) . . .
Site 2: 4 ILE B CD1 5.37 ( 7.54) . . E
: 81 ASP B OD1 4.36 ( 5.24) . . E
: 82 VAL B CG2 5.41 ( 6.94) . . E
: 122 SER B OG 5.93 ( 6.92) . . T
: 124 LYS B CE 5.65 ( 7.22) . . E
: 257 TRP B CH2 2.58 ( 7.56) . . H
: 294 LYS B NZ 3.77 ( 7.65) . . T
: 253 HOH O 1.41 (-1.00) . . .
: 255 HOH O 4.69 (-1.00) . . .
Site 3: 121 LYS B NZ 5.02 ( 8.04) . . T
: 144 PRO B O 4.38 ( 6.67) . . T
: 145 SER B OG 3.87 ( 4.31) . . T
: 146 ILE B N 5.69 ( 6.39) . . T
: 263 HOH O 2.32 (-1.00) . . .
Site 4: 108 PHE A O 5.95 ( 8.18) . . H
: 109 LYS A O 5.53 ( 7.49) . . H
: 110 CYS A O 5.30 ( 7.02) . . H
: 111 GLN A O 3.08 ( 5.08) . . H
: 112 GLY A O 1.03 ( 2.29) . . H
: 113 ALA A O 3.99 ( 3.50) . . H
: 114 ALA A O 4.77 ( 4.27) . . H
: 115 LEU A CD1 3.84 ( 2.92) . . H
: 116 ASP A OD1 5.68 ( 3.90) . . H
: 117 LYS A N 5.30 ( 6.65) . . H
: 139 ALA A O 4.86 ( 6.32) . . H
: 142 SER A O 4.49 ( 5.95) . . H
: 143 ALA A CB 3.82 ( 4.54) . . H
: 146 ILE A CD1 4.85 ( 7.71) . . T
: 151 PHE A CZ 5.45 (10.51) . . E
: 130 HOH O 5.85 (-1.00) . . .
Site 5: 121 LYS B NZ 4.49 ( 5.32) . . T
: 122 SER B N 5.90 ( 6.17) . . T
: 143 ALA B O 5.02 ( 7.20) . . H
: 144 PRO B O 5.46 ( 6.69) . . T
: 145 SER B O 3.34 ( 5.16) . . T
: 146 ILE B CD1 5.08 ( 2.07) . . T
: 147 PRO B CD 0.89 ( 2.38) . . T
: 148 LYS B N 4.61 ( 5.94) . . T
: 150 ASN B OD1 4.51 ( 6.63) . . E
: 151 PHE B CE1 5.12 ( 8.60) . . E
: 384 HOH O 4.95 (-1.00) . . .
Site 6: 95 MET A O 5.50 ( 7.19) . . T
: 96 GLU A OE1 5.94 ( 3.74) . . T
: 97 ARG A O 5.54 ( 5.12) . . T
: 461 HOH O 3.69 (-1.00) . . .
: 464 HOH O 1.59 (-1.00) . . .
Site 7: 320 ALA A O 5.24 ( 6.28) . . H
: 324 GLU A OE1 3.10 ( 6.11) . . H
: 374 HOH O 3.72 (-1.00) . . .
: 320 ALA A O 5.24 ( 6.28) . . H
: 324 GLU A OE1 3.10 ( 6.11) . . H
: 374 HOH O 3.72 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4SBV VIRUS COAT PROTEIN (SOUTHERN BEAN MOSAIC)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : ASAD-ZATERO et.al. 1981 :HERMODSON et.al. 1982 :SUCK et.al. 1978 :
pH Soak time = Hours Reference number = 263.01
Site 1: 76 THR C O 5.95 ( 8.14) . . .
: 77 GLU C CG 5.31 ( 5.96) . . .
: 120 LEU C O 3.86 ( 5.63) . . .
: 121 PRO C O 5.31 ( 5.90) . . .
: 122 SER C OG 4.38 ( 5.69) . . .
: 239 THR C O 5.41 ( 6.98) . . .
: 240 GLY C O 3.50 ( 3.85) . . .
: 241 ARG C NH1 2.01 ( 3.20) . . .
: 242 LEU C N 5.21 ( 6.30) . . .
: 243 TYR C OH 5.38 ( 8.64) . . .