_____________________________________________________________
ANALYSIS FOR DICHLORODIAMMINE PLATINUM (II) [PEC]
_____________________________________________________________
Formula : PT1,N2,H6,CL2
Solution chemistry: PT1,[N1,H3]2,CL2 -0
All distances below are to the element PT [ platinum ]
| PROTEIN: 1CSE SUBTILISIN CARLSBERG / EGLIN COMPLEX
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ++ ION:
Hev Atom conc.: 20.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 1.000 M CITRATE
Addict & conc.:
Comments : HA TRANS PEC
Reference : BODE et.al. 1987 :1986 :
pH 8.5 Soak time = 432.00 Hours Reference number = 302.02
Site 1: 237 LYS E O 4.26 ( 6.18) . . T
: 238 HIS E NE2 4.07 ( 3.85) . . T
: 239 PRO E N 5.46 ( 6.82) . . T
: 241 LEU E CD1 5.78 ( 7.60) . . T
: 249 ARG E NH2 5.46 (11.87) . . T
: 583 HOH O 5.46 (-1.00) . . .
: 610 HOH O 4.05 (-1.00) . . .
: 619 HOH O 3.58 (-1.00) . . .
: 822 HOH O 5.46 (-1.00) . . .
: 832 HOH O 1.37 (-1.00) . . .
: 837 HOH O 3.28 (-1.00) . . .
Site 2: 64 ASN I OD1 5.99 ( 6.47) . . T
: 65 HIS I NE2 2.40 ( 3.88) . . E
: 66 VAL I N 4.84 ( 6.21) . . E
: 699 HOH O 5.97 (-1.00) . . .
: 853 HOH O 4.90 (-1.00) . . .
: 856 HOH O 5.97 (-1.00) . . .
Site 3: 24 TYR I OH 5.58 ( 7.99) . . T
: 27 LEU I O 5.71 ( 7.13) . . T
: 28 HIS I NE2 4.16 ( 3.93) . . T
: 29 TYR I OH 5.00 ( 6.61) . . T
: 655 HOH O 5.84 (-1.00) . . .
: 664 HOH O 5.10 (-1.00) . . .
: 675 HOH O 5.94 (-1.00) . . .
: 679 HOH O 3.09 (-1.00) . . .
: 686 HOH O 4.91 (-1.00) . . .
: 843 HOH O 3.79 (-1.00) . . .
: 851 HOH O 5.16 (-1.00) . . .
Site 4: 1 ALA E O 4.43 ( 2.56) . . .
: 2 GLN E N 4.88 ( 6.20) . . . [Het: CACA - CG 3.90]
: 78 THR E OG1 5.62 ( 5.91) . . T
: 79 THR E OG1 5.87 ( 5.80) . . T [Het: CACA - C 3.60]
: 436 HOH O 3.70 (-1.00) . . .
: 438 HOH O 4.13 (-1.00) . . .
: 439 HOH O 3.30 (-1.00) . . .
: 634 HOH O 5.59 (-1.00) . . .
: 646 HOH O 2.40 (-1.00) . . .
: 650 HOH O 2.36 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1GOX GLYCOLATE OXIDASE (SPINACH)
|
Bound Ligands : FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE PROSTHETIC GROUP:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS/HCL
Addict & conc.:
Comments : 4C
Reference : BRANDEN et.al. 1980 :LINDQVIST et.al. 1988 :
pH 8.3 Soak time = 404.00 Hours Reference number = 175.01
Site 1: 455 HOH O 4.83 (-1.00) . . .
: 631 HOH O 4.26 (-1.00) . . .
: 44 ARG NH2 5.83 ( 9.27) . . .
: 267 MET SD 3.82 ( 4.83) . . H
: 358 TRP CH2 5.53 ( 6.07) . . .
: 432 HOH O 5.77 (-1.00) . . .
: 461 HOH O 2.44 (-1.00) . . .
: 555 HOH O 1.13 (-1.00) . . .
Site 2: 20 MET SD 3.74 ( 5.04) . . H
: 170 ASN O 4.05 ( 5.63) . . .
: 171 ARG O 5.13 ( 6.54) . . .
: 551 HOH O 4.56 (-1.00) . . .
: 16 LYS NZ 3.90 ( 5.58) . . .
: 442 HOH O 3.21 (-1.00) . . .
: 486 HOH O 5.72 (-1.00) . . .
: 613 HOH O 3.36 (-1.00) . . .
: 644 HOH O 2.75 (-1.00) . . .
Site 3: 1 MET SD 5.26 ( 6.53) . . .
: 566 HOH O 5.44 (-1.00) . . .
: 612 HOH O 4.56 (-1.00) . . .
: 1 MET SD 5.26 ( 6.53) . . .
: 566 HOH O 5.44 (-1.00) . . .
: 612 HOH O 4.56 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1MBA MET - MYOGLOBIN (APLYSIA LIMACINA)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX WITH FE3+:
Hev Atom conc.: 0.000 mM
Precip & conc.: 3.800 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : BOLOGNESI et.al. 1989 :UNGARETTI et.al. 1978 :
pH 6.0 Soak time = 888.00 Hours Reference number = 327.01
Site 1: 23 ALA O 5.70 ( 7.28) . . H
: 26 LEU O 5.59 ( 6.41) . . H
: 27 ASP OD1 4.04 ( 4.50) . . H
: 30 VAL CG1 4.94 ( 6.42) . . H
: 55 LYS NZ 5.18 ( 7.23) . . H
: 156 HOH O 3.56 (-1.00) . . .
: 165 HOH O 4.31 (-1.00) . . .
: 263 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 264 HOH O 3.41 (-1.00) . . .
Site 2: 32 LEU CD1 4.94 ( 4.88) . . H
: 33 PHE CE1 5.27 ( 3.69) . . H
: 34 GLU C 5.65 ( 5.96) . . H
: 35 LYS O 5.39 ( 5.57) . . H
: 36 PHE CD1 5.38 ( 2.69) . . .
: 37 PRO CD 4.31 ( 3.55) . . 5
: 38 ASP OD1 4.30 ( 4.74) . . 5
: 39 SER OG 1.94 ( 3.54) . . 5
: 40 ALA CB 5.83 ( 5.62) . . 5
: 187 HOH O 4.64 (-1.00) . . .
: 198 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
: 271 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
Site 3: 23 ALA O 5.76 ( 7.58) . . H
: 27 ASP OD1 2.69 ( 4.40) . . H
: 156 HOH O 4.59 (-1.00) . . .
: 165 HOH O 3.34 (-1.00) . . .
: 244 HOH O 4.16 (-1.00) . . .
: 264 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2ALP ALPHA-LYTIC PROTEASE
|
Bound Ligands : SO4 SULFATE:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 1.300 M LITHIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments : AUTHORS BELIEVE PT DISRUPTS DISULPHIDE
Reference : BRAYER et.al. 1979 :
pH 7.2 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 19.00
Site 1: 137 CYS SG 3.41 ( 5.85) d . .
: 157 TYR OH 5.08 ( 7.17) . . .
: 158 GLN O 5.79 ( 6.00) . . .
: 159 CYS SG 2.15 ( 4.61) d . .
: 48 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
: 70 HOH O 4.13 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 4.96 (-1.00) . . .
: 92 HOH O 4.47 (-1.00) . . .
: 98 HOH O 4.49 (-1.00) . . .
: 221 GLY O 5.57 ( 5.43) . . .
: 46 HOH O 5.61 (-1.00) . . .
: 139 HOH O 1.97 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2PAZ PSEUDOAZURIN
|
Bound Ligands : CU COPPER ION:
Hev Atom conc.: 4.000 mM
Precip & conc.: 80.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : ADMAN et.al. 1989 :
pH 6.6 Soak time = 144.00 Hours Reference number = 330.00
Site 1: 15 ALA CB 5.79 ( 7.13) . . T
: 16 MET SD 5.72 ( 7.25) . . T
: 81 HIS CD2 5.44 ( 6.99) . . T [Het: CUCU - CB 3.50]
: 84 MET SD 2.44 ( 5.16) . . T
: 198 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
: 94 ASP O 5.70 ( 7.40) . . T
: 130 HOH O 5.49 (-1.00) . . .
: 131 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
: 174 HOH O 5.97 (-1.00) . . .
: 175 HOH O 3.98 (-1.00) . . .
: 218 HOH O 5.02 (-1.00) . . .
: 219 HOH O 3.01 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3APP ACID PROTEINASE (PENICILLUM JANTHINELLUM)
|
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 2.500 M LITHIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : DELBAERE et.al. 1977 :HSU et.al. 1976 :1977 :SIELECKI et.al. 1988 :
pH 4.4 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 75.03
Site 1: 13 ASN OD1 4.81 ( 7.32) . . .
: 249 CYS SG 5.73 ( 8.23) d . H
: 274 TYR O 5.96 ( 7.18) . . E
: 275 GLY O 3.50 ( 3.63) . . E
: 276 PRO CD 1.53 ( 1.29) . . E
: 277 SER CB 5.80 ( 4.63) . . E
: 278 GLY N 4.69 ( 5.61) . . H
: 282 THR O 4.71 ( 7.12) . . E
: 283 CYS SG 4.89 ( 5.39) d . E
: 284 LEU N 5.83 ( 7.02) . . E
: 282 HOH O 5.83 (-1.00) . . .
Site 2: 96 THR CG2 5.59 ( 6.98) . . E
: 98 HIS NE2 2.20 ( 6.27) . . .
| PROTEIN: 3CTS CITRATE SYNTHASE (CHICKEN, COA, CITRATE)
|
Bound Ligands : COA COENZYME A: CIT CITRATE ION:
Hev Atom conc.: 20.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 1.200 M CITRATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : REMINGTON et.al. 1982 :
pH 6.0 Soak time = Hours Reference number = 209.03
Site 1: 71 UNK CG2 4.21 ( 6.24) . . H
: 72 UNK CD 5.66 ( 5.69) . . H
: 75 UNK NE2 5.73 ( 6.58) . . H
: 230 UNK CD1 5.30 ( 8.31) . . H
: 328 UNK O 5.57 ( 7.59) . . H
: 331 UNK O 5.32 ( 6.54) . . H
: 332 UNK SG 2.67 ( 3.35) . . H
: 333 UNK N 5.42 ( 6.50) . . H
: 335 UNK OE1 5.11 ( 6.29) . . H
: 93 HOH O 4.52 (-1.00) . . .
: 94 HOH O 5.17 (-1.00) . . .
Site 2: 118 UNK O 5.50 ( 7.35) . . H
: 119 UNK C 5.83 ( 5.69) . . T
: 120 UNK CD2 5.09 ( 5.64) . . T
: 125 UNK CG2 5.99 ( 8.26) . . H
: 184 UNK SG 4.49 ( 5.65) . . H
: 200 UNK CD1 3.59 ( 6.64) . . T
: 201 UNK O 4.43 ( 6.59) . . T
: 216 UNK SD 5.79 ( 9.09) . . H
: 61 HOH O 4.06 (-1.00) . . .
Site 3: 9 UNK O 5.70 ( 7.17) . . .
: 12 UNK O 5.87 ( 6.48) . . .
: 13 UNK CD1 3.62 ( 3.95) . . .
: 16 UNK NZ 4.52 ( 7.35) . . .
: 98 UNK O 5.20 ( 6.72) . . H
: 100 UNK NE2 4.28 ( 8.27) . . T
Site 4: 223 UNK OE1 4.42 ( 6.46) . . H
: 339 UNK O 4.62 ( 6.25) . . H
: 340 UNK NE2 4.62 ( 3.78) . . H
: 341 UNK N 5.85 ( 6.95) . . H
: 385 UNK OH 5.33 (11.00) . . H
Site 5: 35 UNK O 4.66 ( 6.78) . . T
: 37 UNK OG1 4.33 ( 5.97) . . H
: 40 UNK SD 2.91 ( 5.56) . . H
: 46 UNK O 4.30 ( 6.70) . . T [Het: COAAO6 - NH1 4.10]
: 47 UNK O 4.58 ( 4.66) . . T
: 48 UNK N 5.29 ( 5.82) . . T
Bound Ligands : PHO PHOSPHATE:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 20.000 % WATER/ETHANOL
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : ANDREEVA et.al. 1984 :
pH 2.0 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 32.02
Site 1: 232 GLN NE2 5.33 ( 7.55) . . H
: 239 GLU OE1 3.50 ( 5.30) . . E
: 243 GLY O 5.39 ( 7.43) . . E
: 245 MET SD 2.88 ( 5.90) . . E
: 474 HOH O 3.52 (-1.00) . . .
: 477 HOH O 3.35 (-1.00) . . .
: 482 HOH O 4.92 (-1.00) . . .
: 279 ASP OD1 5.02 ( 5.56) . . T
Site 2: 76 GLY O 5.16 ( 5.92) . . T
: 287 GLU OE1 5.74 ( 8.62) . . E
: 288 GLY O 5.06 ( 7.26) . . E
: 289 MET SD 2.12 ( 4.50) . . E
: 290 ASP O 5.60 ( 6.73) . . T
: 291 VAL CG2 5.57 ( 7.19) . . T
: 240 ASN ND2 5.20 ( 8.80) . . E
: 242 ASP OD1 5.48 ( 8.35) . . T
: 244 GLU OE1 5.81 ( 8.99) . . E
: 281 SER OG 4.81 ( 7.04) . . E
Site 3: 199 MET SD 3.08 ( 4.92) . . E
: 200 ASP OD2 4.44 ( 6.57) . . T
: 204 ILE CD1 5.73 ( 6.93) . . E
: 234 ASP OD1 4.42 ( 4.49) . . H
: 235 ILE N 5.95 ( 6.60) . . H
: 256 PRO CG 5.50 ( 7.81) . . T
Site 4: 247 ILE CG1 5.87 ( 5.35) . . E
: 248 SER OG 5.83 ( 4.23) . . T
: 249 CYS SG 1.89 ( 2.29) d . H
: 250 SER N 4.68 ( 6.05) . . H
: 251 SER N 5.96 ( 6.77) . . H
: 252 ILE CD1 4.53 ( 6.72) . . H
: 275 ILE CG1 5.58 ( 6.78) . . E
: 276 LEU O 5.19 ( 7.00) . . E
: 277 GLN OE1 5.53 ( 5.51) . . E
: 280 ASP O 5.25 ( 6.50) . . T
: 281 SER O 5.09 ( 5.54) . . E
: 282 CYS SG 1.51 ( 3.07) d . E
: 283 THR N 5.01 ( 6.27) . . E
: 472 HOH O 5.32 (-1.00) . . .