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ANALYSIS FOR DINITRITODIAMINE PLATINUM (II) [PEA]
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Formula : PT1,N4,O4,H6
Solution chemistry: PT1,[N1,O2]2,[H1,H3]2 -0
All distances below are to the element PT [ platinum ]
| PROTEIN: 1ECD ERYTHROCRUORIN (REDUCED, DEOXY)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX WITH FE2+ AND WATER:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 3.750 M PHOSPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : HUBER et.al. 1968 :1969 :1971 :
pH 7.0 Soak time = Hours Reference number = 112.01
Site 1: 18 GLY O 5.45 ( 6.00) . . .
: 16 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
Site 2: 94 HIS NE2 5.16 ( 9.08) . . H
: 132 ILE O 5.57 ( 7.98) . . H
: 133 PHE O 4.59 ( 6.04) . . H
: 134 SER O 5.04 ( 5.87) . . .
: 135 LYS O 3.67 ( 4.55) . . .
: 136 MET OXT 3.09 ( 2.68) . . .
: 94 HOH O 2.16 (-1.00) . . .
Site 3: 16 VAL CG1 4.18 ( 4.57) . . .
: 17 LYS N 5.72 ( 6.27) . . .
: 19 ASP OD1 5.64 ( 5.11) . . H
: 20 PRO N 5.78 ( 6.24) . . H
: 22 GLY O 5.40 ( 5.44) . . H
: 23 ILE CD1 3.26 ( 4.32) . . H
: 104 PHE CE2 5.86 ( 7.48) . . H
: 107 TYR OH 2.15 ( 5.64) . . H
: 108 MET SD 5.10 ( 6.09) . . H
: 111 HIS NE2 5.61 ( 6.91) . . H
: 79 HOH O 4.42 (-1.00) . . .
Site 4: 18 GLY O 5.52 ( 6.02) . . .
: 16 HOH O 5.49 (-1.00) . . .
Site 5: 94 HIS NE2 5.12 ( 9.02) . . H
: 132 ILE O 5.51 ( 7.92) . . H
: 133 PHE O 4.61 ( 6.01) . . H
: 134 SER O 5.08 ( 5.90) . . .
: 135 LYS O 3.62 ( 4.53) . . .
: 136 MET OXT 3.02 ( 2.57) . . .
: 94 HOH O 2.25 (-1.00) . . .
Site 6: 19 ASP OD1 5.51 ( 6.94) . . H
: 20 PRO O 5.09 ( 5.78) . . H
: 21 VAL CG1 1.50 ( 2.36) . . H
: 22 GLY N 4.13 ( 5.35) . . H
: 50 LYS CE 5.85 ( 5.55) . . H
: 51 GLY N 5.71 ( 5.72) . . .
: 52 THR O 5.90 ( 7.38) . . H
: 55 PHE CE2 4.05 ( 5.89) . . H
: 56 GLU OE1 5.55 ( 4.62) . . H
: 59 ALA CB 4.91 ( 6.38) . . H
: 4 HOH O 4.20 (-1.00) . . .
: 18 HOH O 4.74 (-1.00) . . .
: 40 HOH O 3.27 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1REI IMMUNOGLOBULIN B-J FRAGMENT (V-DIMER) REI
|
Hev Atom conc.: 4.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : EPP et.al. 1974 :
pH Soak time = 504.00 Hours Reference number = 34.01
Site 1: 1 ASP A CG 5.55 ( 3.25) . . .
: 2 ILE A N 5.46 ( 6.66) . . .
: 250 HOH O 5.72 (-1.00) . . .
Site 2: 70 ASP A OD2 5.39 ( 8.98) . . T
: 18 ARG B NE 5.47 ( 8.06) . . T
: 1 ASP B OD1 1.56 ( 4.25) . . T
: 2 ILE B CD1 4.44 ( 4.39) . . T
: 27 GLN B CD 5.00 ( 7.91) . . T
: 90 GLN B AE1 5.63 ( 9.87) . . T
: 93 SER B OG 3.37 ( 5.65) . . T
: 94 LEU B O 4.03 ( 5.99) . s T
: 95 PRO B O 5.62 ( 6.39) . . T
: 221 HOH O 3.24 (-1.00) . . .
Site 3: 24 GLN A CD 4.98 ( 8.14) . . E
: 70 ASP A OD1 5.45 ( 8.02) . . T
: 18 ARG B NH1 5.82 ( 6.48) . . T
: 76 SER B O 5.20 ( 6.88) . . T
: 233 HOH O 5.04 (-1.00) . . .
: 242 HOH O 5.29 (-1.00) . . .
: 56 ALA A CB 5.34 ( 6.72) . . T
: 1 ASP B OD1 3.69 ( 3.48) . . T
: 2 ILE B N 4.89 ( 6.27) . . T
: 94 LEU B O 3.76 ( 5.68) . s T
: 95 PRO B CD 2.58 ( 4.90) . . T
: 217 HOH O 3.49 (-1.00) . . .
: 221 HOH O 3.80 (-1.00) . . .
Site 4: 1 ASP A OD1 5.89 ( 3.06) . . .
: 2 ILE A N 5.27 ( 6.49) . . .
: 95 PRO A CD 5.95 ( 7.94) . . T
: 250 HOH O 5.48 (-1.00) . . .
Site 5: 70 ASP A OD2 5.30 ( 8.89) . . T
: 18 ARG B NE 5.35 ( 7.97) . . T
: 1 ASP B OD1 1.59 ( 4.21) . . T
: 2 ILE B CD1 4.55 ( 4.44) . . T
: 27 GLN B CD 5.02 ( 7.97) . . T
: 90 GLN B AE1 5.73 ( 9.98) . . T
: 93 SER B OG 3.48 ( 5.75) . . T
: 94 LEU B O 4.05 ( 6.05) . s T
: 95 PRO B O 5.69 ( 6.43) . . T
: 221 HOH O 3.31 (-1.00) . . .
Site 6: 24 GLN A CD 4.92 ( 8.06) . . E
: 70 ASP A OD1 5.33 ( 7.90) . . T
: 18 ARG B NH1 5.74 ( 6.52) . . T
: 76 SER B O 5.29 ( 6.96) . . T
: 233 HOH O 5.04 (-1.00) . . .
: 242 HOH O 5.40 (-1.00) . . .
: 56 ALA A CB 5.38 ( 6.78) . . T
: 1 ASP B OD1 3.66 ( 3.38) . . T
: 2 ILE B N 4.82 ( 6.21) . . T
: 94 LEU B O 3.86 ( 5.79) . s T
: 95 PRO B CD 2.68 ( 5.00) . . T
: 217 HOH O 3.58 (-1.00) . . .
: 221 HOH O 3.83 (-1.00) . . .
Site 7: 1 ASP A OD1 5.89 ( 3.09) . . .
: 2 ILE A N 5.33 ( 6.56) . . .
: 95 PRO A CD 5.96 ( 7.96) . . T
: 250 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
Site 8: 70 ASP A OD2 5.54 ( 9.15) . . T
: 18 ARG B NE 5.76 ( 8.27) . . T
: 1 ASP B OD1 1.38 ( 4.22) . . T
: 2 ILE B CD1 4.25 ( 4.24) . . T
: 27 GLN B CD 5.09 ( 7.89) . . T
: 90 GLN B AE1 5.30 ( 9.55) . . T
: 93 SER B OG 3.20 ( 5.43) . . T
: 94 LEU B O 3.90 ( 5.78) . s T
: 95 PRO B O 5.32 ( 6.16) . . T
: 221 HOH O 2.95 (-1.00) . . .
Site 9: 24 GLN A CD 4.99 ( 8.12) . . E
: 70 ASP A OD1 5.41 ( 7.98) . . T
: 18 ARG B NH1 5.84 ( 6.55) . . T
: 76 SER B O 5.27 ( 6.95) . . T
: 233 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
: 242 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
: 56 ALA A CB 5.36 ( 6.75) . . T
: 1 ASP B OD1 3.65 ( 3.41) . . T
: 2 ILE B N 4.82 ( 6.21) . . T
: 94 LEU B O 3.79 ( 5.70) . s T
: 95 PRO B CD 2.59 ( 4.90) . . T
: 217 HOH O 3.56 (-1.00) . . .
: 221 HOH O 3.76 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2IG2 IMMUNOGLOBULIN G1(LAMBDA) KOL
|
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 0.150 M SODIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 0.020 M PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : COLMAN et.al. 1976 :
pH 7.5 Soak time = Hours Reference number = 60.02
Site 2: 14 PRO L CG 5.85 ( 6.85) . . .
: 78 GLN L CG 5.37 ( 6.03) . . .
: 79 SER L OG 5.35 ( 5.47) . . .
: 156 THR H CG2 4.29 ( 5.36) . . .
: 157 VAL H CG1 4.62 ( 2.42) . . .
: 158 SER H OG 3.11 ( 5.16) . . .
: 170 THR H OG1 5.84 ( 8.01) . . .
: 183 LEU H CD1 5.76 ( 8.61) . . .
: 202 ASN H O 4.98 ( 7.63) . . .
: 203 VAL H CA 5.97 ( 5.97) . . .
Site 3: 38 ARG H CB 5.63 ( 5.97) . . .
: 39 GLN H O 3.63 ( 5.22) . . .
: 40 ALA H C 5.59 ( 4.93) . . .
: 41 PRO H CD 5.02 ( 6.32) . . .
: 90 ASP H O 5.38 ( 7.57) . . .
: 91 THR H CG2 5.48 ( 5.01) . . .
: 92 GLY H O 1.69 ( 1.44) . . .
: 93 VAL H CG1 4.67 ( 2.32) . . .
: 94 TYR H CE2 4.71 ( 5.40) . . .
: 112 THR H O 4.96 ( 7.02) . . .
: 113 PRO H CB 5.28 ( 4.64) . . .
: 114 VAL H CG1 5.64 ( 5.23) . . .
Site 5: 40 GLY L O 5.70 ( 7.75) . . .
: 93 VAL H CG1 4.21 ( 5.97) . . .
: 110 GLN H O 4.25 ( 6.18) . . .
: 111 GLY H O 3.00 ( 4.40) . . .
: 112 THR H O 5.51 ( 4.40) . . .
: 113 PRO H CD 3.72 ( 5.13) . . .
| PROTEIN: 2PTC TRYPSIN/TRYPSIN INHIBITOR COMPLEX
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 4.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 2.500 M POTASSIUM/SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : RUHLMANN et.al. 1973 :
pH 7.0 Soak time = Hours Reference number = 105.00
Site 1: 30 CYS I SG 5.81 ( 6.53) d . E
: 48 ALA I O 4.10 ( 5.12) . . H
: 49 GLU I OE2 5.60 ( 5.07) . . H
: 52 MET I SD 3.35 ( 5.05) . . H
: 569 HOH O 3.57 (-1.00) . . .
Site 2: 1 ARG I NH1 5.09 ( 2.87) . . .
: 2 PRO I CD 3.91 ( 5.16) . . .
: 54 THR I O 5.19 ( 7.25) . . H
: 57 GLY I O 5.30 ( 6.35) . . .
Site 3: 39 TYR E CD1 5.44 ( 5.81) . . .
: 17 ARG I NH1 4.96 ( 9.43) . . E
: 19 ILE I CD1 4.18 ( 8.00) . . E
: 413 HOH O 5.61 (-1.00) . . .
: 522 HOH O 5.30 (-1.00) . . .
Site 4: 1 ARG I NH1 3.75 ( 3.68) . . .
: 2 PRO I CD 4.94 ( 4.82) . . .
: 57 GLY I O 5.21 ( 7.11) . . .
Site 5: 21 THR E OG1 4.11 ( 6.00) . . .
: 144 THR E CG2 5.93 ( 7.96) . . .
: 152 PRO E CG 5.96 ( 5.61) . . .
: 154 VAL E CG2 5.01 ( 6.81) . . .
: 156 LYS E NZ 2.37 ( 7.21) . . .
: 411 HOH O 5.66 (-1.00) . . .
: 574 HOH O 5.42 (-1.00) . . .
: 592 HOH O 1.85 (-1.00) . . .
Site 6: 37 SER E OG 4.93 ( 7.41) . . .
: 39 TYR E OH 5.74 (10.67) . . .
: 60 LYS E NZ 3.22 ( 5.91) . . .
: 61 SER E OG 5.64 ( 6.86) . . .
: 18 ILE I CG2 5.79 ( 7.67) . . E
: 20 ARG I NH2 5.70 ( 8.10) . . E
: 46 LYS I NZ 5.70 ( 6.38) . . .
: 511 HOH O 3.88 (-1.00) . . .
: 537 HOH O 3.00 (-1.00) . . .
: 563 HOH O 3.51 (-1.00) . . .
: 570 HOH O 4.06 (-1.00) . . .
: 602 HOH O 3.40 (-1.00) . . .
: 603 HOH O 3.22 (-1.00) . . .
: 609 HOH O 5.87 (-1.00) . . .
Site 7: 25 ASN E O 5.96 ( 7.41) . . .
: 27 VAL E C 5.81 ( 6.97) . . .
: 28 PRO E CD 4.63 ( 3.40) . . .
: 29 TYR E CB 5.83 ( 5.30) . . .
: 115 ASN E OD1 5.50 ( 5.81) . . .
: 116 SER E O 3.64 ( 4.76) . . .
: 117 ARG E O 3.96 ( 4.39) . . .
: 118 VAL E CG1 4.97 ( 2.83) . . .
: 119 ALA E O 3.74 ( 2.43) . . .
: 120 SER E O 5.98 ( 5.85) . . .
: 409 HOH O 5.84 (-1.00) . . .
: 516 HOH O 5.93 (-1.00) . . .
: 614 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 9WGA AGGLUTININ (WHEAT GERM, ISOLECTIN 2)
|
Hev Atom conc.: 3.000 mM
Precip & conc.: 0.010 M SODIUM CHLORIDE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : WRIGHT et.al. 1974 :1977 :
pH 6.5 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 89.01
Site 1: 45 ARG A NH1 4.44 ( 6.73) . . T
: 64 TYR A O 4.73 ( 6.55) . . T
: 65 GLY A O 5.72 ( 6.65) . . T
: 66 HIS A NE2 2.13 ( 6.05) . . T
: 201 HOH A O 5.90 (-1.00) . . .
: 249 HOH A O 5.76 (-1.00) . . .
Site 2: 45 ARG B NH1 3.54 ( 6.94) . . T
: 64 TYR B O 4.59 ( 6.51) . . T
: 65 GLY B O 5.44 ( 6.59) . . T
: 66 HIS B NE2 2.34 ( 6.43) . . T
: 218 HOH B O 5.85 (-1.00) . . .
: 252 HOH B O 3.59 (-1.00) . . .