_____________________________________________________________
ANALYSIS FOR SAMARIUM (III) NITRATE [LIJ]
_____________________________________________________________
Formula : SM1,N3,O9
Solution chemistry: SM +3
All distances below are to the element SM [ samarium ]
| PROTEIN: 1FDX FERREDOXIN (PEPTOCOCCUS AEROGENES)
|
Bound Ligands : FES FE/S (INORGANIC) CLUSTER NUMBER 1:
Hev Atom conc.: 40.000 mM
Precip & conc.: 3.300 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: TRIS/HCL
Addict & conc.:
Comments :
Reference : ADMAN et.al. 1973 :
pH 7.5 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 123.01
Site 1: 8 CYS O 4.78 ( 6.99) . . . [Het: FESFE1 - CB 3.30]
: 9 ILE O 5.54 ( 5.29) . . . [Het: FES S2 - N 3.70]
: 10 ALA N 5.70 ( 6.35) . . . [Het: FES S1 - CA 4.00]
Site 2: 6 ASP OD2 4.03 ( 6.68) . . .
: 7 SER OG 4.78 ( 5.17) . . .
Site 3: 6 ASP OD1 4.23 ( 4.80) . . .
: 32 ALA O 3.68 ( 6.08) . . .
: 33 ASP OD1 5.68 ( 2.95) . . .
: 34 SER OG 5.55 ( 3.82) . . .
: 35 CYS O 4.86 ( 5.92) . . . [Het: FESFE2 - CA 3.70]
Site 4: 54 ASP O 4.87 ( 7.22) . . .
: 15 LYS O 4.56 ( 6.59) . . .
: 16 PRO O 5.31 ( 4.77) . . .
: 18 CYS O 4.25 ( 6.37) . . . [Het: FESFE1 - CA 3.90]
: 19 PRO C 5.98 ( 6.15) . . .
: 20 VAL C 5.93 ( 6.47) . . . [Het: FES S1 - CG2 3.80]
: 21 ASN OD1 4.57 ( 4.64) . . .
Site 5: 6 ASP OD2 5.67 ( 8.73) . . .
: 33 ASP CG 5.60 ( 6.27) . . .
: 26 SER OG 5.92 ( 7.75) . . .
Site 6: 48 GLY O 4.69 ( 5.86) . . .
: 50 PRO O 5.38 ( 7.16) . . . [Het: FES S3 - CG 3.60]
: 51 ASN OD1 2.55 ( 5.27) . . .
: 52 PRO CD 5.79 ( 7.78) . . .
: 16 PRO O 5.11 ( 6.15) . . .
: 17 GLU OE1 3.83 ( 5.95) . . .
Site 7: 3 VAL CG2 5.45 ( 6.31) . . .
: 4 ILE CG1 5.99 ( 5.34) . . . [Het: FES S3 - CG1 3.60]
: 27 ILE CD1 4.20 ( 6.73) . . .
: 28 TYR O 3.51 ( 5.61) . . . [Het: FES S1 - CG 3.60]
: 29 ALA CB 3.77 ( 3.83) . . .
: 30 ILE N 4.94 ( 6.17) . . . [Het: FES S2 - CG2 3.90]
: 36 ILE CD1 4.62 ( 5.91) . . . [Het: FES S1 - N 3.70]
: 38 CYS CB 5.36 ( 5.85) . . . [Het: FESFE3 - N 3.80]
Site 8: 5 ASN OD1 4.77 ( 5.79) . . .
: 6 ASP O 5.35 ( 5.74) . . .
: 7 SER OG 2.94 ( 2.69) . . .
: 8 CYS O 5.85 ( 3.98) . . . [Het: FESFE1 - CB 3.30]
: 9 ILE N 5.50 ( 6.85) . . . [Het: FES S2 - N 3.70]
: 45 CYS SG 5.12 ( 7.45) . . . [Het: FESFE4 - CA 3.80]
: 47 VAL CG1 5.25 ( 4.44) . . . [Het: FES S2 - CG2 3.90]
: 48 GLY O 3.89 ( 4.50) . . .
: 49 ALA O 4.88 ( 2.92) . . .
: 50 PRO N 5.35 ( 6.76) . . . [Het: FES S3 - CG 3.60]
: 1 FES FE4 5.81 (-1.00) . . .
Site 9: 8 CYS O 5.92 ( 8.04) . . . [Het: FESFE1 - CB 3.30]
: 27 ILE CG2 4.93 ( 6.46) . . .
Site A: 9 ILE O 5.71 ( 6.36) . . . [Het: FES S2 - N 3.70]
: 10 ALA CB 5.84 ( 6.79) . . . [Het: FES S1 - CA 4.00]
| PROTEIN: 1FX1 FLAVODOXIN (DESULPHOVIBRIO VULGARIS) (UNREFINED)
|
Bound Ligands : FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE PROSTHETIC GROUP:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 3.700 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.040 M TRIS/HCL
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : WATENPAUGH et.al. 1972 :
pH 7.5 Soak time = 216.00 Hours Reference number = 85.01
Site 1: 17 TYR OH 4.96 ( 8.88) . . .
: 21 THR OG1 4.50 ( 4.68) . . .
: 25 GLN CD 5.43 ( 6.85) . . .
: 134 ARG NH1 2.98 ( 5.75) . . .
: 138 VAL CG1 5.58 ( 6.06) . . .
| PROTEIN: 2CNA CONCANAVALIN A
|
Bound Ligands : MN MANGANESE ION: CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.: 0.100 M SODIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.010 M SODIUM MALEATE
Addict & conc.:
Comments : PROTEIN PREPARED ACCORDING TO CUNNINGHAM (33):XL P
Reference : BECKER et.al. 1975 :QUIOCHO et.al. 1971 :
pH 6.8 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 134.03
Site 1: 87 GLU OE1 3.00 ( 6.93) . . E
: 88 TRP NE1 4.88 ( 8.28) . . E
: 180 HIS NE2 4.96 ( 9.15) . . E
: 182 TRP CH2 5.51 ( 8.20) . . T
: 183 GLU CG 5.49 ( 5.93) . . T
: 184 SER N 5.72 ( 6.54) . . T
: 134 SER OG 4.98 ( 6.08) . . T
: 135 LYS CB 5.92 ( 6.00) . . T
: 136 ASP OD1 4.07 ( 4.59) . . T
: 137 GLN N 5.85 ( 7.21) . . T
: 21 SER OG 5.73 ( 7.30) . . T
Site 2: 107 LEU O 3.82 ( 4.97) . . T
: 108 SER N 5.63 ( 6.00) . . E
: 131 ASN CG 5.69 ( 4.01) . . T
: 132 GLN CD 3.97 ( 3.60) . . T
: 133 PHE N 5.68 ( 7.14) . . T
: 152 GLY O 4.06 ( 6.16) . . T
: 153 ASN CG 5.30 ( 5.93) . . E
: 119 SER OG 4.46 ( 6.49) . . T
Site 3: 59 LYS NZ 5.31 ( 8.76) . . E
: 80 ASP OD1 4.40 ( 5.54) . . T
: 82 ASN CG 3.43 ( 4.29) . . T
: 83 ASP OD1 3.03 ( 5.09) . . T
: 100 TYR OH 5.13 ( 7.62) . . T
: 101 LYS NZ 5.76 ( 8.90) . . T
: 203 ASP OD1 4.51 ( 6.32) . . T
: 204 SER OG 5.78 ( 7.07) . . T
: 205 HIS ND1 5.31 ( 5.78) . . T
| PROTEIN: 5RUB RIBULOSE -1,5- BISPHOSPHATE CARBOXYLASE/OXYLASE
|
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M MES
Addict & conc.:
Comments :
Reference : LINDQVIST et.al. 1988 :SCHNEIDER et.al. 1986 :
pH 5.6 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 178.02
Site 1: 111 ASN A OD1 5.38 ( 7.02) . . T
: 164 ILE B CD1 4.17 ( 6.65) . . E
: 166 LYS B NZ 3.58 ( 8.62) . . T
: 168 LYS B NZ 4.73 ( 7.26) . . T
: 191 LYS B NZ 4.67 ( 8.87) . . E
: 193 ASP B OD1 2.54 ( 4.96) . . T
: 194 GLU B OE1 5.82 ( 5.71) . . T
: 287 HIS B NE2 4.86 ( 8.83) . . E
: 347 HOH O 2.00 (-1.00) . . .
: 352 HOH O 3.94 (-1.00) . . .
: 497 HOH O 3.46 (-1.00) . . .
: 560 HOH O 4.05 (-1.00) . . .
Site 2: 164 ILE A CD1 4.73 ( 6.30) . . E
: 165 ILE A O 5.68 ( 7.47) . . T
: 166 LYS A NZ 3.13 ( 7.08) . . T
: 168 LYS A NZ 3.39 ( 5.43) . . T
: 191 LYS A NZ 5.50 ( 8.97) . . E
: 193 ASP A OD1 2.19 ( 3.99) . . T
: 194 GLU A OE1 5.99 ( 5.36) . . T
: 195 PRO A CD 5.24 ( 7.58) . . T
: 287 HIS A CE1 5.70 (10.22) . . E
: 111 ASN B OD1 5.12 ( 7.78) . . T
: 124 HOH O 3.20 (-1.00) . . .
: 349 HOH O 5.12 (-1.00) . . .
: 624 HOH O 3.78 (-1.00) . . .
: 715 HOH O 5.25 (-1.00) . . .
Site 3: 347 GLU A OE1 4.52 ( 6.23) . . T
: 308 HOH O 5.90 (-1.00) . . .
: 221 GLU A O 5.98 ( 7.89) . . H
: 222 THR A OG1 5.85 ( 4.62) . . H
: 223 GLY A O 4.66 ( 4.31) . . T
: 224 GLU A OE1 4.13 ( 5.50) . . T
: 134 HOH O 2.39 (-1.00) . . .
: 491 HOH O 4.92 (-1.00) . . .
Site 4: 347 GLU B OE1 3.85 ( 6.30) . . T
: 354 ARG B NH1 3.30 ( 8.47) . . T
: 24 HOH O 0.65 (-1.00) . . .
: 208 HOH O 4.59 (-1.00) . . .
: 642 HOH O 6.00 (-1.00) . . .