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ANALYSIS FOR EUROPIUM (III) CHLORIDE [LID]
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Formula : EU1,CL3
Solution chemistry: EU1 +3
All distances below are to the element EU [ europium ]
| PROTEIN: 3TLN THERMOLYSIN (NATIVE)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM(II) ION: ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.010 M TRIS/ACETATE
Addict & conc.: 5.000 % DMSO
Comments : PRESOAKED I.0HR 'CALCIUM FREE BUFFER'
Reference : COLMAN et.al. 1972a:1972b:MATTHEWS et.al. 1974 :1972a:1972b:WEAVER et.al. 1974 :
pH 5.5 Soak time = 144.00 Hours Reference number = 139.04
Site 1: 138 ASP OD1 2.83 ( 5.60) . . H [Het: CACA - CB 4.10]
: 174 THR OG1 4.98 ( 5.62) . . H
: 177 GLU OE1 2.39 ( 6.24) . . H [Het: CACA - CD 3.00]
: 183 ASN O 5.35 ( 7.65) . . T [Het: CACA - C 3.60]
: 184 PRO C 5.39 ( 5.59) . . T
: 185 ASP OD1 3.60 ( 4.62) . . T [Het: CACA - O 4.20]
: 186 TRP C 5.19 ( 5.46) . . T
: 187 GLU CG 5.78 ( 4.37) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 188 ILE CD1 5.28 ( 4.73) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 189 GLY N 5.07 ( 5.99) . . T
: 190 GLU OE1 2.79 ( 6.17) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 1 CA CA 0.49 (-1.00) . . .
: 2 CA CA 3.67 (-1.00) . . .
: 346 HOH O 2.33 (-1.00) . . .
: 350 HOH O 4.94 (-1.00) . . .
: 353 HOH O 4.91 (-1.00) . . .
: 469 HOH O 4.42 (-1.00) . . .
: 475 HOH O 5.44 (-1.00) . . .
Site 2: 138 ASP OD1 5.79 ( 8.09) . . H [Het: CACA - CB 4.10]
: 177 GLU OE1 4.17 ( 7.19) . . H [Het: CACA - CD 3.00]
: 182 LYS O 4.17 ( 6.57) . . T [Het: CACA - O 3.80]
: 183 ASN ND2 4.71 ( 4.60) . . T [Het: CACA - C 3.60]
: 184 PRO CD 5.91 ( 4.30) . . T
: 185 ASP OD1 1.96 ( 4.71) . . T [Het: CACA - O 4.20]
: 187 GLU O 5.79 ( 6.74) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 190 GLU OE1 4.22 ( 6.23) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 191 ASP OD1 4.50 ( 6.56) . . H
: 1 CA CA 3.86 (-1.00) . . .
: 2 CA CA 0.52 (-1.00) . . .
: 346 HOH O 5.54 (-1.00) . . .
: 350 HOH O 5.58 (-1.00) . . .
: 353 HOH O 2.96 (-1.00) . . .
: 469 HOH O 5.06 (-1.00) . . .
: 475 HOH O 2.08 (-1.00) . . .
Site 3: 57 ASP OD1 2.82 ( 5.54) . . E [Het: CACA - CG 2.80]
: 58 ALA CB 5.85 ( 5.72) . . T
: 59 ASP OD1 2.41 ( 5.04) . . T [Het: CACA - CG 3.40]
: 60 ASN N 5.25 ( 6.02) . . T
: 61 GLN CG 5.78 ( 4.45) . . E [Het: CACA - N 3.90]
: 62 PHE CD1 5.96 ( 5.06) . . E
: 63 PHE N 5.45 ( 6.62) . . T
: 67 ASP OD1 5.77 ( 8.33) . . T
: 3 CA CA 0.73 (-1.00) . . .
: 356 HOH O 5.11 (-1.00) . . .
: 419 HOH O 2.30 (-1.00) . . .
: 477 HOH O 5.79 (-1.00) . . .
: 482 HOH O 1.73 (-1.00) . . .
: 484 HOH O 3.70 (-1.00) . . .
: 503 HOH O 2.08 (-1.00) . . .
: 507 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
: 508 HOH O 4.63 (-1.00) . . .
Site 4: 190 GLU O 4.17 ( 5.84) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 192 VAL C 5.95 ( 6.74) . . H
: 193 TYR CD2 5.31 ( 4.74) . . T [Het: CACA - C 3.30]
: 194 THR OG1 3.05 ( 3.98) . . T [Het: CACA - N 3.80]
: 195 PRO CD 5.46 ( 4.60) . . T
: 196 GLY C 5.26 ( 5.84) . . T
: 197 ILE CG1 5.55 ( 4.24) . . T [Het: CACA - CA 4.20]
: 198 SER OG 5.92 ( 4.49) . . T
: 199 GLY N 5.09 ( 6.02) . . T
: 200 ASP OD1 2.79 ( 5.31) . . T [Het: CACA - CG 3.40]
: 201 SER N 5.92 ( 6.39) . . T
: 4 CA CA 0.67 (-1.00) . . .
: 354 HOH O 2.41 (-1.00) . . .
: 476 HOH O 4.77 (-1.00) . . .
: 480 HOH O 1.69 (-1.00) . . .
: 505 HOH O 4.35 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 5TNC TROPONIN-C (TURKEY)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION IN BINDING SITE III:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 39.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments : PRESOAK 1.0 HR MODIFIED XLN SOLN I.E.WITHOUT PEG 2
Reference : HERZBERG et.al. 1987 :1989 :JAMES et.al. 1985a:1985b:1986 :1988 :
pH 5.0 Soak time = 18.00 Hours Reference number = 9.08
Site 1: 13 PHE CE1 5.89 ( 9.39) . . .
: 90 ALA CB 4.42 ( 5.89) . . H
: 72 HOH O 5.16 (-1.00) . . .
: 104 HOH O 3.53 (-1.00) . . .
: 46 MET CE 5.27 ( 7.94) . . H
: 51 GLN OE1 5.48 ( 4.67) . . .
: 52 ASN O 4.93 ( 5.23) . . .
: 53 PRO CD 5.22 ( 4.98) . . .
: 57 GLU OE2 4.74 ( 8.79) . . H
: 81 MET O 5.62 ( 7.95) . . H
: 82 MET O 5.30 ( 6.59) . . H
: 84 ARG O 5.07 ( 6.38) . . H
: 85 GLN OE1 2.86 ( 2.63) . . H
: 86 MET CG 5.86 ( 4.70) . . H
: 87 LYS N 5.91 ( 6.92) . . H
: 88 GLU OE1 5.49 ( 5.68) . . H
: 89 ASP OD1 3.08 ( 5.10) . . H
: 15 HOH O 4.99 (-1.00) . . .
: 54 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
: 55 HOH O 5.11 (-1.00) . . .
Site 2: 11 ARG O 5.93 ( 8.15) . . .
: 14 LEU O 3.92 ( 5.77) . . .
: 15 SER OG 4.37 ( 2.52) . . .
: 16 GLU OE1 5.27 ( 3.10) . . H
: 17 GLU OE1 5.85 ( 5.75) . . H
: 18 MET N 6.00 ( 7.00) . . H
: 19 ILE CD1 5.83 ( 7.40) . . H
: 155 HOH O 0.88 (-1.00) . . .
: 26 PHE CE1 3.17 ( 6.61) . . H
: 35 GLY O 5.30 ( 7.11) . s .
: 73 ILE O 5.60 ( 6.93) . s .
: 74 ASP OD1 5.37 ( 4.72) . s .
: 75 PHE CE1 3.68 ( 1.54) . s H
: 76 GLU O 5.35 ( 4.57) . s H
: 77 GLU C 5.17 ( 5.80) . s H
: 78 PHE CE1 5.61 ( 3.75) . . H
: 79 LEU CD2 4.65 ( 5.40) . . H
: 95 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
: 113 HOH O 5.87 (-1.00) . . .
: 144 ASN OD1 4.87 ( 4.63) . s . [Het: CACA - CG 3.40]
: 40 HOH O 5.90 (-1.00) . . .
: 147 HOH O 4.47 (-1.00) . . .
Site 3: 102 PHE CE1 4.48 ( 8.52) . . H
: 106 ASP OD1 5.19 ( 7.28) . s . [Het: CACA - CG 3.50]
: 110 ASP OD1 5.24 ( 6.47) . s . [Het: CACA - CG 3.10]
: 111 GLY O 1.34 ( 3.51) . s .
: 112 PHE CE1 4.35 ( 2.10) . s . [Het: CACA - N 4.10]
: 113 ILE O 5.92 ( 5.31) . s .
: 148 ARG CG 5.74 ( 6.53) . s . [Het: CACA - C 3.60]
: 149 ILE O 3.09 ( 5.16) . s .
: 150 ASP OD1 5.83 ( 3.18) . s .
: 151 PHE N 4.37 ( 5.59) . s H
: 3 HOH O 5.83 (-1.00) . . .
: 85 HOH O 5.86 (-1.00) . . .
: 149 HOH O 3.49 (-1.00) . . .
: 34 GLY O 5.16 ( 5.55) . s .
: 36 ASP OD1 3.50 ( 6.18) . s .
: 72 THR OG1 5.56 ( 7.20) . s .
: 19 HOH O 5.70 (-1.00) . . .
: 84 HOH O 3.92 (-1.00) . . .