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ANALYSIS FOR SAMARIUM (III) CHLORIDE [LIA]
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Formula : SM1,CL3
Solution chemistry: SM1 +3
All distances below are to the element SM [ samarium ]
| PROTEIN: 2LIV LEUCINE, ISOLEUCINE, VALINE BINDING PROTEIN (E.COL
|
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 20.000 % PEG 6000
Buffer & conc.: 0.010 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 0.020 % SODIUM AZIDE
Comments :
Reference : QUIOCHO et.al. 1983 :
pH 4.5 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 313.03
Site 1: 87 ASP OD1 5.28 ( 5.31) . . H
: 90 GLU OE2 5.82 ( 6.72) . . H
: 91 ASP OD1 2.94 ( 5.64) . . H
: 111 TYR OH 3.61 ( 8.29) . . .
: 172 PHE CE1 4.76 ( 4.45) . . E
: 173 ASP C 5.97 ( 5.08) . . E
Site 2: 66 VAL CG1 5.00 ( 7.41) . . H
: 91 ASP O 5.54 ( 7.33) . . H
: 92 GLU OE1 2.97 ( 5.10) . . H
: 156 ARG O 4.78 ( 6.29) . . H
: 159 GLN NE2 5.91 ( 7.05) . . H
: 160 ASP OD1 2.13 ( 4.68) . . H
: 468 HOH O 5.47 (-1.00) . . .
Site 3: 294 SER OG 5.08 ( 5.99) . . H
: 295 ASP OD1 5.24 ( 4.38) . . .
: 296 ASP OD2 5.47 ( 4.68) . . H
: 472 HOH O 4.83 (-1.00) . . .
Site 4: 1 GLU O 5.83 ( 5.22) . . .
: 450 HOH O 1.93 (-1.00) . . .
: 179 GLU OE1 4.25 ( 5.38) . . .
: 181 ASP O 4.59 ( 5.63) . . .
| PROTEIN: 2PRK PROTEINASE K (TRITIRACNIUM ALBUM LIMBER)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM 2+ ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 1.000 M SODIUM NITRATE
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : BETZEL et.al. 1988 :PAHLER et.al. 1984 :
pH 6.5 Soak time = Hours Reference number = 289.01
Site 1: 174 GLU O 4.53 ( 6.83) . . T
: 175 PRO O 2.56 ( 4.25) . . T [Het: CACA - CA 4.20]
: 176 SER O 5.17 ( 4.89) . . T
: 177 VAL CG2 5.61 ( 4.65) . . T [Het: CACA - C 3.70]
: 178 CYS SG 5.97 ( 4.43) d . E
: 179 THR OG1 4.64 ( 5.43) . . E
: 198 VAL O 4.12 ( 5.92) . . T
: 199 LEU O 5.96 ( 6.25) . . T
: 200 ASP OD1 2.30 ( 5.11) . . E [Het: CACA - CG 2.90]
: 249 CYS SG 4.94 ( 7.38) d . T
: 280 CA CA 0.20 (-1.00) . . .
: 1 HOH O 2.67 (-1.00) . . .
: 2 HOH O 2.54 (-1.00) . . .
: 3 HOH O 2.43 (-1.00) . . .
: 4 HOH O 2.32 (-1.00) . . .
: 15 HOH O 4.87 (-1.00) . . .
: 115 HOH O 4.38 (-1.00) . . .
: 165 HOH O 4.47 (-1.00) . . .
: 166 HOH O 5.16 (-1.00) . . .
Site 2: 12 ARG NH2 5.05 (10.53) . . .
: 16 THR OG1 5.38 ( 4.81) . . . [Het: CACA - C 3.60]
: 17 SER OG 5.26 ( 4.99) . . .
: 18 PRO CD 5.71 ( 7.78) . . .
: 257 ASN OD1 5.82 ( 6.27) . . E
: 258 LYS O 5.72 ( 7.18) . . E
: 260 ASP OD1 2.85 ( 5.25) . . T [Het: CACA - CG 2.90]
: 281 CA CA 0.46 (-1.00) . . .
: 5 HOH O 2.62 (-1.00) . . .
: 6 HOH O 2.45 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 5.40 (-1.00) . . .
: 153 HOH O 5.25 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3FXN FLAVODOXIN (CLOSTRIDIUM MP, OXIDIZED)
|
Bound Ligands : FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE PROSTHETIC GROUP:
Hev Atom conc.: 20.000 mM
Precip & conc.: 2.500 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M TRIS
Addict & conc.:
Comments : THREE SITES CANNOT BE OCCUPIED SIMULTANEOUSLY
Reference : BURNETT et.al. 1974 :
pH 6.8 Soak time = Hours Reference number = 138.01
Site 1: 120 GLU OE1 4.74 ( 5.16) . . T
: 121 PRO O 5.61 ( 6.41) . . T
: 122 ASP OD1 3.73 ( 5.07) . . T
: 123 GLU OE2 4.87 ( 6.81) . . T
: 29 ASP OD1 5.69 ( 6.31) . . E
Site 2: 119 ASN CB 5.96 ( 6.98) . . E
: 120 GLU OE1 5.54 ( 5.60) . . T
: 121 PRO O 5.46 ( 6.59) . . T
: 122 ASP OD1 4.62 ( 5.40) . . T
: 123 GLU OE1 5.60 ( 6.44) . . T
: 29 ASP OD1 4.88 ( 6.11) . . E
Site 3: 120 GLU OE1 5.66 ( 6.18) . . T
: 121 PRO O 4.30 ( 5.99) . . T
: 122 ASP OD1 4.56 ( 4.41) . . T
: 123 GLU OE1 3.86 ( 4.61) . . T
| PROTEIN: 3GPD GLYCERALDEHYDE-3-P-DEHYDROGENASE (HUMAN)
|
Bound Ligands : NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE: SPS SUBSTRATE PHOSPHATE: IPS INORGANIC PHOSPHATE:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 50.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.005 M NAD+/EDTA/B-MERCAPTOETHANOL
Comments :
Reference : WATSON et.al. 1972 :
pH Soak time = Hours Reference number = 91.01
Site 1: 176 THR R CG2 4.51 ( 6.11) . . T
: 178 HIS R CD2 5.23 ( 6.32) . . T
: 196 ARG R NH2 4.74 ( 8.48) . . T
: 206 ILE R O 4.66 ( 6.94) . . T
: 207 PRO R O 5.12 ( 5.66) . . T
: 208 ALA R O 3.70 ( 3.45) . . T
: 209 SER R O 4.57 ( 5.20) . . T
: 210 THR R OG1 4.74 ( 6.40) . s T
: 230 MET R O 5.41 ( 5.55) . . T
: 231 ALA R O 2.33 ( 2.79) . . T
: 232 PHE R CE1 5.80 ( 3.55) . . T
: 233 ARG R NH1 4.58 ( 4.82) . s T
Site 2: 132 MET G SD 5.22 ( 8.97) . . T
: 271 GLY G O 5.54 ( 5.05) . . T
: 321 GLU G OE1 3.78 ( 6.51) . . T
: 322 ARG G NH1 4.82 ( 6.38) . . T
: 325 ASP G OD1 3.28 ( 5.26) . . T
| PROTEIN: 3TLN THERMOLYSIN (NATIVE)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM(II) ION: ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.010 M TRIS / ACETATE
Addict & conc.: 5.000 % DMSO
Comments :
Reference : COLMAN et.al. 1972a:1972b:MATTHEWS et.al. 1974 :1972a:1972b:WEAVER et.al. 1974 :
pH Soak time = 144.00 Hours Reference number = 139.13
Site 1: 138 ASP OD1 2.67 ( 5.52) . . H [Het: CACA - CB 4.10]
: 174 THR OG1 5.06 ( 5.71) . . H
: 177 GLU OE1 2.38 ( 6.32) . . H [Het: CACA - CD 3.00]
: 183 ASN O 5.43 ( 7.73) . . T [Het: CACA - C 3.60]
: 184 PRO C 5.54 ( 5.74) . . T
: 185 ASP OD1 3.66 ( 4.78) . . T [Het: CACA - O 4.20]
: 186 TRP C 5.29 ( 5.60) . . T
: 187 GLU CG 5.79 ( 4.38) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 188 ILE CD1 5.25 ( 4.61) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 189 GLY N 4.90 ( 5.80) . . T
: 190 GLU OE1 2.65 ( 6.02) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 1 CA CA 0.32 (-1.00) . . .
: 2 CA CA 3.68 (-1.00) . . .
: 346 HOH O 2.45 (-1.00) . . .
: 350 HOH O 4.77 (-1.00) . . .
: 353 HOH O 4.88 (-1.00) . . .
: 469 HOH O 4.30 (-1.00) . . .
: 475 HOH O 5.41 (-1.00) . . .
Site 2: 138 ASP OD1 5.98 ( 8.18) . . H [Het: CACA - CB 4.10]
: 177 GLU OE1 4.23 ( 7.09) . . H [Het: CACA - CD 3.00]
: 182 LYS O 3.95 ( 6.33) . . T [Het: CACA - O 3.80]
: 183 ASN ND2 4.56 ( 4.32) . . T [Het: CACA - C 3.60]
: 184 PRO CD 5.64 ( 4.10) . . T
: 185 ASP OD1 2.09 ( 4.70) . . T [Het: CACA - O 4.20]
: 187 GLU O 5.99 ( 6.96) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 190 GLU OE1 4.49 ( 6.50) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 191 ASP OD1 4.59 ( 6.73) . . H
: 1 CA CA 4.05 (-1.00) . . .
: 2 CA CA 0.52 (-1.00) . . .
: 346 HOH O 5.63 (-1.00) . . .
: 350 HOH O 5.77 (-1.00) . . .
: 353 HOH O 2.89 (-1.00) . . .
: 469 HOH O 5.15 (-1.00) . . .
: 475 HOH O 2.11 (-1.00) . . .
Site 3: 57 ASP OD1 2.83 ( 5.57) . . E [Het: CACA - CG 2.80]
: 58 ALA CB 5.89 ( 5.78) . . T
: 59 ASP OD1 2.50 ( 5.13) . . T [Het: CACA - CG 3.40]
: 60 ASN N 5.34 ( 6.10) . . T
: 61 GLN CG 5.84 ( 4.50) . . E [Het: CACA - N 3.90]
: 62 PHE CD1 5.97 ( 5.05) . . E
: 63 PHE N 5.42 ( 6.58) . . T
: 67 ASP OD1 5.70 ( 8.28) . . T
: 3 CA CA 0.78 (-1.00) . . .
: 356 HOH O 5.07 (-1.00) . . .
: 419 HOH O 2.22 (-1.00) . . .
: 477 HOH O 5.75 (-1.00) . . .
: 482 HOH O 1.72 (-1.00) . . .
: 484 HOH O 3.65 (-1.00) . . .
: 503 HOH O 2.09 (-1.00) . . .
: 507 HOH O 5.88 (-1.00) . . .
: 508 HOH O 4.62 (-1.00) . . .
Site 4: 190 GLU O 4.26 ( 5.92) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 193 TYR CD2 5.29 ( 4.76) . . T [Het: CACA - C 3.30]
: 194 THR OG1 2.98 ( 3.93) . . T [Het: CACA - N 3.80]
: 195 PRO CD 5.45 ( 4.59) . . T
: 196 GLY O 5.98 ( 5.79) . . T
: 197 ILE CG1 5.45 ( 4.16) . . T [Het: CACA - CA 4.20]
: 198 SER OG 5.92 ( 4.47) . . T
: 199 GLY N 5.09 ( 6.02) . . T
: 200 ASP OD1 2.74 ( 5.29) . . T [Het: CACA - CG 3.40]
: 201 SER N 5.92 ( 6.41) . . T
: 4 CA CA 0.61 (-1.00) . . .
: 354 HOH O 2.47 (-1.00) . . .
: 476 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 480 HOH O 1.75 (-1.00) . . .
: 505 HOH O 4.37 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4FXN FLAVODOXIN (CLOSTRIDIUM MP, SEMIQUINONE)
|
Bound Ligands : FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE PROSTHETIC GROUP:
Hev Atom conc.: 20.000 mM
Precip & conc.: 2.600 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M TRIS
Addict & conc.:
Comments : SOAK TEMP 4 TO 8.0 C
Reference : LUDWIG et.al. 1972 :
pH 6.8 Soak time = Hours Reference number = 252.00
Site 1: 119 ASN CB 5.75 ( 6.68) . . E
: 120 GLU OE1 5.67 ( 5.26) . . T
: 121 PRO O 5.19 ( 6.39) . . T
: 122 ASP OD1 5.27 ( 5.28) . . T
: 123 GLU N 5.43 ( 6.57) . . T
: 29 ASP OD2 5.74 ( 6.38) . . E
Site 2: 29 ASP OD2 5.52 ( 7.20) . . E
: 118 GLN O 5.75 ( 7.91) . . E
: 120 GLU O 4.49 ( 6.18) . . T
: 121 PRO O 4.75 ( 6.42) . . T
: 122 ASP OD2 4.77 ( 5.55) . . T
: 123 GLU OE2 5.94 ( 5.59) . . T