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ANALYSIS FOR SILVER NITRATE [JWA]
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Formula : AG1,N1,O3
Solution chemistry: AG1 +1
All distances below are to the element AG [ silver ]
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : SASAKI et.al. 1975 :
pH 5.6 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 62.00
Site 1: 23 VAL O 4.62 ( 6.50) . . .
: 24 GLN CG 4.99 ( 4.60) . . .
: 27 MET SD 2.16 ( 4.97) . . .
: 28 ASN OD1 3.10 ( 3.88) . . .
: 29 THR CG2 4.64 ( 5.99) . . .
: 15 ASP O 4.92 ( 6.77) . . .
: 18 ARG O 4.86 ( 6.54) . . .
: 19 ALA O 5.41 ( 4.13) . . .
: 22 PHE CB 5.73 ( 7.10) . . .
| PROTEIN: 2TAA TAKA-AMYLASE
|
Bound Ligands : CA BOUND CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 3.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MATSUURA et.al. 1979 :
pH 5.5 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 88.02
Site 1: 203 LEU A O 5.95 ( 7.53) . . E
: 205 ILE A CD1 5.15 ( 7.70) . . E
: 216 TRP A O 4.81 ( 6.00) . . H
: 220 ASN A CG 3.68 ( 4.20) . . H
: 226 TYR A O 5.86 ( 6.32) . . E
: 227 CYS A SG 3.57 ( 3.62) . . E
: 228 ILE A C 5.43 ( 5.24) . . E
: 229 GLY A N 5.31 ( 5.93) . . E
: 245 VAL A O 5.06 ( 6.43) . . .
: 246 MET A SD 4.65 ( 2.56) . . .
: 247 ASP A OD1 4.43 ( 4.38) . . .
: 248 GLY A O 5.29 ( 6.05) . . E
: 471 SER A O 4.07 ( 6.37) . . .
: 472 LYS A O 4.17 ( 5.16) . . .
: 473 ILE A CG2 4.86 ( 5.74) . . .
: 474 CYS A O 4.16 ( 4.43) d . .
: 475 SER A OG 5.35 ( 3.02) . . .
: 476 ASP A OD1 4.03 ( 2.03) . . .
: 477 SER A CB 5.60 ( 4.67) . . .
: 478 SER A N 5.65 ( 6.71) . . .
Site 2: 254 ILE A O 4.79 ( 6.80) . . .
: 255 TYR A O 5.88 ( 6.76) . . .
: 256 TYR A O 5.85 ( 7.17) . . .
: 257 PRO A CD 5.49 ( 4.30) . . .
: 258 LEU A CD1 4.52 ( 2.73) . . .
: 259 LEU A N 5.00 ( 6.30) . . .
: 261 ALA A CB 4.87 ( 5.72) . . .
: 262 PHE A CE2 4.89 ( 6.56) . . .
: 269 MET A SD 5.93 ( 6.00) . . .
: 271 ASP A C 5.99 ( 6.90) . . .
: 272 LEU A CD1 1.14 ( 4.52) . . .
: 317 PHE A CE1 5.77 ( 9.14) . . .
: 393 ILE A CD1 5.34 ( 9.18) . . .
Site 3: 427 TYR A O 5.55 ( 7.47) . . .
: 447 ASP A OD1 5.09 ( 5.59) . . .
: 448 GLY A O 4.30 ( 4.02) . . .
: 449 ASN A N 5.94 ( 7.01) . . .
: 177 ASP A OD1 4.77 ( 7.25) . . .
: 183 VAL A CG1 4.92 ( 4.93) . . .
: 184 LYS A CE 5.79 ( 1.91) . . .
: 185 ASN A N 4.16 ( 5.54) . . .
: 186 GLU A N 5.96 ( 6.73) . . .
: 187 TRP A CD1 5.73 ( 5.85) . . .
: 188 TYR A OH 4.63 ( 6.10) . . .
: 215 PHE A CE1 4.67 ( 4.84) . . .
: 219 TYR A CD2 5.76 ( 6.72) . . .
| PROTEIN: 4CPA CARBOXYPEPTIDASE A/POTATO INHIBITOR
|
Bound Ligands : ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 3.000 mM
Precip & conc.: 4.000 % PEG 6000
Buffer & conc.: 0.020 M TRIS/ACETATE
Addict & conc.: 0.050 M SODIUM CHLORIDE
Comments :
Reference : LIPSCOMB et.al. 1980 :
pH 7.5 Soak time = 216.00 Hours Reference number = 94.01
Site 1: 1 ALA A N 5.34 ( 6.62) . . T
: 3 SER A OG 5.57 ( 5.86) . . T
: 4 THR A O 3.20 ( 4.72) . . T
: 5 ASN A CG 5.82 ( 3.34) . . T
: 6 THR A OG1 3.91 ( 1.78) . . T
: 7 PHE A CD1 5.45 ( 3.09) . . T
: 8 ASN A C 5.95 ( 5.05) . . T
: 9 TYR A OH 5.37 ( 7.23) . . T
: 123 ASN OD1 5.51 ( 6.26) . . T
: 124 ARG NH1 5.54 ( 5.04) . . T
: 125 LEU N 5.83 ( 7.12) . . T
: 280 LEU CD1 4.84 ( 5.90) . . T
: 12 TYR A OH 5.96 (14.85) . . T
: 124 ARG A NH1 4.66 ( 5.61) . . T
: 279 PHE A O 4.72 ( 7.68) . . T
: 280 LEU A CD1 4.00 ( 4.10) . . T
: 281 LEU A O 3.86 ( 5.07) . . T
: 282 PRO A O 5.87 ( 4.82) . . T
: 234 TYR O 5.66 ( 6.79) . . T
: 235 GLY CA 5.79 ( 5.79) . . T
Site 2: 13 HIS O 5.73 ( 7.92) . . T
: 70 SER O 3.37 ( 5.01) . . T
: 71 ARG C 5.97 ( 5.98) . . T
: 72 GLU C 5.83 ( 6.71) . . H [Het: ZNZN - CD 2.60]
: 73 TRP CH2 5.59 ( 4.46) . . H
: 76 GLN OE1 3.39 ( 6.04) . . H
: 116 PHE CE1 3.36 ( 4.17) . . H
: 117 ALA N 5.81 ( 6.71) . . H
: 119 THR OG1 3.99 ( 6.46) . . H
: 120 HIS NE2 4.87 ( 7.39) . . H
: 199 SER O 4.33 ( 6.51) . . T
: 200 GLN O 5.18 ( 7.61) . . E
: 231 LYS NZ 4.61 (11.52) . . H
: 237 SER OG 2.09 ( 3.82) . . T
: 238 TYR O 4.74 ( 5.02) . . T
: 239 LYS N 5.32 ( 6.32) . . E
: 274 THR OG1 4.92 ( 5.02) . . T
Site 3: 48 TYR O 5.76 ( 7.89) . . T
: 49 VAL CG1 5.83 ( 5.48) . . E
: 50 LEU CD1 4.37 ( 4.78) . . E
: 52 PHE CE1 5.01 ( 8.78) . . E
: 64 ILE O 4.55 ( 6.57) . . E
: 66 LEU CD1 5.01 ( 7.54) . . E
: 79 GLY O 5.68 ( 6.41) . . H
: 83 ALA CB 5.96 ( 6.57) . . H
: 106 PHE O 4.99 ( 5.73) . . E
: 107 LEU CD1 3.13 ( 2.14) . . E
: 108 GLU CG 5.51 ( 3.08) . . E
: 109 ILE CD1 4.17 ( 4.71) . . E
: 245 THR O 4.61 ( 6.84) . . T
: 246 THR O 5.16 ( 5.74) . . T
: 247 ILE O 4.07 ( 6.76) . . T
: 15 HIS I NE2 4.87 ( 5.59) . . T
: 26 ALA I O 5.65 ( 6.75) . . T
: 27 CYS I SG 5.43 ( 3.17) d . T
: 28 TRP I CG 5.89 ( 2.58) . . T
: 29 ASN I OD1 4.28 ( 2.28) . . T
: 30 SER I OG 3.54 ( 3.50) . . T
: 31 ALA I N 5.20 ( 6.57) . . T
Site 4: 95 SER O 5.61 ( 7.80) . . H
: 96 PHE O 5.78 ( 7.36) . . H
: 97 THR O 5.78 ( 7.24) . . H
: 98 ALA O 3.12 ( 4.76) . . H
: 99 ILE CD1 4.86 ( 2.04) . . H
: 100 LEU C 5.53 ( 5.21) . . H
: 101 ASP C 5.21 ( 5.70) . . H
: 102 SER OG 3.43 ( 4.23) . . H
: 103 MET SD 4.73 ( 5.01) . . H
: 301 MET O 5.90 ( 7.25) . . H
: 305 VAL CG1 3.61 ( 5.13) . . H
Site 5: 145 ARG O 3.35 ( 5.33) . . T
: 146 ASN O 5.56 ( 4.98) . . T
: 147 TRP O 4.84 ( 6.61) . . T
: 150 GLY O 4.58 ( 6.36) . . T
: 151 PHE CE1 2.56 ( 2.85) . . T
: 152 GLY O 5.06 ( 2.77) . . T
: 153 LYS O 5.62 ( 5.91) . . T
: 156 ALA CB 4.56 ( 6.05) . . T
: 166 HIS NE2 4.88 ( 5.00) . . T
: 170 ALA CB 5.85 ( 5.93) . . T
: 251 SER OG 4.19 ( 6.12) . . T
: 252 GLY O 5.93 ( 4.78) . . T
: 40 ARG NH1 5.89 ( 8.86) . . T
Site 6: 40 ARG A NH1 5.70 ( 7.05) . . T
: 152 GLY A O 5.18 ( 8.09) . . T
: 153 LYS A NZ 5.34 ( 2.91) . . T
: 154 ALA A O 1.47 ( 2.94) . . T
: 155 GLY A C 5.10 ( 4.02) . . T
: 156 ALA A O 4.74 ( 6.51) . . T
: 207 GLY A O 4.17 ( 5.72) . . T
: 208 TYR A CD2 4.91 ( 2.85) . . T
: 209 THR A CG2 5.86 ( 5.41) . . T
: 249 GLN A NE2 4.18 ( 6.20) . . T
: 250 ALA A C 5.66 ( 5.79) . . T
: 251 SER A CB 4.74 ( 5.59) . . T
Site 7: 94 PRO A O 6.00 ( 8.06) . . T
: 95 SER A O 5.80 ( 6.52) . . T
: 98 ALA A O 4.69 ( 4.53) . . T
: 99 ILE A N 5.17 ( 6.00) . . T
: 102 SER A OG 5.37 ( 7.78) . . T
: 305 VAL A CG1 4.43 ( 6.53) . . T
: 306 ASN A OD1 5.77 ( 7.26) . . T
: 42 TYR A OH 2.94 ( 5.65) . . T
: 174 VAL A CG1 5.76 ( 6.17) . . T
Site 8: 231 LYS A NZ 2.54 ( 6.40) . . T
: 235 GLY A O 4.36 ( 6.27) . . T
: 236 THR A O 4.37 ( 5.24) . . T
: 237 SER A OG 2.39 ( 2.33) . . T
: 238 TYR A O 5.05 ( 5.33) . . T
: 7 ILE CG2 5.87 ( 7.50) . . T
: 9 ASN O 5.73 ( 8.45) . . T
: 10 LYS NZ 3.31 ( 3.66) . . T
: 11 PRO O 4.81 ( 4.73) . . T
: 12 CYS N 5.32 ( 6.03) d . T
: 17 ASP O 4.13 ( 6.43) . . T
: 19 SER OG 2.56 ( 5.62) . . T
| PROTEIN: 5CPA CARBOXYPEPTIDASE A/WATER (BOVINE)
|
Bound Ligands : ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.200 M SODIUM ACETATE/TRIS
Addict & conc.:
Comments : CPA PREP :DELTA
Reference : HARTSUCK et.al. 1965 :LIPSCOMB et.al. 1966 :1971 :1973 :REES et.al. 1981 :1983 :
pH 8.0 Soak time = 720.00 Hours Reference number = 228.03
Site 1: 151 PHE CE2 5.83 ( 7.28) . . T
: 152 GLY O 3.22 ( 3.59) . . T
: 153 LYS O 5.47 ( 5.99) . . T
: 156 ALA O 5.09 ( 6.48) . . T
: 157 SER O 5.05 ( 5.64) . . T
: 158 SER OG 4.52 ( 4.11) . . T
: 166 HIS NE2 2.12 ( 6.68) . . T
: 527A HOH O 1.77 (-1.00) . . .
Site 2: 13 HIS C 5.96 ( 6.81) . . T
: 14 THR CG2 3.73 ( 5.39) . . T
: 73 TRP CH2 5.14 (11.19) . . T
: 120 HIS NE2 4.50 ( 4.21) . . T
: 121 SER N 5.80 ( 6.62) . . T
: 569A HOH O 1.36 (-1.00) . . .
: 576A HOH O 5.05 (-1.00) . . .
: 578A HOH O 5.76 (-1.00) . . .
: 580A HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 586A HOH O 5.23 (-1.00) . . .
: 576L HOH O 5.05 (-1.00) . . .
: 248 TYR OH 1.72 ( 7.28) . . T
: 569B HOH O 2.01 (-1.00) . . .
: 575B HOH O 5.81 (-1.00) . . .
: 578B HOH O 4.89 (-1.00) . . .
: 580B HOH O 3.75 (-1.00) . . .
: 586B HOH O 5.40 (-1.00) . . .
Site 3: 4 THR OG1 3.32 ( 5.67) . . T
: 5 ASN OD1 5.42 ( 7.13) . . T
: 24 LEU O 5.87 ( 7.53) . . T
: 25 LEU CD1 3.86 ( 5.13) . . T
: 28 GLN OE1 2.80 ( 4.78) . . T
: 29 HIS NE2 1.69 ( 5.65) . . T
: 84 LYS NZ 3.55 ( 6.23) . . T
: 87 THR OG1 3.84 ( 5.75) . . T
: 450A HOH O 2.68 (-1.00) . . .
Site 4: 222 VAL CG2 5.09 ( 6.33) . . T
: 299 THR O 5.43 ( 7.50) . . T
: 302 GLU O 5.25 ( 6.33) . . T
: 303 HIS NE2 3.93 ( 3.51) . . T
: 304 THR N 5.70 ( 6.96) . . T
: 306 ASN ND2 5.25 ( 6.51) . . T
: 307 ASN OD1 5.38 ( 7.35) . . T
: 451A HOH O 3.77 (-1.00) . . .
: 454A HOH O 3.01 (-1.00) . . .
: 31 GLU OE2 5.91 ( 7.37) . . T
: 451J HOH O 3.75 (-1.00) . . .
: 454J HOH O 3.01 (-1.00) . . .