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ANALYSIS FOR POTASSIUM IODIDE (IODINE) [ILB]
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Formula : K1,I1
Solution chemistry: [K1,I3]1 -1 : [I] +1
All distances below are to the element I [ iodine ]
PROTEIN: 1HNE ELASTASE (HUMAN NEUTROPHIL / CHLOROMETHYL KETONE I
|
Bound Ligands : MSU METHOXYSUCCINYL: ALM ALANINE,METHYLENE C BOUND TO CARBOXY C.:
Hev Atom conc.: 4.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 2.000 M SODIUM / POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments : SOAK OVERNIGHT NIGHT IN DARK AT RT:SOAK KI (10.0MM
pH 7.0 Soak time = 12.00 Hours Reference number = 328.03
Site 1: 167 LEU E CD1 2.08 ( 4.28) . . .
: 217A ARG E NH1 5.02 ( 9.37) . . . [Het: MSU O1 - CA 3.80]
: 223 LEU E CD1 4.95 ( 6.77) . . .
: 224 TYR E OH 5.68 ( 5.53) . . . [Het: MSU OT2 - OH 4.10]
: 225 PRO E CD 5.56 ( 7.99) . . .
: 10 HOH O 5.37 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 4.28 (-1.00) . . .
: 182 HOH O 4.92 (-1.00) . . .
: 507 HOH O 5.11 (-1.00) . . .
: 35 LEU E CD1 5.06 ( 8.17) . . .
: 41 PHE E CE1 5.39 ( 5.27) . . .
: 62 VAL E CG2 5.20 ( 7.46) . . .
: 108 HOH O 5.60 (-1.00) . . .
: 120 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 342 HOH O 4.95 (-1.00) . . .
Site 2: 57 HIS E CE1 5.56 ( 5.23) . . . [Het: ALM N - CE1 3.30]
: 94 TYR E OH 2.93 ( 6.59) . . .
: 95 ASP E O 4.47 ( 6.19) . . .
: 98 PRO E O 5.30 ( 4.95) . . .
: 99A ASN E C 5.67 ( 6.90) . . .
: 99B LEU E CD1 4.16 ( 3.31) . . .
: 100 LEU E O 4.91 ( 5.60) . . .
: 101 ASN E C 5.81 ( 6.77) . . .
: 102 ASP E OD1 3.64 ( 4.54) . . .
: 214 SER E OG 4.39 ( 6.27) . . . [Het: ALM N - O 2.90]
: 215 PHE E CD1 5.75 ( 7.21) . . .
: 4 PRO I CG 5.77 ( 5.84) . . . [Het: ALM N - N 3.50]
: 4 HOH O 4.87 (-1.00) . . .
: 190 HOH O 5.47 (-1.00) . . .
: 424 HOH O 5.78 (-1.00) . . .
Site 3: 217A ARG E O 5.35 ( 5.99) . . . [Het: MSU O1 - CA 3.80]
: 218 GLY E N 4.88 ( 4.67) . . . [Het: MSU OT1 - N 3.50]
: 222 SER E OG 5.75 ( 7.94) . . .
: 223 LEU E CD2 4.34 ( 6.85) . . .
: 224 TYR E OH 1.12 ( 6.07) . . . [Het: MSU OT2 - OH 4.10]
: 1 MSU I OT1 4.86 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 4.71 (-1.00) . . .
: 182 HOH O 5.26 (-1.00) . . .
: 192 PHE E CE1 5.19 ( 4.54) . . . [Het: ALM O - CA 4.00]
: 193 GLY E N 5.28 ( 6.43) . . . [Het: ALM O - N 3.10]
: 4 PRO I O 4.24 ( 6.63) . . . [Het: ALM N - N 3.50]
: 5 ALM I O 5.18 (-1.00) . . .
: 108 HOH O 4.58 (-1.00) . . .
: 148 HOH O 4.24 (-1.00) . . .
: 422 HOH O 5.32 (-1.00) . . .
PROTEIN: 1LH1 LEGHEMOGLOBIN (ACETATE MET)
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Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINS FE3+: ACE ACETATE ION:
Hev Atom conc.: 0.050 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 2.000 M PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments : POTASSIUM IODIDE 0.12 MM + IODINE 0.05 MM BACKSOAK
Reference : VAINSHTEIN et.al. 1975a:1975b:1978 :
pH 7.0 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 247.02
Site 1: 68 HOH O 5.63 (-1.00) . . .
: 71 VAL O 5.31 ( 7.39) . . H
: 72 TYR OH 5.71 ( 4.96) . . H
: 73 GLU CG 4.81 ( 2.49) . . H
: 74 ALA O 3.98 ( 3.19) . . H
: 75 ALA CB 5.59 ( 4.98) . . H
: 76 ILE CD1 5.65 ( 4.54) . . H
: 77 GLN OE1 4.91 ( 4.19) . . H
: 78 LEU N 5.72 ( 7.30) . . H
: 11 HOH O 2.53 (-1.00) . . .
: 42 HOH O 4.62 (-1.00) . . .
: 55 HOH O 4.78 (-1.00) . . .
Site 2: 77 GLN OE1 1.82 ( 5.48) . . H
: 81 THR OG1 5.05 ( 7.52) . . H
: 83 VAL O 4.83 ( 6.58) . . .
: 84 VAL O 5.44 ( 4.99) . . .
: 85 VAL CG1 3.58 ( 3.43) . . .
: 86 THR N 5.76 ( 7.05) . . .
: 27 HOH O 3.68 (-1.00) . . .
: 42 HOH O 5.04 (-1.00) . . .
: 55 HOH O 5.20 (-1.00) . . .
PROTEIN: 2CRO CRO PROTEIN (PHAGE 434)
|
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 0.300 M SODIUM CHLORIDE / MPD
Buffer & conc.: 1.740 M SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments : KI/I2 VIA SIGLER`S METHOD.
Reference : MONDRAGON et.al. 1989 :
pH 6.5 Soak time = 1440.00 Hours Reference number = 320.03
Site 1: 45 LEU CD2 5.22 ( 8.81) . . H
: 56 PRO O 5.19 ( 6.96) . . H
: 57 VAL CG1 5.44 ( 4.76) . . H
: 60 GLN OE1 4.69 ( 4.71) . . H
: 61 TYR OH 2.80 ( 5.60) . . H
: 57 VAL CG1 4.57 ( 6.96) . . H
: 61 TYR CD1 5.55 ( 7.10) . . H
: 63 THR OG1 4.15 ( 6.40) . . .
Site 2: 26 VAL CG1 5.30 ( 6.88) . . .
: 30 SER OG 4.10 ( 5.10) . . H
: 34 ILE CD1 4.17 ( 7.34) . . H
: 39 THR CG2 5.54 ( 7.58) . . .
: 42 PRO CG 5.54 ( 4.17) . . .
: 43 ARG CG 5.58 ( 4.24) . . .
: 44 PHE CE2 4.85 ( 4.70) . . .
: 45 LEU N 5.60 ( 6.48) . . H
: 48 ILE CD1 4.42 ( 8.06) . . H
: 113 HOH O 5.40 (-1.00) . . .
Site 3: 60 GLN NE2 5.58 ( 7.17) . . H
: 61 TYR OH 4.28 ( 5.82) . . H
: 61 TYR CD2 5.26 ( 5.45) . . H
: 63 THR CG2 4.54 ( 6.84) . . .
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 0.300 M SODIUM CHLORIDE / MPD
Buffer & conc.: 1.740 M SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments : KI/I2 VIA GRAHAM AND BUTLER METHOD.
Reference : MONDRAGON et.al. 1989 :
pH 6.5 Soak time = Hours Reference number = 320.04
Site A: 9 ARG NH1 4.56 ( 6.35) . . .
: 52 LEU O 4.62 ( 6.27) . . .
: 53 ASN O 4.76 ( 6.14) . . .
: 54 CYS SG 2.69 ( 3.33) . . .
: 55 ASP O 4.90 ( 5.40) . . .
: 58 TRP CH2 3.29 ( 6.25) . . H
: 59 LEU CD1 5.55 ( 5.85) . . H
: 103 HOH O 5.45 (-1.00) . . .
: 47 GLU OE2 4.56 ( 7.07) . . H
: 109 HOH O 3.23 (-1.00) . . .
PROTEIN: 2GCH GAMMA-CHYMOTRYPSIN
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Hev Atom conc.: 2.500 mM
Precip & conc.: 65.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.010 M SODIUM CACODYLATE
Addict & conc.:
Comments : POTASSIUM IODIDE/IODINE (0.01/0.0025)
Reference : COHEN et.al. 1969 :1981 :
pH 5.6 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 227.00
Site 1: 189 SER OG 4.20 ( 6.20) . . .
: 190 SER O 3.53 ( 5.12) . s .
: 191 CYS C 5.95 ( 5.25) d s .
: 215 TRP O 3.64 ( 4.72) . s E
: 216 GLY O 4.54 ( 3.07) . . E
: 217 SER OG 5.90 ( 4.68) . . E
: 220 CYS SG 5.33 ( 5.29) d s .
: 225 PRO O 5.38 ( 7.13) . . E
: 226 GLY C 5.33 ( 4.29) . . E
: 227 VAL O 5.92 ( 6.29) . . E
: 1 HOH O 2.48 (-1.00) . . .
: 2 HOH O 1.25 (-1.00) . . .
: 3 HOH O 3.87 (-1.00) . . .
: 4 HOH O 2.92 (-1.00) . . .
: 5 HOH O 2.52 (-1.00) . . .
: 27 HOH O 5.30 (-1.00) . . .
: 78 HOH O 5.66 (-1.00) . . .
: 92 HOH O 2.28 (-1.00) . . .
: 146 HOH O 3.35 (-1.00) . . .
PROTEIN: 2GN5 GENE-5 DNA BINDING PROTEIN
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Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 12.000 % PEG 4000
Buffer & conc.: 0.010 M TRIS/HCL
Addict & conc.:
Comments : TEMP 4 C, KI(5MM) + I2(5MM)
Reference : AXELROD et.al. 1985 :MCPHERSON et.al. 1979 :
pH 7.6 Soak time = 120.00 Hours Reference number = 63.00
Site 1: 61 TYR OH 5.10 ( 7.85) . . .
: 85 PRO CD 4.67 ( 5.58) . . .
: 18 GLY O 5.21 ( 7.34) . . .
: 19 VAL CG1 5.95 ( 4.92) . . .
: 20 SER OG 2.09 ( 4.24) . . .
: 21 ARG N 5.82 ( 7.19) . . .
: 27 SER O 5.59 ( 7.12) . . .
: 28 LEU CD1 1.92 ( 5.06) . . .
: 30 GLU OE1 4.91 ( 6.18) . . .
Site 2: 3 LYS O 5.94 ( 5.75) . . .
: 4 VAL CG1 3.96 ( 4.72) . . .
: 62 THR OG1 5.62 ( 7.99) . . .
: 63 VAL CG1 4.44 ( 5.75) . . .
: 68 PHE CE1 3.99 ( 8.87) . . .
: 3 LYS O 5.94 ( 5.75) . . .
: 4 VAL CG1 3.96 ( 4.72) . . .
: 62 THR OG1 5.62 ( 7.99) . . .
: 63 VAL CG1 4.44 ( 5.75) . . .
: 68 PHE CE1 3.99 ( 8.87) . . .