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ANALYSIS FOR CHLORO(2-OXOETHYL) MERCURY [HDZ]
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Formula : HG1,C2,H3,CL1,O1
Solution chemistry: [(CL1),(HG1),(C1,H2),(C1,H1,O1)]1 -0
All distances below are to the element HG [ mercury ]
PROTEIN: 1GP1 GLUTATHIONE PEROXIDASE (BOVINE)
|
Bound Ligands : SEC SELENINIC ACID:
Hev Atom conc.: 3.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 2.500 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.005 M GSSG/SODIUM AZIDE/EDTA
Comments : STATE OF ENXYME : OXIDIZED; WASHING : 120.0 HRS 2.
Reference : LADENSTEIN et.al. 1979 :
pH 7.0 Soak time = 120.00 Hours Reference number = 97.01
Site 1: 44 LEU A CD1 4.58 ( 7.54) . . T [Het: SEC N - N 2.80]
: 83 ALA A CB 6.00 ( 7.07) . . T
: 91 CYS A SG 3.22 ( 4.45) . . T
: 95 VAL A CG1 4.20 ( 5.58) . . T
: 44 LEU B CD1 4.45 ( 7.31) . . T [Het: SEC N - N 2.90]
: 90 ASN B O 5.95 ( 7.10) . . H
: 91 CYS B SG 2.97 ( 4.17) . . H
: 95 VAL B CG1 4.16 ( 5.46) . . T
: 542 HOH O 5.55 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 5.90 (-1.00) . . .
: 552 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
Site 2: 78 GLY A O 4.00 ( 4.22) . . T
: 79 HIS A NE2 2.06 ( 4.62) . . T
: 145 PHE A CE2 5.54 ( 7.20) . . T
: 78 GLY B O 3.85 ( 4.09) . . T
: 79 HIS B NE2 2.29 ( 4.43) . . T
: 145 PHE B CE2 5.48 ( 7.10) . . 5
: 418 HOH O 5.52 (-1.00) . . .
: 431 HOH O 5.43 (-1.00) . . .
: 479 HOH O 5.51 (-1.00) . . .
: 484 HOH O 5.58 (-1.00) . . .
: 546 HOH O 3.43 (-1.00) . . .
: 550 HOH O 2.90 (-1.00) . . .
Site 3: 40 ASN B CB 5.06 ( 5.58) . . E
: 72 PHE B CD2 5.31 ( 4.68) . . E
: 73 PRO B CD 5.62 ( 4.62) . . E
: 74 CYS B SG 3.70 ( 3.77) . . E
: 75 ASN B N 5.78 ( 7.21) . . T
: 109 GLU B O 5.42 ( 7.75) . . T
: 110 LYS B CG 5.90 ( 5.37) . . T
: 111 CYS B O 2.63 ( 4.03) . . T
: 112 GLU B O 4.36 ( 4.51) . . T
: 113 VAL B CG1 3.23 ( 5.04) . . T
: 122 PHE B CE1 5.95 ( 7.96) . . H
: 434 HOH O 5.35 (-1.00) . . .
: 493 HOH O 5.93 (-1.00) . . .
Site 4: 40 ASN A CB 4.83 ( 5.46) . . E
: 41 VAL A O 5.83 ( 6.98) . . E
: 72 PHE A CD2 5.78 ( 4.71) . . E
: 73 PRO A CD 5.47 ( 4.34) . . E
: 74 CYS A SG 3.56 ( 3.33) . . E
: 75 ASN A N 5.38 ( 6.81) . . T
: 109 GLU A O 5.53 ( 7.86) . . T
: 110 LYS A CG 5.82 ( 5.41) . . T
: 111 CYS A O 2.62 ( 4.08) . . T
: 112 GLU A O 4.66 ( 4.49) . . T
: 113 VAL A CG1 3.40 ( 5.15) . . T
: 122 PHE A CE2 5.21 ( 8.24) . . T
: 412 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
: 476 HOH O 4.97 (-1.00) . . .
PROTEIN: 3CTS CITRATE SYNTHASE (CHICKEN, COA CITRATE)
|
Bound Ligands : COA COENZYME A: CIT CITRATE ION:
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 1.200 M CITRATE
Addict & conc.: 0.002 M COA
Comments :
Reference : REMINGTON et.al. 1982 :
pH 6.0 Soak time = Hours Reference number = 209.01
Site 1: 66 UNK CE2 4.95 ( 7.99) . . T
: 70 UNK O 4.40 ( 6.42) . . H
: 71 UNK CD1 5.33 ( 3.77) . . H
: 72 UNK O 5.89 ( 5.89) . . H
: 73 UNK O 5.87 ( 6.21) . . H
: 74 UNK SG 3.30 ( 3.31) . . H
: 75 UNK CG 5.27 ( 4.41) . . H
: 78 UNK CD1 4.60 ( 7.30) . . H
: 87 UNK CD 5.75 ( 6.65) . . T
: 92 UNK CD1 5.65 ( 7.49) . . H
: 233 UNK CG2 4.18 ( 6.54) . . H
: 234 UNK CG2 5.25 ( 6.16) . . H
Site 2: 71 UNK CD1 5.83 ( 5.88) . . H
: 72 UNK N 5.66 ( 6.02) . . H
: 75 UNK NE2 5.47 ( 6.31) . . H
: 86 UNK OE1 5.73 ( 8.32) . . T
: 230 UNK CD1 4.17 ( 7.18) . . H
: 234 UNK CG2 5.00 ( 7.57) . . H
: 328 UNK O 5.52 ( 7.64) . . H
: 331 UNK O 5.90 ( 6.96) . . H
: 332 UNK SG 1.73 ( 3.45) . . H
: 333 UNK N 5.22 ( 6.26) . . H
: 335 UNK OE2 4.41 ( 6.99) . . H
: 93 HOH O 4.89 (-1.00) . . .
: 94 HOH O 5.28 (-1.00) . . .
Site 3: 242 UNK CB 5.85 ( 6.37) . . H [Het: CIT C1 - CB 3.30]
: 243 UNK CG2 5.62 ( 6.52) . . H
: 273 UNK O 2.93 ( 5.24) . . T [Het: COAPC3 - O 3.90]
: 274 UNK NE2 4.70 ( 3.23) . . H [Het: COAPC3 - O 3.70]
: 275 UNK N 4.87 ( 5.93) . . H [Het: CIT O3 - N 4.00]
: 320 UNK NE2 5.73 ( 7.00) . . T [Het: COAAO4 - O 4.00]
: 375 UNK OD1 5.72 ( 9.01) . . H [Het: COAPC3 - OD1 3.70]
: 1 COA PC3 4.09 (-1.00) . . .
: 2 CIT O6 5.31 (-1.00) . . .
: 86 HOH O 3.15 (-1.00) . . .
: 87 HOH O 0.82 (-1.00) . . .
: 88 HOH O 3.85 (-1.00) . . .
: 419 UNK CD1 4.96 ( 7.86) . . T
PROTEIN: 7API ALPHA-1-ANTITRYPSIN/MODIFIED (TETRAGONAL)
|
Bound Ligands : NAG N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE: MAN ALPHA-D-MANNOSE:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 0.000 M POTASSIUM/SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : XL REDUCED BY GLUTATHIONE : UNBLOCKED CYS 232
Reference : LOBERMANN et.al. 1984 :
pH 8.0 Soak time = Hours Reference number = 244.02
Site 1: 62 ALA A O 5.72 ( 7.05) . . H
: 65 SER A OG 3.64 ( 5.36) . . H
: 66 LEU A CD1 5.15 ( 5.36) . . H
: 73 HIS A NE2 3.15 ( 6.74) . . H
: 77 LEU A CD1 3.72 ( 6.46) . . H
: 89 GLU A OE1 3.65 ( 5.00) . . H
: 90 ALA A N 5.99 ( 6.54) . . H
: 92 ILE A CD1 5.62 ( 7.04) . . H
: 93 HIS A NE2 2.66 ( 7.05) . . H
Site 2: 521 NAG O3 5.62 (-1.00) . . .
: 70 ALA A O 5.34 ( 5.92) . . H
: 73 HIS A NE2 4.75 ( 6.87) . . H
: 74 ASP A OD1 3.35 ( 5.41) . . H
: 84 LEU A CD1 4.58 ( 7.44) . . .
: 89 GLU A OE1 5.11 ( 7.61) . . H
: 663 HOH O 1.38 (-1.00) . . .
Site 3: 62 ALA A O 5.19 ( 6.71) . . H
: 65 SER A OG 3.37 ( 5.09) . . H
: 66 LEU A CD1 4.25 ( 4.65) . . H
: 73 HIS A NE2 3.84 ( 7.19) . . H
: 77 LEU A CD1 4.16 ( 7.03) . . H
: 89 GLU A OE1 4.14 ( 5.49) . . H
: 93 HIS A NE2 2.12 ( 6.62) . . H
Site 4: 39 ARG A CD 5.93 ( 5.97) . . .
: 42 ALA A CB 5.76 ( 6.95) . . .
: 261 GLN A OE1 5.63 ( 5.88) . . H
: 264 GLU A OE1 5.06 ( 6.72) . . H
: 265 ASN A OD1 3.47 ( 6.02) . . H
: 662 HOH O 3.18 (-1.00) . . .
Site 5: 207 ASP A OD1 4.97 ( 5.82) . . .
: 209 HIS A NE2 3.14 ( 7.53) . . .
: 365 LYS B NZ 4.78 ( 8.84) . . E
: 367 ASN B OD1 5.89 ( 7.18) . . E
: 655 HOH O 3.57 (-1.00) . . .
Site 6: 65 SER A OG 3.74 ( 4.08) . . H
: 66 LEU A N 5.65 ( 6.63) . . H
: 68 THR A OG1 5.12 ( 6.04) . . H
: 72 THR A O 4.83 ( 6.61) . . H
: 73 HIS A NE2 3.44 ( 3.01) . . H
: 74 ASP A OD2 5.28 ( 4.48) . . H
: 75 GLU A N 5.53 ( 6.37) . . H
: 76 ILE A CD1 4.48 ( 4.64) . . H
: 77 LEU A CD1 2.80 ( 4.40) . . H
: 78 GLU A N 5.92 ( 7.30) . . H