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ANALYSIS FOR MERCURY (II) CHLOROANILATE [HDX]
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Formula : HG1,C6,O4,CL2
Solution chemistry: HG +2
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 2ALP ALPHA-LYTIC PROTEASE
|
Bound Ligands : SO4 SULFATE:
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 1.300 M LITHIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : BRAYER et.al. 1979 :
pH 7.2 Soak time = 12.00 Hours Reference number = 19.02
Site 1: 143 THR CG2 5.97 ( 5.31) . . .
: 157 TYR O 5.49 ( 7.08) . . .
: 158 GLN OE1 3.81 ( 6.38) . . .
: 189 CYS SG 5.32 ( 7.92) d . .
: 220A CYS SG 5.23 ( 7.08) d . .
: 97 HOH O 2.61 (-1.00) . . .
: 102 HOH O 4.03 (-1.00) . . .
: 143 THR O 3.93 ( 5.38) . . .
: 157 TYR O 5.53 ( 7.13) . . .
: 158 GLN OE1 3.87 ( 6.45) . . .
: 189 CYS SG 5.41 ( 8.02) d . .
: 220A CYS SG 5.31 ( 7.14) d . .
: 97 HOH O 2.57 (-1.00) . . .
: 102 HOH O 4.02 (-1.00) . . .
Site 2: 101 ASN ND2 5.76 ( 8.13) . . .
: 103 ARG NH1 2.30 ( 8.70) . . .
: 232 GLN O 5.96 ( 7.36) . . .
: 233 PRO CD 5.48 ( 3.55) . . . [Het: SO4 O2 - CB 3.90]
: 234 ILE C 5.80 ( 5.09) . . .
: 236 SER OG 4.92 ( 6.37) . . . [Het: SO4 O4 - OG 4.10]
: 237 GLN OE1 3.50 ( 4.76) . . .
: 2 SO4 S 5.74 (-1.00) . . .
: 33 HOH O 5.88 (-1.00) . . .
: 60 HOH O 3.87 (-1.00) . . .
: 79 HOH O 3.68 (-1.00) . . .
: 15B ASN OD1 2.76 ( 5.31) . . .
: 113 THR OG1 4.92 ( 6.62) . . .
: 119 LEU CD1 5.88 ( 9.19) . . .
: 68 HOH O 2.12 (-1.00) . . .
: 126 HOH O 5.75 (-1.00) . . .
Site 3: 173 ALA CB 5.96 ( 6.06) . . .
: 120 PRO CG 5.76 ( 7.82) . . .
: 120A ARG NH1 2.96 ( 8.35) . . .
: 39 HOH O 5.58 (-1.00) . . .
: 94 HOH O 2.49 (-1.00) . . .
: 115 HOH O 3.91 (-1.00) . . .
: 48A ARG NH1 2.68 ( 7.78) . . .
: 236 SER O 5.99 ( 8.06) . . . [Het: SO4 O4 - OG 4.10]
: 237 GLN O 4.40 ( 6.59) . . .
: 238 TYR CD2 5.41 ( 4.06) . . .
: 239 GLY O 5.75 ( 4.62) . . .
: 26 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
: 85 HOH O 5.07 (-1.00) . . .
: 135 HOH O 2.86 (-1.00) . . .
: 155 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
Site 4: 120E GLY N 5.66 ( 5.99) . . .
: 143 THR O 2.98 ( 5.22) . . .
: 156 GLY O 4.14 ( 3.02) . . .
: 157 TYR CD1 5.91 ( 3.49) . . .
: 158 GLN OE1 5.48 ( 5.51) . . .
: 11 HOH O 4.54 (-1.00) . . .
: 17 HOH O 3.84 (-1.00) . . .
: 25 HOH O 5.59 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 2.03 (-1.00) . . .
: 92 HOH O 5.07 (-1.00) . . .
: 97 HOH O 5.35 (-1.00) . . .
: 102 HOH O 2.15 (-1.00) . . .
: 103 HOH O 5.90 (-1.00) . . .
: 142 THR O 6.00 ( 8.18) . . .
: 143 THR CG2 5.92 ( 6.09) . . .
: 219D ASN ND2 5.27 ( 8.44) . . .
: 220A CYS CB 5.87 ( 7.30) d . .
: 46 HOH O 5.18 (-1.00) . . .
: 82 HOH O 6.00 (-1.00) . . .
Site 5: 48A ARG NH1 3.48 ( 7.44) . . .
: 105 TRP CZ2 5.55 (11.24) . . .
: 26 HOH O 5.12 (-1.00) . . .
: 40 HOH O 4.19 (-1.00) . . .
: 135 HOH O 4.50 (-1.00) . . .
: 170 ASN CG 5.62 ( 4.72) . . .
: 171 TYR O 3.46 ( 4.50) . . .
: 173 ALA O 5.14 ( 4.20) . . .
: 174 GLU N 5.98 ( 7.08) . . .
: 86 HOH O 5.47 (-1.00) . . .
: 94 HOH O 5.20 (-1.00) . . .
: 115 HOH O 5.09 (-1.00) . . .
Site 6: 48A ARG NH1 4.54 ( 7.45) . . .
: 238 TYR O 4.36 ( 5.86) . . .
: 239 GLY O 5.18 ( 4.52) . . .
: 135 HOH O 1.88 (-1.00) . . .
: 155 HOH O 3.85 (-1.00) . . .
: 173 ALA O 5.43 ( 4.69) . . .
: 142 HOH O 5.46 (-1.00) . . .
: 120 PRO O 5.70 ( 6.96) . . .
: 120A ARG NH1 1.90 ( 6.90) . . .
: 120K THR OG1 3.70 ( 5.57) . . .
: 245 GLY O 5.20 ( 5.84) . . .
: 39 HOH O 3.45 (-1.00) . . .
: 94 HOH O 3.84 (-1.00) . . .
: 115 HOH O 3.23 (-1.00) . . .
Site 7: 57 HIS O 5.91 ( 6.42) . . . [Het: SO4 O2 - NE2 3.90]
: 94 PHE CE1 4.60 ( 9.16) . . .
: 173 ALA CB 5.36 ( 6.06) . . .
: 174 GLU OE1 3.05 ( 5.46) . . .
: 64 HOH O 4.73 (-1.00) . . .
: 86 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
: 130 HOH O 2.57 (-1.00) . . .
: 122 ARG NH1 5.40 ( 7.29) . . .
: 202 ALA O 5.20 ( 6.21) . . .
: 45 HOH O 5.47 (-1.00) . . .
: 52 HOH O 4.33 (-1.00) . . .
: 99 HOH O 3.35 (-1.00) . . .
: 112 HOH O 5.94 (-1.00) . . .
: 140 HOH O 5.89 (-1.00) . . .
Site 8: 122 ARG NH1 3.64 ( 6.77) . . .
: 202 ALA O 5.23 ( 6.65) . . .
: 52 HOH O 5.50 (-1.00) . . .
: 99 HOH O 3.34 (-1.00) . . .
: 112 HOH O 5.14 (-1.00) . . .
: 140 HOH O 4.81 (-1.00) . . .
: 57 HIS NE2 5.17 ( 5.60) . . . [Het: SO4 O2 - NE2 3.90]
: 94 PHE CE1 4.83 ( 9.26) . . .
: 174 GLU OE1 3.75 ( 6.79) . . .
: 1 SO4 O2 5.97 (-1.00) . . .
: 53 HOH O 5.42 (-1.00) . . .
: 64 HOH O 3.26 (-1.00) . . .
: 78 HOH O 5.43 (-1.00) . . .
: 86 HOH O 5.81 (-1.00) . . .
: 130 HOH O 4.03 (-1.00) . . .
Site 9: 136 VAL O 4.81 ( 6.44) . . .
: 137 CYS SG 2.25 ( 3.67) d . .
: 138 ARG O 5.31 ( 6.02) . . .
: 157 TYR OH 4.15 ( 5.26) . . .
: 158 GLN O 3.31 ( 4.01) . . .
: 159 CYS SG 1.01 ( 3.17) d . .
: 160 GLY N 5.34 ( 6.80) . . .
: 48 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
: 70 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 4.56 (-1.00) . . .
: 92 HOH O 4.44 (-1.00) . . .
: 98 HOH O 5.34 (-1.00) . . .
: 139 HOH O 3.98 (-1.00) . . .
Site A: 131 ALA O 4.18 ( 4.56) . . .
: 132 VAL CG1 2.05 ( 1.55) . . .
: 133 GLY N 3.66 ( 5.02) . . .
: 134 ALA N 5.87 ( 7.17) . . .
: 162 ILE CG2 4.35 ( 5.90) . . .
: 163 THR O 5.11 ( 5.55) . . .
: 164 ALA O 5.88 ( 5.11) . . .
: 165 LYS NZ 5.51 ( 6.28) . . .
: 58 HOH O 3.96 (-1.00) . . .
: 93 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
: 96 HOH O 5.78 (-1.00) . . .
: 118 HOH O 5.10 (-1.00) . . .
: 133 HOH O 4.30 (-1.00) . . .
: 157 HOH O 5.21 (-1.00) . . .
Site B: 120D ASN OD1 5.58 ( 6.88) . . .
: 137 CYS SG 5.12 ( 5.51) d . .
: 138 ARG O 4.29 ( 6.06) . . .
: 156 GLY O 5.20 ( 6.32) . . .
: 157 TYR OH 5.83 ( 2.91) . . .
: 158 GLN OE1 4.50 ( 2.25) . . .
: 159 CYS SG 3.75 ( 4.52) d . .
: 17 HOH O 5.17 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 5.68 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 3.90 (-1.00) . . .
: 92 HOH O 2.84 (-1.00) . . .
: 98 HOH O 5.07 (-1.00) . . .
: 102 HOH O 4.55 (-1.00) . . .
: 46 HOH O 4.59 (-1.00) . . .
: 139 HOH O 5.03 (-1.00) . . .
Site C: 124 SER O 5.18 ( 6.29) . . .
: 125 THR O 3.49 ( 5.48) . . .
: 129 GLU OE1 5.17 ( 2.88) . . .
: 130 ALA O 4.60 ( 4.21) . . .
: 162 ILE CD1 5.47 ( 9.29) . . .
: 201 THR CG2 5.78 ( 7.68) . . .
: 208 GLN O 5.22 ( 6.50) . . .
: 209 ALA O 4.11 ( 5.90) . . .
: 210 GLN OE1 1.10 ( 3.29) . . .
: 211 GLY N 5.46 ( 6.54) . . .
: 228 PHE CE1 5.34 ( 9.94) . . .
: 7 HOH O 4.77 (-1.00) . . .
: 9 HOH O 4.66 (-1.00) . . .
: 18 HOH O 3.28 (-1.00) . . .
: 22 HOH O 5.15 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 3.22 (-1.00) . . .
: 101 HOH O 2.60 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2SGA PROTEINASE A (STREPTOMYCES GRISEUS)
|
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 1.500 M SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : BRAYER et.al. 1978 :
pH 4.1 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 45.01
Site 1: 42 CYS SG 4.93 ( 7.42) d . E
: 57 HIS NE2 2.89 ( 4.00) . . .
: 58 CYS SG 4.17 ( 4.26) d . .
: 63 ILE CD1 4.68 ( 7.47) . . .
: 195 SER OG 5.36 ( 6.94) . . .
: 31 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
: 32 HOH O 3.68 (-1.00) . . .
: 37 HOH O 5.80 (-1.00) . . .
: 70 HOH O 4.96 (-1.00) . . .
: 74 HOH O 4.73 (-1.00) . . .
: 82 HOH O 5.47 (-1.00) . . .
: 125 HOH O 4.71 (-1.00) . . .
: 141 HOH O 4.07 (-1.00) . . .
Site 2: 190 VAL O 5.78 ( 8.02) . . .
: 191 CYS O 5.83 ( 5.02) d . .
: 192 ALA O 2.42 ( 4.03) . . .
: 192A GLN CG 5.49 ( 4.90) . . .
: 215 GLY O 5.69 ( 6.51) . . E
: 216 GLY O 4.65 ( 4.52) . . E
: 217 SER OG 5.85 ( 4.15) . . E
: 218 GLY O 3.04 ( 4.32) . . E
: 219 ASN O 5.50 ( 4.27) . . E
: 220 CYS N 5.83 ( 6.91) d . .
: 224 GLY C 5.65 ( 5.31) . . E
: 225 THR O 4.38 ( 6.13) . . E
: 226 THR CG2 4.00 ( 5.83) . . E
: 40 HOH O 2.11 (-1.00) . . .
: 94 HOH O 5.95 (-1.00) . . .
: 97 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 128 HOH O 0.89 (-1.00) . . .
: 131 HOH O 3.16 (-1.00) . . .
: 147 HOH O 3.85 (-1.00) . . .
: 148 HOH O 4.73 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 5TNC TROPONIN-C (TURKEY)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION IN BINDING SITE III:
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 39.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 3.000 % PEG 200/CALCIUM CHLORIDE
Comments :
Reference : HERZBERG et.al. 1987 :1989 :JAMES et.al. 1985a:1985b:1986 :1988 :
pH 5.0 Soak time = 20.00 Hours Reference number = 9.04
Site 1: 95 GLU OE1 4.38 ( 5.22) . . H
: 98 LEU CD1 4.34 ( 6.62) . . H
: 151 PHE CE2 5.69 ( 8.13) . s H
: 155 LEU CD1 2.74 ( 4.37) . . H
: 156 LYS N 6.00 ( 7.08) . . H
: 159 GLU OE1 5.00 ( 7.00) . . .
: 146 HOH O 4.09 (-1.00) . . .
: 96 GLU OE1 4.02 ( 6.32) . . H
: 99 GLU OE1 5.97 ( 9.25) . . H
: 83 HOH O 5.05 (-1.00) . . .
: 112 HOH O 5.25 (-1.00) . . .
: 135 HOH O 3.50 (-1.00) . . .
: 66 ASP OD1 4.83 ( 5.45) . s .
: 67 GLU O 2.81 ( 4.24) . s .
: 68 ASP OD2 5.24 ( 3.42) . s .
: 69 GLY O 5.45 ( 3.06) . s .
: 70 SER N 5.18 ( 6.65) . s .