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ANALYSIS FOR MERCURIC (II) CHLORIDE [HDO]
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Formula : HG1,CL1
Solution chemistry: HG1,CL2 -0
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 1ACX ACTINOXANTHIN
|
Hev Atom conc.: 20% SATURATION
Precip & conc.: 75.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.020 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : PLETNEV et.al. 1981 :1982 :
pH 4.4 Soak time = 120.00 Hours Reference number = 83.04
Site 1: 91 GLY CA 5.71 ( 5.71) . . E
: 92 ALA O 5.92 ( 7.16) . . E
: 98 ASN OD1 2.07 ( 5.44) . . T [Het: HEM CHD - C 4.00]
: 99 LEU O 5.01 ( 5.49) . . T [Het: HEMFE - CB 3.80]
: 100 GLY O 3.76 ( 2.28) . . T
: 101 HIS NE2 3.91 ( 4.14) . . E [Het: HEM CHC - CB 4.00]
Site 2: 90 LEU O 5.92 ( 7.34) . . E
: 91 GLY O 5.71 ( 3.94) . . E
: 92 ALA O 4.57 ( 5.28) . . E
: 98 ASN OD1 2.71 ( 4.95) . . T [Het: HEM CHD - C 4.00]
: 99 LEU O 5.58 ( 5.61) . . T [Het: HEMFE - CB 3.80]
: 100 GLY O 3.53 ( 3.57) . . T
: 101 HIS NE2 4.86 ( 4.21) . . E [Het: HEM CHC - CB 4.00]
Site 3: 54 ASP CB 5.50 ( 6.35) . . T
: 55 ALA CB 4.87 ( 5.84) . . T [Het: HEM CGA - CE2 3.50]
: 8 PRO O 5.48 ( 6.22) . . .
: 10 SER O 4.77 ( 6.59) . . T
: 11 GLY O 2.88 ( 4.91) . . T
: 12 ALA O 3.86 ( 2.12) . . T
: 13 SER OG 4.79 ( 3.75) . . T
: 14 ASP N 5.42 ( 6.63) . . T
: 16 GLN OE1 1.45 ( 5.55) . . E [Het: HEM CHC - CA 3.50]
Site 4: 32 ALA O 5.91 ( 7.87) . . E
: 34 CYS SG 4.59 ( 5.91) d . E
: 41 ASP OD1 5.59 ( 6.70) . . E
: 43 CYS SG 5.55 ( 8.18) d . E
: 89 ASN OD1 5.00 ( 7.99) . . E
: 91 GLY C 5.63 ( 4.93) . . E
: 98 ASN ND2 5.86 ( 8.34) . . T [Het: HEM CHD - C 4.00]
: 101 HIS ND1 4.20 ( 6.76) . . E [Het: HEM CHC - CB 4.00]
Site 5: 91 GLY CA 5.80 ( 5.80) . . E
: 92 ALA N 5.94 ( 6.81) . . E
: 98 ASN OD1 2.97 ( 5.08) . . T [Het: HEM CHD - C 4.00]
: 100 GLY O 5.86 ( 5.38) . . T
: 101 HIS NE2 5.50 ( 6.38) . . E [Het: HEM CHC - CB 4.00]
: 7 SER OG 5.00 ( 7.19) . . .
Site 6: 32 ALA O 5.64 ( 7.11) . . E
: 34 CYS SG 2.97 ( 5.11) d . E
: 41 ASP OD1 5.20 ( 5.23) . . E
: 43 CYS SG 3.35 ( 6.17) d . E
: 73 PRO CD 5.13 ( 6.39) . . T
Site 7: 37 VAL CG1 4.79 ( 6.61) . . E [Het: HEM C4D - CD 4.20]
: 80 SER OG 5.92 ( 5.87) . . E
: 81 VAL CG1 5.27 ( 4.07) . . E
: 82 ASP O 5.70 ( 5.47) . . E
: 85 THR CG2 5.07 ( 7.04) . . T
: 86 ASP OD1 2.33 ( 5.52) . . T
: 65 ARG NH1 5.65 (10.01) . . T
Site 8: 30 TYR O 5.71 ( 7.48) . . E
: 31 ILE C 5.82 ( 5.86) . . E
: 32 ALA O 4.15 ( 5.86) . . E
: 34 CYS SG 4.62 ( 6.32) d . E
: 43 CYS SG 5.91 ( 8.25) d . E
: 89 ASN OD1 4.88 ( 7.63) . . E
: 90 LEU O 5.33 ( 5.43) . . E
: 91 GLY O 3.41 ( 2.78) . . E
: 92 ALA O 5.80 ( 4.66) . . E
: 98 ASN ND2 5.25 ( 7.69) . . T [Het: HEM CHD - C 4.00]
: 100 GLY O 5.87 ( 7.19) . . T
: 101 HIS ND1 4.90 ( 5.85) . . E [Het: HEM CHC - CB 4.00]
| PROTEIN: 1GP1 GLUTATHIONE PEROXIDASE (BOVINE)
|
Bound Ligands : SEC SELENINIC ACID:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 2.500 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.005 M GSSG/SODIUM AZIDE/EDTA
Comments : PRETREATMENT 5 MM-GSH FOR 24 HRS; STATE ENZYME: RE
Reference : LADENSTEIN et.al. 1979 :
pH 7.0 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 97.00
Site 1: 44 LEU A CD1 4.58 ( 7.54) . . T [Het: SEC N - N 2.80]
: 83 ALA A CB 6.00 ( 7.07) . . T
: 91 CYS A SG 3.22 ( 4.45) . . T
: 95 VAL A CG1 4.20 ( 5.58) . . T
: 44 LEU B CD1 4.45 ( 7.31) . . T [Het: SEC N - N 2.90]
: 90 ASN B O 5.95 ( 7.10) . . H
: 91 CYS B SG 2.97 ( 4.17) . . H
: 95 VAL B CG1 4.16 ( 5.46) . . T
: 542 HOH O 5.55 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 5.90 (-1.00) . . .
: 552 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
Site 2: 78 GLY A O 3.98 ( 4.30) . . T
: 79 HIS A NE2 2.06 ( 4.59) . . T
: 145 PHE A CE2 5.68 ( 7.38) . . T
: 78 GLY B O 3.68 ( 3.95) . . T
: 79 HIS B NE2 2.34 ( 4.28) . . T
: 145 PHE B CE2 5.43 ( 7.12) . . 5
: 418 HOH O 5.67 (-1.00) . . .
: 431 HOH O 5.39 (-1.00) . . .
: 479 HOH O 5.51 (-1.00) . . .
: 484 HOH O 5.45 (-1.00) . . .
: 546 HOH O 3.60 (-1.00) . . .
: 550 HOH O 2.94 (-1.00) . . .
Site 3: 40 ASN B CB 5.10 ( 5.64) . . E
: 72 PHE B CD2 5.38 ( 4.80) . . E
: 73 PRO B CD 5.75 ( 4.74) . . E
: 74 CYS B SG 3.65 ( 3.81) . . E
: 75 ASN B N 5.79 ( 7.21) . . T
: 109 GLU B O 5.49 ( 7.83) . . T
: 110 LYS B CG 5.95 ( 5.44) . . T
: 111 CYS B O 2.57 ( 3.99) . . T
: 112 GLU B O 4.23 ( 4.39) . . T
: 113 VAL B CG1 3.14 ( 4.91) . . T
: 122 PHE B CE1 5.93 ( 7.88) . . H
: 434 HOH O 5.31 (-1.00) . . .
: 493 HOH O 5.97 (-1.00) . . .
Site 4: 40 ASN A CB 5.07 ( 5.71) . . E
: 72 PHE A CD2 5.75 ( 4.87) . . E
: 73 PRO A CD 5.63 ( 4.57) . . E
: 74 CYS A SG 3.63 ( 3.52) . . E
: 75 ASN A N 5.48 ( 6.91) . . T
: 76 GLN A OE1 5.93 ( 7.78) . . T
: 109 GLU A O 5.46 ( 7.81) . . T
: 110 LYS A O 5.89 ( 5.37) . . T
: 111 CYS A O 2.44 ( 3.83) . . T
: 112 GLU A O 4.39 ( 4.25) . . T
: 113 VAL A CG1 3.37 ( 5.00) . . T
: 122 PHE A CE2 5.19 ( 8.10) . . T
: 476 HOH O 4.91 (-1.00) . . .
Site 5: 39 GLU A OE2 5.51 ( 9.19) . . E
: 47 THR A OG1 4.32 ( 6.05) . . T [Het: SEC C - N 3.20]
: 50 ARG A NH1 4.94 ( 7.08) . . T
: 51 ASP A OD1 2.80 ( 5.51) . . T
: 159 ASN A O 5.97 ( 8.14) . . T [Het: SEC CB - CB 4.30]
: 160 PHE A CD1 5.81 ( 5.33) . . E [Het: SEC CB - CE1 4.10]
: 162 LYS A NZ 2.24 ( 7.70) . . E
: 176 SER A O 4.77 ( 7.15) . . T
: 177 ARG A O 3.44 ( 4.84) . . T
: 178 ARG A O 4.96 ( 5.15) . . T
: 179 PHE A O 2.91 ( 4.99) . . T
: 180 LEU A CD1 5.74 ( 4.39) . . T
: 181 THR A OG1 4.71 ( 5.55) . . T
: 417 HOH O 4.99 (-1.00) . . .
: 455 HOH O 3.58 (-1.00) . . .
: 472 HOH O 0.93 (-1.00) . . .
Site 6: 39 GLU B OE2 5.50 ( 9.19) . . E
: 47 THR B OG1 4.77 ( 6.43) . . T [Het: SEC CA - N 4.20]
: 50 ARG B NH1 5.47 ( 7.30) . . T
: 51 ASP B OD1 3.01 ( 5.58) . . T
: 160 PHE B CD2 5.95 ( 5.54) . . E [Het: SEC CB - CE1 4.20]
: 162 LYS B NZ 2.17 ( 7.62) . . E
: 176 SER B O 4.71 ( 7.12) . . T
: 177 ARG B O 3.48 ( 5.08) . . T
: 178 ARG B O 4.80 ( 4.93) . . T
: 179 PHE B O 2.81 ( 4.77) . . T
: 180 LEU B CD1 5.66 ( 4.17) . . T
: 181 THR B OG1 4.43 ( 5.12) . . T
: 454 HOH O 3.49 (-1.00) . . .
: 492 HOH O 5.11 (-1.00) . . .
: 494 HOH O 5.43 (-1.00) . . .
: 496 HOH O 1.18 (-1.00) . . .
Site 7: 16 SER B O 5.85 ( 8.18) . . T
: 17 ALA B CB 5.10 ( 5.55) . . T
: 18 ARG B N 5.70 ( 6.75) . . T
: 72 PHE B CE2 5.76 ( 7.81) . . E
: 109 GLU B OE1 5.51 ( 6.26) . . T
: 110 LYS B O 4.96 ( 6.33) . . T
: 111 CYS B SG 2.44 ( 4.37) . . T
: 112 GLU B O 5.69 ( 6.83) . . T
: 119 HIS B NE2 3.99 ( 4.70) . . T
: 120 PRO B CD 5.90 ( 7.70) . . H
: 441 HOH O 2.92 (-1.00) . . .
: 493 HOH O 2.57 (-1.00) . . .
Site 8: 16 SER A O 5.67 ( 8.05) . . .
: 17 ALA A CB 5.87 ( 5.91) . . .
: 110 LYS A O 5.91 ( 7.53) . . T
: 111 CYS A SG 2.48 ( 5.01) . . T
: 112 GLU A N 5.92 ( 7.10) . . T
: 119 HIS A NE2 4.21 ( 4.39) . . T
: 120 PRO A N 5.79 ( 7.17) . . T
: 473 HOH O 3.88 (-1.00) . . .
: 525 HOH O 3.33 (-1.00) . . .
Site 9: 44 LEU A O 5.49 ( 7.34) . . T [Het: SEC N - N 2.80]
: 45 SEC A OD1 1.51 (-1.00) . . .
: 46 GLY A N 4.38 ( 5.50) . . T [Het: SEC N - N 3.60]
: 47 THR A N 5.87 ( 7.04) . . T [Het: SEC C - N 3.20]
: 77 PHE A O 4.70 ( 6.45) . . T
: 80 GLN A OE1 3.20 ( 6.59) . . T [Het: SEC N - NE2 4.00]
: 158 TRP A CH2 4.44 ( 6.22) . . T [Het: SECSEG - CD1 3.90]
: 159 ASN A OD1 3.37 ( 5.67) . . T [Het: SEC CB - CB 4.30]
: 177 ARG A NH2 5.28 ( 8.78) . . T
: 417 HOH O 5.12 (-1.00) . . .
: 421 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
: 479 HOH O 5.92 (-1.00) . . .
: 526 HOH O 5.81 (-1.00) . . .
: 544 HOH O 5.79 (-1.00) . . .
: 572 HOH O 3.64 (-1.00) . . .
Site A: 94 TYR A OH 3.50 ( 6.65) . . T
: 94 TYR B OH 3.65 ( 6.77) . . T
Site B: 44 LEU B O 5.69 ( 7.52) . . T [Het: SEC N - N 2.90]
: 45 SEC B OD1 1.25 (-1.00) . . .
: 46 GLY B C 5.94 ( 5.17) . . T [Het: SEC N - N 3.70]
: 47 THR B N 5.58 ( 6.72) . . T [Het: SEC CA - N 4.20]
: 77 PHE B O 5.33 ( 6.96) . . T
: 80 GLN B OE1 3.44 ( 7.07) . . T [Het: SEC N - NE2 4.00]
: 158 TRP B CH2 4.69 ( 6.56) . . T [Het: SECSEG - CD1 3.90]
: 159 ASN B OD1 3.57 ( 5.80) . . T [Het: SEC CB - OD1 4.00]
: 177 ARG B NH2 4.36 ( 8.60) . . T
: 428 HOH O 5.72 (-1.00) . . .
: 492 HOH O 5.11 (-1.00) . . .
: 585 HOH O 4.92 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1L03 LYS0ZYME (T4) MUTANT (T157C)
|
Bound Ligands : SEO BETA-MERCAPTOETHANOL(S COORDS ONLY):
Hev Atom conc.: 0.250 mM
Precip & conc.: 0.230 M SODIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 1.050 M DIPOTASSIUM HYDROGEN PHOSPHATE / SODIUM DIHYDOGEN
Addict & conc.:
Comments : SITE DIRECTED MUTAGENESIS T157C +54:HG CONC REDUCE
Reference : DAO-PIN et.al. 1989 :
pH 6.7 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 373.00
Site 1: 50 ILE CG1 5.42 ( 6.87) . . H
: 52 ARG NH1 2.84 ( 6.71) . . T
: 53 ASN O 5.40 ( 6.96) . . T
: 54 CYS SG 3.33 ( 4.37) . . T
: 57 VAL CG1 5.85 ( 5.17) . . E
: 58 ILE CG1 5.30 ( 3.23) . . E
: 59 THR OG1 5.68 ( 5.46) . . T
: 62 GLU OE1 2.47 ( 6.68) . . H
: 201 HOH O 3.34 (-1.00) . . .
: 348 HOH O 4.79 (-1.00) . . .
: 615 HOH O 4.32 (-1.00) . . .
Site 2: 1 MET O 5.58 ( 7.56) . . .
: 2 ASN C 5.51 ( 5.36) . . .
: 3 ILE CB 5.59 ( 5.72) . . .
: 93 ALA O 2.55 ( 4.44) . . H
: 94 VAL CG1 5.43 ( 3.83) . . H
: 95 ARG N 5.52 ( 6.49) . . H
: 96 ARG CB 5.40 ( 5.70) . . H
: 97 CYS SG 2.00 ( 4.25) . . H
: 158 TRP CH2 4.15 ( 9.06) . . T
: 197 HOH O 3.52 (-1.00) . . .
: 213 HOH O 3.65 (-1.00) . . .
: 297 HOH O 5.32 (-1.00) . . .
: 317 HOH O 5.53 (-1.00) . . .
: 68 ASN OD1 3.98 ( 5.49) . . H
: 275 HOH O 2.74 (-1.00) . . .
Site 3: 549 HOH O 4.70 (-1.00) . . .
: 155 THR O 5.36 ( 7.21) . . H
: 156 GLY O 3.84 ( 5.72) . . T
: 157 CYS SG 2.51 ( 3.49) . . T
: 158 TRP N 4.96 ( 6.36) . . T
: 1 SEO SD 0.55 (-1.00) . . .
: 219 HOH O 5.51 (-1.00) . . .
: 256 HOH O 3.57 (-1.00) . . .
: 312 HOH O 5.98 (-1.00) . . .
: 601 HOH O 2.38 (-1.00) . . .
: 618 HOH O 4.17 (-1.00) . . .
: 531 HOH O 3.73 (-1.00) . . .
: 65 LYS NZ 5.14 ( 8.53) . . H
| PROTEIN: 1L26 LYS0ZYME (T4) MUTANT (P86C)
|
Bound Ligands : SEO BETA-MERCAPTOETHANOL:
Hev Atom conc.: 0.250 mM
Precip & conc.: 0.230 M SODIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 1.050 M DIPOTASSIUM HYDROGEN PHOSPHATE / SODIUM DIHYDOGEN
Addict & conc.:
Comments : TO X-RAY.
Reference : DAO-PIN et.al. 1989 :
pH 6.7 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 374.00
Site 1: 50 ILE CG1 5.07 ( 6.74) . . H
: 52 ARG NH1 2.97 ( 6.62) . . T
: 53 ASN O 5.07 ( 6.64) . . T
: 54 CYS SG 2.86 ( 4.03) . . T
: 57 VAL CG1 5.26 ( 5.05) . . E
: 58 ILE CG1 5.27 ( 3.34) . . E
: 59 THR OG1 5.95 ( 5.71) . . T
: 62 GLU OE1 2.72 ( 6.88) . . H
: 201 HOH O 3.26 (-1.00) . . .
: 348 HOH O 5.22 (-1.00) . . .
Site 2: 1 MET O 5.54 ( 7.49) . . .
: 2 ASN C 5.60 ( 5.43) . . .
: 3 ILE CB 5.74 ( 5.85) . . .
: 93 ALA O 2.63 ( 4.50) . . H
: 94 VAL CG1 5.23 ( 3.73) . . H
: 95 ARG N 5.50 ( 6.45) . . H
: 96 ARG CB 5.40 ( 5.72) . . H
: 97 CYS SG 1.98 ( 4.19) . . H
: 158 TRP CH2 4.06 ( 8.75) . . T
: 197 HOH O 3.82 (-1.00) . . .
: 213 HOH O 3.37 (-1.00) . . .
: 297 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
: 317 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
: 68 ASN OD1 3.84 ( 5.55) . . H
: 275 HOH O 2.92 (-1.00) . . .
Site 3: 82 ALA O 5.51 ( 7.52) . . H
: 83 LYS O 5.98 ( 6.75) . . H
: 86 CYS SG A 2.24 ( 4.41) . . H [Het: SEO CB - CA 3.50]
: 87 VAL N 5.80 ( 6.85) . . H
: 122 GLN OE1 4.72 ( 8.44) . . H
: 500 SEO SG 3.05 (-1.00) . . .
: 314 HOH O 5.19 (-1.00) . . .
: 194 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1PPT AVIAN PANCREATIC POLYPEPTIDE
|
Bound Ligands : ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.100 M TRIS/ACT
Addict & conc.:
Comments : ZN ION FOR EACH PROTOMER ESSENTIAL:XLN AND STABILI
Reference : PITTS et.al. 1982 :
pH 7.0 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 33.00
Site 1: 29 ASN OD1 5.53 ( 5.48) . . .
: 32 THR OG1 4.68 ( 7.05) . . .
: 34 HIS NE2 4.11 ( 4.85) . . .
: 36 TYR OXT 6.00 ( 6.01) . . .
: 1 ZN ZN 5.91 (-1.00) . . .
Site 2: 34 HIS NE2 2.20 ( 6.42) . . .
: 36 TYR OH 5.84 ( 6.26) . . .
: 19 ARG CD 5.76 ( 5.90) . . .
: 23 ASN OD1 1.84 ( 5.17) . . .
: 1 GLY O 2.21 ( 3.02) . . .
: 2 PRO O 5.38 ( 4.96) . . .
: 3 SER N 5.62 ( 6.39) . . .
: 1 ZN ZN 0.18 (-1.00) . . .
: 11 ASP OD1 5.76 ( 7.31) . . .
Bound Ligands : CYA TWO OXYGEN ATOMS BOUND TO SG OF CYS-25.: NH4 AMMONIUM ION:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 25.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : BAKER et.al. 1976 :1977 :
pH 5.5 Soak time = 120.00 Hours Reference number = 42.04
Site 1: 19 GLN OE1 5.92 ( 9.71) . s T [Het: CYA OD1 - NE2 3.20]
: 23 GLY O 5.10 ( 5.12) . . T [Het: CYA OD1 - CA 3.70]
: 24 GLY N 5.98 ( 6.59) . . T [Het: CYA OD1 - N 3.80]
: 25 CYS SG 2.64 ( 5.26) . s T [Het: CYA OD1 - N 2.80]
: 26 TRP N 5.96 ( 7.07) . . T [Het: CYA OD2 - N 3.00]
: 161 ASP OD1 5.42 ( 5.16) . . T
: 162 HIS NE2 5.55 ( 3.62) . s E [Het: CYA OD1 - ND1 3.90]
: 163 ALA N 4.67 ( 6.06) . s E [Het: CYA OD2 - N 3.10]
: 1 CYA I OD1 2.48 (-1.00) . . .
: 77 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 4.60 (-1.00) . . .
: 212 HOH O 4.77 (-1.00) . . .
: 215 HOH O 3.87 (-1.00) . . .
: 216 HOH O 2.08 (-1.00) . . .
: 222 HOH O 3.97 (-1.00) . . .
: 223 HOH O 2.23 (-1.00) . . .
Site 2: 25 CYS SG 5.45 ( 7.02) . s T [Het: CYA OD1 - N 2.80]
: 26 TRP CD1 5.10 ( 5.51) . . T [Het: CYA OD2 - N 3.00]
: 67 GLY O 5.86 ( 4.80) . . T
: 68 GLY O 2.35 ( 4.13) . . T
: 69 TYR CE1 5.75 ( 4.88) . s H
: 161 ASP O 4.90 ( 5.38) . . T
: 162 HIS N 5.57 ( 5.92) . s E [Het: CYA OD1 - ND1 3.90]
: 163 ALA N 5.70 ( 6.36) . s E [Het: CYA OD2 - N 3.10]
: 1 CYA I OD2 4.11 (-1.00) . . .
: 88 HOH O 4.72 (-1.00) . . .
: 126 HOH O 5.36 (-1.00) . . .
: 162 HOH O 2.39 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 2.44 (-1.00) . . .
: 212 HOH O 2.16 (-1.00) . . .
: 222 HOH O 3.11 (-1.00) . . .
: 223 HOH O 5.34 (-1.00) . . .
: 224 HOH O 2.64 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2CAB CARBONIC ANHYDRASE B (HUMAN)
|
Bound Ligands : ZN ZINC(II) CATALYTICALLY ACTIVE METAL ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 2.300 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : 2,3 DIMERCAPTOPROPANOL - APOENZYME
Reference : KANNAN et.al. 1975 :
pH 8.7 Soak time = Hours Reference number = 74.02
Site 1: 17 SER OG 3.70 ( 4.19) . . T
: 18 LYS N 5.56 ( 6.41) . . T
: 20 TYR O 5.19 ( 7.11) . . 5
: 21 PRO O 3.71 ( 4.24) . . 5
: 22 ILE N 5.69 ( 6.40) . . 5
: 23 ALA O 5.90 ( 5.51) . . 5
: 24 ASN OD1 0.74 ( 4.15) . . 5
: 41 ASP OD1 5.50 ( 8.30) . . E
: 43 SER OG 3.41 ( 4.25) . . T
: 158 GLN OE1 4.07 ( 5.58) . . H
: 162 ASP OD1 5.31 ( 7.97) . . H
Site 2: 58 GLU C 5.89 ( 7.05) . . E
: 59 ILE CD1 2.45 ( 3.57) . . E
: 60 ILE O 5.29 ( 4.83) . . E
: 61 ASN N 5.51 ( 6.33) . . E
: 66 PHE CE1 5.71 ( 6.30) . . E
: 67 HIS O 5.15 ( 6.83) . . E
: 68 VAL CG2 5.89 ( 6.65) . . E
: 160 VAL O 5.54 ( 6.83) . . H
: 163 ALA O 3.94 ( 4.91) . . H
: 164 LEU CD2 4.24 ( 4.64) . . H
: 166 ALA C 5.84 ( 6.38) . . H
: 167 ILE CD1 2.72 ( 5.06) . . H
: 174 ALA O 5.43 ( 5.93) . . E
: 176 PHE CD1 5.70 ( 7.12) . . E
| PROTEIN: 2LZM LYSOZYME (BACTERIOPHAGE T4)
|
Hev Atom conc.: 0.250 mM
Precip & conc.: 1.050 M POTASSIUM HYDROGEN PHOSPHATE/SODIUM DIHYDROGEN PHO
Buffer & conc.: 0.010 M SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.230 M SODIUM CHLORIDE/MAGNESIUM CHLORIDE
Comments : DATA COLLECTION : 0.001 HGCL2 ADDED JUST BEFORE
Reference : REMINGTON et.al. 1978 :
pH 6.7 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 28.00
Site 1: 50 ILE CG1 5.07 ( 6.75) . . T
: 52 ARG NH1 2.86 ( 6.57) . . T
: 53 ASN O 5.05 ( 6.64) . . T
: 54 CYS SG 2.83 ( 4.09) . . T
: 57 VAL CG1 5.38 ( 5.15) . . E
: 58 ILE CG1 5.41 ( 3.42) . . E
: 59 THR OG1 5.85 ( 5.73) . . T
: 62 GLU OE1 2.74 ( 6.82) . . T
: 201 HOH O 3.30 (-1.00) . . .
: 348 HOH O 4.95 (-1.00) . . .
Site 2: 1 MET O 5.79 ( 7.72) . . .
: 2 ASN C 5.62 ( 5.43) . . .
: 3 ILE CB 5.56 ( 5.77) . . .
: 93 ALA O 2.61 ( 4.42) . . T
: 94 VAL CG1 5.57 ( 3.92) . . T
: 95 ARG N 5.60 ( 6.54) . . T
: 96 ARG CB 5.18 ( 5.53) . . T
: 97 CYS SG 1.95 ( 4.16) . . T
: 158 TRP CH2 4.40 ( 9.11) . . T
: 197 HOH O 3.58 (-1.00) . . .
: 213 HOH O 3.10 (-1.00) . . .
: 297 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
: 317 HOH O 5.24 (-1.00) . . .
: 68 ASN OD1 3.94 ( 5.48) . . T
: 275 HOH O 2.53 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2MHB HAEMOGLOBIN (HORSE)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX, WITH FE3+ AND WATER:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 1.900 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : CULLIS et.al. 1961 :
pH 7.0 Soak time = Hours Reference number = 145.00
Site 1: 38 THR A OG1 5.30 ( 6.85) . . 5
: 92 HIS B O 5.80 ( 7.18) . s G [Het: HEMFE - ND1 4.20]
: 93 CYS B SG 1.34 ( 3.39) . . G
: 94 ASP B OD1 5.52 ( 3.96) . . G
: 95 LYS B N 5.83 ( 7.13) . . G
: 97 HIS B ND1 5.00 ( 5.86) . . G
: 145 TYR B OH 4.61 ( 5.51) . . .
: 146 HIS B N 5.58 ( 5.66) . . .
Site 2: 31 ARG A O 5.45 ( 6.29) . . H
: 32 MET A CB 5.92 ( 5.54) . . H
: 36 PHE A CE1 3.53 ( 7.66) . . 5
: 99 LYS A O 5.72 ( 7.97) . . H
: 100 LEU A O 3.16 ( 5.01) . . H
: 101 LEU A O 5.23 ( 5.53) . s H [Het: HEM CHC - CD2 3.40]
: 102 SER A O 5.80 ( 6.41) . . H
: 103 HIS A NE2 3.47 ( 3.81) . . H
: 104 CYS A SG 2.10 ( 2.95) . . H
: 105 LEU A N 5.16 ( 6.62) . . H
: 107 SER A OG 4.54 ( 6.35) . . H
: 127 GLN B OE1 5.84 ( 8.27) . . H
: 131 GLN B OE1 4.32 ( 8.14) . . H
| PROTEIN: 2PAD PAPAIN (CYS DERIV OF CYS-25)
|
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M METHANOL/WATER
Buffer & conc.: 0.100 M AMINOETHANOL/HCL
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : PAPAIN -S - HGCL + HCL
Reference : DRENTH et.al. 1962 :1967 :1968 :1971 :
pH 9.3 Soak time = Hours Reference number = 129.03
Site 1: 19 GLN AE1 5.90 (10.00) . . .
: 25 CYS SG 2.42 ( 4.72) d . .
: 26 TRP N 5.34 ( 6.16) . . .
: 134 LEU O 5.83 ( 7.28) . . T
: 136 ALA CB 5.79 ( 7.11) . . T
: 158 ASP OD1 5.94 ( 5.52) . . T
: 159 HIS NE2 3.86 ( 2.05) . . T
: 160 ALA O 3.49 ( 3.31) . . T
: 161 VAL N 5.04 ( 6.05) . . T
: 1 CYS I SG 3.26 ( 4.20) d . T
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M METHANOL/WATER
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : CO-CRYSTALLIZATION
Reference : DRENTH et.al. 1962 :1967 :1968 :1971 :
pH Soak time = Hours Reference number = 129.07
Site A: 19 GLN AE1 5.82 ( 9.94) . . .
: 25 CYS SG 2.41 ( 4.70) d . .
: 26 TRP N 5.37 ( 6.21) . . .
: 134 LEU O 5.85 ( 7.31) . . T
: 136 ALA CB 5.73 ( 7.06) . . T
: 158 ASP OD1 5.95 ( 5.57) . . T
: 159 HIS NE2 3.76 ( 2.08) . . T
: 160 ALA O 3.47 ( 3.35) . . T
: 161 VAL N 5.04 ( 6.04) . . T
: 1 CYS I SG 3.22 ( 4.13) d . T
Site B: 155 ASN CG 5.27 ( 6.73) . . T
: 195 ASN CG 1.89 ( 3.66) . . T
: 196 SER O 5.08 ( 4.91) . . T
: 197 TYR CE2 5.63 ( 3.52) . . T
: 198 GLY O 3.22 ( 3.40) . . T
: 199 VAL CG1 5.85 ( 4.43) . . T
: 200 CYS N 5.47 ( 6.60) d . T
: 201 GLY N 5.42 ( 5.66) . . T
: 24 HOH O 5.87 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2PRK PROTEINASE K (TRITIRACNIUM ALBUM LIMBER)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM 2+ ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 1.000 M SODIUM NITRATE
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS
Addict & conc.: 0.010 M CALCIUM CHLORIDE
Comments :
Reference : BETZEL et.al. 1988 :PAHLER et.al. 1984 :
pH 6.5 Soak time = Hours Reference number = 289.02
Site 1: 69 HIS NE2 5.52 ( 5.63) . . T
: 71 THR C 5.96 ( 7.08) . . T
: 72 HIS NE2 4.52 ( 3.91) . . T
: 73 CYS SG 3.01 ( 3.32) . . T
: 74 ALA N 5.60 ( 6.97) . . T
: 76 THR OG1 4.81 ( 6.47) . . T
: 132 SER OG 6.00 ( 7.81) . . T
: 208 ILE CG2 5.98 ( 7.44) . . E
: 210 SER OG 5.69 ( 6.85) . . E
: 220 ILE CD1 4.37 ( 7.04) . . E
: 224 SER O 4.16 ( 5.61) . . T
: 225 MET SD 3.84 ( 4.20) . . T
: 228 PRO CD 5.63 ( 7.18) . . T
: 24 HOH O 2.06 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2SOD SUPEROXIDE DISMUSTASE (COPPER ZINC BOVINE)
|
Bound Ligands : CU COPPER ION: ZN ZINC ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 60.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.050 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : CO-XLN:HA ADDED TO P BEFORE XLN
Reference : TAINER et.al. 1982 :THOMAS et.al. 1974 :THOMAS JR. et.al. 1974 :
pH 7.5 Soak time = Hours Reference number = 46.03
Site 1: 5 VAL B O 4.41 ( 6.15) . . E
: 6 CYS B SG 3.92 ( 3.35) . . E
: 7 VAL B CG1 3.85 ( 3.70) . . E
: 8 LEU B N 5.22 ( 6.13) . . E
: 145 GLY B O 5.13 ( 4.22) . . E
: 146 VAL B O 2.60 ( 4.44) . . E
: 147 ILE B C 5.61 ( 5.09) . . E
: 148 GLY B N 5.21 ( 6.11) . . E
: 49 GLY G O 5.47 ( 7.20) . . .
: 50 ASP G C 5.87 ( 5.86) . . .
: 51 ASN G N 5.95 ( 6.50) . . .
: 146 VAL G CG1 5.48 ( 6.97) . . E
Site 2: 49 GLY B O 5.58 ( 7.82) . . .
: 50 ASP B OD1 3.04 ( 6.54) . . .
: 146 VAL B CG2 5.33 ( 6.95) . . E
: 5 VAL G O 4.51 ( 6.41) . . E
: 6 CYS G SG 3.51 ( 3.41) . . E
: 7 VAL G CG1 4.39 ( 3.92) . . E
: 8 LEU G CB 5.88 ( 5.73) . . E
: 144 CYS G O 5.85 ( 7.38) d . E
: 145 GLY G O 4.41 ( 3.74) . . E
: 146 VAL G CG1 5.13 ( 3.77) . . E
: 147 ILE G CG2 5.46 ( 4.80) . . E
: 148 GLY G N 5.36 ( 6.37) . . E
Site 3: 49 GLY O O 4.79 ( 7.13) . . .
: 51 ASN O ND2 4.52 ( 5.76) . . .
: 146 VAL O CG2 4.90 ( 7.09) . . E
: 5 VAL Y O 4.70 ( 6.42) . . E
: 6 CYS Y SG 4.34 ( 3.67) . . E
: 7 VAL Y CG1 2.63 ( 3.51) . . E
: 8 LEU Y N 5.10 ( 6.07) . . E
: 145 GLY Y O 5.39 ( 4.21) . . E
: 146 VAL Y CG1 5.86 ( 4.52) . . E
: 147 ILE Y C 5.70 ( 5.35) . . E
: 148 GLY Y N 5.55 ( 6.34) . . E
Site 4: 5 VAL O O 4.50 ( 6.20) . . E
: 6 CYS O SG 3.75 ( 3.21) . . E
: 7 VAL O CG1 2.71 ( 3.46) . . E
: 8 LEU O N 4.89 ( 5.84) . . E
: 144 CYS O O 5.89 ( 7.42) d . E
: 145 GLY O O 4.88 ( 4.05) . . E
: 146 VAL O O 2.69 ( 4.53) . . E
: 147 ILE O C 5.63 ( 5.11) . . E
: 148 GLY O N 5.43 ( 6.38) . . E
: 49 GLY Y O 5.41 ( 7.43) . . .
: 50 ASP Y OD1 2.41 ( 5.72) . . .
: 51 ASN Y ND2 5.16 ( 6.97) . . .
: 52 THR Y OG1 5.57 ( 6.99) . . .
: 146 VAL Y CG2 5.29 ( 7.44) . . E
Site 5: 44 HIS B NE2 5.84 ( 7.32) . s E
: 61 HIS B NE2 4.11 ( 4.99) . s .
: 68 LYS B O 5.75 ( 6.46) . . .
: 69 HIS B NE2 4.25 ( 3.95) . s .
: 70 GLY B O 5.83 ( 6.40) . . .
: 77 ARG B C 5.95 ( 6.33) . . .
: 78 HIS B NE2 3.76 ( 4.80) . s .
: 80 GLY B C 5.59 ( 5.96) . . E
: 81 ASP B OD1 2.57 ( 5.30) . s E
: 133 THR B O 5.96 ( 7.05) . . H
: 134 LYS B O 3.19 ( 5.37) . . H
: 135 THR B O 4.25 ( 4.84) . . H
: 136 GLY B N 5.73 ( 6.18) . . .
: 2 ZN BZN 0.58 (-1.00) . . .
: 3 HOH B O 5.97 (-1.00) . . .
: 66 SER Y OG 5.79 ( 7.33) . . .
Site 6: 44 HIS G NE2 5.15 ( 7.01) . s E
: 61 HIS G NE2 3.82 ( 4.78) . s .
: 68 LYS G O 5.04 ( 7.14) . . .
: 69 HIS G NE2 4.33 ( 4.49) . s .
: 70 GLY G O 5.73 ( 6.59) . . .
: 78 HIS G NE2 4.29 ( 4.90) . s .
: 80 GLY G O 5.67 ( 5.61) . . E
: 81 ASP G OD1 2.18 ( 4.84) . s E
: 134 LYS G O 3.68 ( 5.37) . . H
: 135 THR G O 5.50 ( 5.07) . . H
: 136 GLY G N 5.55 ( 6.26) . . .
: 1 CU GCU 5.93 (-1.00) . . .
: 2 ZN GZN 0.36 (-1.00) . . .
Site 7: 44 HIS Y NE2 5.34 ( 7.16) . s E
: 60 PRO Y O 5.08 ( 7.12) . . .
: 61 HIS Y NE2 4.01 ( 4.77) . s .
: 68 LYS Y C 5.92 ( 6.98) . . .
: 69 HIS Y NE2 4.39 ( 4.29) . s .
: 70 GLY Y O 5.84 ( 6.43) . . .
: 78 HIS Y NE2 3.85 ( 5.14) . s .
: 80 GLY Y O 5.97 ( 5.86) . . E
: 81 ASP Y OD1 2.65 ( 5.24) . s E
: 134 LYS Y O 3.32 ( 5.15) . . H
: 135 THR Y O 4.65 ( 4.75) . . H
: 136 GLY Y N 5.42 ( 6.04) . . .
: 1 CU YCU 5.84 (-1.00) . . .
: 2 ZN YZN 0.64 (-1.00) . . .
: 3 HOH Y O 5.71 (-1.00) . . .
Site 8: 44 HIS O NE2 5.29 ( 7.27) . s E [Het: CUCU - CB 3.20]
: 61 HIS O NE2 4.10 ( 5.06) . s . [Het: CUCU - CD2 3.10]
: 68 LYS O O 5.31 ( 6.58) . . .
: 69 HIS O NE2 4.30 ( 4.05) . s . [Het: ZNZN - CA 4.10]
: 70 GLY O O 5.39 ( 6.18) . . .
: 78 HIS O NE2 3.91 ( 5.02) . s . [Het: ZNZN - CB 3.30]
: 80 GLY O O 5.62 ( 6.24) . . E
: 81 ASP O OD1 2.23 ( 5.56) . s E [Het: ZNZN - CB 3.90]
: 134 LYS O NZ 4.26 ( 5.07) . . .
: 135 THR O OG1 5.83 ( 4.72) . . .
: 136 GLY O N 5.70 ( 6.06) . . .
: 2 ZN OZN 0.33 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2TAA TAKA-AMYLASE
|
Bound Ligands : CA BOUND CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.: 3.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS/HCL
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MATSUURA et.al. 1979 :
pH 7.2 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 88.00
Site 1: 155 TYR A OH 4.61 ( 9.39) . . .
: 166 LEU A CD1 5.03 ( 7.98) . . E
: 209 LYS A NZ 3.60 ( 7.24) . . .
: 210 HIS A NE2 2.21 ( 6.64) . . .
: 231 VAL A CG2 4.78 ( 6.72) . . E
: 232 LEU A CD1 5.99 ( 6.65) . . .
Site 3: 148 PRO A O 4.62 ( 6.54) . . .
: 149 PHE A CE1 5.65 ( 3.99) . . .
: 150 CYS A SG 4.06 ( 3.40) d . .
: 151 PHE A O 5.95 ( 4.65) . . .
: 152 ILE A CD1 5.88 ( 5.91) . . .
: 163 ASP A O 5.20 ( 7.09) . . .
: 164 CYS A SG 4.37 ( 3.46) d . .
: 165 TRP A NE1 4.31 ( 1.80) . . .
: 166 LEU A N 4.15 ( 5.54) . . .
: 175 ASP A CB 5.56 ( 6.70) . . .
Site 4: 203 LEU A CD2 5.91 ( 6.91) . . E
: 216 TRP A O 5.89 ( 7.94) . . H
: 219 TYR A O 5.07 ( 6.63) . . H
: 220 ASN A CG 2.60 ( 2.97) . . H
: 221 LYS A N 4.53 ( 5.49) . . H
: 223 ALA A O 4.29 ( 6.49) . . .
: 224 GLY A O 3.78 ( 5.71) . . .
: 225 VAL A O 4.84 ( 5.99) . . .
: 226 TYR A O 4.60 ( 4.32) . . E
: 227 CYS A SG 2.14 ( 3.78) . . E
: 228 ILE A N 5.94 ( 7.27) . . E
: 246 MET A O 3.42 ( 5.24) . . .
: 247 ASP A OD1 2.94 ( 5.64) . . .
: 434 THR A OG1 5.09 ( 7.30) . . .
: 439 CYS A SG 5.68 ( 7.41) d . .
: 468 LEU A CD1 5.16 ( 7.09) . . .
: 471 SER A O 5.71 ( 7.49) . . .
: 472 LYS A O 4.96 ( 6.95) . . .
: 473 ILE A CG1 6.00 ( 5.66) . . .
: 474 CYS A SG 4.58 ( 3.82) d . .
: 475 SER A OG 5.64 ( 3.88) . . .
: 476 ASP A CB 4.52 ( 4.58) . . .
Site 5: 254 ILE A CD1 5.03 ( 5.67) . . .
: 255 TYR A O 5.91 ( 5.75) . . .
: 257 PRO A C 5.76 ( 6.74) . . .
: 258 LEU A CD1 1.87 ( 3.96) . . .
: 262 PHE A CE2 4.42 ( 8.25) . . .
: 272 LEU A CD1 3.65 ( 6.94) . . .
: 314 VAL A O 5.69 ( 6.22) . . .
: 317 PHE A CE1 2.16 ( 6.17) . . .
: 318 ILE A N 5.66 ( 5.82) . . .
: 321 ASN A CG 5.92 ( 7.79) . . .
Site 6: 426 SER A O 5.75 ( 5.38) . . .
: 427 TYR A O 2.26 ( 4.39) . . .
: 428 THR A O 5.42 ( 4.25) . . .
: 429 ALA A CB 4.45 ( 4.39) . . .
: 444 VAL A O 5.09 ( 7.30) . . .
: 447 ASP A O 5.12 ( 6.91) . . .
: 448 GLY A O 4.82 ( 3.92) . . .
: 449 ASN A N 5.91 ( 7.16) . . .
: 181 ASP A O 5.92 ( 7.91) . . .
: 182 VAL A O 5.55 ( 7.54) . . .
: 183 VAL A O 3.83 ( 5.70) . . .
: 184 LYS A CD 5.71 ( 2.56) . . .
: 185 ASN A CG 5.54 ( 3.16) . . .
: 186 GLU A CG 5.99 ( 4.49) . . .
: 187 TRP A CG 5.62 ( 4.17) . . .
: 188 TYR A OH 4.70 ( 3.09) . . .
: 189 ASP A N 4.85 ( 6.31) . . .
: 215 PHE A CE2 5.12 ( 7.04) . . .
: 218 GLY A C 5.99 ( 6.43) . . .
: 219 TYR A CE2 5.55 ( 6.00) . . .
| PROTEIN: 3TLN THERMOLYSIN (NATIVE)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM(II) ION: ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 0.030 M LITHIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 0.010 M TRIS/ACETATE
Addict & conc.: 5.000 % DMSO/CALCIUM ACETATE
Comments : APOENZYME:PRESOAKED XL'S IN EDTA AND 1,10 PHENANTH
Reference : COLMAN et.al. 1972a:1972b:MATTHEWS et.al. 1974 :1972a:1972b:WEAVER et.al. 1974 :
pH 6.0 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 139.08
Site 1: 113 ALA O 5.97 ( 8.07) . . E
: 142 HIS NE2 2.39 ( 6.42) . . H [Het: ZNZN - CD2 3.00]
: 143 GLU OE1 4.00 ( 6.09) . . H
: 146 HIS NE2 2.32 ( 6.87) . . H [Het: ZNZN - ND1 4.10]
: 157 TYR OH 3.66 ( 9.47) . . T [Het: ZNZN - OH 3.80]
: 166 GLU OE1 2.31 ( 5.34) . . H [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 169 SER OG 5.29 ( 6.52) . . H
: 203 ARG NH2 5.49 (11.81) . . T
: 231 HIS NE2 4.02 ( 7.58) . . T
: 5 ZN ZN 0.57 (-1.00) . . .
: 362 HOH O 4.18 (-1.00) . . .
: 363 HOH O 4.60 (-1.00) . . .
: 364 HOH O 4.08 (-1.00) . . .
: 392 HOH O 1.34 (-1.00) . . .
: 394 HOH O 4.28 (-1.00) . . .
Site 2: 112 ASN OD1 5.83 ( 8.81) . . E
: 113 ALA O 5.80 ( 8.17) . . E
: 142 HIS NE2 4.90 ( 9.04) . . H [Het: ZNZN - CD2 3.00]
: 143 GLU OE1 5.48 ( 8.27) . . H
: 146 HIS NE2 4.40 ( 8.82) . . H [Het: ZNZN - ND1 4.10]
: 157 TYR OH 2.13 ( 8.58) . . T [Het: ZNZN - OH 3.80]
: 166 GLU OE1 2.99 ( 6.58) . . H [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 230 VAL CG1 5.48 ( 7.51) . . T
: 231 HIS NE2 2.44 ( 6.73) . . T
: 5 ZN ZN 3.10 (-1.00) . . .
: 362 HOH O 4.32 (-1.00) . . .
: 363 HOH O 4.53 (-1.00) . . .
: 364 HOH O 4.29 (-1.00) . . .
: 387 HOH O 5.61 (-1.00) . . .
: 392 HOH O 1.68 (-1.00) . . .
: 394 HOH O 2.47 (-1.00) . . .
: 402 HOH O 4.40 (-1.00) . . .
: 456 HOH O 5.89 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4CPA CARBOXYPEPTIDASE A/POTATO INHIBITOR
|
Bound Ligands : ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 4.000 % PEG 6000
Buffer & conc.: 0.010 M TRIS/HCL
Addict & conc.: 0.120 M LITHIUM CHLORIDE
Comments :
Reference : LIPSCOMB et.al. 1980 :
pH 7.5 Soak time = 576.00 Hours Reference number = 94.00
Site 1: 65 ASP OD1 5.86 ( 6.42) . . E
: 66 LEU CD1 5.25 ( 2.63) . . E
: 67 GLY O 4.95 ( 2.57) . . T
: 68 ILE N 4.60 ( 6.08) . . T
: 69 HIS O 5.68 ( 6.73) . . T [Het: ZNZN - CG 3.40]
: 72 GLU O 4.85 ( 6.67) . . H [Het: ZNZN - CD 2.60]
: 73 TRP O 5.97 ( 6.69) . . H
: 74 ILE C 5.90 ( 6.96) . . H
: 75 THR OG1 1.97 ( 3.65) . . H
: 76 GLN OE1 4.28 ( 4.17) . . H
: 108 GLU O 5.48 ( 7.90) . . E
: 109 ILE O 3.91 ( 5.50) . . E
: 110 VAL N 5.69 ( 5.86) . . T
: 195 ILE O 4.23 ( 5.75) . . E
: 196 HIS N 5.90 ( 6.14) . . E [Het: ZNZN - CB 3.70]
: 238 TYR O 5.60 ( 8.80) . . T
: 239 LYS NZ 3.32 ( 4.95) . . E
Site 2: 70 SER O 3.24 ( 4.79) . . T
: 71 ARG C 5.80 ( 5.90) . . T
: 72 GLU O 5.56 ( 6.31) . . H [Het: ZNZN - CD 2.60]
: 73 TRP NE1 3.34 ( 4.13) . . H
: 76 GLN OE1 2.74 ( 5.50) . . H
: 110 VAL CG1 5.82 ( 7.06) . . T
: 116 PHE CE1 3.67 ( 4.42) . . H
: 119 THR OG1 4.48 ( 6.95) . . H
: 120 HIS NE2 5.49 ( 8.04) . . H
: 199 SER O 4.62 ( 6.91) . . T
: 200 GLN O 5.26 ( 7.95) . . E
: 231 LYS NZ 4.44 (11.87) . . H
: 237 SER OG 1.94 ( 4.10) . . T
: 238 TYR O 4.35 ( 5.07) . . T
: 239 LYS CD 4.36 ( 5.87) . . E
: 274 THR OG1 5.52 ( 5.63) . . T
Site 3: 231 LYS A NZ 2.57 ( 6.78) . . T
: 235 GLY A O 4.32 ( 6.31) . . T
: 236 THR A O 4.76 ( 5.41) . . T
: 237 SER A OG 2.25 ( 2.68) . . T
: 238 TYR A O 5.46 ( 5.75) . . T
: 7 ILE CG2 5.94 ( 7.43) . . T
: 9 ASN O 5.84 ( 8.53) . . T
: 10 LYS NZ 3.61 ( 3.88) . . T
: 11 PRO O 5.29 ( 5.21) . . T
: 12 CYS N 5.89 ( 6.60) d . T
: 17 ASP O 4.64 ( 6.90) . . T
: 19 SER OG 2.64 ( 5.78) . . T
: 2 ARG NH1 5.97 (13.75) . . .
Site 4: 231 LYS A NZ 5.31 (10.00) . . T
: 16 ASP O 3.64 ( 5.55) . . T
: 17 ASP O 4.70 ( 5.19) . . T
: 18 CYS O 5.52 ( 4.17) d . T
: 19 SER OG 3.62 ( 2.22) . . T
: 20 GLY N 5.90 ( 8.13) . . T
| PROTEIN: 4PTP TRYPSIN (DIP INHIBITED)
|
Bound Ligands : DIP DERIVATIVE OF SER 195 - SEE REMARK 9: CA CALCIUM (II) ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M MAGNESIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M CACADYLIC ACID
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : STROUD et.al. 1974 :1972 :
pH 6.8 Soak time = Hours Reference number = 106.04
Site 1: 396 HOH O 5.34 (-1.00) . . .
: 304 HOH O 4.60 (-1.00) . . .
: 312 HOH O 2.79 (-1.00) . . .
Site 2: 100 ASN OD1 5.76 ( 8.47) . . T
: 177 THR OG1 5.35 ( 6.08) . . T
: 178 SER OG 1.81 ( 3.40) . . T
: 179 ASN OD1 2.38 ( 3.74) . . E
: 180 MET N 5.78 ( 7.24) . . E
: 233 ASN OD1 5.13 ( 6.39) . . T
: 234 TYR OH 5.81 ( 9.00) . . T
: 248 HOH O 5.48 (-1.00) . . .
: 279 HOH O 2.18 (-1.00) . . .
: 288 HOH O 5.00 (-1.00) . . .
: 297 HOH O 5.66 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 5CPA CARBOXYPEPTIDASE A/WATER (BOVINE)
|
Bound Ligands : ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 0.800 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.200 M LITHIUM CHLORIDE/TRIS
Addict & conc.:
Comments : CPA PREP : DELTA
Reference : HARTSUCK et.al. 1965 :LIPSCOMB et.al. 1966 :1971 :1973 :REES et.al. 1981 :1983 :
pH 7.5 Soak time = 3360.00 Hours Reference number = 228.02
Site 1: 69 HIS NE2 4.35 ( 5.57) . . T [Het: ZNZN - CB 3.40]
: 72 GLU OE1 2.37 ( 7.02) . . T [Het: ZNZN - CD 2.60]
: 127 ARG NH2 3.99 ( 7.98) . . T
: 196 HIS NE2 4.82 ( 4.88) . . E [Het: ZNZN - CB 3.40]
: 197 SER O 3.78 ( 5.55) . . T [Het: ZNZN - O 4.00]
: 198 TYR N 5.74 ( 7.03) . . T
: 270 GLU OE1 3.61 ( 7.07) . . E
: 279 PHE CE1 5.71 ( 9.56) . . T
: 308 ZN ZN 1.15 (-1.00) . . .
: 560A HOH O 5.46 (-1.00) . . .
: 567A HOH O 2.47 (-1.00) . . .
: 571A HOH O 1.22 (-1.00) . . .
: 587A HOH O 3.69 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 6LDH LACTATE DEHYDROGENASE
|
Bound Ligands : SO4 SULFATE GROUP:
Hev Atom conc.: 0.038 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments : APO-ENZYME
Reference : ADAMS et.al. 1969 :1970 :WHITE et.al. 1976 :
pH Soak time = 36.00 Hours Reference number = 218.05
Site 1: 179 GLY O 2.87 ( 4.81) . . T
: 180 VAL C 5.72 ( 5.15) . . T
: 181 HIS N 5.93 ( 6.93) . . T
: 347 HOH O 5.04 (-1.00) . . .
: 348 HOH O 4.18 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 1.95 (-1.00) . . .
: 552 HOH O 3.59 (-1.00) . . .
: 645 HOH O 5.12 (-1.00) . . .
: 264 LEU O 5.60 ( 6.86) . . T
: 265 CYS SG 1.86 ( 4.25) . . E
: 291 VAL CG1 4.25 ( 6.73) . . E
: 292 LEU O 5.77 ( 7.09) . . E
: 293 ASN OD1 4.54 ( 6.32) . . T
: 298 SER OG 4.38 ( 6.45) . . T
: 299 ASN ND2 5.77 ( 7.90) . . E
: 18 ARG NH1 5.65 ( 9.88) . . T
: 369 HOH O 5.44 (-1.00) . . .
Site 2: 140 VAL CG1 5.50 ( 7.96) . . H
: 141 ASP OD1 5.95 ( 8.51) . . H
: 162 GLY O 3.04 ( 4.55) . . T
: 163 CYS SG 2.64 ( 3.01) . . T
: 164 ASN N 5.18 ( 6.50) . . H
: 166 ASP OD1 4.66 ( 5.59) . . H [Het: SO4 O3 - OD1 3.70]
: 189 VAL CG1 5.33 ( 7.10) . . E
: 191 GLY O 5.19 ( 6.90) . . E
: 192 GLU O 5.02 ( 5.84) . . E
: 193 HIS NE2 4.44 ( 2.70) . . T [Het: SO4 S - CE1 4.00]
: 194 GLY N 3.78 ( 5.12) . . T
: 197 VAL CG1 3.85 ( 6.14) . . E
: 287 SER OG 4.91 ( 6.97) . . E
: 340 HOH O 4.03 (-1.00) . . .
: 474 HOH O 5.13 (-1.00) . . .
: 553 HOH O 4.87 (-1.00) . . .
: 658 HOH O 5.85 (-1.00) . . .