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ANALYSIS FOR MERCURY (II) CYANIDE [HDM]
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Formula : HG1,C2,N2
Solution chemistry: HG1,[C1,N1]2 -0
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 2LHB HAEMOGLOBIN V (CYANO, MET, SEA LAMPREY) (PETROMYZO
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX,HAS FE3+ WITH CN BOUN:
Hev Atom conc.: 0.500 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 2.800 M POTASSIUM PHOSPHATE (DRABKIN'S BUFFER)
Addict & conc.: 0.000 M SODIUM CYANIDE
Comments :
Reference : HENDRICKSON et.al. 1973 :
pH 6.8 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 126.00
Site 1: 100 ASN OD1 2.87 ( 4.89) . . H
: 197 HOH O 4.74 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 1.53 (-1.00) . . .
: 218 HOH O 5.67 (-1.00) . . .
: 239 HOH O 3.68 (-1.00) . . .
: 250 HOH O 2.16 (-1.00) . . .
: 271 HOH O 4.08 (-1.00) . . .
: 1 PRO CB 5.04 ( 4.49) . . .
: 2 ILE N 5.61 ( 6.83) . . .
: 121 ALA CB 5.81 ( 6.32) . . H
: 130 GLY N 4.97 ( 4.99) . . T
: 135 GLU OE1 4.39 ( 7.26) . . H
: 169 HOH O 3.03 (-1.00) . . .
: 176 HOH O 3.38 (-1.00) . . .
: 188 HOH O 5.76 (-1.00) . . .
: 261 HOH O 3.69 (-1.00) . . .
: 267 HOH O 3.74 (-1.00) . . .
: 276 HOH O 5.29 (-1.00) . . .
Site 2: 103 GLY O 5.36 ( 4.52) . . H
: 107 LYS NZ A 4.52 ( 7.23) . . H
: 148 ALA CB 5.50 ( 6.51) . . H
: 197 HOH O 2.81 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 5.78 (-1.00) . . .
: 233 HOH O 5.74 (-1.00) . . .
: 271 HOH O 5.74 (-1.00) . . .
: 299 HOH O 3.17 (-1.00) . . .
: 360 HOH O 4.65 (-1.00) . . .
: 226 HOH O 5.50 (-1.00) . . .
: 246 HOH O 3.24 (-1.00) . . .
: 259 HOH O 4.94 (-1.00) . . .
: 1 PRO CD 5.75 ( 5.27) . . .
: 171 HOH O 5.11 (-1.00) . . .
: 261 HOH O 4.83 (-1.00) . . .
: 10 PRO CD 5.29 ( 6.59) . . .
Site 3: 107 LYS NZ A 5.99 ( 9.71) . . H
: 197 HOH O 4.16 (-1.00) . . .
: 271 HOH O 5.55 (-1.00) . . .
: 299 HOH O 3.13 (-1.00) . . .
: 50 GLU CG 5.97 ( 8.31) . . 5
: 221 HOH O 5.59 (-1.00) . . .
: 226 HOH O 3.04 (-1.00) . . .
: 234 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 242 HOH O 5.16 (-1.00) . . .
: 246 HOH O 2.71 (-1.00) . . .
: 259 HOH O 3.34 (-1.00) . . .
: 1 PRO CD 3.62 ( 3.57) . . .
: 2 ILE O 5.50 ( 6.08) . . .
: 171 HOH O 4.04 (-1.00) . . .
: 261 HOH O 4.48 (-1.00) . . .
: 10 PRO CG 4.96 ( 7.11) . . .
: 315 HOH O 4.93 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2MHR MYOHEMERYTHRIN
|
Bound Ligands : FEO IRON CENTER: AZI AZIDE ION, N3 -: SO4 SULFATE ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 80.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : HENDRICKSON et.al. 1975 :SHERIFF et.al. 1987 :
pH 6.7 Soak time = Hours Reference number = 67.00
Site 1: 32 ILE CD1 5.80 ( 6.20) . . T
: 35 CYS SG 5.89 ( 7.29) . . T
: 44 LEU CD1 5.35 ( 7.35) . . T
: 47 LEU CD2 4.16 ( 7.94) . . T
: 84 ILE CG2 4.91 ( 6.39) . . T
: 87 LEU CD1 4.15 ( 7.83) . . T [Het: SO4 S - CD2 3.70]
: 91 VAL CG1 4.36 ( 6.59) . . T [Het: SO4 O2 - CA 3.70]
: 95 ASN O 3.58 ( 5.43) . . T [Het: SO4 S - ND2 3.90]
: 96 VAL CG1 5.43 ( 4.05) . . T
: 99 CYS SG 2.37 ( 4.43) . . T
: 100 LYS N 5.77 ( 6.99) . . T [Het: SO4 O1 - NZ 3.80]
Site 2: 32 ILE O 5.44 ( 6.87) . . T
: 34 ASP O 5.68 ( 7.04) . . T
: 35 CYS SG 4.33 ( 3.34) . . T
: 36 ILE CG1 5.37 ( 4.27) . . T [Het: SO4 O1 - CG2 4.20]
: 37 ARG N 5.83 ( 6.92) . . T
: 38 ASP O 5.11 ( 6.23) . . T
: 39 ASN OD1 2.63 ( 3.73) . . T
: 40 SER N 5.41 ( 6.72) . . T
: 90 PRO C 5.97 ( 6.12) . . T
: 91 VAL CG1 5.28 ( 5.10) . . T [Het: SO4 O2 - CA 3.70]
: 96 VAL CG1 5.03 ( 5.95) . . T
: 139 HOH O 3.44 (-1.00) . . .
: 175 HOH O 5.56 (-1.00) . . .
: 153 HOH O 3.42 (-1.00) . . .
: 255 HOH O 5.72 (-1.00) . . .
: 286 HOH O 4.82 (-1.00) . . .
: 68 SER OG 5.98 ( 7.80) . . T