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ANALYSIS FOR MERCURY (II) BROMIDE [HDK]
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Formula : HG1,BR2
Solution chemistry: HG1,BR2 -0
All distances below are to the element AU [ gold ]
PROTEIN: 1CHG CHYMOTRYPSINOGEN
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Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 10.000 % ETHANOL/WATER
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M DIPHENYLCARBAMYL FLUORIDE/METHANOL
Comments :
Reference : FREER et.al. 1970 :KRAUT et.al. 1962 :
pH 6.3 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 140.00
Site 4: 49 GLU OE1 5.20 ( 9.46) . . E
PROTEIN: 1FC2 IMMUNOGLOBULIN FC - FRAGMENT B COMPLEX
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Bound Ligands : NAG N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE: FUC FUCOSE: MAN ALPHA-D-MANNOSE: GAL D-GALACTOSE: SO4 SULFATE:
Hev Atom conc.: 1.400 mM
Precip & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.200 M ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : DEISENHOFER et.al. 1978 :
pH 4.1 Soak time = Hours Reference number = 242.01
Site 1: 124 PHE C CE1 5.84 ( 5.38) . . .
: 248 LYS D NZ 4.69 ( 7.21) . . .
: 252 MET D SD 3.42 ( 7.39) . . .
: 380 GLU D OE1 4.80 ( 7.65) . . E
: 426 SER D O 5.93 ( 6.91) . . E
: 428 MET D SD 2.43 ( 6.07) . . E
: 436 TYR D OH 5.47 ( 6.43) . . E
Site 2: 358 MET D SD 1.91 ( 5.14) . . .
: 414 LYS D CE 5.98 ( 7.40) . . .
: 417 TRP D NE1 5.38 ( 7.60) . . .
: 418 GLN D OE1 3.48 ( 5.82) . . .
: 443 LEU D CD1 5.57 ( 8.48) . . E
PROTEIN: 2FB4 IMMUNOGLOBULIN FAB (LAMBDA) KOL
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Hev Atom conc.: 5.700 mM
Precip & conc.: 1.500 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MATSUSHIMA et.al. 1978 :
pH 8.0 Soak time = Hours Reference number = 84.00
Site 1: 152 ALA L CB 4.98 ( 6.42) . . .
: 186 GLN L NE2 5.91 ( 6.09) . . .
: 189 SER L OG 5.36 ( 7.39) . . .
: 190 HIS L NE2 2.60 ( 6.99) . . .
: 193 TYR L OH 4.92 ( 9.89) . . .
Site 2: 152 ALA L CB 4.63 ( 6.16) . . .
: 157 VAL L CG1 5.44 ( 5.70) . . .
: 182 LEU L CD2 5.16 ( 7.18) . . .
: 186 GLN L OE1 5.77 ( 5.26) . . .
: 189 SER L OG 5.97 ( 7.96) . . .
: 190 HIS L NE2 3.82 ( 7.53) . . .
: 193 TYR L OH 3.38 ( 8.86) . . .
Site 3: 49 ARG L NH1 2.84 ( 7.93) . . .
: 101A HIS H ND1 4.70 ( 7.51) . . .
: 104A SER H OG 4.36 ( 6.13) . . .
: 104C PHE H CD2 5.33 ( 6.18) . . .
: 24 HOH H O 5.22 (-1.00) . . .
: 213 CYS L O 4.69 ( 6.49) d . .
: 214 SER L OG 4.61 ( 3.06) . . .
Site 4: 49 ARG L NH1 5.23 (10.81) . . .
: 101 GLY H C 5.68 ( 5.48) . . .
: 101A HIS H NE2 3.21 ( 5.52) . . .
: 104A SER H OG 5.23 ( 7.49) . . .
: 211 THR L OG1 5.93 ( 4.85) . . .
: 213 CYS L O 5.63 ( 6.51) d . .
: 214 SER L OG 3.43 ( 2.88) . . .
Site 5: 49 ARG L NH1 4.01 ( 8.59) . . .
: 100 GLY H O 5.05 ( 6.82) . . .
: 101 GLY H C 5.54 ( 4.63) . . .
: 101A HIS H NE2 4.73 ( 6.61) . . .
: 104A SER H OG 5.99 ( 8.14) . . .
: 104C PHE H CE2 4.30 ( 6.05) . . .
: 214 SER L OG 5.93 ( 5.00) . . .
Site 6: 49 ARG L NH1 5.83 (11.69) . . .
: 101A HIS H NE2 2.70 ( 6.71) . . .
: 191 ARG L NH2 5.50 ( 8.13) . . .
: 211 THR L CG2 5.30 ( 6.41) . . .
: 214 SER L OG 4.87 ( 5.37) . . .
Site 7: 94 LEU L O 4.50 ( 6.73) . . .
: 95 ASN L OD1 5.42 ( 5.01) . . .
: 20 HOH L O 2.71 (-1.00) . . .
: 58 GLN H O 4.73 ( 6.85) . . .
: 59 HIS H NE2 4.48 ( 3.91) . . .
: 60 TYR H O 4.91 ( 5.55) . . .
: 65 LYS H NZ 4.82 ( 8.83) . . .
: 20 HOH H O 2.54 (-1.00) . . .
Site 8: 38 LEU L CD2 4.74 ( 6.81) . . .
: 41 MET L SD 2.41 ( 5.41) . . .
: 16 HOH L O 5.65 (-1.00) . . .
: 17 ARG L NE 5.80 ( 6.13) . . .
: 75 GLY L O 4.31 ( 4.25) . . .
: 76 GLY L N 4.93 ( 5.70) . . .
: 11 HOH L O 5.88 (-1.00) . . .
Site 9: 60 ARG L NH1 4.87 ( 7.42) . . .
: 78 GLN L OE1 4.02 ( 8.62) . . .
: 19 HOH L O 4.05 (-1.00) . . .
: 5 THR L CG2 5.59 ( 7.47) . . .
: 7 PRO L CD 5.39 ( 5.71) . . .
: 21 SER L OG 4.51 ( 6.84) . . .
: 23 SER L CB 6.00 ( 7.20) . . .
: 15 HOH L O 3.75 (-1.00) . . .
Site A: 139 SER L OG 5.62 ( 6.59) . . .
: 140 ASP L OD1 5.77 ( 7.33) . . .
: 169 GLN L OE1 3.78 ( 6.29) . . .
: 171 ASN L OD1 5.85 ( 7.94) . . .
: 175 ALA L CB 5.27 ( 6.63) . . .
: 168 VAL H O 5.83 ( 7.85) . . .
: 169 HIS H NE2 1.95 ( 4.72) . . .
: 170 THR H O 5.27 ( 6.41) . . .
: 171 PHE H CE2 5.69 ( 6.43) . . .
PROTEIN: 4APE ACID PROTEINASE (ENDOTHIA PARASITICA)
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Hev Atom conc.: 0.000 mM
Precip & conc.: 2.700 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : JENKINS et.al. 1975 :1979 :
pH 4.5 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 72.07
Site 1: 213 ILE O 5.38 ( 7.27) . . E
: 218 THR OG1 5.74 ( 6.40) . . T
: 220 LEU O 3.10 ( 5.30) . . E
: 221 LEU CD1 4.10 ( 3.40) . . E
: 222 TYR CE2 4.58 ( 3.63) . . E
: 223 LEU N 5.60 ( 6.64) . . E
: 300 ASN O 5.34 ( 5.74) . . E
: 301 ILE CD1 4.84 ( 2.75) . . E
: 302 PHE CD2 5.37 ( 3.34) . . E
: 303 GLY O 5.55 ( 3.98) . . H
Site 2: -2 SER OG 2.64 ( 4.02) . . .
: -1 THR OG1 4.97 ( 4.64) . . E
: 0 GLY N 5.43 ( 5.80) . . E
: 93 GLY O 3.55 ( 5.51) . . T
: 94 LEU CD1 5.27 ( 4.97) . . E
: 18 HOH O 5.72 (-1.00) . . .
: 142 HOH O 3.80 (-1.00) . . .
: 143 HOH O 3.34 (-1.00) . . .
: 225 HOH O 4.15 (-1.00) . . .
: 296 HOH O 5.36 (-1.00) . . .
: 298 HOH O 2.57 (-1.00) . . .
: 299 HOH O 5.54 (-1.00) . . .
: 118 HOH O 5.76 (-1.00) . . .
PROTEIN: 4PTP TRYPSIN (DIP INHIBITED)
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Bound Ligands : DIP DERIVATIVE OF SER 195 - SEE REMARK 9: CA CALCIUM (II) ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M MAGNESIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M CACADYLIC ACID
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : STROUD et.al. 1974 :1972 :
pH 6.8 Soak time = Hours Reference number = 106.03
Site 1: 61 SER O 5.48 ( 6.98) . . T
: 62 GLY O 3.67 ( 3.67) . . T
: 63 ILE N 5.36 ( 6.28) . . E
: 304 HOH O 0.62 (-1.00) . . .
: 312 HOH O 3.86 (-1.00) . . .
: 320 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 351 HOH O 5.85 (-1.00) . . .
: 365 HOH O 4.28 (-1.00) . . .
: 397 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
: 411 HOH O 5.90 (-1.00) . . .
Site 2: 177 THR C 5.62 ( 6.70) . . T
: 178 SER OG 2.05 ( 3.54) . . T
: 179 ASN OD1 2.99 ( 4.29) . . E
: 230 LYS CD 5.93 ( 7.91) . . E
: 233 ASN OD1 4.53 ( 6.08) . . T
: 279 HOH O 1.66 (-1.00) . . .
: 288 HOH O 5.48 (-1.00) . . .
: 297 HOH O 5.12 (-1.00) . . .
PROTEIN: 5CPV CALCIUM BINDING PARVALBUMIN SET 6A
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Bound Ligands : CA CALCIUM(II) ION:
Hev Atom conc.: 1.200 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 4.000 M PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : KRETSINGER et.al. 1975a:1975b:MARCHETTII et.al. 1985 :NOCKOLDS et.al. 1973 :SOWADSKI et.al. 1978 :
pH 6.8 Soak time = 96.00 Hours Reference number = 120.01
Site 1: 27 LYS NZ 4.55 ( 5.14) . . H
: 28 ALA O 4.14 ( 4.17) . . H
: 29 PHE N 5.63 ( 6.44) . . H
: 30 PHE O 5.88 ( 5.96) . . H
: 31 ALA O 5.08 ( 3.21) . . H
: 32 LYS N 4.49 ( 5.75) . . H
: 36 THR OG1 5.84 ( 7.61) . . T
: 125 HOH O 5.82 (-1.00) . . .
: 137 HOH O 5.93 (-1.00) . . .
: 165 HOH O 3.41 (-1.00) . . .
: 17 ALA O 5.64 ( 7.62) . . T
: 20 ALA O 5.67 ( 4.48) . . T
: 23 SER OG 5.12 ( 6.02) . . T
: 112 HOH O 3.40 (-1.00) . . .
: 159 HOH O 4.88 (-1.00) . . .
Site 2: 27 LYS NZ 4.28 ( 9.00) . . H
: 75 ARG CD 5.25 ( 5.12) . . T
: 129 HOH O 4.37 (-1.00) . . .
: 135 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
: 164 HOH O 5.00 (-1.00) . . .
: 185 HOH O 2.09 (-1.00) . . .
: 19 LYS O 4.49 ( 5.99) . . T
: 20 ALA O 5.32 ( 3.21) . . T
: 21 ALA O 5.87 ( 5.21) . . T
: 112 HOH O 5.95 (-1.00) . . .