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ANALYSIS FOR POTASSIUM TETRACYANO MERCURATE (II) [HDJ]
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Formula : K2,HG1,C4,N4
Solution chemistry: HG1,[C1,N1]4 -2
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 1GOX GLYCOLATE OXIDASE (SPINACH)
|
Bound Ligands : FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE PROSTHETIC GROUP:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS/HCL
Addict & conc.:
Comments : 4C
Reference : BRANDEN et.al. 1980 :LINDQVIST et.al. 1988 :
pH 8.3 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 175.00
Site 1: 50 ARG CG 5.53 ( 6.85) . . .
: 53 ILE CD1 5.77 ( 8.78) . . .
: 295 PHE CZ 5.93 (10.73) . . H
: 341 SER O 4.27 ( 6.19) . . H
: 342 GLY O 3.06 ( 4.70) . . .
: 343 CYS SG 2.42 ( 3.61) . . .
: 344 ARG N 5.28 ( 6.73) . . .
: 348 GLU OE1 4.96 ( 4.46) . . .
: 349 ILE CG1 5.94 ( 4.73) . . .
: 350 SER OG 5.92 ( 6.26) . . .
: 353 HIS NE2 2.64 ( 6.83) . . .
: 477 HOH O 2.25 (-1.00) . . .
: 617 HOH O 2.90 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2CPP CYTOCHROME P450 CAM (PSEUDOMONAS PUTIDA)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX GROUP CONTAINS FE+++: CAM CAMPHOR SUBSTRATE:
Hev Atom conc.: 7.840 mM
Precip & conc.: 40.000 % AMMONIUM SULPHATE/POTASSIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 0.050 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.001 M CAMPHOR (2-BORNANONE)
Comments : TEMP 20 C:HA CONC 3MG/ML
Reference : POULOS et.al. 1982 :1985 :1987 :
pH 7.0 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 213.01
Site 1: 10 ASN O 3.91 ( 5.22) . . .
: 11 LEU CD1 3.18 ( 5.34) . . .
: 25 ASP O 5.20 ( 6.19) . . T
: 26 PHE O 5.38 ( 6.41) . . T
: 27 ASP OD1 5.12 ( 4.86) . . T
: 56 THR OG1 5.65 ( 7.68) . . E
: 57 ARG O 5.37 ( 6.26) . . E
: 58 CYS SG 2.20 ( 3.55) . . E
: 59 ASN OD1 5.61 ( 6.17) . . T
: 638 HOH O 4.01 (-1.00) . . .
: 668 HOH O 3.03 (-1.00) . . .
: 704 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
Site 2: 85 CYS SG 3.02 ( 3.70) . . T
: 86 PRO CD 4.94 ( 4.02) . . T
: 87 PHE O 2.92 ( 4.37) . . T
: 88 ILE CD1 5.54 ( 5.09) . . T
: 89 PRO O 5.55 ( 6.64) . . H
: 90 ARG NH1 5.92 ( 5.10) . . H
: 93 GLY O 5.52 ( 4.32) . . H
: 94 GLU N 5.75 ( 6.87) . . H
: 298 GLY O 5.81 ( 6.22) . . E
: 299 ARG O 4.48 ( 5.41) . . E
: 300 ILE CD1 5.07 ( 5.31) . . E
: 317 GLN OE1 3.55 ( 4.98) . . E
: 318 ILE N 5.91 ( 7.07) . . E
: 640 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
: 647 HOH O 2.13 (-1.00) . . .
Site 3: 281 ILE O 5.18 ( 7.32) . . H
: 282 PRO CG 6.00 ( 4.28) . . H
: 283 ALA C 5.90 ( 5.93) . . H
: 284 ALA C 5.80 ( 6.73) . . H
: 285 CYS SG 2.58 ( 3.85) . . H
: 286 GLU OE1 4.87 ( 4.36) . . H
: 289 LEU CD1 4.60 ( 7.54) . . H
: 364 ARG NH1 5.56 ( 5.18) . . H
: 368 ILE CD1 3.99 ( 6.70) . . H
: 614 HOH O 1.71 (-1.00) . . .
Site 4: 21 HIS NE2 5.45 ( 9.76) . . T
: 309 GLY O 5.06 ( 6.65) . . T
: 667 HOH O 3.96 (-1.00) . . .
: 133 GLU O 4.89 ( 6.28) . . H
: 136 CYS SG 4.73 ( 3.97) . . H
: 137 SER OG 5.52 ( 3.90) . . H
: 140 GLU CG 4.94 ( 5.72) . . H
: 377 ARG NH2 5.15 (10.21) . . H
: 414 VAL O 5.69 ( 7.05) . . T
: 562 HOH O 1.77 (-1.00) . . .
: 589 HOH O 4.72 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3GRS GLUTATHIONE REDUCTASE (HUMAN)
|
Bound Ligands : FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE:
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: DIPOTASSIUM HYDROGEN PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : SCHULTZ et.al. 1981 :SCHULZ et.al. 1978 :
pH 7.0 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 76.03
Site 1: 200 VAL CG1 4.30 ( 6.48) . . .
: 222 VAL CG2 5.24 ( 7.76) . . .
: 223 LEU CD1 5.92 ( 8.72) . . .
: 233 ASN O 5.04 ( 6.82) . . .
: 234 CYS SG 2.08 ( 3.27) . . .
: 235 THR O 5.78 ( 5.16) . . .
: 237 GLU CG 5.37 ( 4.92) . . .
: 238 LEU CD1 3.91 ( 4.62) . . .
: 373 SER OG 4.53 ( 5.32) . . .
: 374 HIS O 4.90 ( 6.03) . . .
: 375 PRO O 5.46 ( 7.06) . . .
: 377 ILE CD1 5.12 ( 8.05) . . .
: 436 GLN OE1 4.72 ( 8.50) . . .
: 73 HOH O 4.83 (-1.00) . . .
: 91 HOH O 1.48 (-1.00) . . .
: 92 HOH O 5.36 (-1.00) . . .
: 197 HOH O 3.85 (-1.00) . . .
: 517 HOH O 3.23 (-1.00) . . .
: 128 GLY O 5.91 ( 5.04) . . . [Het: FADAC2 - O 3.40]
: 129 HIS CE1 5.52 ( 3.00) . . . [Het: FADAC6 - ND1 3.80]
: 130 ALA O 5.51 ( 4.31) . . . [Het: FADAC6 - N 3.70]
: 141 GLU O 5.62 ( 7.64) . . .
: 142 VAL CG1 2.21 ( 2.96) . . .
: 143 SER OG 2.90 ( 4.77) . . .
: 145 LYS CE 5.49 ( 6.82) . . .
: 147 TYR CE2 5.86 ( 9.95) . . .
: 479 FAD AN6 5.74 (-1.00) . . .
: 101 HOH O 4.29 (-1.00) . . .
: 123 HOH O 3.41 (-1.00) . . .
: 227 HOH O 5.51 (-1.00) . . .
: 249 HOH O 3.57 (-1.00) . . .
Site 1: 325 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
Site 2: 376 PRO O 5.62 ( 7.48) . . .
: 403 PHE CZ 5.55 ( 9.04) . . .
: 416 LYS O 5.67 ( 7.62) . . .
: 417 CYS SG 2.70 ( 4.54) . . .
: 418 VAL O 5.49 ( 6.45) . . .
: 419 MET SD 5.79 ( 7.18) . . .
: 435 MET SD 5.57 ( 6.11) . . .
: 436 GLN O 3.57 ( 4.84) . . .
: 437 GLY O 3.35 ( 2.80) . . .
: 438 LEU O 3.49 ( 4.53) . . .
: 439 GLY O 5.90 ( 5.42) . . .
: 440 CYS SG 2.28 ( 4.46) . . .
: 443 MET SD 5.06 ( 8.05) . . .
: 470 SER OG 4.91 ( 6.00) . . .
: 23 HOH O 5.17 (-1.00) . . .
: 45 HOH O 2.81 (-1.00) . . .
: 91 GLU OE1 3.47 ( 6.78) . . .
: 427 GLU OE1 4.82 ( 6.86) . . .
: 255 HOH O 4.02 (-1.00) . . .
: 458 HOH O 5.36 (-1.00) . . .
Site 3: 173 LEU O 5.66 ( 8.09) . . .
: 175 ILE CD1 3.63 ( 5.52) . . .
: 183 LEU CD1 4.96 ( 7.00) . . .
: 187 PRO CG 5.68 ( 7.07) . . .
: 283 ASP O 3.77 ( 5.97) . . .
: 284 CYS SG 3.31 ( 3.53) . . .
: 285 LEU O 4.98 ( 5.63) . . .
: 47 HOH O 3.00 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 5.04 (-1.00) . . .
: 141 HOH O 1.01 (-1.00) . . .
: 143 HOH O 5.64 (-1.00) . . .
: 228 HOH O 3.20 (-1.00) . . .
: 315 VAL CG1 5.12 ( 6.01) . . .
: 328 ALA CB 5.92 ( 6.15) . . .
: 333 CYS SG 4.00 ( 3.84) . . .
: 334 GLY O 4.95 ( 4.74) . . .
: 335 LYS N 5.32 ( 6.66) . . .
: 76 HOH O 3.89 (-1.00) . . .
: 105 HOH O 3.82 (-1.00) . . .
: 267 HOH O 5.78 (-1.00) . . .
: 376 HOH O 5.03 (-1.00) . . .
Site 4: 315 VAL CG2 5.08 ( 7.45) . . .
: 319 GLN OE1 5.31 ( 7.37) . . .
: 328 ALA O 5.38 ( 6.93) . . .
: 329 VAL O 5.36 ( 4.76) . . . [Het: FAD OP2 - O 4.30]
: 330 GLY O 3.17 ( 4.48) . . . [Het: FAD OP2 - CA 3.50]
: 331 ASP O 5.95 ( 5.77) . . . [Het: FAD C3* - CG 3.70]
: 332 VAL N 5.81 ( 6.34) . . .
: 333 CYS SG 3.39 ( 3.66) . . .
: 334 GLY C 5.23 ( 5.40) . . .
: 335 LYS CE 5.03 ( 4.70) . . .
: 364 TYR OH 4.06 ( 9.43) . . .
: 11 HOH O 3.84 (-1.00) . . .
: 21 HOH O 3.33 (-1.00) . . .
: 44 HOH O 1.51 (-1.00) . . .
: 93 HOH O 5.63 (-1.00) . . .
: 95 HOH O 1.45 (-1.00) . . .
: 105 HOH O 5.81 (-1.00) . . .
: 175 ILE CD1 4.28 (10.03) . . .
: 178 ASP O 5.11 ( 7.36) . . .
: 179 GLY O 1.99 ( 4.82) . . .
: 180 PHE C 5.39 ( 4.51) . . .
: 181 PHE N 5.77 ( 6.95) . . .
: 182 GLN NE2 4.26 ( 2.63) . . .
: 183 LEU CD1 4.23 ( 3.84) . . .
: 284 CYS SG 4.46 ( 6.61) . . .
: 71 HOH O 4.05 (-1.00) . . .
: 142 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
: 176 HOH O 4.74 (-1.00) . . .
: 216 HOH O 4.85 (-1.00) . . .
: 285 HOH O 3.74 (-1.00) . . .
: 332 HOH O 4.18 (-1.00) . . .
Site 4: 417 HOH O 5.50 (-1.00) . . .
Site 5: 395 ASN O 4.95 ( 6.66) . . .
: 396 VAL O 5.34 ( 5.00) . . .
: 397 LYS CE 5.76 ( 3.65) . . .
: 398 THR N 5.36 ( 6.24) . . .
: 399 TYR OH 5.51 ( 8.38) . . .
: 422 VAL C 5.94 ( 6.91) . . .
: 423 CYS SG 4.38 ( 3.84) . . .
: 424 ALA O 4.76 ( 4.48) . . .
: 425 ASN O 3.89 ( 5.66) . . .
: 427 GLU C 5.95 ( 7.00) . . .
: 428 GLU OE1 3.40 ( 3.94) . . .
: 429 LYS O 5.89 ( 6.70) . . .
: 483 HOH O 1.44 (-1.00) . . .
: 229 MET SD 5.25 ( 7.87) . . .
: 230 ILE CD1 5.82 ( 9.09) . . .
: 368 PRO CB 5.73 ( 6.63) . . .
: 378 GLY O 3.61 ( 5.27) . . .
: 379 THR OG1 5.94 ( 3.73) . . .
: 380 VAL CG1 4.62 ( 4.74) . . .
: 420 LYS NZ 5.67 ( 5.98) . . .
: 422 VAL CG2 5.18 ( 6.91) . . .
: 432 GLY O 5.46 ( 5.41) . . .
: 433 ILE O 1.41 ( 3.93) . . .
: 434 HIS NE2 4.83 ( 1.35) . . .
: 435 MET N 4.06 ( 5.88) . . .
: 444 LEU CD1 5.80 ( 9.69) . . .
| PROTEIN: 6ADH ALCOHOL DEHYDROGENASE (HOLO)/NADH/DMSO
|
Bound Ligands : ZN CATALYTIC ZINC(II) ION: NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE: DMS DIMETHYL SULFOXIDE:
Hev Atom conc.: 0.100 mM
Precip & conc.: 25.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.050 M TES
Addict & conc.:
Comments :
Reference : BRANDEN et.al. 1979 :EKLUND et.al. 1981 :
pH 7.0 Soak time = Hours Reference number = 98.04
Site 1: 73 VAL A CG2 5.70 ( 7.15) . . E
: 82 THR A O 5.63 ( 7.75) . . T
: 83 VAL A CG1 5.84 ( 4.12) . . T
: 84 ARG A NE 5.95 ( 2.47) . . T
: 85 PRO A CD 4.71 ( 4.27) . . T
: 86 GLY A O 5.99 ( 5.77) . . E
: 87 ASP A OD1 2.08 ( 4.00) . . E
: 88 LYS A N 5.97 ( 7.25) . . E
: 159 LYS A NZ 5.45 ( 7.49) . . E
Site 2: 125 ASP B OD2 5.78 ( 7.78) . . T
Site 3: 272 LEU A CG 5.64 ( 5.58) . . H
: 276 VAL A CG2 4.77 ( 6.71) . . H
: 300 ASN A O 3.77 ( 4.96) . . T
: 301 LEU A CD1 3.18 ( 1.25) . . T
: 302 SER A OG 5.10 ( 3.01) . . T
: 303 MET A CB 5.21 ( 5.07) . . T
: 301 LEU B O 5.56 ( 7.94) . . T
: 303 MET B O 4.94 ( 6.78) . . T
Site 4: 183 ALA B O 5.01 ( 6.62) . . H
: 187 ALA B O 3.40 ( 4.57) . . H
: 188 LYS B O 2.96 ( 4.39) . . H
: 189 VAL B CG1 4.47 ( 2.50) . . T
: 190 THR B OG1 4.20 ( 4.65) . . T
: 193 SER B OG 5.40 ( 7.36) . . E
: 195 CYS B SG 5.80 ( 7.27) . . E
: 263 ASP B O 5.56 ( 6.98) . . E
: 264 PHE B CE1 2.65 ( 5.03) . . E
: 266 PHE B CZ 5.65 ( 9.59) . . E
: 288 VAL B CG2 5.27 ( 6.62) . . E
Site 5: 96 GLN B OE1 3.06 ( 4.38) . . T [Het: ZNZN - C 3.80]
: 97 CYS B O 4.80 ( 5.09) d . T [Het: ZNZN - N 3.50]
: 98 GLY B N 5.03 ( 5.44) . . T [Het: ZNZN - N 3.90]
: 103 CYS B SG 5.51 ( 7.70) . . T [Het: ZNZN - CA 3.90]
: 155 ILE B O 5.42 ( 6.56) . . T
: 325 LYS B NZ 5.46 ( 4.56) . . H
: 326 ASP B OD1 4.77 ( 6.65) . . H
Site 6: 44 GLY A O 5.33 ( 5.14) . . E
: 45 ILE A O 5.64 ( 6.02) . . E
: 46 CYS A SG 3.99 ( 4.56) . s T [Het: ZNZN - CB 3.50]
: 67 HIS A NE2 5.30 ( 7.94) . s T [Het: ZNZN - CD2 3.30]
: 68 GLU A OE1 2.23 ( 4.98) . . E
: 170 CYS A O 5.44 ( 7.59) . . H
: 171 LEU A CD1 4.30 ( 5.15) . . H
: 173 GLY A C 5.87 ( 6.86) . . H
: 174 CYS A SG 4.59 ( 4.62) . s H [Het: ZNZN - CB 3.50]
: 175 GLY A O 5.44 ( 3.13) . . H
: 176 PHE A N 5.35 ( 6.84) . . H
: 203 VAL A CG2 5.70 ( 7.19) . s H [Het: NADNP - N 4.40]
: 369 ARG A NH1 4.22 ( 7.51) . s E [Het: NADNP - NH1 4.00]
: 1 ZN AZN 4.41 (-1.00) . s .
: 3 NAD ANO1 5.98 (-1.00) . s .
Site 7: 348 HIS A NE2 5.37 ( 9.47) . . E
: 366 GLU A OE1 4.72 ( 6.18) . . T
: 367 SER A OG 3.73 ( 5.74) . . T
Site 8: 45 ILE B CG2 4.90 ( 6.57) . . E
: 46 CYS B O 5.54 ( 6.98) . s H [Het: ZNZN - CB 3.90]
: 47 ARG B NH1 4.72 ( 5.09) . s H [Het: NADAO1 - CD 3.50]
: 50 ASP B OD1 2.85 ( 4.85) . . H
: 358 GLY B O 5.01 ( 7.04) . . H
: 359 PHE B CE2 4.68 ( 3.99) . . H
: 360 ASP B N 5.48 ( 6.34) . . H
: 362 LEU B CD1 2.11 ( 4.16) . . H [Het: NADAO1 - CD2 3.80]
: 363 ARG B NH2 5.11 ( 5.01) . . H
Site 9: 196 ALA A CB 5.20 ( 6.46) . . E
: 198 PHE A CE2 4.96 ( 9.06) . s E
: 254 LEU A CD1 5.34 ( 7.18) . . H
: 255 THR A CG2 5.62 ( 7.29) . . H
: 262 VAL A CG1 4.51 ( 5.63) . . T
: 264 PHE A O 5.72 ( 6.61) . . E
: 265 SER A OG 3.38 ( 4.78) . . E
: 277 THR A O 4.53 ( 6.75) . . H
: 278 ALA A O 2.33 ( 3.96) . . H
: 279 LEU A O 4.74 ( 4.71) . . H
: 280 SER A O 5.27 ( 5.37) . . H
: 281 CYS A SG 1.44 ( 3.01) . . H
: 282 CYS A SG 4.02 ( 3.41) . . H
: 283 GLN A N 5.85 ( 7.31) . . T
: 289 SER A OG 5.90 ( 6.26) . . E
Site A: 345 LEU A O 5.59 ( 7.05) . . T
: 346 ILE A CD1 5.69 ( 3.70) . . T
: 347 THR A OG1 4.29 ( 4.31) . . E
: 348 HIS A ND1 5.01 ( 3.74) . . E
: 349 VAL A CG2 4.98 ( 4.94) . . E
: 368 ILE A C 5.57 ( 6.65) . . T
: 369 ARG A CG 4.85 ( 3.59) . s E [Het: NADNP - NH1 4.00]
: 370 THR A OG1 4.22 ( 2.16) . . E
: 371 ILE A CD1 3.55 ( 4.17) . . E