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ANALYSIS FOR PARA-HYDROXYMERCURI BENZENE SULPHONATE [HBP]
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Formula : C6,H6,S1,HG1,O4
Solution chemistry: [C6,H4]1,[S1,O3]1,[(HG1),(O1,H1)]1 -1
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 2MCG IMMUNOGLOBULIN B-J INTACT MCG
|
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.: 1.600 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : SCHIFFER et.al. 1973 :
pH 6.2 Soak time = 672.00 Hours Reference number = 128.02
Site 1: 39 GLN 1 NE2 4.85 ( 7.88) . . .
: 41 HIS 1 NE2 4.25 ( 4.56) . . .
: 44 LYS 1 NZ 1.82 ( 5.23) . . .
: 45 ALA 1 O 5.53 ( 7.05) . . .
: 47 LYS 1 CE 5.42 ( 7.58) . . .
: 56 HOH O 4.08 (-1.00) . . .
: 58 HOH O 2.79 (-1.00) . . .
: 87 HOH O 4.54 (-1.00) . . .
: 129 HOH O 5.29 (-1.00) . . .
Site 2: 154 ALA 1 CB 4.39 ( 5.81) . . .
: 159 VAL 1 CG1 4.95 ( 7.34) . . .
: 188 GLN 1 NE2 5.20 ( 6.19) . . .
: 191 SER 1 OG 4.80 ( 6.94) . . .
: 192 HIS 1 NE2 1.60 ( 5.85) . . .
: 195 TYR 1 OH 4.28 ( 9.28) . . .
: 40 HOH O 3.22 (-1.00) . . .
: 59 HOH O 2.73 (-1.00) . . .
: 77 HOH O 2.73 (-1.00) . . .
Site 3: 44 LYS 1 NZ 5.35 ( 5.62) . . .
: 45 ALA 1 N 5.60 ( 6.41) . . .
: 1 PCA 2 OE 5.80 ( 7.70) . . .
: 3 ALA 2 CB 4.42 ( 5.79) . . .
: 101 PHE 2 O 5.97 ( 8.02) . . .
: 103 THR 2 CG2 5.67 ( 6.13) . . .
: 56 HOH O 4.34 (-1.00) . . .
: 128 HOH O 3.87 (-1.00) . . .
: 129 HOH O 3.62 (-1.00) . . .
: 231 HOH O 2.96 (-1.00) . . .
Site 4: 39 GLN 2 OE1 5.86 ( 7.81) . . .
: 40 GLN 2 C 5.81 ( 6.49) . . .
: 41 HIS 2 NE2 4.42 ( 4.15) . . .
: 42 ALA 2 N 5.61 ( 6.78) . . .
: 44 LYS 2 CE 5.46 ( 6.31) . . .
: 45 ALA 2 O 5.40 ( 6.81) . . .
: 47 LYS 2 NZ 5.36 ( 7.58) . . .
Site 5: 154 ALA 2 CB 4.13 ( 5.59) . . .
: 188 GLN 2 CG 5.28 ( 6.27) . . .
: 191 SER 2 CB 5.95 ( 6.95) . . .
: 192 HIS 2 NE2 1.03 ( 5.70) . . .
: 195 TYR 2 OH 4.07 ( 8.83) . . .
: 204 HOH O 3.04 (-1.00) . . .
: 235 HOH O 3.56 (-1.00) . . .
: 289 HOH O 2.62 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4MDH MALATE DEHYDROGENASE
|
Bound Ligands : NAD NAD CO-ENZYME: SUL SULFATE:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 70.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : BIRKTOFT et.al. 1989 :TSERNOGLOU et.al. 1972 :
pH 5.0 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 115.00
Site 1: 166 ILE A CD1 5.95 ( 6.83) . . H
: 170 LEU A CD1 3.97 ( 7.73) . . H
: 176 ASP A O 5.05 ( 7.24) . . E
: 177 VAL A CG1 4.93 ( 5.25) . . E
: 178 LYS A N 5.70 ( 6.87) . . E
: 197 ALA A O 5.33 ( 6.05) . . E
: 198 LYS A O 3.76 ( 4.27) . . E
: 199 VAL A CG1 2.04 ( 2.65) . . E
: 200 LYS A N 4.86 ( 6.25) . . E
: 206 VAL A O 4.09 ( 5.97) . . E
: 207 GLY A O 4.51 ( 5.35) . . H
: 208 VAL A CG1 4.21 ( 3.55) . . H
: 209 TYR A N 5.96 ( 7.30) . . H
: 211 ALA A CB 4.75 ( 6.05) . . H
Site 2: 165 GLN B O 4.28 ( 6.16) . . H
: 166 ILE B CD1 3.01 ( 3.19) . . H
: 167 ALA B N 4.94 ( 5.91) . . H
: 169 LYS B CE 5.37 ( 4.67) . . H
: 170 LEU B CD1 3.75 ( 5.55) . . H
: 208 VAL B O 5.47 ( 6.35) . . H
: 212 VAL B CG1 4.87 ( 5.36) . . H
: 217 TRP B CH2 4.11 ( 8.80) . . H
: 218 LEU B CD1 5.87 ( 7.28) . . H
Site 3: 57 GLN A OE1 4.79 ( 6.41) . . H
: 164 ALA B O 2.47 ( 4.59) . . H
: 165 GLN B OE1 4.58 ( 4.18) . . H
: 166 ILE B O 5.82 ( 6.11) . . H
: 167 ALA B O 5.08 ( 5.04) . . H
: 168 LEU B CD1 1.21 ( 2.77) . . H
: 169 LYS B N 4.66 ( 6.08) . . H
: 268 HOH O 3.60 (-1.00) . . .
: 270 HOH O 4.94 (-1.00) . . .
: 348 HOH O 5.34 (-1.00) . . .
: 424 HOH O 5.40 (-1.00) . . .
: 213 LYS A CD 5.71 ( 8.17) . . H
| PROTEIN: 4SBV VIRUS COAT PROTEIN (SOUTHERN BEAN MOSAIC)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 0.430 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : ASAD-ZATERO et.al. 1981 :HERMODSON et.al. 1982 :SUCK et.al. 1978 :
pH Soak time = 168.00 Hours Reference number = 263.02
Site 7: 68 ILE C CD1 5.90 ( 8.13) . . .
: 110 TYR C O 5.44 ( 5.65) . . .
: 111 ALA C O 3.11 ( 3.29) . . .
: 112 TRP C O 4.38 ( 5.21) . . .
: 113 VAL C CG2 4.20 ( 5.69) . . .
: 195 LYS C O 5.80 ( 8.12) . . .
: 196 ARG C NH1 5.03 ( 6.94) . . .
: 248 ILE C O 5.99 ( 5.71) . . .
: 249 ARG C NH1 5.37 ( 3.75) . . .
: 250 LEU C N 5.79 ( 6.79) . . .
: 251 ILE C CD1 5.93 ( 8.08) . . .
Site 8: 147 VAL A O 4.33 ( 6.30) . . .
: 148 ASN A O 3.96 ( 5.15) . . .
: 149 GLN A O 4.84 ( 6.12) . . .
: 150 LEU A CG 5.81 ( 4.79) . . .
: 151 SER A OG 2.09 ( 1.04) . . .
: 152 ASN A OD1 5.23 ( 4.04) . . .
: 153 LEU A N 4.86 ( 6.22) . . .
: 156 TYR A OH 4.25 ( 5.57) . . .
: 90 LEU A CD1 5.20 ( 5.91) . . .
: 92 MET A CE 4.93 ( 7.80) . . .
: 139 MET A SD 3.63 ( 5.27) . . .
: 205 TYR A OH 2.83 ( 7.47) . . .
: 209 VAL A CG2 5.62 ( 7.98) . . .
: 216 GLY A O 3.33 ( 4.16) . . .
: 217 ASN A OD1 5.98 ( 5.21) . . .
: 219 LEU A O 5.23 ( 5.37) . . .
: 220 VAL A CG1 2.82 ( 3.71) . . .
: 221 PRO A N 5.32 ( 6.30) . . .
: 222 ALA A O 5.30 ( 5.98) . . .
: 12 HOH A O 5.21 (-1.00) . . .
: 73 GLU A O 4.53 ( 6.48) . . .
: 74 LEU A CD1 4.42 ( 4.66) . . .
: 75 SER A N 5.16 ( 6.43) . . .
: 76 THR A O 5.56 ( 7.02) . . .
: 118 THR A O 3.99 ( 5.92) . . .
: 119 TYR A C 5.54 ( 5.36) . . .
: 120 LEU A CD1 5.26 ( 5.73) . . .
: 171 VAL A CG1 5.73 ( 7.30) . . .
: 241 ARG A CD 5.59 ( 4.63) . . .
: 242 LEU A CG 5.69 ( 3.70) . . .
: 243 TYR A OH 4.05 ( 2.73) . . .
Site 8: 244 ALA A N 5.04 ( 6.45) . . .
Site 9: 61 ARG C NH2 5.25 (10.81) . . .
: 66 VAL C CG2 5.08 ( 7.56) . . .
: 68 ILE C CD1 5.25 ( 7.86) . . .
: 249 ARG C NH1 4.16 ( 7.50) . . .
Site A: 172 ASN B O 5.82 ( 8.13) . . .
: 65 ASP A OD1 4.78 ( 7.99) . . .
: 154 LYS C O 5.60 ( 7.72) . . .
: 6 HOH C O 5.76 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 6ACN ACONITASE (CITRATE [ISOCITRATE] HYDROLASE) PIG HEA
|
Bound Ligands : FS4 FE4-S4 CLUSTER: SO4 SULFATE: TRC TRICARBALLYLIC ACID:
Hev Atom conc.: 0.100 mM
Precip & conc.: 2.900 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.250 M BIS-TRIS
Addict & conc.: 0.350 M SODIUM CHLORIDE/MERCAPTOSUCCINIC ACID
Comments : BACK SOAK 1 DAY
Reference : STOUT et.al. 1988 :
pH 7.0 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 273.01
Site 1: 36 LEU O 5.61 ( 7.51) . . T
: 37 THR CG2 5.56 ( 5.50) . . T
: 239 GLU OE1 5.36 ( 9.14) . . E
: 241 HIS NE2 5.88 ( 7.55) . . E
: 301 PRO CD 5.81 ( 5.03) . . T
: 302 ASP O 3.32 ( 5.49) . . T
: 303 PRO O 5.63 ( 5.24) . . T
: 304 GLY O 5.40 ( 4.72) . . T
: 305 CYS SG 1.83 ( 3.78) . . T
: 306 HIS N 5.10 ( 5.89) . . T
: 307 TYR OH 3.57 ( 7.11) . . T
: 854 HOH O 1.97 (-1.00) . . .
:1038 HOH O 3.49 (-1.00) . . .
:1065 HOH O 5.76 (-1.00) . . .
Site 2: 382 LYS CG 5.25 ( 5.87) . . T
: 383 CYS SG 3.86 ( 3.12) . . T
: 384 LYS O 5.46 ( 4.98) . . T
: 385 SER O 2.65 ( 4.82) . . T
: 386 GLN O 5.52 ( 4.49) . . E
: 387 PHE CD2 5.90 ( 5.34) . . E
: 412 VAL O 3.70 ( 6.04) . . H
: 413 GLY O 3.95 ( 4.21) . . T
: 414 GLY N 5.28 ( 5.94) . . T
: 473 ALA O 5.70 ( 7.13) . . H
: 858 HOH O 2.22 (-1.00) . . .
:1046 HOH O 4.32 (-1.00) . . .