_____________________________________________________________
ANALYSIS FOR 4-CHLOROMERCURIBENESULPHONIC ACID [HBA]
_____________________________________________________________
Formula : CL1,HG1,C6,H5,S1,O3
Solution chemistry: [C6,H4]1,[S1,O3]1,[(HG1),(CL1)]1 -1
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 1ABP L-ARABINOSE-BINDING PROTEIN (ESCHERICHIA COLI)
|
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 60.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.010 M SODIUM MALEATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : QUIOCHO et.al. 1977 :
pH 6.5 Soak time = 336.00 Hours Reference number = 55.01
Site 1: 169 ILE O 5.09 ( 6.67) . . .
: 170 TYR OH 3.10 ( 4.95) . . E
: 189 MET SD 3.93 ( 6.41) . . .
: 192 GLN NE2 4.40 ( 6.57) . . .
: 193 HIS NE2 2.45 ( 6.31) . . .
Site 2: 10 LYS NZ 4.48 ( 7.68) . . E
: 17 PHE CE1 5.28 ( 9.23) . . .
: 63 ILE O 4.84 ( 6.69) . . E
: 64 CYS SG 1.91 ( 3.34) . . E
: 65 THR O 5.19 ( 5.78) . . .
: 88 VAL CG1 4.54 ( 4.63) . . E
: 89 ASP OD1 4.46 ( 3.71) . . E
: 90 ASP OD1 4.25 ( 2.60) . . .
: 91 GLN O 5.58 ( 5.73) . . .
Site 3: 129 GLY O 5.72 ( 6.53) . . .
: 130 TRP NE1 4.18 ( 4.99) . . .
: 131 ASP N 5.45 ( 6.56) . . .
: 198 HIS NE2 2.15 ( 5.86) . . .
: 225 ASP OD2 3.96 ( 6.75) . . E
| PROTEIN: 1EST ELASTASE (PORCINE TOSYL)
|
Bound Ligands : SUL SULFATE ION - ONLY S ATOM GIVEN: TOS P-TOLUENESULFONYL DERIVATIVE OF SER 195:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : SULPHONYL GROUP COVALENTLY ATTACHED ACTIVE CENTRE
Reference : SAWYER et.al. 1978 :WATSON et.al. 1970 :
pH Soak time = Hours Reference number = 187.02
Site 1: 41 THR OG1 5.15 ( 7.46) . . E
: 42 CYS SG 5.64 ( 8.10) d . E
: 57 HIS NE2 5.34 ( 4.98) . s .
: 58 CYS SG 5.73 ( 3.99) d . .
: 59 VAL N 5.28 ( 6.17) . . .
: 60 ASP OD2 5.06 ( 5.83) . . .
: 61 ARG NE 5.93 ( 6.73) . . .
: 27 TOS C1 2.46 (-1.00) . s .
| PROTEIN: 1GPD GLYCERALDEHYDE-3P-DEHYDROGENASE (LOBSTER)
|
Bound Ligands : NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE: SPS SUBSTRATE PHOSPHATE: IPS INORGANIC PHOSPHATE:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 69.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.005 M NAD+
Comments : CO-CRYSTALLIZATION; HBA: 4.4 MOL EXCESS (10% MORE
Reference : BUEHNER et.al. 1974 :MORAS et.al. 1975 :
pH 6.2 Soak time = Hours Reference number = 124.00
Site 1: 165 PHE R CZ 5.89 (10.02) . . H
: 250 CYS R SG 3.38 ( 4.80) . . .
: 251 SER R OG 5.54 ( 3.81) . . H
: 252 TYR R CD1 5.79 ( 3.27) . . H
: 253 ASP R N 5.06 ( 6.27) . . H
: 254 ASP R CB 5.45 ( 5.86) . . H
: 255 ILE R CD1 5.10 ( 4.67) . . H
: 299 GLN R O 5.96 ( 7.93) . . E
: 300 LEU R CD2 5.74 ( 6.45) . . E
: 305 VAL R CG1 4.20 ( 5.89) . . E
: 250 CYS G SG 4.82 ( 5.49) . . .
: 251 SER G O 3.27 ( 4.79) . . .
: 252 TYR G CE1 5.23 ( 2.85) . . .
: 253 ASP G N 4.96 ( 6.15) . . .
: 254 ASP G N 5.68 ( 6.05) . . .
: 255 ILE G CD1 2.35 ( 4.45) . . .
: 256 LYS G N 5.29 ( 6.55) . . .
: 299 GLN G O 5.38 ( 6.72) . . .
: 300 LEU G CD1 5.86 ( 5.64) . . .
: 305 VAL G CG1 5.14 ( 5.97) . . .
: 306 LYS G O 5.58 ( 7.11) . . .
: 307 VAL G CG1 5.88 ( 7.30) . . .
Site 2: 165 PHE G CE2 5.81 ( 9.94) . . .
: 250 CYS G SG 4.62 ( 5.06) . . .
: 251 SER G OG 5.73 ( 4.46) . . .
: 252 TYR G CE1 5.63 ( 2.92) . . .
: 253 ASP G N 4.88 ( 6.05) . . .
: 254 ASP G CB 5.56 ( 5.69) . . .
: 255 ILE G CD1 2.16 ( 4.19) . . .
: 256 LYS G N 5.26 ( 6.58) . . .
: 299 GLN G O 5.78 ( 7.18) . . .
: 300 LEU G CD1 5.94 ( 5.90) . . .
: 305 VAL G CG1 5.19 ( 6.17) . . .
: 165 PHE R CE1 5.78 ( 9.64) . . .
: 249 GLU R O 5.92 ( 7.70) . . .
: 250 CYS R SG 2.94 ( 4.35) . . .
: 251 SER R OG 5.37 ( 3.67) . . .
: 252 TYR R CG 5.99 ( 3.56) . . .
: 253 ASP R N 5.17 ( 6.32) . . .
: 254 ASP R CB 5.09 ( 5.59) . . .
: 255 ILE R CD1 5.27 ( 4.52) . . .
: 300 LEU R CB 5.98 ( 6.79) . . .
: 305 VAL R CG1 4.38 ( 6.18) . . .
Site 3: 165 PHE G CE2 5.86 (10.00) . . H
: 250 CYS G SG 4.66 ( 5.09) . . .
: 251 SER G OG 5.69 ( 4.43) . . H
: 252 TYR G CE1 5.57 ( 2.83) . . H
: 253 ASP G C 5.77 ( 5.97) . . H
: 254 ASP G CB 5.53 ( 5.64) . . H
: 255 ILE G CD1 2.23 ( 4.18) . . H
: 256 LYS G N 5.22 ( 6.53) . . H
: 299 GLN G O 5.80 ( 7.17) . . E
: 300 LEU G CD1 5.89 ( 5.89) . . E
: 305 VAL G CG1 5.27 ( 6.23) . . E
: 165 PHE R CE1 5.83 ( 9.70) . . .
: 249 GLU R O 5.94 ( 7.73) . . .
: 250 CYS R SG 3.00 ( 4.35) . . .
: 251 SER R OG 5.30 ( 3.60) . . .
: 252 TYR R CG 5.92 ( 3.49) . . .
: 253 ASP R N 5.08 ( 6.23) . . .
: 254 ASP R CB 5.04 ( 5.53) . . .
: 255 ILE R CD1 5.27 ( 4.49) . . .
: 300 LEU R CD2 5.98 ( 6.79) . . .
: 305 VAL R CG1 4.45 ( 6.23) . . .
Site 4: 165 PHE R CE1 5.93 ( 9.95) . . .
: 250 CYS R SG 3.77 ( 5.20) . . .
: 251 SER R OG 5.48 ( 4.11) . . .
: 252 TYR R CD1 5.36 ( 3.06) . . .
: 253 ASP R O 5.75 ( 5.82) . . .
: 254 ASP R O 5.97 ( 5.35) . . .
: 255 ILE R CD1 4.37 ( 3.84) . . .
: 256 LYS R N 5.16 ( 6.51) . . .
: 305 VAL R CG1 4.62 ( 6.45) . . .
: 250 CYS G SG 5.62 ( 6.00) . . .
: 251 SER G O 3.27 ( 5.15) . . .
: 252 TYR G CE1 4.89 ( 2.92) . . .
: 253 ASP G C 5.60 ( 5.83) . . .
: 254 ASP G CB 5.79 ( 5.66) . . .
: 255 ILE G CD1 2.24 ( 3.71) . . .
: 256 LYS G CB 5.93 ( 5.67) . . .
: 300 LEU G CD2 5.83 ( 6.43) . . .
: 305 VAL G CG1 5.60 ( 6.60) . . .
: 306 LYS G O 5.68 ( 7.40) . . .
: 307 VAL G CG1 5.71 ( 7.13) . . .
Site 5: 130 CYS R SG 3.32 ( 4.96) d . .
: 133 ASN R CG 4.82 ( 7.24) . . .
: 270 PHE R CE2 5.26 ( 9.59) . . .
: 320 ARG R O 5.48 ( 6.49) . . H
: 323 ASP R OD1 5.44 ( 4.25) . . H
: 324 LEU R CB 5.47 ( 4.62) . . H
: 327 HIS R CD2 4.93 ( 5.62) . . H
: 130 CYS G SG 3.39 ( 4.68) d . .
: 133 ASN G AD1 5.09 ( 8.52) . . .
: 270 PHE G CE2 4.87 ( 9.05) . . .
: 319 GLN G O 5.71 ( 8.07) . . .
: 320 ARG G O 5.33 ( 5.47) . . .
: 322 ILE G O 5.82 ( 7.31) . . .
: 323 ASP G OD1 4.71 ( 3.60) . . .
: 324 LEU G O 5.88 ( 4.46) . . .
: 326 LYS G CG 5.82 ( 6.85) . . .
: 327 HIS G CD2 5.37 ( 5.62) . . .
Site 6: 129 VAL G C 5.83 ( 6.88) . . .
: 130 CYS G SG 2.12 ( 3.95) d . .
: 131 GLY G N 6.00 ( 7.20) . . .
: 133 ASN G AD1 5.19 ( 8.38) . . .
: 270 PHE G CE2 4.75 ( 8.66) . . .
: 319 GLN G O 4.98 ( 7.21) . . .
: 320 ARG G NH2 5.78 ( 4.26) . . .
: 321 VAL G O 5.90 ( 6.47) . . .
: 322 ILE G O 5.64 ( 6.74) . . .
: 323 ASP G OD1 3.96 ( 3.19) . . .
: 324 LEU G O 5.94 ( 4.06) . . .
: 327 HIS G CG 5.90 ( 6.33) . . .
: 129 VAL R C 5.87 ( 6.88) . . .
: 130 CYS R SG 2.44 ( 4.28) d . .
: 133 ASN R CG 4.85 ( 7.06) . . .
: 270 PHE R CE2 5.18 ( 9.21) . . .
: 319 GLN R O 5.96 ( 8.05) . . .
: 320 ARG R O 4.27 ( 5.33) . . .
: 322 ILE R O 5.81 ( 7.22) . . .
: 323 ASP R OD1 4.79 ( 3.88) . . .
: 324 LEU R CD2 5.91 ( 4.14) . . .
: 327 HIS R CD2 5.69 ( 6.27) . . .
Site 7: 130 CYS G SG 2.83 ( 4.17) d . .
: 133 ASN G AD1 4.81 ( 8.16) . . .
: 270 PHE G CE2 4.78 ( 8.96) . . .
: 319 GLN G O 5.64 ( 7.94) . . H
: 320 ARG G CD 5.95 ( 5.12) . . H
: 322 ILE G O 5.86 ( 7.23) . . H
: 323 ASP G OD1 4.62 ( 3.59) . . H
: 324 LEU G O 5.79 ( 4.19) . . H
: 327 HIS G CD2 5.37 ( 5.76) . . H
: 130 CYS R SG 2.97 ( 4.51) d . .
: 133 ASN R CG 4.50 ( 6.86) . . .
: 270 PHE R CE2 5.36 ( 9.55) . . .
: 320 ARG R O 5.07 ( 6.18) . . .
: 323 ASP R OD1 5.41 ( 4.29) . . .
: 324 LEU R CD2 5.97 ( 4.38) . . .
: 327 HIS R CD2 4.98 ( 5.77) . . .
: 135 GLU G OE1 4.78 ( 6.64) . . .
Site 8: 129 VAL R C 5.93 ( 6.91) . . .
: 130 CYS R SG 2.44 ( 4.35) d . .
: 133 ASN R CG 4.97 ( 7.17) . . .
: 270 PHE R CE2 5.17 ( 9.19) . . .
: 319 GLN R O 5.81 ( 7.90) . . .
: 320 ARG R O 4.15 ( 5.21) . . .
: 322 ILE R O 5.71 ( 7.10) . . .
: 323 ASP R OD1 4.67 ( 3.76) . . .
: 324 LEU R CD2 5.93 ( 4.09) . . .
: 327 HIS R CD2 5.80 ( 6.31) . . .
: 129 VAL G C 5.89 ( 6.91) . . .
: 130 CYS G SG 2.10 ( 4.02) d . .
: 133 ASN G AD1 5.32 ( 8.50) . . .
: 270 PHE G CE2 4.80 ( 8.65) . . .
: 319 GLN G O 4.84 ( 7.07) . . .
: 320 ARG G NH2 5.66 ( 4.14) . . .
: 321 VAL G O 5.81 ( 6.36) . . .
: 322 ILE G O 5.55 ( 6.62) . . .
: 323 ASP G OD1 3.85 ( 3.07) . . .
: 324 LEU G O 5.94 ( 4.04) . . .
: 327 HIS G CG 6.00 ( 6.38) . . .
Site 9: 251 SER R O 5.75 ( 5.81) . . H
: 252 TYR R CE1 4.99 ( 3.24) . . H
: 253 ASP R OD1 5.37 ( 6.35) . . H
: 255 ILE R CG2 5.96 ( 8.17) . . H
: 298 ILE R CD1 3.72 ( 4.42) . . .
: 299 GLN R O 4.20 ( 4.49) . . E
: 300 LEU R CD1 4.51 ( 4.86) . . E
: 305 VAL R CG2 5.04 ( 7.11) . . E
: 306 LYS R O 5.89 ( 7.68) . . E
: 252 TYR G OH 4.54 ( 4.41) . . .
: 295 LYS G O 5.46 ( 5.63) . . .
: 297 GLY G C 5.94 ( 7.15) . . .
: 298 ILE G CD1 1.80 ( 3.65) . . .
: 299 GLN G CD 4.98 ( 3.47) . . .
: 300 LEU G CD1 5.38 ( 4.88) . . .
: 306 LYS G O 5.60 ( 7.38) . . .
Site A: 252 TYR G OH 4.35 ( 4.40) . . .
: 253 ASP G N 5.47 ( 6.45) . . .
: 256 LYS G NZ 5.69 ( 8.63) . . .
: 295 LYS G N 5.84 ( 5.68) . . .
: 298 ILE G CD1 2.03 ( 4.99) . . .
: 299 GLN G O 5.87 ( 4.76) . . .
: 300 LEU G CD1 4.94 ( 5.59) . . .
: 251 SER R O 5.85 ( 5.57) . . .
: 252 TYR R OH 5.93 ( 3.48) . . .
: 253 ASP R OD1 3.96 ( 5.60) . . .
: 298 ILE R CD1 3.66 ( 5.52) . . .
: 299 GLN R O 5.79 ( 5.78) . . .
: 300 LEU R CD1 4.53 ( 5.85) . . .
Site B: 252 TYR G OH 3.68 ( 5.18) . . H
: 256 LYS G NZ 5.45 ( 8.69) . . H
: 295 LYS G NZ 5.59 ( 4.80) . . .
: 298 ILE G CD1 1.44 ( 4.63) . . .
: 299 GLN G CD 5.54 ( 5.02) . . E
: 300 LEU G CD1 5.91 ( 6.40) . . E
: 251 SER R C 5.73 ( 6.47) . . .
: 252 TYR R OH 5.18 ( 4.00) . . .
: 253 ASP R OD1 4.12 ( 5.84) . . .
: 295 LYS R NZ 5.60 ( 6.93) . . .
: 298 ILE R CD1 2.87 ( 4.99) . . .
: 299 GLN R C 5.83 ( 5.81) . . .
: 300 LEU R CD1 5.11 ( 6.47) . . .
Site C: 251 SER R O 5.61 ( 5.50) . . .
: 252 TYR R CE1 4.90 ( 3.13) . . .
: 253 ASP R OD1 4.72 ( 5.93) . . .
: 298 ILE R CD1 3.73 ( 4.94) . . .
: 299 GLN R O 4.84 ( 5.05) . . .
: 300 LEU R CD1 4.41 ( 5.18) . . .
: 305 VAL R CG2 5.67 ( 7.72) . . .
: 252 TYR G OH 4.44 ( 4.19) . . .
: 253 ASP G N 5.67 ( 6.75) . . .
: 295 LYS G O 5.78 ( 5.70) . . .
: 298 ILE G CD1 1.83 ( 4.26) . . .
: 299 GLN G CD 5.32 ( 3.99) . . .
: 300 LEU G CD1 5.01 ( 5.03) . . .
| PROTEIN: 1PRC PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER (RHODOCASEUDOMONAS
|
Bound Ligands : BCL BACTERIOCHLOROPHYLL B: BPB BACTERIOPHEOPHYTIN B: FE IRON: MQ7 MENAQUINONE-7: HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINS FE: NS
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 2.700 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.020 M SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : HUBER et.al. 1984 :
pH 6.5 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 177.04
Site 1: 62 PHE L CD1 5.73 ( 7.30) . . .
: 151 LEU L CD1 4.83 ( 8.65) . . .
: 196 TYR M O 5.92 ( 6.90) . . .
: 295 TRP M CH2 5.42 ( 6.70) . . .
: 296 CYS M SG 3.03 ( 3.20) . . .
: 297 VAL M N 4.65 ( 5.58) . . .
: 299 HIS M O 5.21 ( 5.49) . . .
: 300 GLY M O 5.58 ( 5.49) . . .
: 301 ALA M O 4.71 ( 3.29) . . .
: 302 ALA M CB 5.62 ( 5.06) . . .
: 616 LDA C4 5.48 (-1.00) . . .
Site 2: 101 MET L SD 3.82 ( 7.12) . . .
: 118 PRO L O 3.92 ( 5.65) . . .
: 119 LEU L CD1 5.57 ( 3.98) . . .
: 120 ALA L N 5.75 ( 6.73) . . .
: 121 PHE L C 5.85 ( 6.57) . . .
: 122 CYS L SG 1.79 ( 4.41) . . .
Site 3: 41 PHE L CE1 5.36 ( 6.58) . . .
: 44 LEU L CD1 4.56 ( 6.30) . . .
: 45 GLY L N 5.86 ( 6.08) . . .
: 48 LEU L CD1 4.34 ( 8.04) . . .
: 87 GLN L O 5.82 ( 7.83) . . .
: 88 ALA L O 2.87 ( 4.38) . . .
: 89 ILE L O 5.45 ( 5.37) . . .
: 91 VAL L CG1 3.95 ( 4.58) . . .
: 92 CYS L SG 2.24 ( 3.81) . . .
: 93 ALA L N 5.96 ( 7.38) . . .
Site 4: 94 LEU L CD1 5.66 ( 7.33) . . .
: 98 ILE L CD1 5.47 ( 8.53) . . .
: 125 ILE L CG2 4.38 ( 5.68) . . .
: 126 PHE L CD1 5.86 ( 4.54) . . .
: 129 CYS L SG 1.80 ( 4.32) . . .
: 133 VAL L CG2 6.00 ( 7.48) . . .
: 134 PHE L CE1 5.23 ( 8.48) . . .
Site 5: 153 PHE M CE1 2.56 ( 4.50) . . .
: 154 PHE M O 5.34 ( 5.27) . . .
: 156 LEU M CD1 5.43 ( 4.89) . . .
: 157 CYS M SG 2.24 ( 3.45) . . .
: 158 ILE M N 5.77 ( 7.17) . . .
: 161 ILE M CD1 2.56 ( 5.58) . . .
: 279 SER M OG 5.55 ( 6.01) . . .
: 283 LEU M CD1 5.66 ( 7.24) . . .
Site 6: 156 LEU M O 5.77 ( 7.13) . . .
: 159 GLY M C 5.87 ( 7.18) . . .
: 160 CYS M SG 3.23 ( 3.50) . . .
: 161 ILE M CD1 5.97 ( 4.52) . . .
: 164 THR M OG1 3.55 ( 5.61) . . .
: 169 TRP M CH2 4.41 ( 9.29) . . .
: 613 NS1 C29 5.97 (-1.00) . . .
Site 7: 101 MET L SD 5.90 ( 8.13) . . .
: 119 LEU L O 5.82 ( 7.10) . . .
: 121 PHE L O 5.43 ( 6.85) . . .
: 122 CYS L SG 2.63 ( 3.14) . . .
: 123 VAL L N 4.80 ( 5.71) . . .
: 125 ILE L CD1 4.71 ( 5.42) . . .
: 126 PHE L CB 4.80 ( 5.19) . . .
Site 8: 60 ASP L OD1 5.83 ( 8.98) . . .
: 62 PHE L CE1 4.87 ( 6.83) . . .
: 151 LEU L CD1 5.72 ( 9.43) . . .
: 295 TRP M CH2 5.60 ( 7.92) . . .
: 296 CYS M SG 4.88 ( 4.77) . . .
: 297 VAL M N 5.99 ( 6.67) . . .
: 299 HIS M CG 5.86 ( 5.08) . . .
: 300 GLY M O 5.05 ( 5.03) . . .
: 301 ALA M O 5.15 ( 3.17) . . .
: 302 ALA M N 4.91 ( 6.21) . . .
: 616 LDA C3 4.52 (-1.00) . . .
: 95 HOH O 4.93 (-1.00) . . .
Site 9: 88 ALA L CB 5.79 ( 6.24) . . .
Site A: 295 TRP M CH2 5.61 ( 9.67) . . .
: 299 HIS M NE2 5.95 ( 5.77) . . .
: 14 GLN H OE1 5.96 ( 5.52) . . .
: 17 TRP H CH2 5.02 ( 7.08) . . .
: 18 TYR H OH 3.56 ( 7.93) . . .
: 616 LDA O1 3.31 (-1.00) . . .
: 95 HOH O 5.91 (-1.00) . . .
Site B: 94 LEU L CD1 4.48 ( 7.51) . . .
: 129 CYS L SG 2.57 ( 4.25) . . .
: 133 VAL L CG1 4.00 ( 5.44) . . .
: 134 PHE L CE1 3.81 ( 6.89) . . .
| PROTEIN: 1PYP INORGANIC PYROPHOSPHATASE
|
Hev Atom conc.: 0.000 mM
Precip & conc.: 16.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.030 M MES
Addict & conc.:
Comments : CO-CRYSTALLIZATION, TEMP 4 C
Reference : MAKHALDIANI et.al. 1980 :SMIRNOVA et.al. 1980 :
pH 6.0 Soak time = Hours Reference number = 86.02
Site 1: 225 TRP CH2 5.20 ( 7.66) . . T
: 226 LYS CE 5.94 ( 4.39) . . T
: 227 GLN N 5.36 ( 5.90) . . T
: 228 LEU N 5.86 ( 6.49) . . T
: 229 ILE CD1 2.29 ( 4.18) . . T
: 230 ALA N 4.27 ( 5.17) . . T
: 246 LEU CD1 5.89 ( 7.15) . . T
: 248 ASP O 5.71 ( 7.26) . . T
: 249 THR OG1 4.92 ( 6.96) . . T
Site 2: 1 THR OG1 4.80 ( 4.65) . . .
: 31 ASP O 4.81 ( 6.99) . . T [Het: NADAC8 - O 3.60]
: 32 ILE CD1 4.63 ( 4.73) . . T [Het: NADAO4* - CG 3.90]
: 33 PRO CD 3.06 ( 5.17) . . T [Het: NADAC2* - O 3.90]
: 36 ALA CB 5.49 ( 7.01) . . T
: 44 ASN CG 4.75 ( 6.88) . . E
: 133 VAL CG1 5.57 ( 8.16) . . E
Site 3: 35 TYR OH 2.47 ( 5.24) . . T [Het: NADAO2* - CB 3.60]
: 97 GLN AE1 5.89 ( 9.32) . . T [Het: NADNO3* - N 3.60]
: 222 HIS NE2 4.53 ( 7.84) . . T
: 226 LYS NZ 3.80 ( 8.99) . . T
: 178 PRO O 5.32 ( 7.59) . . T
: 179 GLY CA 5.38 ( 5.38) . . T
: 83 PHE A CE1 5.95 ( 8.92) . . T
Site 4: 6 GLN A CD 5.70 ( 9.03) . . T
: 8 GLY A C 5.94 ( 5.29) . . T
: 9 ALA A O 5.88 ( 6.46) . . T
: 265 PRO A O 4.77 ( 5.54) . . T
: 266 LYS A CD 5.95 ( 2.75) . . T
: 267 ALA A O 3.63 ( 1.45) . . T
: 268 ASP A O 5.97 ( 5.14) . . T
| PROTEIN: 1RHD RHODANESE (BOVINE LIVER)
|
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : HOL et.al. 1987 :LIJK et.al. 1983 :1984 :PLOEGMAN et.al. 1978 :
pH 7.3 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 36.00
Site 1: 62 GLU O 3.17 ( 5.38) . . T
: 63 CYS SG 3.76 ( 3.24) . . T
: 64 ARG O 5.01 ( 5.08) . . T
: 75 PRO CD 5.65 ( 5.59) . . T
: 79 GLY O 3.90 ( 4.76) . . H
: 80 PHE O 4.96 ( 4.59) . . H
: 83 TYR CE1 5.98 ( 5.08) . . H
Site 2: 292 LYS NZ 5.05 ( 9.70) . . T
: 224 SER O 5.80 ( 7.60) . . H
: 225 PRO CG 5.65 ( 4.00) . . H
: 226 GLU O 5.10 ( 5.13) . . H
: 228 LEU CD1 5.59 ( 5.50) . . H
: 229 ARG NH1 5.73 ( 4.06) . . H
: 239 LEU CD1 5.61 ( 9.15) . . T
: 259 ALA O 5.64 ( 7.90) . . H
: 262 LEU O 4.70 ( 6.24) . . H
: 263 CYS SG 2.61 ( 3.17) . . H
: 264 GLY N 5.34 ( 6.54) . . H
Site 3: 62 GLU CG 5.61 ( 5.39) . . T
: 63 CYS SG 4.58 ( 3.95) . . T
: 64 ARG O 5.15 ( 5.65) . . T
: 75 PRO CG 5.35 ( 6.14) . . T
: 79 GLY O 3.76 ( 4.58) . . H
: 80 PHE O 5.21 ( 5.05) . . H
: 83 TYR CE2 4.80 ( 5.00) . . H
Site 4: 189 GLY O 5.25 ( 6.93) . . H
: 192 PRO CG 5.90 ( 5.25) . . T
: 199 LEU O 5.06 ( 7.37) . . T
: 200 ASP OD1 5.25 ( 4.87) . . T
: 201 SER OG 4.39 ( 5.28) . . T
: 291 GLY O 4.90 ( 6.09) . . T
: 229 ARG NH1 4.81 ( 9.20) . . H
Site 5: 292 LYS NZ 5.01 ( 9.93) . . T
: 229 ARG CD 5.47 ( 5.71) . . H
: 232 PHE CD2 5.93 ( 8.49) . . H
: 239 LEU CD1 1.27 ( 5.07) . . T
: 260 ALA O 4.76 ( 5.59) . . H
: 263 CYS SG 4.42 ( 3.83) . . H
: 264 GLY O 5.42 ( 4.90) . . H
: 265 LYS CB 5.27 ( 5.95) . . T
Site 6: 79 GLY N 5.87 ( 5.12) . . H
: 82 ASP OD2 5.97 ( 7.91) . . H
Site 7: 110 ARG NH2 4.55 ( 5.04) . . H
: 113 TRP CE3 5.62 ( 8.20) . . H
: 247 CYS SG 4.41 ( 7.01) . . T
: 249 LYS O 4.64 ( 6.21) . . T
: 250 GLY O 1.53 ( 2.74) . . T
: 251 VAL CG1 5.40 ( 2.88) . . H
: 252 THR OG1 5.90 ( 4.92) . . H
: 253 ALA O 5.63 ( 3.99) . . H
: 254 CYS SG 2.92 ( 4.71) . . H
: 270 ILE CD1 5.16 ( 6.67) . . E
: 272 ASP OD1 5.59 ( 5.95) . . T
: 274 SER OG 5.44 ( 7.63) . . H
: 1 S S 4.88 (-1.00) . . .
Site 8: 292 LYS NZ 4.19 ( 9.25) . . T
: 225 PRO O 5.81 ( 7.10) . . H
: 229 ARG NH1 5.53 ( 4.68) . . H
: 232 PHE CD2 5.81 ( 8.33) . . H
: 239 LEU CD1 2.51 ( 6.22) . . T
: 259 ALA O 6.00 ( 8.31) . . H
: 260 ALA O 5.26 ( 6.06) . . H
: 262 LEU C 5.78 ( 7.07) . . H
: 263 CYS SG 3.57 ( 3.33) . . H
: 264 GLY C 5.85 ( 5.34) . . H
| PROTEIN: 2PAD PAPAIN (CYS DERIV OF CYS-25)
|
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.: METHANOL/WATER
Buffer & conc.: 0.100 M AMINOETHANOL/HCL
Addict & conc.:
Comments :
Reference : DRENTH et.al. 1962 :1967 :1968 :1971 :
pH 9.3 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 129.02
Site 1: 52 GLU OE2 5.61 (10.37) . . H
: 78 TYR O 5.49 ( 6.72) . . H
: 79 GLY O 5.92 ( 4.96) . . T
: 80 ILE O 5.07 ( 5.35) . . T
: 81 HIS NE2 3.96 ( 5.84) . . T
: 97 SER O 5.57 ( 6.23) . . T
: 101 GLY O 3.95 ( 6.34) . . T
: 102 PRO O 3.83 ( 4.38) . . T
: 103 TYR OH 4.66 ( 1.82) . . T
: 104 ALA N 3.92 ( 5.38) . . T
: 105 ALA O 5.36 ( 6.73) . . T
Site 2: 19 GLN AE1 5.67 ( 9.95) . . .
: 25 CYS SG 3.12 ( 5.44) d . .
: 134 LEU O 5.63 ( 7.34) . . T
: 136 ALA CB 4.71 ( 6.06) . . T
: 158 ASP OD1 5.23 ( 5.41) . . T
: 159 HIS NE2 3.23 ( 2.09) . . T
: 160 ALA O 4.31 ( 4.43) . . T
: 161 VAL N 5.88 ( 6.74) . . T
: 177 TRP NE1 5.76 ( 9.44) . . T
: 1 CYS I SG 3.08 ( 3.16) d . T
Site 3: 78 TYR CD1 5.98 ( 6.59) . . H
: 103 TYR OH 5.95 ( 7.89) . . T
| PROTEIN: 2SNS STAPHYLOCOCCAL NUCLEASE
|
Bound Ligands : CA CALCIUM(II) ION: PTP THYMIDINE INHIBITOR:
Hev Atom conc.: 0.300 mM
Precip & conc.: 40.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.010 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments : HEAVY ATOM CONC. RAISED IN 2 STEPS AT 10 DAY INTER
Reference : ARNONE et.al. 1969 :1971 :COTTON et.al. 1966 :1979 :
pH 8.2 Soak time = 672.00 Hours Reference number = 241.02
Site 1: 8 HIS NE2 4.41 ( 6.27) . . .
: 10 GLU OE1 3.22 ( 6.17) . . .
: 27 TYR OH 4.40 ( 9.85) . . E
: 28 LYS NZ 5.05 ( 9.20) . . T
: 76 PHE CE1 5.89 ( 8.67) . . T
Site 2: 1 ALA O 4.28 ( 5.34) . . .
: 2 THR OG1 5.46 ( 6.69) . . .
: 3 SER O 4.69 ( 5.88) . . .
: 4 THR OG1 1.17 ( 2.30) . . .
: 5 LYS O 4.95 ( 4.29) . . .
: 6 LYS O 3.50 ( 4.84) . . .
: 7 LEU O 4.09 ( 4.92) . . .
: 8 HIS NE2 5.60 ( 4.08) . . .
Site 3: 28 LYS CE 5.44 ( 6.81) . . T
: 124 HIS NE2 3.45 ( 4.55) . . T
: 127 LYS NZ 2.92 ( 6.97) . . T
: 128 SER OG 5.72 ( 7.35) . . T
| PROTEIN: 3CTS CITRATE SYNTHASE (CHICKEN, COA, CITRATE)
|
Bound Ligands : COA COENZYME A: CIT CITRATE ION:
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 1.200 M CITRATE
Addict & conc.: 0.000 M COA
Comments :
Reference : REMINGTON et.al. 1982 :
pH 5.9 Soak time = Hours Reference number = 209.00
Site 1: 69 UNK CE1 5.07 ( 5.02) . . T
: 70 UNK O 4.87 ( 6.66) . . H
: 71 UNK O 5.96 ( 6.95) . . H
: 73 UNK O 3.56 ( 4.77) . . H
: 74 UNK SG 3.02 ( 2.75) . . H
: 75 UNK N 5.04 ( 6.30) . . H
: 77 UNK CD1 4.04 ( 4.76) . . H
: 78 UNK CD1 4.21 ( 5.35) . . H
: 95 UNK CD1 5.30 ( 7.54) . . H
: 101 UNK CD1 4.16 ( 6.58) . . T
Site 2: 71 UNK CG2 5.60 ( 7.87) . . H
: 75 UNK NE2 5.56 ( 7.55) . . H
: 86 UNK OE1 4.94 ( 8.26) . . T
: 230 UNK CD1 4.53 ( 7.33) . . H
: 331 UNK O 5.04 ( 6.70) . . H
: 332 UNK SG 2.34 ( 3.18) . . H
: 333 UNK C 5.79 ( 5.18) . . H
: 335 UNK OE1 5.20 ( 5.27) . . H
: 336 UNK CD2 5.92 ( 5.30) . . H
: 94 HOH O 3.61 (-1.00) . . .
Site 3: 69 UNK CE2 4.96 ( 8.49) . . T
: 73 UNK O 5.20 ( 6.94) . . H
: 76 UNK O 5.74 ( 6.72) . . H
: 77 UNK CD1 2.63 ( 3.31) . . H
: 78 UNK CD2 5.98 ( 5.78) . . H
: 101 UNK CD1 2.31 ( 5.44) . . T
| PROTEIN: 3FAB IMMUNOGLOBULIN FAB (PRIME) NEW
|
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 45.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 1.500 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : POLJAK et.al. 1971 :1972 :
pH 6.0 Soak time = Hours Reference number = 137.05
Site 1: 28 ALA L O 5.88 ( 7.24) . . . [Het: MTX CT - CB 3.80]
: 30 ASN L OD1 3.43 ( 4.64) . . .
: 90 TYR L CG 5.42 ( 5.53) . . E
: 91 ASP L O 5.77 ( 5.34) . . E
: 92 ARG L O 4.27 ( 5.14) . . .
: 93 SER L N 5.23 ( 5.52) . . .
: 199 HIS L O 5.85 ( 7.55) . . E
: 200 GLU L OE1 5.05 ( 4.16) . . .
: 201 GLY L N 4.55 ( 5.21) . . .
Site 2: 59 THR H OG1 3.68 ( 5.60) . . .
: 60 ASP H O 5.59 ( 6.67) . . .
: 61 THR H O 5.25 ( 5.36) . . .
: 63 LEU H O 5.91 ( 6.75) . . .
: 64 ARG H NH1 5.51 ( 3.18) . . .
: 65 SER H N 4.27 ( 5.47) . . .
Site 3: 139 SER L OG 4.79 ( 6.01) . . E
: 140 ASP L OD1 5.64 ( 7.39) . . E
: 169 GLN L OE1 4.14 ( 8.19) . . E
: 175 ALA L CB 5.86 ( 7.16) . . E
: 167 VAL H O 5.97 ( 6.90) . . E
: 168 HIS H ND1 5.72 ( 5.15) . . E
: 170 PHE H CE1 5.49 ( 7.36) . . E
Site 4: 152 ALA L CB 4.67 ( 5.82) . . .
: 182 LEU L CD2 5.75 ( 8.45) . . E
: 186 GLN L OE1 4.59 ( 6.24) . . .
: 187 TRP L CG 5.43 ( 3.85) . . .
: 188 LYS L CE 5.87 ( 1.90) . . .
: 189 SER L OG 2.69 ( 3.37) . . .
: 190 HIS L N 5.26 ( 6.63) . . .
: 193 TYR L OH 3.55 ( 9.21) . . E
Site 5: 47 ILE L CD1 5.22 ( 7.32) . . . [Het: MTX C11 - CD 4.00]
: 49 HIS L CE1 5.24 ( 4.35) . . .
: 50 ASN L OD1 4.26 ( 4.04) . . .
: 51 ASN L N 5.15 ( 6.19) . . . [Het: MTX C16 - CD1 4.00]
: 6 GLN L O 5.93 ( 7.83) . . . [Het: NDPNC7 - N 3.80]
: 7 PRO L O 5.10 ( 6.88) . . E
: 8 PRO L CD 5.88 ( 3.73) . . E
: 9 SER L N 5.42 ( 6.43) . . E
: 101 GLY L O 5.21 ( 6.80) . . E
: 102 GLY L O 5.61 ( 3.66) . . E
: 103 THR L C 5.64 ( 5.06) . . E [Het: NDPNC4 - O 3.30]
: 104 LYS L N 5.42 ( 6.30) . . E [Het: NDPAO1 - C 4.10]
Site 6: 49 HIS L NE2 1.38 ( 4.50) . . .
: 50 ASN L OD1 4.16 ( 6.02) . . .
: 8 PRO L O 5.36 ( 7.41) . . E
: 84 ASP L OD1 2.59 ( 5.73) . . E
: 103 THR L O 5.88 ( 6.37) . . E [Het: NDPNC4 - O 3.30]
: 104 LYS L NZ 4.52 ( 4.44) . . E [Het: NDPAO1 - C 4.10]
: 43 ARG H NH1 3.09 ( 6.51) . . E
| PROTEIN: 3RN3 RIBONUCLEASE A
|
Bound Ligands : SO4 SULFATE ANION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 60.000 % AQUEOUS ETHANOL
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : CO-CRYSTALLIZATION
Reference : BOLES et.al. 1967 :CARLISLE et.al. 1974 :
pH 5.2 Soak time = Hours Reference number = 70.00
Site 1: 203 HOH O 5.81 (-1.00) . . .
Site 2: 18 SER OG 5.43 ( 6.72) . . T
: 19 ALA CB 5.52 ( 6.40) . . T
: 79 MET O 5.96 ( 6.76) . . E
: 80 SER OG 3.92 ( 4.49) . . E
: 101 GLN OE1 4.69 ( 8.29) . . E
: 102 ALA O 5.61 ( 7.13) . . E
: 103 ASN OD1 2.88 ( 5.70) . . E
: 236 HOH O 4.71 (-1.00) . . .
: 237 HOH O 3.04 (-1.00) . . .
: 298 HOH O 1.15 (-1.00) . . .
: 305 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
Site 3: 7 LYS NZ 3.01 ( 7.19) . . .
: 11 GLN OE1 1.85 ( 6.01) . . . [Het: SO4 S - OE1 3.90]
: 12 HIS NE2 4.75 ( 8.25) . s . [Het: SO4 S - NE2 3.50]
: 35 LEU CD2 5.69 ( 7.70) . . T
: 41 LYS NZ 4.18 ( 8.22) . s T
: 44 ASN OD1 5.36 ( 7.68) . . E
: 155 SO4 S 3.54 (-1.00) . . .
: 202 HOH O 4.18 (-1.00) . . .
: 203 HOH O 5.83 (-1.00) . . .
: 209 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
: 282 HOH O 2.89 (-1.00) . . .
: 296 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
: 319 HOH O 5.63 (-1.00) . . .
Site 4: 201 HOH O 5.37 (-1.00) . . .