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ANALYSIS FOR THIOMERSAL, ETHYL MERCURY THIOSALICYLAT [HAZ]
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Formula : C9,H9,O2,NA1,S1,HG1
Solution chemistry: [C6,H4]1,[C1,O2]1,[(S1),(HG1),(C1,H2),(C1,H3)]1 -1
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 1GCR GAMMA II CRYSTALLIN (CALF)
|
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS/ACETATE
Addict & conc.:
Comments : PRE X-LINKING 3% (V/V) GLUTALDHYDE .05M PHOSPHATE
Reference : WISTOW et.al. 1983a:1983b:
pH 7.0 Soak time = 14.00 Hours Reference number = 15.00
Site 1: 107 ASP OD2 5.34 ( 7.43) . . T
: 108 ASP O 4.14 ( 6.21) . . E
: 109 CYS SG 2.58 ( 3.04) . . E
: 110 PRO CD 3.79 ( 5.09) . . E
: 111 SER O 4.19 ( 5.26) . . T
: 112 LEU N 5.43 ( 5.62) . . T
: 115 ARG NH1 5.04 ( 5.18) . . T
: 116 PHE CE2 5.77 ( 7.95) . . T
: 217 HOH O 2.47 (-1.00) . . .
: 248 HOH O 2.34 (-1.00) . . .
: 249 HOH O 5.88 (-1.00) . . .
: 426 HOH O 5.93 (-1.00) . . .
Site 2: 40 GLY O 4.21 ( 3.95) . . T
: 41 CYS SG 2.17 ( 3.59) . . E
: 42 TRP N 5.90 ( 7.22) . . E
: 81 ILE O 4.78 ( 6.63) . . E
: 83 GLN NE2 4.06 ( 5.72) . . T
: 170 VAL CG1 5.38 ( 6.97) . . T
: 171 MET O 5.55 ( 5.59) . . T
: 172 ASP OD1 4.52 ( 4.34) . . T
: 211 HOH O 3.07 (-1.00) . . .
: 212 HOH O 5.16 (-1.00) . . .
: 213 HOH O 5.41 (-1.00) . . .
: 269 HOH O 4.79 (-1.00) . . .
: 333 HOH O 4.63 (-1.00) . . .
Site 3: 110 PRO O 5.62 ( 7.45) . . E
: 111 SER CB 5.64 ( 6.91) . . T
: 137 PRO CD 5.69 ( 4.97) . . T
: 138 SER OG 3.10 ( 4.78) . . T
: 140 ARG NH1 4.18 ( 8.50) . . E
: 6 TYR CE1 4.72 ( 6.67) . . E
: 12 GLN C 5.88 ( 6.66) . . E
: 13 GLY O 2.86 ( 5.24) . . E
: 14 HIS CD2 5.20 ( 3.97) . . E
: 15 CYS SG 2.55 ( 3.95) . . E
: 16 TYR N 5.95 ( 7.05) . . E
: 220 HOH O 4.64 (-1.00) . . .
: 302 HOH O 3.80 (-1.00) . . .
: 320 HOH O 0.70 (-1.00) . . .
: 322 HOH O 4.57 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1WSY TRYPTOPHN SYNTHASE (SALMONELLA TYPHIMURIUM)
|
Bound Ligands : PLP PYRIDOXAL 5(PRIME)-PHOSPHATE:
Hev Atom conc.: 3.000 mM
Precip & conc.: 20.000 % PEG 8000
Buffer & conc.: 0.050 M BICINE
Addict & conc.: 0.001 M SPERMIN/EDTA
Comments : TEMP 20 C
Reference : DAVIES et.al. 1987 :HYDE et.al. 1988 :
pH 7.8 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 272.01
Site 1: 154 CYS A SG 2.38 ( 4.06) . . E
: 155 PRO A CD 4.70 ( 4.08) . . .
: 156 PRO A O 5.85 ( 4.88) . . .
: 157 ASN A N 5.90 ( 6.84) . . .
: 158 ALA A CB 4.08 ( 5.35) . . .
: 163 LEU A CD2 4.82 ( 7.52) . . .
: 175 TYR A O 5.71 ( 7.85) . . E
: 176 LEU A CD1 3.58 ( 4.99) . . E
: 177 LEU A CB 5.93 ( 5.73) . . E
: 196 LEU A CD1 3.33 ( 5.71) . . .
: 200 LEU A CD2 5.73 ( 8.94) . . .
Site 2: 119 SER B O 5.86 ( 7.39) . . .
: 120 ALA B O 4.78 ( 4.94) . . .
: 123 SER B OG 4.44 ( 5.05) . . .
: 124 ALA B N 5.10 ( 5.71) . . .
: 128 LEU B O 3.96 ( 5.98) . . E
: 129 LYS B O 5.05 ( 4.46) . . E
: 130 CYS B SG 3.84 ( 2.98) . . E
: 131 ARG B N 4.88 ( 6.01) . . E
: 152 MET B O 4.70 ( 6.73) . . .
: 153 GLY B O 3.87 ( 4.96) . . .
: 154 ALA B O 5.60 ( 3.40) . . E
: 155 GLU B N 4.80 ( 6.18) . . E
Site 3: 52 TYR B CE1 5.52 ( 7.67) . . .
: 125 LEU B CD1 5.47 ( 8.00) . . .
: 60 THR B OG1 5.49 ( 5.37) . . E
: 61 LYS B O 4.07 ( 5.29) . . E
: 62 CYS B SG 2.60 ( 3.08) . . E
: 63 GLN B CB 5.89 ( 5.64) . . .
: 65 ILE B CG1 5.65 ( 7.36) . . .
: 73 LEU B O 5.74 ( 7.44) . . E
: 75 LEU B CD1 5.23 ( 6.12) . . E
: 339 LEU B CD1 4.87 ( 7.31) . . H
: 343 GLU B OE1 3.89 ( 5.13) . . .
: 345 ILE B CD1 4.00 ( 7.31) . . .
Site 4: 82 PHE A CE1 2.87 ( 6.12) . . .
: 99 LEU A CD1 4.32 ( 8.10) . . E
: 114 PHE A CE1 3.67 ( 5.32) . . .
: 115 TYR A O 5.73 ( 5.69) . . .
: 117 ARG A CD 4.92 ( 4.58) . . .
: 118 CYS A SG 2.44 ( 3.50) . . .
: 119 GLU A N 5.88 ( 7.29) . . .
: 121 VAL A CG2 5.91 ( 6.89) . . .
: 123 VAL A CG1 5.90 ( 7.11) . . .
Site 5: 109 GLU B OE1 4.67 ( 7.18) . . E
: 166 LEU B CD1 5.73 ( 6.44) . . .
: 167 LYS B O 5.57 ( 5.33) . . .
: 169 ALA B C 5.89 ( 6.95) . . .
: 170 CYS B SG 1.50 ( 3.72) . . .
: 171 ASN B N 5.51 ( 6.74) . . .
: 186 TYR B OH 4.37 (10.79) . . E
: 188 LEU B CD1 4.57 ( 7.26) . . E
: 280 PHE B CE1 5.81 ( 5.89) . . .
: 306 PHE B CE2 4.46 ( 7.90) . . .
Site 6: 121 LEU B CB 5.93 ( 6.24) . . .
: 148 ARG B O 4.39 ( 6.07) . . .
: 151 LEU B CD2 5.33 ( 5.55) . . .
: 152 MET B SD 2.73 ( 4.12) . . .
: 339 LEU B O 5.43 ( 6.92) . . H
: 340 CYS B SG 3.37 ( 3.48) . . H
: 341 ARG B N 5.00 ( 5.86) . . H
: 344 GLY B O 4.85 ( 4.34) . . .
: 345 ILE B O 4.20 ( 4.81) . . .
: 346 ILE B CD1 3.48 ( 4.56) . . .
Site 7: 25 LEU A CD1 4.36 ( 7.11) . . .
: 52 VAL A CG1 3.98 ( 5.48) . . E
: 77 THR A O 4.34 ( 6.58) . . .
: 78 PRO A O 2.84 ( 4.06) . . .
: 79 ALA A O 5.51 ( 5.49) . . .
: 80 GLN A O 4.93 ( 5.44) . . .
: 81 CYS A SG 2.84 ( 2.21) . . .
: 82 PHE A CE1 5.13 ( 3.85) . . .
: 83 GLU A N 5.35 ( 6.69) . . .
: 85 LEU A CD2 4.14 ( 6.88) . . .
: 99 LEU A CD2 5.72 ( 8.85) . . E
Hev Atom conc.: 0.500 mM
Precip & conc.: 20.000 % PEG 8000
Buffer & conc.: 0.050 M BICINE
Addict & conc.: 0.001 M SPERMIN/EDTA
Comments : TEMP 20 C:IODOACETAMIDE-CYS BLOCKED CYS-340B CYS 1
Reference : DAVIES et.al. 1987 :HYDE et.al. 1988 :
pH 7.8 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 272.02
Site A: 154 CYS A SG 2.30 ( 4.08) . . E
: 155 PRO A CD 4.65 ( 4.13) . . .
: 156 PRO A O 5.77 ( 4.90) . . .
: 157 ASN A N 5.83 ( 6.73) . . .
: 158 ALA A CB 3.86 ( 5.14) . . .
: 163 LEU A CD2 4.62 ( 7.32) . . .
: 175 TYR A O 5.87 ( 8.03) . . E
: 176 LEU A CD1 3.72 ( 5.21) . . E
: 177 LEU A C 5.75 ( 5.95) . . E
: 196 LEU A CD1 3.31 ( 5.65) . . .
: 200 LEU A CD2 5.72 ( 8.86) . . .
Site B: 52 TYR B CE1 5.58 ( 7.67) . . .
: 125 LEU B CD1 5.39 ( 7.94) . . .
: 60 THR B OG1 5.55 ( 5.34) . . E
: 61 LYS B O 3.84 ( 5.11) . . E
: 62 CYS B SG 2.61 ( 2.86) . . E
: 63 GLN B CB 5.65 ( 5.40) . . .
: 65 ILE B CG1 5.60 ( 7.29) . . .
: 73 LEU B O 5.62 ( 7.36) . . E
: 75 LEU B CD1 5.38 ( 6.22) . . E
: 339 LEU B CD1 5.08 ( 7.48) . . H
: 343 GLU B OE1 3.78 ( 5.19) . . .
: 345 ILE B CD1 4.22 ( 7.53) . . .
Site C: 82 PHE A CE1 2.98 ( 6.36) . . .
: 99 LEU A CD1 4.38 ( 8.12) . . E
: 114 PHE A CE1 3.55 ( 5.12) . . .
: 115 TYR A O 5.55 ( 5.47) . . .
: 117 ARG A CD 5.03 ( 4.54) . . .
: 118 CYS A SG 2.28 ( 3.43) . . .
: 119 GLU A N 5.81 ( 7.23) . . .
: 121 VAL A CB 5.97 ( 7.02) . . .
: 123 VAL A CG2 4.85 ( 7.15) . . .
: 126 VAL A CG2 5.87 ( 8.29) . . E
Site D: 109 GLU B OE1 4.58 ( 7.23) . . E
: 166 LEU B CD1 5.84 ( 6.65) . . .
: 167 LYS B O 5.80 ( 5.56) . . .
: 170 CYS B SG 1.69 ( 3.89) . . .
: 171 ASN B N 5.68 ( 6.89) . . .
: 186 TYR B OH 4.28 (10.67) . . E
: 188 LEU B CD1 4.34 ( 7.07) . . E
: 280 PHE B CE1 5.88 ( 5.84) . . .
: 306 PHE B CE2 4.42 ( 7.93) . . .
Site E: 25 LEU A CD1 4.28 ( 7.16) . . .
: 52 VAL A CG1 3.90 ( 5.38) . . E
: 77 THR A O 4.62 ( 6.84) . . .
: 78 PRO A O 3.00 ( 4.21) . . .
: 79 ALA A O 5.74 ( 5.70) . . .
: 80 GLN A O 5.19 ( 5.74) . . .
: 81 CYS A SG 3.00 ( 2.47) . . .
: 82 PHE A CE1 4.98 ( 3.89) . . .
: 83 GLU A N 5.50 ( 6.85) . . .
: 85 LEU A CD2 3.98 ( 6.83) . . .
: 99 LEU A CD2 5.44 ( 8.56) . . E
| PROTEIN: 2AZA AZURIN (ALCALIGENES DENITRIFICANS)
|
Bound Ligands : CU COPPER ION: SO4 SULFATE ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 75.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : BAKER et.al. 1988 :NORRIS et.al. 1983 :
pH 6.0 Soak time = Hours Reference number = 20.03
Site 1: 9 SER A OG 5.52 ( 5.84) . . E
: 14 GLN A O 5.64 ( 6.37) . . E
: 15 TYR A OH 2.63 ( 5.70) . . E
: 33 LEU A CD1 5.67 ( 8.74) . . E
: 46 HIS A NE2 5.66 ( 5.14) . s E [Het: CUCU - N 4.20]
: 47 ASN A OD1 5.54 ( 5.43) . . E
: 48 TRP A CB 5.91 ( 5.53) . . E
: 111 PHE A O 4.92 ( 5.34) . . E
: 112 CYS A SG 3.54 ( 3.52) . s E [Het: CUCU - CB 3.20]
: 113 SER A N 5.76 ( 7.16) . . T
: 117 HIS A ND1 5.58 ( 6.68) . s T [Het: CUCU - CB 3.30]
: 121 MET A SD 3.20 ( 4.58) . s E [Het: CUCU - SD 3.10]
: 122 LYS A N 5.79 ( 6.61) . . E
: 130 CU ACU 3.85 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2CPP CYTOCHROME P450 CAM (PSEUDOMONAS PUTIDA)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX GROUP CONTAINS FE+++: CAM CAMPHOR SUBSTRATE:
Hev Atom conc.: 0.000 mM
Precip & conc.: 40.000 % AMMONIUM SULPHATE/POTASSIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 0.050 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.001 M CAMPHOR (2-BORNANONE)
Comments : TEMP 20 C:HA CONC 3MG/ML
Reference : POULOS et.al. 1982 :1985 :1987 :
pH 7.0 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 213.00
Site 1: 87 PHE CE1 5.95 ( 7.85) . . T
: 96 TYR OH 4.07 ( 9.84) . . H
: 101 THR OG1 5.34 ( 6.94) . . T
: 244 LEU CD1 5.37 ( 8.27) . . H
: 295 VAL CG1 5.22 ( 7.58) . . E
: 297 ASP OD1 4.84 ( 6.07) . . E
: 395 ILE CG2 4.98 ( 7.45) . . E
: 417 HEM O2A 4.27 (-1.00) . . .
: 422 CAM O 2.69 (-1.00) . . .
Site 2: 10 ASN O 3.91 ( 5.30) . . .
: 11 LEU CD1 2.69 ( 5.01) . . .
: 25 ASP OD2 5.95 ( 5.69) . . T
: 26 PHE O 5.23 ( 6.20) . . T
: 27 ASP OD1 5.54 ( 5.02) . . T
: 56 THR OG1 5.27 ( 7.23) . . E
: 57 ARG O 5.04 ( 5.78) . . E
: 58 CYS SG 1.84 ( 3.36) . . E
: 59 ASN OD1 5.86 ( 6.30) . . T
: 638 HOH O 3.91 (-1.00) . . .
: 668 HOH O 3.35 (-1.00) . . .
: 704 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
Site 3: 138 LEU O 5.89 ( 7.68) . . H
: 142 LEU CD1 2.55 ( 4.96) . . H
: 143 ARG N 6.00 ( 6.88) . . H
: 147 GLN O 5.27 ( 6.50) . . E
: 148 CYS SG 2.39 ( 4.65) . . E
: 149 ASN O 5.85 ( 6.57) . . E
: 150 PHE CE1 5.16 ( 5.07) . . E
: 153 ASP OD2 5.55 ( 5.72) . . H
: 154 TYR CD1 5.77 ( 5.90) . . H
: 374 TRP CH2 2.74 ( 8.57) . . H
: 378 ILE CD1 5.41 ( 9.01) . . H
: 404 LEU CD1 5.45 ( 7.17) . . E
: 406 TRP CH2 3.77 ( 9.60) . . T
Site 4: 85 CYS SG 2.66 ( 3.59) . . T
: 86 PRO CD 5.11 ( 4.35) . . T
: 87 PHE O 3.20 ( 4.77) . . T
: 88 ILE CD1 5.83 ( 5.39) . . T
: 89 PRO O 5.63 ( 6.75) . . H
: 90 ARG NH1 5.49 ( 4.94) . . H
: 93 GLY O 5.44 ( 4.36) . . H
: 94 GLU N 5.60 ( 6.66) . . H
: 298 GLY C 5.94 ( 6.60) . . E
: 299 ARG O 4.54 ( 5.57) . . E
: 300 ILE CD1 4.64 ( 5.14) . . E
: 317 GLN OE1 3.43 ( 4.89) . . E
: 318 ILE N 5.99 ( 7.22) . . E
: 583 HOH O 5.82 (-1.00) . . .
: 640 HOH O 5.89 (-1.00) . . .
: 647 HOH O 2.50 (-1.00) . . .
Site 5: 163 PHE CE1 5.81 ( 9.35) . . H
: 167 ALA CB 5.34 ( 5.83) . . H
: 204 LEU CD2 5.80 ( 8.54) . . H
: 219 ALA O 4.76 ( 5.33) . . H
: 220 ILE CD1 3.97 ( 4.09) . . H
: 223 VAL CG1 5.65 ( 6.58) . . H
: 241 MET O 5.31 ( 6.60) . . H
: 242 CYS SG 2.89 ( 3.45) . . H
: 243 GLY N 5.53 ( 6.62) . . H
: 245 LEU CD1 3.64 ( 5.25) . . H
: 246 LEU CD2 4.58 ( 6.32) . . H
Site 6: 21 HIS NE2 5.12 ( 9.48) . . T
: 309 GLY O 4.98 ( 6.52) . . T
: 667 HOH O 3.81 (-1.00) . . .
: 132 GLN O 5.99 ( 8.25) . . H
: 133 GLU O 4.50 ( 5.89) . . H
: 136 CYS SG 4.74 ( 3.97) . . H
: 137 SER OG 5.28 ( 3.76) . . H
: 138 LEU N 5.94 ( 7.29) . . H
: 140 GLU CG 5.33 ( 6.05) . . H
: 377 ARG NH2 5.47 (10.63) . . H
: 562 HOH O 2.23 (-1.00) . . .
: 589 HOH O 4.83 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2CRO CRO PROTEIN (PHAGE 434)
|
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.: 1.000 % MPD / SODIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 1.740 M SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MONDRAGON et.al. 1989 :
pH 6.5 Soak time = Hours Reference number = 320.00
Site 1: 9 ARG NH1 4.10 ( 6.24) . . .
: 52 LEU O 4.82 ( 6.62) . . .
: 53 ASN O 4.83 ( 6.38) . . .
: 54 CYS SG 3.35 ( 3.71) . . .
: 55 ASP O 5.41 ( 5.83) . . .
: 58 TRP CH2 3.22 ( 6.52) . . H
: 103 HOH O 4.93 (-1.00) . . .
: 47 GLU OE2 4.27 ( 6.92) . . H
: 109 HOH O 3.24 (-1.00) . . .
: 117 HOH O 5.48 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2MCG IMMUNOGLOBULIN B-J INTACT MCG
|
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.: 1.600 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : SCHIFFER et.al. 1973 :
pH 6.2 Soak time = 672.00 Hours Reference number = 128.04
Site 1: 129 LEU 2 CD2 5.91 ( 8.93) . . .
: 189 TRP 2 NE1 5.11 ( 8.37) . . .
: 190 LYS 2 NZ 2.48 ( 6.86) . . .
: 212 PRO 2 O 4.81 ( 5.78) . . .
: 215 CYS 2 O 4.80 ( 6.80) d . .
: 216 SER 2 O 4.59 ( 6.33) . . .
: 256 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
: 298 HOH O 2.77 (-1.00) . . .
: 310 HOH O 2.87 (-1.00) . . .
: 311 HOH O 5.97 (-1.00) . . .
: 312 HOH O 3.71 (-1.00) . . .
: 313 HOH O 5.20 (-1.00) . . .
: 18 HOH O 5.46 (-1.00) . . .
: 19 HOH O 4.79 (-1.00) . . .
Site 2: 129 LEU 1 CD2 5.93 ( 7.15) . . .
: 189 TRP 1 NE1 5.57 ( 8.74) . . .
: 190 LYS 1 NZ 2.65 ( 6.92) . . .
: 213 THR 1 O 3.44 ( 4.82) . . .
: 214 GLU 1 OE1 5.13 ( 3.40) . . .
: 215 CYS 1 N 5.48 ( 6.67) d . .
: 216 SER 1 OXT 5.44 ( 6.70) . . .
: 124 HOH O 4.18 (-1.00) . . .
Site 3: 36 SER 1 OG 5.88 ( 8.15) . . .
: 38 TYR 1 OH 4.29 (10.26) . . .
: 99 PHE 1 CE1 5.36 ( 7.53) . . .
: 36 SER 2 OG 5.99 ( 7.86) . . .
: 38 TYR 2 OH 4.44 (10.67) . . .
: 99 PHE 2 CE1 4.64 ( 7.82) . . .
: 170 HOH O 5.18 (-1.00) . . .
: 171 HOH O 5.03 (-1.00) . . .
: 225 HOH O 5.91 (-1.00) . . .
: 229 HOH O 1.95 (-1.00) . . .
Site 4: 93 TYR 1 CE2 5.87 ( 9.57) . . .
: 34 TYR 2 CE2 5.79 ( 8.41) . . .
: 99 PHE 2 CZ 5.80 (10.78) . . .
: 16 HOH O 3.68 (-1.00) . . .
: 120 HOH O 5.98 (-1.00) . . .
: 164 HOH O 4.42 (-1.00) . . .
: 170 HOH O 2.71 (-1.00) . . .
: 171 HOH O 1.45 (-1.00) . . .
: 176 HOH O 3.66 (-1.00) . . .
: 225 HOH O 2.05 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2SSI SUBTILISIN INHIBITOR (STREPTOMYCES)
|
Hev Atom conc.: 2.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS/HCL
Addict & conc.:
Comments :
Reference : HIRONO et.al. 1979 :MITSUI et.al. 1979 :
pH Soak time = 168.00 Hours Reference number = 39.02
Site 1: 12 LEU CD1 5.62 ( 8.69) . . E
: 53 LEU CD2 5.84 ( 8.27) . . T [Het: CUCU - CD2 3.20]
: 58 GLY O 1.93 ( 3.91) . . T
: 59 ASP O 5.81 ( 4.13) . . T
: 60 LEU CD1 4.60 ( 6.02) . . T
: 86 TRP NE1 5.68 ( 5.46) . . E
: 89 LYS O 5.65 ( 7.48) . . E
: 90 ARG O 5.11 ( 6.96) . . E
: 91 VAL CG1 2.46 ( 4.78) . . E
Site 2: 57 GLY O 5.10 ( 7.32) . . T
: 58 GLY O 2.89 ( 4.62) . . T
: 59 ASP OD1 5.18 ( 3.39) . . T
: 60 LEU N 5.15 ( 6.62) . . T
: 89 LYS CD 5.80 ( 7.89) . . E
: 90 ARG O 5.35 ( 7.73) . . E
: 91 VAL CG1 4.42 ( 6.16) . . E
| PROTEIN: 3PFK PHOSPHOFRUCTOKINASE (BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS)
|
Bound Ligands : PO4 PHOSPHATE:
Hev Atom conc.: 0.250 mM
Precip & conc.: 2.000 M POTASSIUM PHOSPHATE
Buffer & conc.: 2.000 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : HUDSON et.al. 1979 :1978 :
pH 7.3 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 156.01
Site 1: 41 TYR O 4.55 ( 5.43) . . H
: 42 ALA O 4.00 ( 2.67) . . H
: 43 GLY N 4.98 ( 6.24) . . H
: 45 ILE CD1 4.11 ( 6.10) . . H
: 72 ARG O 4.63 ( 6.47) . . .
: 73 CYS SG 1.81 ( 3.60) . . 5
: 74 PRO N 5.05 ( 6.22) . . 5
: 75 GLU OE2 5.76 ( 5.39) . . 5
: 76 PHE N 5.53 ( 6.25) . . 5
: 45 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
: 77 HOH O 1.61 (-1.00) . . .
Site 2: 106 TYR OH 3.87 ( 5.80) . . H
: 121 GLY O 5.27 ( 5.29) . . E
: 130 ILE CG2 5.38 ( 7.60) . . .
: 131 PRO O 4.72 ( 6.95) . . .
: 282 ARG O 4.98 ( 6.01) . . E
: 283 CYS SG 1.94 ( 3.29) . . E
: 284 VAL O 5.30 ( 6.09) . . E
: 294 HIS O 5.51 ( 6.46) . . E
: 295 ASP O 5.43 ( 6.71) . . H
: 296 ILE CD1 4.90 ( 4.28) . . H
: 299 ALA CB 4.56 ( 5.81) . . H
: 300 LEU N 5.94 ( 6.65) . . H
: 34 HOH O 3.69 (-1.00) . . .
: 82 HOH O 4.46 (-1.00) . . .
Site 3: 97 LEU O 5.59 ( 7.45) . . E
: 99 VAL CG2 5.61 ( 6.75) . . E
: 106 TYR O 4.59 ( 5.76) . . H
: 108 GLY O 5.60 ( 6.71) . . H
: 109 ALA O 2.89 ( 2.98) . . H
: 110 LYS O 5.83 ( 4.64) . . H
: 112 LEU CB 5.82 ( 6.53) . . H
: 113 THR OG1 4.80 ( 6.22) . . H
: 117 PHE O 5.93 ( 8.24) . . .
: 118 PRO C 5.81 ( 6.74) . . E
: 119 CYS SG 4.02 ( 3.64) . . E
: 120 VAL O 4.91 ( 4.39) . . E
: 121 GLY N 4.49 ( 5.15) . . E
: 280 GLY C 5.99 ( 6.68) . . .
: 281 GLY O 5.47 ( 4.38) . . .
: 282 ARG O 4.43 ( 5.99) . . E
: 296 ILE CD1 2.77 ( 6.66) . . H
| PROTEIN: 5RUB RIBULOSE -1,5 - BISPHOSPHATE CARBOXYLASE/OXYLASE (
|
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M MES
Addict & conc.:
Comments :
Reference : LINDQVIST et.al. 1988 :SCHNEIDER et.al. 1986 :
pH 5.6 Soak time = 240.00 Hours Reference number = 178.00
Site 1: 288 ARG A NH1 3.82 ( 9.36) . . T
: 305 ALA A O 3.09 ( 4.05) . . H
: 306 PHE A O 5.05 ( 4.42) . . H
: 308 HIS A CB 5.78 ( 6.11) . . H
: 309 CYS A SG 2.22 ( 4.52) . . H
: 321 HIS A O 5.14 ( 7.35) . . E
: 322 THR A OG1 5.53 ( 4.58) . . T
: 339 ILE A CD1 2.77 ( 5.47) . . H
: 343 LEU A CD1 5.96 ( 8.87) . . H
: 307 HOH O 4.86 (-1.00) . . .
: 387 HOH O 5.56 (-1.00) . . .
: 592 HOH O 5.37 (-1.00) . . .
: 664 HOH O 3.13 (-1.00) . . .
Site 2: 288 ARG B NH1 3.33 ( 8.66) . . T
: 304 THR B O 5.93 ( 7.53) . . T
: 305 ALA B O 2.74 ( 3.85) . . H
: 306 PHE B O 5.02 ( 4.62) . . H
: 307 VAL B N 5.91 ( 6.78) . . H
: 308 HIS B CD2 5.72 ( 5.42) . . H
: 309 CYS B SG 1.64 ( 4.03) . . H
: 310 LYS B N 5.80 ( 7.24) . . H
: 320 ILE B CD1 5.51 ( 7.64) . . E
: 321 HIS B O 4.91 ( 7.22) . . E
: 322 THR B CG2 4.88 ( 4.90) . . T
: 339 ILE B CD1 3.66 ( 6.24) . . H
: 343 LEU B CD1 5.98 ( 9.02) . . H
: 535 HOH O 5.07 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 6ADH ALCOHOL DEHYDROGENASE (HOLO)/HADH/DMSO
|
Bound Ligands : ZN CATALYTIC ZINC(II) ION: NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE: DMS DIMETHYL SULFOXIDE:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 25.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.050 M TES
Addict & conc.: NADH(COENZYME)/DMSO(INHIBITOR)
Comments : ACON IS QUOTED AT 5MG/.5ML
Reference : BRANDEN et.al. 1979 :EKLUND et.al. 1981 :
pH 7.0 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 98.01
Site 1: 82 THR A O 5.64 ( 7.87) . . T
: 83 VAL A CG2 5.16 ( 4.36) . . T
: 84 ARG A NE 5.99 ( 3.06) . . T
: 85 PRO A O 4.44 ( 4.80) . . T
: 86 GLY A O 5.87 ( 5.91) . . E
: 87 ASP A OD1 1.61 ( 3.91) . . E
: 88 LYS A N 5.77 ( 7.06) . . E
: 159 LYS A NZ 4.86 ( 7.24) . . E
Site 2: 125 ASP B OD2 5.86 ( 8.00) . . T
Site 3: 272 LEU A CG 5.83 ( 5.67) . . H
: 276 VAL A CG1 5.98 ( 6.50) . . H
: 300 ASN A O 4.06 ( 5.18) . . T
: 301 LEU A CD1 2.92 ( 1.45) . . T
: 302 SER A OG 5.17 ( 2.99) . . T
: 303 MET A CB 4.92 ( 4.82) . . T
: 301 LEU B O 5.45 ( 7.84) . . T
: 303 MET B O 4.97 ( 6.76) . . T
Site 4: 183 ALA B O 4.14 ( 5.95) . . H
: 187 ALA B O 3.01 ( 4.11) . . H
: 188 LYS B CG 5.80 ( 3.37) . . H
: 189 VAL B CG1 4.16 ( 1.78) . . T
: 190 THR B OG1 4.35 ( 4.53) . . T
: 193 SER B OG 5.86 ( 8.01) . . E
: 214 ALA B CB 5.93 ( 7.27) . . H
: 264 PHE B CE1 3.53 ( 5.97) . . E
: 266 PHE B CZ 5.68 ( 9.95) . . E
: 288 VAL B CG2 5.93 ( 7.38) . . E
Site 5: 44 GLY A O 3.71 ( 5.19) . . E
: 45 ILE A CD1 5.08 ( 1.77) . . E
: 46 CYS A SG 5.31 ( 2.58) . s T [Het: ZNZN - CB 3.50]
: 47 ARG A O 6.00 ( 4.86) . s T [Het: NADAO1 - CG 3.80]
: 48 SER A N 5.85 ( 6.81) . s T [Het: NADNO2* - N 3.40]
: 49 ASP A OD1 4.16 ( 5.22) . . T
: 50 ASP A N 5.65 ( 6.52) . . T
: 67 HIS A CE1 6.00 ( 8.73) . s T [Het: ZNZN - CD2 3.30]
: 146 PHE A CZ 5.41 (10.46) . . T
: 359 PHE A CE1 5.21 ( 6.58) . . H
: 362 LEU A CD1 5.18 ( 7.54) . . H [Het: NADAO2 - CD1 3.50]
: 369 ARG A NH1 5.96 ( 7.30) . s E [Het: NADNP - NH1 4.00]
: 3 NAD ANO1 5.99 (-1.00) . s .
Site 6: 18 LYS B NZ 4.15 ( 9.11) . . T
: 158 ALA B CB 5.42 ( 5.92) . . E
: 159 LYS B O 3.49 ( 5.28) . . E
: 160 ILE B N 5.70 ( 6.03) . . E
: 325 LYS B O 4.14 ( 6.14) . . H
: 326 ASP B O 5.78 ( 5.61) . . H
: 329 PRO B CD 4.29 ( 4.17) . . H
: 330 LYS B N 5.62 ( 6.85) . . H
Site 7: 44 GLY A O 3.14 ( 4.20) . . E
: 45 ILE A CG1 5.83 ( 3.37) . . E
: 46 CYS A SG 3.35 ( 2.15) . s T [Het: ZNZN - CB 3.50]
: 47 ARG A N 4.49 ( 5.88) . s T [Het: NADAO1 - CG 3.80]
: 49 ASP A OD1 4.39 ( 6.32) . . T
: 67 HIS A NE2 4.63 ( 7.08) . s T [Het: ZNZN - CD2 3.30]
: 68 GLU A OE1 3.74 ( 5.34) . . E
: 174 CYS A CB 5.87 ( 7.13) . s H [Het: ZNZN - CB 3.50]
: 175 GLY A N 5.98 ( 6.14) . . H
: 369 ARG A NH1 4.73 ( 7.41) . s E [Het: NADNP - NH1 4.00]
: 1 ZN AZN 4.59 (-1.00) . s .
: 3 NAD ANO1 5.50 (-1.00) . s .
Site 8: 96 GLN B OE1 3.95 ( 8.17) . . T [Het: ZNZN - C 3.80]
: 325 LYS B O 5.26 ( 5.96) . . H
: 326 ASP B OD1 1.74 ( 4.80) . . H
Hev Atom conc.: 0.100 mM
Precip & conc.: 25.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.050 M TES
Addict & conc.: NAD+ (COENZYME)/EMTS (INHIBITOR)
Comments : CO-XL
Reference : BRANDEN et.al. 1979 :EKLUND et.al. 1981 :
pH 7.0 Soak time = Hours Reference number = 98.02
Site A: 82 THR A O 5.09 ( 7.32) . . T
: 83 VAL A CG1 5.57 ( 3.85) . . T
: 84 ARG A NE 5.89 ( 2.95) . . T
: 85 PRO A O 4.90 ( 5.07) . . T
: 86 GLY A N 5.79 ( 6.38) . . E
: 87 ASP A OD1 2.05 ( 4.22) . . E
: 88 LYS A N 5.97 ( 7.20) . . E
: 89 VAL A CG1 5.90 ( 7.89) . . E
: 159 LYS A NZ 4.66 ( 6.93) . . E
Site B: 125 ASP B OD2 5.72 ( 7.92) . . T
Site D: 183 ALA B O 4.22 ( 5.83) . . H
: 186 VAL B O 5.84 ( 7.05) . . H
: 187 ALA B O 2.38 ( 3.46) . . H
: 188 LYS B CG 5.62 ( 3.28) . . H
: 189 VAL B CG1 4.79 ( 2.44) . . T
: 190 THR B OG1 4.86 ( 5.24) . . T
: 264 PHE B CE1 3.90 ( 5.83) . . E
: 266 PHE B CE2 5.99 ( 9.59) . . E
: 288 VAL B CG1 5.89 ( 6.82) . . E