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ANALYSIS FOR MEROXYL MERCUHYDRIN [HAN]
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Formula : H16,O6,HG1,C9,N2
Solution chemistry: [(H1,O1),(HG1),(C1,H2),{(C1,H1),(O1),(C1,H3)},(C1,
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 1GPD GLYCERALDEHYDE-3P-DEHYDROGENASE (LOBSTER)
|
Bound Ligands : NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE: SPS SUBSTRATE PHOSPHATE: IPS INORGANIC PHOSPHATE:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 69.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : BUEHNER et.al. 1974 :MORAS et.al. 1975 :
pH 6.2 Soak time = Hours Reference number = 124.02
Site 1: 165 PHE R CE1 5.73 ( 8.58) . . H
: 246 LEU R CD1 5.58 ( 8.13) . . E
: 248 LYS R O 4.53 ( 5.45) . . .
: 249 GLU R O 4.78 ( 5.74) . . .
: 250 CYS R SG 1.41 ( 2.85) . . .
: 251 SER R O 4.72 ( 4.51) . . H
: 252 TYR R N 5.45 ( 6.20) . . H
: 301 SER R O 5.35 ( 7.03) . . E
: 302 LYS R O 3.59 ( 5.19) . . .
: 303 THR R N 5.75 ( 5.98) . . E
: 304 PHE R O 5.84 ( 6.31) . . E
: 305 VAL R CG1 4.56 ( 6.13) . . E
: 165 PHE G CE2 5.43 ( 8.91) . . .
: 246 LEU G CD1 4.20 ( 7.62) . . .
: 249 GLU G O 4.98 ( 5.95) . . .
: 250 CYS G SG 2.04 ( 2.56) . . .
: 251 SER G OG 5.66 ( 4.09) . . .
: 252 TYR G CB 5.82 ( 4.96) . . .
: 254 ASP G CB 5.97 ( 6.80) . . .
: 255 ILE G CD1 3.47 ( 6.16) . . .
: 300 LEU G CB 5.06 ( 5.77) . . .
: 301 SER G O 5.41 ( 5.70) . . .
: 302 LYS G O 4.35 ( 5.67) . . .
: 304 PHE G O 5.14 ( 6.64) . . .
: 305 VAL G CG1 4.52 ( 5.57) . . .
Site 2: 165 PHE G CE2 4.36 ( 8.28) . . .
: 246 LEU G CD1 4.67 ( 8.03) . . .
: 249 GLU G O 4.84 ( 6.31) . . .
: 250 CYS G SG 3.30 ( 2.82) . . .
: 251 SER G OG 4.97 ( 3.87) . . .
: 252 TYR G O 5.72 ( 4.58) . . .
: 254 ASP G CB 4.90 ( 5.67) . . .
: 255 ILE G CD1 2.70 ( 4.90) . . .
: 300 LEU G CB 5.84 ( 6.69) . . .
: 302 LYS G O 5.36 ( 6.82) . . .
: 305 VAL G CG1 5.00 ( 6.41) . . .
: 165 PHE R CE1 4.64 ( 7.99) . . .
: 246 LEU R CD1 5.51 ( 8.46) . . .
: 248 LYS R O 4.17 ( 5.65) . . .
: 249 GLU R O 4.02 ( 5.47) . . .
: 250 CYS R SG 0.63 ( 2.61) . . .
: 251 SER R O 3.94 ( 4.30) . . .
: 252 TYR R N 5.17 ( 5.80) . . .
: 254 ASP R CB 5.15 ( 6.19) . . .
: 255 ILE R CG2 5.67 ( 5.59) . . .
: 302 LYS R O 4.80 ( 6.49) . . .
: 305 VAL R CG1 4.89 ( 6.84) . . .
Site 3: 165 PHE G CE2 4.98 ( 8.46) . . H
: 246 LEU G CD1 4.54 ( 7.64) . . E
: 249 GLU G O 5.80 ( 7.00) . . .
: 250 CYS G SG 3.39 ( 3.79) . . .
: 251 SER G O 4.04 ( 5.00) . . H
: 252 TYR G CB 5.80 ( 4.90) . . H
: 255 ILE G CD1 2.04 ( 5.29) . . H
: 300 LEU G CB 5.62 ( 6.19) . . E
: 301 SER G N 5.98 ( 6.72) . . E
: 302 LYS G O 5.45 ( 6.99) . . .
: 304 PHE G O 5.48 ( 6.87) . . E
: 305 VAL G CG1 3.67 ( 5.13) . . E
: 165 PHE R CE1 5.03 ( 8.10) . . .
: 246 LEU R CD1 5.00 ( 7.99) . . .
: 248 LYS R O 4.96 ( 6.11) . . .
: 249 GLU R O 5.32 ( 6.64) . . .
: 250 CYS R SG 1.44 ( 3.91) . . .
: 251 SER R O 4.50 ( 5.02) . . .
: 252 TYR R N 5.35 ( 5.75) . . .
: 255 ILE R CG1 5.69 ( 5.85) . . .
: 301 SER R O 5.95 ( 7.71) . . .
: 302 LYS R O 4.65 ( 6.36) . . .
: 304 PHE R O 5.92 ( 6.32) . . .
: 305 VAL R CG1 3.49 ( 5.52) . . .
Site 4: 165 PHE R CE1 4.72 ( 8.11) . . .
: 246 LEU R CD1 5.52 ( 8.52) . . .
: 248 LYS R O 4.47 ( 5.91) . . .
: 249 GLU R O 4.35 ( 5.83) . . .
: 250 CYS R SG 0.83 ( 2.92) . . .
: 251 SER R O 3.83 ( 4.29) . . .
: 252 TYR R N 5.00 ( 5.56) . . .
: 254 ASP R CB 5.25 ( 6.22) . . .
: 255 ILE R CG1 5.80 ( 5.46) . . .
: 302 LYS R O 4.89 ( 6.56) . . .
: 305 VAL R CG1 4.59 ( 6.56) . . .
: 165 PHE G CE2 4.51 ( 8.41) . . .
: 246 LEU G CD1 4.80 ( 8.11) . . .
: 249 GLU G O 5.19 ( 6.62) . . .
: 250 CYS G SG 3.38 ( 3.14) . . .
: 251 SER G OG 5.19 ( 4.04) . . .
: 252 TYR G O 5.58 ( 4.43) . . .
: 254 ASP G CB 5.09 ( 5.78) . . .
: 255 ILE G CD1 2.41 ( 4.81) . . .
: 300 LEU G CB 5.70 ( 6.52) . . .
: 302 LYS G O 5.53 ( 6.98) . . .
: 305 VAL G CG1 4.77 ( 6.17) . . .
Site 5: 130 CYS R SG 3.21 ( 4.95) d . .
: 133 ASN R CG 4.96 ( 7.34) . . .
: 270 PHE R CE2 5.26 ( 9.56) . . .
: 320 ARG R O 5.15 ( 6.17) . . H
: 322 ILE R O 5.88 ( 7.51) . . H
: 323 ASP R OD1 5.19 ( 3.97) . . H
: 324 LEU R O 5.89 ( 4.38) . . H
: 327 HIS R CD2 5.11 ( 5.66) . . H
: 130 CYS G SG 3.17 ( 4.65) d . .
: 133 ASN G AD1 5.25 ( 8.64) . . .
: 270 PHE G CE2 4.95 ( 9.04) . . .
: 319 GLN G O 5.42 ( 7.76) . . .
: 320 ARG G O 5.03 ( 5.15) . . .
: 322 ILE G O 5.58 ( 7.01) . . .
: 323 ASP G OD1 4.46 ( 3.30) . . .
: 324 LEU G O 5.78 ( 4.26) . . .
: 326 LYS G CG 5.70 ( 6.79) . . .
: 327 HIS G CD2 5.57 ( 5.70) . . .
Site 6: 129 VAL G CG2 5.72 ( 4.41) . . .
: 130 CYS G SG 1.12 ( 2.01) d . .
: 131 GLY G N 4.34 ( 5.74) . . .
: 133 ASN G CG 5.24 ( 6.69) . . .
: 146 ASN G CG 5.44 ( 7.41) . . .
: 152 ASN G AD2 5.77 ( 8.57) . . .
: 270 PHE G CE2 5.02 ( 8.79) . . .
: 320 ARG G CD 5.19 ( 4.45) . . .
: 321 VAL G N 5.65 ( 6.25) . . .
: 323 ASP G OD1 5.25 ( 4.99) . . .
: 324 LEU G CD2 5.65 ( 4.39) . . .
: 327 HIS G CB 5.97 ( 7.35) . . .
: 128 PHE R O 5.87 ( 6.85) . . .
: 129 VAL R CG2 5.75 ( 4.44) . . .
: 130 CYS R SG 2.56 ( 2.70) d . .
: 131 GLY R N 5.10 ( 6.43) . . .
: 133 ASN R CG 3.78 ( 5.36) . . .
: 146 ASN R AD2 5.39 ( 7.79) . . .
: 320 ARG R O 4.15 ( 5.55) . . .
: 323 ASP R O 5.42 ( 5.70) . . .
: 324 LEU R CD2 5.46 ( 4.71) . . .
Site 7: 129 VAL G O 5.53 ( 6.31) . . .
: 130 CYS G SG 1.97 ( 2.95) d . .
: 131 GLY G N 4.75 ( 5.89) . . .
: 133 ASN G CG 5.96 ( 7.68) . . .
: 270 PHE G CE1 5.71 ( 7.59) . . .
: 319 GLN G O 5.60 ( 7.71) . . H
: 320 ARG G NH2 5.82 ( 4.62) . . H
: 323 ASP G OD1 4.14 ( 4.41) . . H
: 324 LEU G CB 5.64 ( 5.16) . . H
: 129 VAL R O 5.31 ( 6.14) . . .
: 130 CYS R SG 1.39 ( 3.08) d . .
: 131 GLY R N 4.99 ( 6.18) . . .
: 133 ASN R CG 4.39 ( 6.40) . . .
: 270 PHE R CE1 5.17 ( 8.29) . . .
: 320 ARG R O 4.84 ( 5.62) . . .
: 323 ASP R OD1 5.07 ( 5.03) . . .
: 324 LEU R CB 5.66 ( 5.33) . . .
: 135 GLU G OE1 5.54 ( 7.96) . . .
Site 8: 129 VAL R C 5.83 ( 6.93) . . .
: 130 CYS R SG 2.67 ( 4.20) d . .
: 133 ASN R CG 4.39 ( 6.69) . . .
: 270 PHE R CE2 5.32 ( 9.42) . . .
: 320 ARG R O 4.82 ( 5.94) . . .
: 323 ASP R OD1 5.32 ( 4.33) . . .
: 324 LEU R CD2 5.89 ( 4.34) . . .
: 327 HIS R CD2 5.17 ( 6.01) . . .
: 129 VAL G C 5.79 ( 6.93) . . .
: 130 CYS G SG 2.46 ( 3.85) d . .
: 131 GLY G N 5.91 ( 7.07) . . .
: 133 ASN G CG 5.97 ( 8.00) . . .
: 270 PHE G CE2 4.66 ( 8.81) . . .
: 319 GLN G O 5.55 ( 7.81) . . .
: 320 ARG G CD 5.68 ( 4.87) . . .
: 322 ILE G O 5.95 ( 7.20) . . .
: 323 ASP G OD1 4.50 ( 3.62) . . .
: 324 LEU G O 5.87 ( 4.14) . . .
: 327 HIS G CD2 5.52 ( 5.99) . . .
| PROTEIN: 3FAB IMMUNOGLOBULIN FAB (PRIME) NEW
|
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 45.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : POLJAK et.al. 1971 :1972 :
pH 6.0 Soak time = Hours Reference number = 137.06
Site 1: 29 GLY L O 5.88 ( 7.70) . . .
: 30 ASN L OD1 5.37 ( 4.46) . . .
: 31 HIS L CB 5.11 ( 5.69) . . E
: 90 TYR L OH 5.78 ( 5.23) . . E
: 100 ILE H CG2 4.56 ( 5.89) . . E
: 101 ALA H CB 5.53 ( 5.14) . . E
: 200 GLU L OE1 3.60 ( 5.52) . . .
Site 2: 140 ASP L OD2 5.93 ( 8.24) . . E
: 169 GLN L OE1 4.33 ( 7.94) . . E
: 167 VAL H O 4.88 ( 6.28) . . E
: 168 HIS H NE2 5.71 ( 4.97) . . E
Site 3: 49 HIS L NE2 2.57 ( 6.31) . . .
: 50 ASN L OD1 4.18 ( 6.85) . . .
: 37 GLN L O 5.97 ( 7.65) . . E
: 84 ASP L OD1 2.60 ( 5.18) . . E
: 86 TYR L OH 4.62 ( 9.88) . . E
: 104 LYS L CG 5.61 ( 5.86) . . E [Het: NDPAO1 - C 4.10]
: 43 ARG H NH1 1.68 ( 5.50) . . E