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ANALYSIS FOR CHLOROETHYLMERCURY [HAE]
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Formula : C2,H5,HG1,CL1
Solution chemistry: [(H3,C1),(C1,H2),(HG1)]1 +1
All distances below are to the element HG [ mercury ]
PROTEIN: 1GCR GAMMA II CRYSTALLIN (CALF)
|
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS/ACETATE
Addict & conc.:
Comments : PRE X-LINKING 3% (V/V) GLUTALDHYDE .05M PHOSPHATE
Reference : WISTOW et.al. 1983a:1983b:
pH 7.0 Soak time = 14.00 Hours Reference number = 15.01
Site 1: 107 ASP OD2 5.51 ( 7.69) . . T
: 108 ASP O 4.56 ( 6.60) . . E
: 109 CYS SG 2.50 ( 3.39) . . E
: 110 PRO CD 4.23 ( 5.40) . . E
: 111 SER O 3.96 ( 5.24) . . T
: 112 LEU CD1 5.76 ( 5.34) . . T
: 115 ARG NH1 4.95 ( 4.73) . . T
: 116 PHE CE2 5.39 ( 7.47) . . T
: 217 HOH O 2.48 (-1.00) . . .
: 248 HOH O 2.53 (-1.00) . . .
: 249 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
Site 2: 40 GLY O 4.08 ( 4.03) . . T
: 41 CYS SG 1.94 ( 3.59) . . E
: 42 TRP N 5.92 ( 7.28) . . E
: 58 ARG CD 5.72 ( 6.38) . . T
: 81 ILE O 5.19 ( 6.97) . . E
: 83 GLN NE2 4.28 ( 6.09) . . T
: 170 VAL CG1 5.43 ( 6.91) . . T
: 171 MET O 5.21 ( 5.41) . . T
: 172 ASP OD1 4.11 ( 3.97) . . T
: 211 HOH O 3.50 (-1.00) . . .
: 212 HOH O 5.61 (-1.00) . . .
: 213 HOH O 5.43 (-1.00) . . .
: 269 HOH O 4.71 (-1.00) . . .
: 333 HOH O 4.25 (-1.00) . . .
Site 3: 110 PRO O 5.84 ( 7.73) . . E
: 111 SER CB 5.81 ( 7.10) . . T
: 137 PRO CD 5.54 ( 4.98) . . T
: 138 SER OG 3.40 ( 4.98) . . T
: 140 ARG NH1 3.94 ( 8.43) . . E
: 6 TYR OH 5.99 ( 6.67) . . E
: 11 PHE O 5.99 ( 7.71) . . T
: 12 GLN C 5.92 ( 6.63) . . E
: 13 GLY O 3.05 ( 5.43) . . E
: 14 HIS CD2 5.52 ( 4.30) . . E
: 15 CYS SG 2.40 ( 4.04) . . E
: 16 TYR N 5.97 ( 7.07) . . E
: 220 HOH O 4.28 (-1.00) . . .
: 302 HOH O 3.67 (-1.00) . . .
: 320 HOH O 0.85 (-1.00) . . .
: 322 HOH O 4.92 (-1.00) . . .
Site 4: 5 PHE CD1 5.40 ( 4.50) . . E
: 6 TYR O 3.46 ( 4.25) . . E
: 7 GLU OE1 5.35 ( 3.99) . . E
: 14 HIS O 5.33 ( 7.33) . . E
: 29 PHE CE1 3.02 ( 4.86) . . T
: 30 SER C 5.41 ( 5.91) . . T
: 31 ARG CG 5.42 ( 4.47) . . T
: 32 CYS SG 3.75 ( 3.18) . . T
: 33 ASN N 4.84 ( 6.28) . . T
: 34 SER O 5.68 ( 7.27) . . E
: 75 ILE O 5.97 ( 6.90) . . T
Site 5: 90 MET O 3.97 ( 5.76) . . E
: 91 ARG NE 5.50 ( 2.34) . . E
: 92 ILE CD1 5.47 ( 3.53) . . E
: 93 TYR OH 5.78 ( 5.87) . . E
: 102 MET SD 3.02 ( 4.42) . . E
: 103 SER OG 5.37 ( 3.32) . . E
: 104 GLU CD 5.69 ( 3.39) . . E
: 105 ILE N 4.79 ( 6.11) . . E
: 214 HOH O 5.98 (-1.00) . . .
: 417 HOH O 5.92 (-1.00) . . .
Site 6: 3 ILE CG2 5.42 ( 7.90) . . E
: 5 PHE CE1 4.11 ( 7.95) . . E
: 18 CYS SG 4.64 ( 6.28) . . E
: 20 SER O 5.61 ( 7.89) . . T
: 21 ASP C 5.98 ( 6.65) . . E
: 22 CYS SG 5.22 ( 4.96) . . E
: 25 LEU CD1 2.38 ( 5.69) . . T
: 29 PHE CE2 5.60 ( 9.98) . . T
: 42 TRP CE3 5.87 ( 8.61) . . E
: 44 LEU CD2 5.11 ( 6.30) . . E
: 75 ILE CG2 5.12 ( 6.95) . . T
: 76 ARG O 5.90 ( 6.33) . . T
: 77 SER O 4.05 ( 4.29) . . E
: 78 CYS SG 1.79 ( 3.48) . . E
: 79 ARG N 5.44 ( 6.68) . . E
Site 7: 16 TYR OH 4.84 (10.31) . . E
: 18 CYS SG 5.81 ( 7.98) . . E
: 21 ASP O 5.15 ( 7.19) . . E
: 22 CYS SG 1.74 ( 3.92) . . E
: 23 PRO CD 4.45 ( 5.44) . . E
: 24 ASN O 3.57 ( 4.84) . . T
: 25 LEU CD2 4.84 ( 5.13) . . T
: 28 TYR OH 3.89 ( 7.90) . . T
: 202 HOH O 5.68 (-1.00) . . .
Bound Ligands : CYA TWO OXYGEN ATOMS BOUND TO SG OF CYS-25.: NH4 AMMONIUM ION:
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 25.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : TEMP 4 C
Reference : BAKER et.al. 1976 :1977 :
pH 6.0 Soak time = 120.00 Hours Reference number = 42.02
Site 1: 19 GLN OE1 5.32 ( 9.18) . s T [Het: CYA OD1 - NE2 3.20]
: 23 GLY O 5.14 ( 5.06) . . T [Het: CYA OD1 - CA 3.70]
: 24 GLY N 5.79 ( 6.41) . . T [Het: CYA OD1 - N 3.80]
: 25 CYS SG 2.31 ( 4.88) . s T [Het: CYA OD1 - N 2.80]
: 26 TRP N 5.80 ( 6.98) . . T [Het: CYA OD2 - N 3.00]
: 161 ASP OD1 5.66 ( 5.58) . . T
: 162 HIS NE2 5.05 ( 3.61) . s E [Het: CYA OD1 - ND1 3.90]
: 163 ALA O 5.88 ( 5.89) . s E [Het: CYA OD2 - N 3.10]
: 1 CYA I OD1 2.13 (-1.00) . . .
: 77 HOH O 3.79 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 5.05 (-1.00) . . .
: 212 HOH O 5.01 (-1.00) . . .
: 215 HOH O 3.92 (-1.00) . . .
: 216 HOH O 1.81 (-1.00) . . .
: 222 HOH O 4.16 (-1.00) . . .
: 223 HOH O 2.54 (-1.00) . . .
PROTEIN: 2CHY CHE Y (SALMONELLA TYPHIMURIUM)
|
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 0.500 % ACETONITRILE
Comments : DIRECT SITE MUTERGENISIS:SER____CYS (S 56C): TEMP
Reference : MOTTONEN et.al. 1989 :STOCK et.al. 1989 :
pH 5.0 Soak time = 5.00 Hours Reference number = 326.00
Site 1: 56 CYS CA 3.98 ( 3.98) . . E
: 57 ASP CA 4.46 ( 4.46) . . .
: 58 TRP CA 5.24 ( 5.24) . . .
: 65 GLY CA 3.50 ( 3.50) . . .
: 85 MET CA 4.40 ( 4.40) . . E
PROTEIN: 4INS INSULIN (PORCINE 2-ZN)
|
Bound Ligands : ZN ZINC ION ON 3-FOLD CRYSTAL AXIS:
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 0.010 M ZINC ACETATE
Comments :
Reference : ADAMS et.al. 1969 :DODSON et.al. 1989 :SCHLICHTKRULL et.al. 1956a:1956b:
pH 6.3 Soak time = Hours Reference number = 278.08
Site 1: 9 SER B OG 4.88 ( 5.86) . . .
: 13 GLU B OE2 4.00 ( 7.13) . s .
: 9 SER D O 4.78 ( 6.71) . . T
: 10 HIS D O 5.39 ( 5.53) . . T [Het: ZNZN - CD2 3.10]
: 12 VAL D O 5.91 ( 6.72) . s T
: 13 GLU D OE1 1.27 ( 3.29) . s T
: 14 ALA D N 5.05 ( 6.28) . s T
: 18 HOH O 3.82 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 3.88 (-1.00) . . .
: 41 HOH O 3.41 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 3.90 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 3.63 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 3.99 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 5.68 (-1.00) . . .
: 75 HOH O 5.37 (-1.00) . . .
: 113 HOH O 5.87 (-1.00) . . .
: 18 HOH O 5.09 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 5.68 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 5.68 (-1.00) . . .
: 13 GLU B OE1 4.91 ( 6.99) . s .
: 72 HOH O 5.68 (-1.00) . . .
: 642 HOH O 4.94 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 5.82 (-1.00) . . .
: 652 HOH O 4.04 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 4.82 (-1.00) . . .
: 671 HOH O 5.95 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 3.30 (-1.00) . . .
: 702 HOH O 2.17 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 5.82 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 5.82 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.87 (-1.00) . . .
Site 2: 7 CYS B O 4.00 ( 5.75) d s .
: 8 GLY B O 4.76 ( 3.23) . . .
: 9 SER B OG 3.29 ( 3.92) . . .
: 10 HIS B NE2 4.82 ( 5.69) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 16 TYR D OH 4.28 ( 9.01) . s T
: 1 ZN ZN 4.96 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 5.76 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 5.50 (-1.00) . . .
: 113 HOH O 4.32 (-1.00) . . .
: 161 HOH O 0.59 (-1.00) . . .
: 172 HOH O 2.61 (-1.00) . . .
: 186 HOH O 4.92 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 3.78 (-1.00) . . .
: 204 HOH O 3.42 (-1.00) . . .
: 211 HOH O 4.25 (-1.00) . . .
: 226 HOH O 3.16 (-1.00) . . .
: 241 HOH O 3.84 (-1.00) . . .
: 244 HOH O 5.40 (-1.00) . . .
: 245 HOH O 4.31 (-1.00) . . .
: 251 HOH O 5.94 (-1.00) . . .
: 252 HOH O 4.86 (-1.00) . . .
: 262 HOH O 5.64 (-1.00) . . .
: 1 ZN ZN 4.96 (-1.00) . . .
: 244 HOH O 5.25 (-1.00) . . .
: 251 HOH O 5.91 (-1.00) . . .
: 5 HIS B O 5.70 ( 8.01) . . .
: 10 HIS B NE2 4.15 ( 6.62) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 1 ZN ZN 4.96 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 5.76 (-1.00) . . .
: 251 HOH O 5.88 (-1.00) . . .
PROTEIN: 5CPV CALCIUM-BINDING PARVALBUMIN SET 6A
|
Bound Ligands : CA CALCIUM(II) ION:
Hev Atom conc.: 0.800 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 4.000 M PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : KRETSINGER et.al. 1975a:1975b:MARCHETTII et.al. 1985 :NOCKOLDS et.al. 1973 :SOWADSKI et.al. 1978 :
pH 6.8 Soak time = 96.00 Hours Reference number = 120.00
Site 1: 27 LYS NZ 4.66 ( 5.06) . . H
: 28 ALA O 3.97 ( 4.02) . . H
: 29 PHE N 5.46 ( 6.27) . . H
: 30 PHE O 5.81 ( 5.86) . . H
: 31 ALA O 5.04 ( 3.16) . . H
: 32 LYS N 4.38 ( 5.65) . . H
: 36 THR OG1 5.90 ( 7.64) . . T
: 125 HOH O 5.85 (-1.00) . . .
: 165 HOH O 3.42 (-1.00) . . .
: 17 ALA O 5.56 ( 7.54) . . T
: 20 ALA O 5.72 ( 4.59) . . T
: 23 SER OG 5.10 ( 5.97) . . T
: 112 HOH O 3.38 (-1.00) . . .
: 159 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
Site 2: 27 LYS NZ 3.97 ( 8.82) . . H
: 75 ARG CD 5.14 ( 5.21) . . T
: 129 HOH O 4.71 (-1.00) . . .
: 135 HOH O 5.24 (-1.00) . . .
: 157 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
: 164 HOH O 4.78 (-1.00) . . .
: 185 HOH O 1.63 (-1.00) . . .
: 19 LYS O 4.33 ( 5.99) . . T
: 20 ALA O 4.95 ( 2.99) . . T
: 21 ALA O 5.38 ( 4.65) . . T