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ANALYSIS FOR CHLOROMETHYLMERCURY [HAC]
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Formula : C1,H3,HG1,CL
Solution chemistry: [(H3,C1),(HG1)] +1
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 1CTS CITRATE SYNTHASE (PIG)
|
Bound Ligands : CIT CITRATE ION:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 2.200 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.002 M ATP/CO-A-SH
Comments :
Reference : REMINGTON et.al. 1982 :WIEGAND et.al. 1979 :
pH 7.4 Soak time = Hours Reference number = 48.00
Site 1: 66 PHE CE2 4.78 ( 8.02) . . T
: 70 SER O 5.23 ( 6.85) . . H
: 71 ILE CD1 5.06 ( 4.61) . . H
: 72 PRO N 5.60 ( 6.16) . . H
: 73 GLU O 5.88 ( 6.38) . . H
: 74 CYS SG 3.42 ( 3.29) . . H
: 75 GLN CG 5.44 ( 4.32) . . H
: 78 LEU CD1 3.74 ( 6.71) . . H
: 87 PRO CG 4.74 ( 6.87) . . T
: 92 LEU CD1 4.89 ( 7.43) . . H
: 233 THR CG2 4.01 ( 6.35) . . H
: 234 ILE CG2 5.12 ( 6.34) . . H
Site 2: 64 ILE O 5.02 ( 7.22) . . E
: 65 ARG CA 5.99 ( 5.99) . . E
: 66 PHE CE1 5.31 ( 5.72) . . T
: 69 TYR O 4.81 ( 6.16) . . T
: 70 SER O 3.63 ( 4.53) . . H
: 71 ILE CD1 3.72 ( 3.28) . . H
: 72 PRO N 5.03 ( 6.03) . . H
: 73 GLU N 5.64 ( 6.10) . . H
: 74 CYS SG 2.44 ( 3.99) . . H
: 75 GLN N 5.23 ( 6.44) . . H
: 78 LEU CD1 5.42 ( 8.36) . . H
: 92 LEU CD1 5.03 ( 8.13) . . H
: 95 LEU CD2 5.79 ( 9.46) . . H
: 233 THR CG2 5.77 ( 7.68) . . H
Site 3: 8 ASP A OD2 5.39 ( 8.13) . . T
: 66 PHE CD2 5.62 ( 7.26) . . T
: 69 TYR CE2 5.86 ( 5.71) . . T
: 70 SER O 4.33 ( 6.16) . . H
: 71 ILE O 4.38 ( 5.88) . . H
: 72 PRO O 5.59 ( 6.42) . . H
: 73 GLU O 3.41 ( 4.39) . . H
: 74 CYS SG 2.01 ( 1.28) . . H
: 75 GLN C 5.63 ( 4.98) . . H
: 76 LYS N 5.43 ( 6.23) . . H
: 77 MET SD 5.79 ( 5.12) . . H
: 78 LEU CD1 3.99 ( 5.15) . . H
: 92 LEU CD1 5.98 ( 7.52) . . H
: 95 LEU CD2 4.91 ( 8.12) . . H
: 101 ILE CD1 4.65 ( 7.74) . . T
| PROTEIN: 1PTE D-ALANYL-CARBOXYPEPTIDASE-TRANSPEPTIDASE
|
Hev Atom conc.: 2.500 mM
Precip & conc.: 30.000 % PEG 8000
Buffer & conc.: 0.050 M PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : KELLY et.al. 1982 :1985 :
pH 6.8 Soak time = 69.00 Hours Reference number = 95.02
Site 1: 131 SER CA 5.96 ( 5.96) . . .
: 133 TYR CA 4.72 ( 4.72) . . .
: 134 GLY CA 5.04 ( 5.04) . . .
Site 2: 54A SER CA 5.72 ( 5.72) . . .
: 55 GLY CA 5.95 ( 5.95) . . .
| PROTEIN: 2CPP CYTOCHROME P450 CAM (PSEUDOMONAS PUTIDA)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX GROUP CONTAINS FE+++: CAM CAMPHOR SUBSTRATE:
Hev Atom conc.: 11.950 mM
Precip & conc.: 40.000 % AMMONIUM SULPHAE/POTASSIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 0.050 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.001 M CAMPHOR (2-BORNANONE)
Comments : TEMP 20 C
Reference : POULOS et.al. 1982 :1985 :1987 :
pH 7.0 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 213.03
Site 1: 138 LEU O 5.64 ( 7.33) . . H
: 142 LEU CD1 2.20 ( 5.06) . . H
: 147 GLN O 5.58 ( 6.94) . . E
: 148 CYS SG 2.60 ( 4.81) . . E
: 149 ASN O 5.56 ( 6.47) . . E
: 150 PHE CE1 4.99 ( 4.85) . . E
: 153 ASP OD2 5.32 ( 5.21) . . H
: 154 TYR CD1 5.33 ( 5.34) . . H
: 374 TRP CH2 3.00 ( 8.70) . . H
: 378 ILE CD1 5.82 ( 9.44) . . H
: 404 LEU CD1 5.73 ( 7.55) . . E
: 406 TRP CH2 4.34 (10.19) . . T
Site 2: 85 CYS SG 3.11 ( 3.75) . . T
: 86 PRO CD 5.00 ( 4.03) . . T
: 87 PHE O 3.03 ( 4.45) . . T
: 88 ILE CD1 5.48 ( 5.15) . . T
: 89 PRO O 5.67 ( 6.72) . . H
: 90 ARG NH1 5.91 ( 5.20) . . H
: 93 GLY O 5.64 ( 4.47) . . H
: 94 GLU N 5.89 ( 7.00) . . H
: 298 GLY O 5.73 ( 6.13) . . E
: 299 ARG O 4.33 ( 5.29) . . E
: 300 ILE CD1 5.03 ( 5.19) . . E
: 317 GLN OE1 3.57 ( 4.86) . . E
: 318 ILE N 5.77 ( 6.94) . . E
: 640 HOH O 5.98 (-1.00) . . .
: 647 HOH O 2.02 (-1.00) . . .
Site 3: 21 HIS NE2 5.25 ( 9.62) . . T
: 309 GLY O 4.94 ( 6.43) . . T
: 667 HOH O 3.89 (-1.00) . . .
: 133 GLU O 4.48 ( 5.93) . . H
: 136 CYS SG 4.85 ( 3.97) . . H
: 137 SER OG 5.12 ( 3.61) . . H
: 138 LEU N 5.80 ( 7.15) . . H
: 140 GLU CG 5.24 ( 5.94) . . H
: 377 ARG NH2 5.58 (10.65) . . H
: 562 HOH O 2.30 (-1.00) . . .
: 589 HOH O 5.01 (-1.00) . . .
Site 4: 10 ASN O 3.93 ( 5.37) . . .
: 11 LEU CD1 2.98 ( 5.19) . . .
: 25 ASP CG 5.96 ( 5.83) . . T
: 26 PHE O 5.11 ( 6.16) . . T
: 27 ASP OD1 5.24 ( 4.80) . . T
: 56 THR OG1 5.26 ( 7.27) . . E
: 57 ARG O 5.08 ( 5.88) . . E
: 58 CYS SG 1.83 ( 3.26) . . E
: 59 ASN OD1 5.56 ( 6.08) . . T
: 638 HOH O 4.02 (-1.00) . . .
: 668 HOH O 3.15 (-1.00) . . .
: 704 HOH O 5.89 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2CYP CYTOCHROME C PEROXIDASE (YEAST)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX GROUP CONTAINS FE+++:
Hev Atom conc.: 1.990 mM
Precip & conc.: 30.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.050 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : FINZEL et.al. 1984 :POULOS et.al. 1978 :
pH 6.0 Soak time = 72.00 Hours Reference number = 96.00
Site 1: 8 ALA CB 5.14 ( 6.07) . . .
: 9 SER O 5.57 ( 5.66) . . .
: 10 VAL CG1 4.45 ( 4.20) . . .
: 11 GLU OE2 5.55 ( 7.42) . . T
: 127 ARG O 5.58 ( 5.37) . . T
: 128 CYS SG 2.50 ( 3.64) . . T
: 129 GLY O 5.84 ( 3.91) . . T
: 276 PHE CE1 5.11 ( 7.55) . . T
: 280 ALA CB 5.02 ( 5.64) . . T
: 281 PRO CD 4.03 ( 5.86) . . T
: 284 PHE CE1 5.72 ( 9.37) . . T
: 427 HOH O 3.35 (-1.00) . . .
: 428 HOH O 1.73 (-1.00) . . .
: 577 HOH O 3.91 (-1.00) . . .
: 727 HOH O 4.22 (-1.00) . . .
Site 2: 96 HIS NE2 2.74 ( 6.54) . . T
: 99 PHE O 5.46 ( 7.64) . . T
: 100 PRO O 3.07 ( 4.77) . . T
: 101 TRP O 5.07 ( 5.17) . . T
: 102 ILE CG2 5.38 ( 4.90) . . T
: 103 SER O 5.21 ( 4.50) . . T
: 104 SER OG 5.03 ( 5.50) . . T
: 132 ASP OD1 5.68 ( 7.81) . . T
: 400 HOH O 1.42 (-1.00) . . .
: 402 HOH O 4.85 (-1.00) . . .
: 732 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
: 996 HOH O 4.86 (-1.00) . . .
Site 3: 4 LEU CD2 5.62 ( 5.89) . . .
: 5 VAL O 3.36 ( 5.42) . . .
: 6 HIS NE2 2.02 ( 3.99) . . .
: 7 VAL N 5.56 ( 6.96) . . .
: 67 TYR OH 5.01 ( 7.30) . . T
: 133 THR OG1 5.92 ( 6.78) . . T
: 306 HOH O 2.70 (-1.00) . . .
: 307 HOH O 4.27 (-1.00) . . .
: 433 HOH O 4.58 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2MCG IMMUNOGLOBULIN B-J INTACT MCG
|
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 1.600 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : SCHIFFER et.al. 1973 :
pH 6.2 Soak time = 672.00 Hours Reference number = 128.03
Site A: 214 GLU 1 O 4.16 ( 5.76) . . .
: 215 CYS 1 SG 3.57 ( 3.05) d . .
: 216 SER 1 OG 1.99 ( 3.00) . . .
: 214 GLU 2 O 2.68 ( 5.15) . . .
: 215 CYS 2 SG 4.67 ( 4.45) d . .
: 56 ARG 1 CD 5.99 ( 8.76) . . .
: 58 SER 1 OG 5.91 ( 5.44) . . .
: 59 GLY 1 O 4.06 ( 5.29) . . .
: 60 VAL 1 O 3.42 ( 4.59) . . .
: 61 PRO 1 CD 4.94 ( 3.65) . . .
: 62 ASP 1 OD1 4.91 ( 6.00) . . .
: 16 GLN 1 OE1 5.40 ( 7.80) . . .
Site 1: 39 GLN 1 OE1 4.52 ( 7.29) . . .
: 41 HIS 1 NE2 2.86 ( 5.99) . . .
: 44 LYS 1 NZ 4.50 ( 8.61) . . .
: 47 LYS 1 CE 5.76 ( 8.45) . . .
: 83 GLU 1 OE1 5.73 ( 5.30) . . .
: 84 ASP 1 N 5.85 ( 6.14) . . .
: 85 GLU 1 O 5.63 ( 7.58) . . .
: 36 HOH O 3.10 (-1.00) . . .
: 58 HOH O 4.69 (-1.00) . . .
: 87 HOH O 1.48 (-1.00) . . .
Site 2: 154 ALA 1 O 5.88 ( 5.63) . . .
: 155 ASP 1 OD1 5.79 ( 7.54) . . .
: 159 VAL 1 CG1 5.03 ( 7.42) . . .
: 188 GLN 1 O 5.17 ( 6.43) . . .
: 191 SER 1 OG 4.74 ( 6.85) . . .
: 192 HIS 1 NE2 1.38 ( 5.61) . . .
: 195 TYR 1 OH 4.41 ( 9.19) . . .
: 40 HOH O 3.42 (-1.00) . . .
: 59 HOH O 2.50 (-1.00) . . .
: 77 HOH O 2.77 (-1.00) . . .
Site 3: 36 SER 1 OG 5.58 ( 7.67) . . .
: 38 TYR 1 OH 3.85 ( 9.22) . . .
: 48 VAL 1 CG1 5.96 ( 7.55) . . .
: 99 PHE 1 CE2 4.96 ( 8.58) . . .
: 38 TYR 2 OH 4.27 (10.73) . . .
: 91 SER 2 OG 5.60 ( 7.90) . . .
: 99 PHE 2 CE1 4.39 ( 6.75) . . .
: 101 PHE 2 CE1 5.86 ( 9.73) . . .
: 170 HOH O 5.66 (-1.00) . . .
: 229 HOH O 2.65 (-1.00) . . .
Site 4: 34 TYR 2 OH 3.86 ( 6.44) . . .
: 93 TYR 2 OH 4.95 ( 6.27) . . .
: 99 PHE 2 CE1 5.72 ( 9.10) . . .
: 164 HOH O 1.59 (-1.00) . . .
: 165 HOH O 4.34 (-1.00) . . .
: 170 HOH O 4.77 (-1.00) . . .
: 171 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
: 225 HOH O 2.83 (-1.00) . . .
: 202 GLU 2 OE1 5.86 ( 9.21) . . .
: 260 HOH O 5.70 (-1.00) . . .
Site 5: 39 GLN 2 OE1 3.74 ( 7.37) . . .
: 41 HIS 2 NE2 1.41 ( 4.80) . . .
: 47 LYS 2 NZ 4.36 ( 8.85) . . .
: 83 GLU 2 OE2 5.84 ( 5.19) . . .
: 84 ASP 2 N 5.69 ( 5.90) . . .
: 85 GLU 2 O 5.36 ( 7.30) . . .
: 86 ALA 2 CB 5.44 ( 6.63) . . .
: 212 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
Site 6: 38 TYR 1 CD1 5.44 ( 6.78) . . .
: 40 GLN 1 OE1 4.91 ( 6.83) . . .
: 45 ALA 1 C 5.87 ( 6.52) . . .
: 46 PRO 1 CD 3.66 ( 4.32) . . .
: 89 TYR 1 CE2 5.46 ( 7.32) . . .
: 101 PHE 1 CE1 5.10 ( 8.28) . . .
: 38 TYR 2 CE1 5.82 ( 6.76) . . .
: 40 GLN 2 OE1 4.66 ( 6.89) . . .
: 45 ALA 2 C 5.88 ( 6.74) . . .
: 46 PRO 2 CD 4.10 ( 4.08) . . .
: 47 LYS 2 N 5.81 ( 7.13) . . .
: 89 TYR 2 CE1 5.76 ( 7.70) . . .
: 101 PHE 2 CE2 5.04 ( 9.09) . . .
Site 7: 4 LEU 1 CD2 4.53 ( 7.67) . . .
: 22 CYS 1 SG 5.48 ( 5.89) d . .
: 23 THR 1 O 5.67 ( 4.95) . . .
: 24 GLY 1 N 5.20 ( 6.00) . . .
: 28 ASP 1 O 5.72 ( 7.91) . . .
: 29 VAL 1 CG2 5.47 ( 4.87) . . .
: 30 GLY 1 O 4.95 ( 2.93) . . .
: 31 GLY 1 N 5.20 ( 6.67) . . .
: 35 VAL 1 CG1 5.31 ( 6.69) . . .
: 68 LYS 1 CG 5.51 ( 5.93) . . .
: 70 GLY 1 O 4.67 ( 6.25) . . .
: 71 ASN 1 O 3.37 ( 4.43) . . .
: 72 THR 1 OG1 5.95 ( 3.76) . . .
: 73 ALA 1 O 5.82 ( 4.27) . . .
: 37 HOH O 5.56 (-1.00) . . .
Site 8: 154 ALA 2 CB 4.54 ( 5.96) . . .
: 188 GLN 2 O 5.51 ( 6.32) . . .
: 191 SER 2 CB 5.48 ( 6.48) . . .
: 192 HIS 2 NE2 0.79 ( 5.35) . . .
: 195 TYR 2 OH 4.57 ( 9.21) . . .
: 204 HOH O 3.24 (-1.00) . . .
: 235 HOH O 3.76 (-1.00) . . .
: 289 HOH O 1.99 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3CNA CONCANAVALIN A'
|
Bound Ligands : MN MANGANESE ION-REFER TO SITE MN: CA CALCIUM ION-REFER TO SITE CA:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 2.000 M PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : SAT SOL ADDED TO CAPILLARY PREVENT LOSS THROUGH VO
Reference : AINSWORTH et.al. 1972 :HARDMAN et.al. 1971 :
pH 6.0 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 293.02
Site 1: 110 SER OG 5.44 ( 6.79) . . E
: 112 THR OG1 5.56 ( 7.62) . . E
: 127 HIS NE2 1.78 ( 5.98) . . E
: 128 PHE O 5.39 ( 4.99) . . E
: 129 MET SD 2.68 ( 5.50) . . E
: 123 THR CG2 5.89 ( 8.16) . . .
: 125 ALA O 5.97 ( 5.47) . . E
Site 2: 204 SER OG 4.87 ( 6.50) . . .
: 205 HIS NE2 2.52 ( 6.26) . s .
: 81 LEU O 5.39 ( 7.29) . s .
: 82 ASN ND2 5.68 ( 3.74) . . .
: 83 ASP N 4.97 ( 5.60) . . .
: 85 LEU O 3.99 ( 6.39) . s .
: 86 PRO O 5.14 ( 5.27) . . .
: 87 GLU CG 5.68 ( 4.64) . . .
: 181 ILE O 5.47 ( 7.49) . s .
: 182 TRP CB 5.44 ( 5.73) . . .
Site 3: 100 TYR OH 3.13 ( 8.58) . s .
: 56 SER OG 2.88 ( 4.89) . . E
: 80 ASP OD1 5.26 ( 7.51) . . .
: 82 ASN OD1 4.85 ( 6.08) . . .
: 181 ILE O 5.80 ( 7.93) . s .
: 186 ALA O 4.68 ( 5.93) . . .
: 187 ALA N 5.82 ( 5.85) . . .
: 188 THR N 5.79 ( 6.34) . . .
: 189 VAL CG1 5.50 ( 6.63) . . E
Site 4: 108 SER OG 5.82 ( 7.06) . . E
: 129 MET CE 5.56 ( 8.61) . . E
: 131 ASN OD1 5.41 ( 7.23) . . E
: 121 HIS O 4.55 ( 6.91) . . .
: 122 GLN CG 5.85 ( 4.54) . . .
: 121 HIS CD2 5.74 ( 6.25) . . .
: 122 GLN O 5.91 ( 5.83) . . .
Site 5: 54 TYR OH 4.80 ( 7.53) . s E
: 56 SER OG 4.63 ( 5.35) . . E
: 80 ASP O 5.73 ( 8.13) . . .
: 81 LEU CD2 4.97 ( 6.41) . s .
: 181 ILE CD1 4.20 ( 4.21) . s .
: 182 TRP N 5.55 ( 6.29) . . .
: 189 VAL CG1 2.83 ( 5.03) . . E
: 190 SER N 5.77 ( 6.38) . . E
: 191 PHE CE2 5.33 ( 7.52) . s E
Site 6: 87 GLU OE1 2.18 ( 4.89) . . .
: 88 TRP NE1 3.79 ( 5.89) . . .
: 180 HIS NE2 5.79 ( 6.20) . . .
: 182 TRP CH2 3.64 ( 4.92) . . .
: 183 GLU CB 5.98 ( 4.99) . . .
: 134 SER OG 5.20 ( 7.26) . . .
: 136 ASP OD1 5.37 ( 7.86) . . .
| PROTEIN: 7API ALPHA-1-ANTITRYPSIN (MODIFIED, TETRAGONAL)
|
Bound Ligands : NAG N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE: MAN ALPHA-D-MANNOSE:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 2.600 M POTASSIUM/SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : XL REDUCED BY GLUTATHIONE : UNBLOCKED CYS 232. RED
Reference : LOBERMANN et.al. 1984 :
pH 8.0 Soak time = Hours Reference number = 244.00
Site 1: 151 GLU A OE1 5.51 ( 9.05) . . H
: 230 GLN A NE2 5.28 ( 8.38) . . E
: 231 HIS A O 5.79 ( 7.09) . . E
: 232 CYS A SG 2.02 ( 4.16) d . E
: 233 LYS A N 5.75 ( 6.90) . . E
: 234 LYS A NZ 5.05 ( 5.91) . . .
: 235 LEU A CD1 5.31 ( 6.79) . . .
: 271 ILE A CG2 5.76 ( 7.28) . . H
: 275 PHE A CE1 4.21 ( 7.45) . . H
: 395 CYS C SG 1.00 ( 2.38) d . .
Site 2: 149 ASP A OD1 5.62 ( 7.51) . . .
: 151 GLU A OE1 5.40 ( 9.18) . . H
: 231 HIS A O 4.75 ( 6.03) . . E
: 232 CYS A SG 2.11 ( 2.23) d . E
: 233 LYS A CG 5.93 ( 4.23) . . E
: 234 LYS A NZ 5.82 ( 3.75) . . .
: 235 LEU A CD1 5.08 ( 4.92) . . .
: 236 SER A N 5.43 ( 6.47) . . E
: 275 PHE A CE1 5.85 ( 9.80) . . H
: 395 CYS C SG 2.16 ( 4.97) d . .
| PROTEIN: 8API ALPHA-1-ANTI-TRYPSIN (MODIFIED, HEXAGONAL)
|
Bound Ligands : NAG N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE: MAN ALPHA-D-MANNOSE:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 2.600 M POTASSIUM/SODIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : XL REDUCED BY GLUTATHIONE: UNBLOCKED CYC 232. REDU
Reference : LOBERMANN et.al. 1984 :
pH 8.0 Soak time = Hours Reference number = 245.00
Site 1: 230 GLN A NE2 4.93 ( 7.92) . . E
: 231 HIS A O 5.38 ( 6.63) . . E
: 232 CYS A SG 1.28 ( 3.92) d . E
: 233 LYS A N 5.56 ( 6.77) . . E
: 234 LYS A NZ 5.68 ( 5.43) . . .
: 235 LEU A CD1 4.44 ( 6.22) . . .
: 271 ILE A CG2 5.51 ( 6.93) . . H
: 275 PHE A CE1 3.80 ( 7.25) . . H
: 395 CYS C SG 1.45 ( 3.07) d . .
: 151 GLU A OE1 5.68 ( 9.40) . . H
Site 2: 208 PHE A O 5.92 ( 6.98) . . .
: 209 HIS A NE2 4.30 ( 4.19) . . .
: 210 VAL A N 5.78 ( 7.05) . . .
: 211 ASP A O 4.62 ( 6.83) . . .
: 212 GLN A O 4.79 ( 5.80) . . .
: 213 VAL A O 5.77 ( 5.97) . . .
: 214 THR A O 4.85 ( 5.89) . . .
: 215 THR A OG1 3.30 ( 4.89) . . E