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ANALYSIS FOR METHYL (NITRATO-O) MERCURY [HAB]
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Formula : C1,H3,HG1,N1,O3
Solution chemistry: [(H3,C1),(HG1)]1 +1
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 2TBV VIRUS (TOMATO BUSHY STUNT)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 0.000 mM
Precip & conc.: 3.400 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments : 3D PATTERSON UNINTERPRETABLE
Reference : CAMPBELL et.al. 1990 :HARRISON et.al. 1978 :HOGLE et.al. 1983 :JACK et.al. 1975 :OLSON et.al. 1983 :WINKLER et.al. 1977 :
pH Soak time = Hours Reference number = 81.03
Site 1: 136 PRO A O 4.61 ( 6.67) . . .
: 137 SER A OG 4.40 ( 6.29) . . .
: 149 ALA A O 2.54 ( 4.82) . . .
: 150 SER A OG 5.38 ( 4.41) . . .
: 151 ASN A N 5.74 ( 6.68) . . .
: 152 PHE A O 3.05 ( 5.12) . . .
: 153 ASP A O 5.59 ( 4.96) . . .
: 223 CYS A SG 3.12 ( 3.99) . . .
: 224 ASN A C 5.55 ( 5.54) . . .
: 225 ASP A OD1 4.13 ( 5.99) . . .
: 270 ASN A ND2 5.09 ( 6.95) . . .
: 1 CA GCA 5.80 (-1.00) . . .
Site 2: 153 ASP A OD1 2.40 ( 4.69) . . .
: 154 GLN A NE2 5.76 ( 7.14) . . E
: 222 TYR A OH 5.42 ( 7.12) . . .
: 225 ASP A OD2 5.76 ( 7.35) . . .
: 267 GLN A OE1 4.67 ( 8.70) . . .
: 181 ASP C OD1 2.58 ( 4.92) . . E
: 182 LYS C CG 4.76 ( 3.60) . . .
: 183 ASP C OD1 4.29 ( 2.51) . . .
: 184 SER C N 4.84 ( 6.19) . . .
: 185 GLN C N 5.98 ( 6.87) . . .
: 186 ASP C OD1 4.79 ( 6.03) . . .
: 1 CA GCA 3.60 (-1.00) . . .
: 1 CA UCA 3.99 (-1.00) . . .
Site 3: 136 PRO C O 5.09 ( 6.99) . . .
: 137 SER C OG 5.33 ( 7.09) . . .
: 149 ALA C O 2.54 ( 4.56) . . H
: 150 SER C O 5.83 ( 4.79) . . H
: 151 ASN C N 5.89 ( 6.71) . . H
: 152 PHE C O 2.52 ( 4.70) . . H
: 153 ASP C OD2 5.89 ( 4.17) . . .
: 154 GLN C N 5.27 ( 6.19) . . E
: 222 TYR C C 5.96 ( 6.86) . . .
: 223 CYS C SG 2.94 ( 4.00) . . .
: 224 ASN C N 5.12 ( 6.11) . . .
: 225 ASP C OD1 3.86 ( 5.96) . . .
: 2 CA GCA 5.48 (-1.00) . . .
Site 4: 318 LEU A O 5.30 ( 7.04) . . E
: 319 ARG A C 5.56 ( 6.12) . . E
: 320 CYS A SG 2.26 ( 4.15) . . .
: 321 LEU A O 5.59 ( 3.89) . . .
: 322 THR A O 2.87 ( 4.41) . . .
: 323 SER A C 5.63 ( 5.29) . . .
: 324 LEU A CD1 5.92 ( 6.56) . . .
: 341 ASP A OD1 3.26 ( 5.04) . . E
: 342 ASN A ND2 4.78 ( 6.09) . . E
: 343 VAL A CG2 5.85 ( 5.04) . . .
: 344 GLY A N 5.63 ( 6.73) . . .
: 345 THR A O 3.53 ( 5.74) . . .
: 346 ALA A O 3.94 ( 4.54) . . E
: 347 SER A OG 4.57 ( 4.38) . . E
: 366 VAL A CG1 4.53 ( 6.62) . . E
Site 5: 318 LEU B O 5.72 ( 7.47) . . E
: 319 ARG B C 5.88 ( 6.48) . . E
: 320 CYS B SG 2.58 ( 4.34) . . .
: 321 LEU B O 5.30 ( 3.71) . . .
: 322 THR B OG1 5.80 ( 4.07) . . .
: 323 SER B C 5.42 ( 4.99) . . .
: 324 LEU B CD2 5.20 ( 6.50) . . .
: 341 ASP B OD1 3.34 ( 4.98) . . E
: 342 ASN B ND2 4.84 ( 5.95) . . E
: 343 VAL B CG2 5.44 ( 4.71) . . .
: 344 GLY B N 5.38 ( 6.53) . . .
: 345 THR B O 3.59 ( 5.78) . . .
: 346 ALA B O 4.14 ( 4.84) . . E
: 347 SER B OG 4.79 ( 4.72) . . E
: 366 VAL B CG1 4.60 ( 6.61) . . E
Site 6: 318 LEU C O 5.30 ( 7.05) . . E
: 319 ARG C O 5.94 ( 5.85) . . E
: 320 CYS C SG 2.03 ( 3.63) . . .
: 321 LEU C O 5.20 ( 3.43) . . .
: 322 THR C OG1 5.72 ( 4.23) . . .
: 323 SER C C 5.84 ( 5.52) . . .
: 324 LEU C CD2 5.25 ( 6.82) . . .
: 341 ASP C OD1 3.81 ( 5.58) . . E
: 342 ASN C ND2 4.97 ( 6.41) . . E
: 343 VAL C CG2 6.00 ( 5.09) . . .
: 344 GLY C N 5.45 ( 6.49) . . .
: 345 THR C O 3.50 ( 5.58) . . .
: 346 ALA C O 4.14 ( 4.47) . . E
: 347 SER C OG 5.08 ( 4.72) . . E
: 366 VAL C CG1 4.22 ( 6.41) . . E
: 367 SER C O 5.81 ( 7.02) . . .
| PROTEIN: 3GPD GLYCERALDEHYDE-3-P-DEHYDROGENASE (HUMAN)
|
Bound Ligands : NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE: SPS SUBSTRATE PHOSPHATE: IPS INORGANIC PHOSPHATE:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 50.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.005 M NAD+/EDTA/B-MERCPTOETHANOL
Comments :
Reference : WATSON et.al. 1972 :
pH Soak time = Hours Reference number = 91.00
Site 1: 174 MET R O 4.58 ( 6.43) . . T
: 175 THR R OG1 2.38 ( 3.58) . . T
: 176 THR R O 5.91 ( 5.97) . . T
: 208 ALA R O 5.88 ( 7.44) . . T
: 230 MET R SD 2.37 ( 4.82) . . T
: 231 ALA R O 4.98 ( 4.37) . . T
: 232 PHE R CE1 3.84 ( 5.82) . . T
: 243 ASP G OD1 4.66 ( 6.49) . . T
: 299 GLY G CA 5.54 ( 5.54) . . T
: 308 LYS G NZ 4.44 ( 8.77) . . T
Site 2: 274 GLY G O 4.11 ( 4.41) . . T
: 275 TYR G O 4.89 ( 5.97) . . T
: 290 HIS G NE2 4.86 ( 8.23) . . T
| PROTEIN: 3GRS GLUTATHIONE REDUCTASE (HUMAN)
|
Bound Ligands : FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE:
Hev Atom conc.: 0.150 mM
Precip & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M DIPOTASSIUM HYDROGEN PHOSPHATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : SCHULTZ et.al. 1981 :SCHULZ et.al. 1978 :
pH 7.0 Soak time = 21.60 Hours Reference number = 76.01
Site 1: 401 THR OG1 5.48 ( 5.93) . . .
: 402 SER C 5.31 ( 5.26) . . .
: 403 PHE CE1 1.65 ( 5.36) . . .
: 417 CYS SG 2.41 ( 3.91) . . .
: 418 VAL O 4.85 ( 4.45) . . .
: 419 MET SD 3.43 ( 5.08) . . .
: 436 GLN O 5.47 ( 7.40) . . .
: 470 SER OG 5.59 ( 5.85) . . .
: 473 GLU CD 5.69 ( 6.10) . . .
: 45 HOH O 4.99 (-1.00) . . .
: 80 HOH O 5.84 (-1.00) . . .
: 91 GLU OE1 5.49 ( 9.88) . . .
: 429 LYS NZ 4.44 ( 7.86) . . .
: 255 HOH O 5.39 (-1.00) . . .
: 458 HOH O 4.15 (-1.00) . . .
Site 2: 173 LEU O 5.90 ( 8.32) . . .
: 175 ILE CD1 3.56 ( 5.63) . . .
: 183 LEU CD1 4.73 ( 6.84) . . .
: 187 PRO CG 5.47 ( 6.89) . . .
: 283 ASP O 3.82 ( 5.97) . . .
: 284 CYS SG 3.17 ( 3.52) . . .
: 285 LEU O 5.07 ( 5.71) . . .
: 47 HOH O 3.21 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 5.02 (-1.00) . . .
: 141 HOH O 1.12 (-1.00) . . .
: 143 HOH O 5.48 (-1.00) . . .
: 228 HOH O 3.28 (-1.00) . . .
: 313 ILE O 5.95 ( 9.29) . . .
: 315 VAL CG1 4.92 ( 5.88) . . .
: 328 ALA CB 5.70 ( 5.91) . . .
: 333 CYS SG 3.77 ( 3.68) . . .
: 334 GLY O 4.97 ( 4.70) . . .
: 335 LYS N 5.29 ( 6.64) . . .
: 76 HOH O 3.83 (-1.00) . . .
: 105 HOH O 3.75 (-1.00) . . .
: 267 HOH O 5.87 (-1.00) . . .
: 376 HOH O 4.98 (-1.00) . . .
Site 3: 313 ILE O 5.71 ( 7.86) . . .
: 315 VAL CG1 5.22 ( 5.98) . . .
: 316 ASP O 5.83 ( 7.54) . . .
: 319 GLN OE1 4.67 ( 6.36) . . .
: 328 ALA O 5.28 ( 7.04) . . .
: 329 VAL C 5.81 ( 5.59) . . . [Het: FAD OP2 - O 4.30]
: 330 GLY O 4.90 ( 6.19) . . . [Het: FAD OP2 - CA 3.50]
: 333 CYS SG 3.55 ( 4.21) . . .
: 334 GLY N 5.26 ( 6.13) . . .
: 335 LYS NZ 5.14 ( 5.17) . . .
: 364 TYR OH 3.93 ( 9.02) . . .
: 11 HOH O 5.41 (-1.00) . . .
: 21 HOH O 4.52 (-1.00) . . .
: 44 HOH O 2.95 (-1.00) . . .
: 76 HOH O 5.17 (-1.00) . . .
: 93 HOH O 4.07 (-1.00) . . .
: 95 HOH O 1.04 (-1.00) . . .
: 105 HOH O 5.01 (-1.00) . . .
: 376 HOH O 5.05 (-1.00) . . .
: 175 ILE CD1 4.80 (10.25) . . .
: 179 GLY O 3.63 ( 5.98) . . .
: 180 PHE N 5.57 ( 5.98) . . .
: 182 GLN NE2 4.83 ( 4.07) . . .
: 183 LEU CD1 4.49 ( 3.92) . . .
: 184 GLU OE2 5.21 ( 7.85) . . .
: 284 CYS SG 4.22 ( 5.64) . . .
: 71 HOH O 3.89 (-1.00) . . .
: 141 HOH O 5.57 (-1.00) . . .
: 143 HOH O 4.81 (-1.00) . . .
: 176 HOH O 3.09 (-1.00) . . .
: 216 HOH O 5.09 (-1.00) . . .
Site 3: 285 HOH O 3.96 (-1.00) . . .
: 332 HOH O 2.91 (-1.00) . . .
Site 4: 395 ASN O 5.04 ( 6.82) . . .
: 396 VAL O 5.59 ( 5.16) . . .
: 397 LYS CE 5.99 ( 3.87) . . .
: 398 THR N 5.49 ( 6.31) . . .
: 399 TYR OH 5.56 ( 8.40) . . .
: 422 VAL C 5.77 ( 6.79) . . .
: 423 CYS SG 4.13 ( 3.60) . . .
: 424 ALA O 4.55 ( 4.33) . . .
: 425 ASN O 3.84 ( 5.60) . . .
: 427 GLU C 5.73 ( 6.82) . . .
: 428 GLU OE1 3.43 ( 3.66) . . .
: 429 LYS O 5.58 ( 6.38) . . .
: 483 HOH O 1.57 (-1.00) . . .
: 229 MET SD 5.21 ( 8.13) . . .
: 230 ILE CD1 5.97 ( 9.35) . . .
: 368 PRO CB 5.75 ( 6.78) . . .
: 378 GLY O 3.58 ( 5.23) . . .
: 379 THR O 5.18 ( 3.94) . . .
: 380 VAL CG1 4.47 ( 4.90) . . .
: 420 LYS NZ 5.95 ( 5.71) . . .
: 422 VAL CG2 5.30 ( 6.84) . . .
: 432 GLY O 5.30 ( 5.45) . . .
: 433 ILE O 1.32 ( 3.66) . . .
: 434 HIS NE2 5.12 ( 1.24) . . .
: 435 MET O 6.00 ( 5.68) . . .
: 444 LEU CD1 5.51 ( 9.38) . . .
| PROTEIN: 6LDH LACTATE DEHYDROGENASE
|
Bound Ligands : SO4 SULFATE GROUP:
Hev Atom conc.: 0.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments : APO-ENZYME
Reference : ADAMS et.al. 1969 :1970 :WHITE et.al. 1976 :
pH Soak time = 36.00 Hours Reference number = 218.06
Site 1: 179 GLY O 2.64 ( 4.57) . . T
: 180 VAL C 5.50 ( 4.94) . . T
: 181 HIS N 5.75 ( 6.76) . . T
: 347 HOH O 4.90 (-1.00) . . .
: 348 HOH O 4.18 (-1.00) . . .
: 550 HOH O 5.91 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 1.91 (-1.00) . . .
: 552 HOH O 3.39 (-1.00) . . .
: 645 HOH O 5.19 (-1.00) . . .
: 264 LEU O 5.58 ( 6.92) . . T
: 265 CYS SG 1.99 ( 4.27) . . E
: 291 VAL CG1 4.30 ( 6.77) . . E
: 292 LEU O 5.92 ( 7.24) . . E
: 293 ASN OD1 4.79 ( 6.54) . . T
: 298 SER OG 4.53 ( 6.63) . . T
: 299 ASN ND2 5.76 ( 7.96) . . E
: 18 ARG NH1 5.83 (10.07) . . T
: 369 HOH O 5.34 (-1.00) . . .
Site 2: 179 GLY O 5.21 ( 6.31) . . T
: 347 HOH O 4.33 (-1.00) . . .
: 348 HOH O 2.14 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 3.13 (-1.00) . . .
: 265 CYS SG 5.42 ( 7.51) . . E
: 291 VAL CG1 5.50 ( 7.58) . . E
: 293 ASN OD1 4.65 ( 7.75) . . T
: 298 SER OG 2.45 ( 4.54) . . T
: 299 ASN OD1 5.07 ( 5.90) . . E
: 17 PRO CG 5.84 ( 7.53) . . T
: 18 ARG NH2 5.70 (10.20) . . T
: 361 HOH O 5.35 (-1.00) . . .
: 452 HOH O 4.79 (-1.00) . . .
: 454 HOH O 5.74 (-1.00) . . .
: 602 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
: 624 HOH O 3.18 (-1.00) . . .
: 625 HOH O 3.07 (-1.00) . . .
Site 3: 179 GLY O 4.64 ( 6.51) . . T
: 181 HIS N 5.95 ( 6.54) . . T
: 358 HOH O 5.95 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 3.86 (-1.00) . . .
: 552 HOH O 3.93 (-1.00) . . .
: 645 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 263 ASN OD1 4.66 ( 5.57) . . T
: 264 LEU O 4.17 ( 5.00) . . T
: 265 CYS SG 1.30 ( 3.74) . . E
: 291 VAL CG1 5.39 ( 7.65) . . E
: 292 LEU O 5.08 ( 7.03) . . E
: 293 ASN OD1 4.53 ( 5.38) . . T
: 298 SER OG 6.00 ( 7.70) . . T
: 18 ARG NH1 4.42 ( 8.81) . . T
: 75 ALA CB 5.59 ( 6.58) . . T
: 369 HOH O 4.03 (-1.00) . . .
Site 4: 162 GLY O 5.12 ( 6.50) . . T
: 163 CYS SG 2.19 ( 3.96) . . T
: 166 ASP OD1 4.53 ( 5.21) . . H [Het: SO4 O3 - OD1 3.70]
: 189 VAL CG1 3.32 ( 5.38) . . E
: 190 ILE O 4.71 ( 5.45) . . E
: 191 GLY O 5.23 ( 6.22) . . E
: 192 GLU O 4.57 ( 5.85) . . E
: 193 HIS CE1 5.05 ( 3.52) . . T [Het: SO4 S - CE1 4.00]
: 194 GLY O 4.89 ( 4.89) . . T
: 197 VAL CG1 2.33 ( 4.32) . . E
: 198 PRO N 5.76 ( 6.90) . . E
: 287 SER OG 5.80 ( 7.42) . . E
: 340 HOH O 5.42 (-1.00) . . .
: 658 HOH O 4.82 (-1.00) . . .
Site 5: 170 PHE CE2 5.36 ( 6.12) . . H
: 171 ARG CD 4.74 ( 4.04) . . H [Het: SO4 S - CZ 4.10]
: 174 MET SD 1.03 ( 4.34) . . H
: 175 GLY N 5.19 ( 6.18) . . H
: 178 LEU CD1 5.80 ( 8.37) . . T
: 182 SER O 5.83 ( 6.82) . . T
: 185 CYS SG 4.30 ( 3.86) . . E
: 186 HIS O 4.09 ( 4.27) . . E [Het: SO4 S - ND1 3.30]
: 187 GLY O 5.91 ( 4.69) . . E
: 204 MET SD 5.81 ( 5.78) . . E
: 205 ASN O 4.95 ( 6.37) . . E
: 206 VAL CG2 5.82 ( 7.23) . . E
Site 6: 170 PHE O 5.42 ( 7.27) . . H
: 173 LEU O 5.40 ( 6.57) . . H
: 174 MET SD 3.21 ( 3.21) . . H
: 175 GLY N 5.22 ( 6.44) . . H
: 177 ARG CB 5.50 ( 6.62) . . H
: 178 LEU CD1 4.14 ( 6.61) . . T
: 185 CYS CB 5.85 ( 7.09) . . E
: 204 MET SD 5.32 ( 6.82) . . E
: 211 LEU CD2 4.08 ( 7.73) . . E
: 224 TRP CH2 2.77 ( 7.57) . . T
: 227 LEU CD2 3.68 ( 7.26) . . H
: 3 LEU CD1 5.99 ( 9.26) . . T