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ANALYSIS FOR (ACETATO-O)METHYLMERCURY [HAA]
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Formula : C3,H6,HG1,O2
Solution chemistry: [(H3,C1),(HG1),(O1),(C1,O1),(C1,H3)]1 -0
All distances below are to the element HG [ mercury ]
| PROTEIN: 1WSY TRYPTOPHAN SYNTHASE (SALMONELLA TYPHIMURIUM)
|
Bound Ligands : PLP PYRIDOXAL 5(PRIME)-PHOSPHATE:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 20.000 % PEG 8000
Buffer & conc.: 0.050 M BICINE
Addict & conc.: 0.001 M SPERMIN/EDTA
Comments : TEMP 20 C:PYRIDOXAL PHOSPHATE .6MM ADDED TO STABEL
Reference : DAVIES et.al. 1987 :HYDE et.al. 1988 :
pH 7.8 Soak time = 168.00 Hours Reference number = 272.00
Site 1: 154 CYS A SG 2.23 ( 4.03) . . E
: 155 PRO A CD 4.63 ( 4.13) . . .
: 156 PRO A O 5.83 ( 4.95) . . .
: 157 ASN A N 5.87 ( 6.77) . . .
: 158 ALA A CB 3.87 ( 5.16) . . .
: 163 LEU A CD2 4.59 ( 7.28) . . .
: 175 TYR A O 5.82 ( 7.98) . . E
: 176 LEU A CD1 3.69 ( 5.19) . . E
: 177 LEU A C 5.77 ( 5.95) . . E
: 196 LEU A CD1 3.36 ( 5.66) . . .
: 200 LEU A CD2 5.68 ( 8.83) . . .
Site 2: 119 SER B O 5.59 ( 7.17) . . .
: 120 ALA B O 4.50 ( 4.72) . . .
: 123 SER B OG 4.22 ( 4.77) . . .
: 124 ALA B CB 5.87 ( 5.46) . . .
: 128 LEU B O 3.89 ( 5.88) . . E
: 129 LYS B O 5.17 ( 4.57) . . E
: 130 CYS B SG 3.81 ( 3.11) . . E
: 131 ARG B N 5.05 ( 6.21) . . E
: 152 MET B O 4.60 ( 6.64) . . .
: 153 GLY B O 4.09 ( 5.04) . . .
: 154 ALA B O 5.82 ( 3.57) . . E
: 155 GLU B N 5.05 ( 6.45) . . E
Site 3: 52 TYR B CE1 5.53 ( 7.59) . . .
: 125 LEU B CD1 5.34 ( 7.92) . . .
: 60 THR B OG1 5.48 ( 5.27) . . E
: 61 LYS B O 3.78 ( 5.06) . . E
: 62 CYS B SG 2.68 ( 2.87) . . E
: 63 GLN B CB 5.64 ( 5.40) . . .
: 65 ILE B CG1 5.69 ( 7.36) . . .
: 73 LEU B O 5.63 ( 7.40) . . E
: 75 LEU B CD1 5.43 ( 6.22) . . E
: 339 LEU B CD1 5.15 ( 7.55) . . H
: 343 GLU B OE1 3.84 ( 5.22) . . .
: 345 ILE B CD1 4.20 ( 7.54) . . .
Site 4: 82 PHE A CE1 3.07 ( 6.24) . . .
: 99 LEU A CD1 4.03 ( 7.80) . . E
: 101 MET A SD 5.88 ( 9.30) . . E
: 114 PHE A CE1 3.61 ( 5.44) . . .
: 115 TYR A O 5.77 ( 5.70) . . .
: 117 ARG A CD 5.23 ( 4.83) . . .
: 118 CYS A SG 2.22 ( 3.49) . . .
: 119 GLU A N 5.89 ( 7.30) . . .
: 121 VAL A CB 5.90 ( 6.97) . . .
: 123 VAL A CG1 5.71 ( 6.92) . . .
: 126 VAL A CG2 5.72 ( 8.10) . . E
Site 5: 109 GLU B OE1 4.79 ( 7.38) . . E
: 166 LEU B CD1 5.99 ( 6.66) . . .
: 167 LYS B O 5.61 ( 5.42) . . .
: 170 CYS B SG 1.73 ( 3.79) . . .
: 171 ASN B N 5.50 ( 6.70) . . .
: 186 TYR B OH 4.36 (10.77) . . E
: 188 LEU B CD1 4.52 ( 7.27) . . E
: 280 PHE B CE1 5.72 ( 5.64) . . .
: 306 PHE B CE2 4.44 ( 8.00) . . .
Site 6: 148 ARG B O 4.46 ( 6.08) . . .
: 151 LEU B CD2 5.28 ( 5.63) . . .
: 152 MET B SD 2.84 ( 4.29) . . .
: 339 LEU B O 5.45 ( 6.89) . . H
: 340 CYS B SG 3.29 ( 3.50) . . H
: 341 ARG B N 5.10 ( 5.98) . . H
: 344 GLY B O 4.85 ( 4.41) . . .
: 345 ILE B O 4.09 ( 4.72) . . .
: 346 ILE B CD1 3.34 ( 4.38) . . .
Site 7: 25 LEU A CD1 4.88 ( 8.18) . . .
: 52 VAL A CG1 4.40 ( 5.99) . . E
: 77 THR A O 5.69 ( 7.86) . . .
: 78 PRO A O 3.31 ( 4.79) . . .
: 79 ALA A N 5.56 ( 6.01) . . .
: 80 GLN A C 5.57 ( 6.63) . . .
: 81 CYS A SG 4.31 ( 3.57) . . .
: 82 PHE A CE1 3.81 ( 3.60) . . .
: 83 GLU A N 5.65 ( 7.08) . . .
: 85 LEU A CD2 3.73 ( 6.67) . . .
: 99 LEU A CD1 5.20 ( 8.01) . . E
: 101 MET A SD 5.57 ( 8.89) . . E
: 114 PHE A CE1 5.87 ( 9.24) . . .
Site 8: 230 CYS B SG 3.66 ( 3.69) . . E
: 231 VAL B O 4.58 ( 4.92) . . E
: 232 GLY B N 5.17 ( 5.71) . . .
: 255 VAL B CG1 5.21 ( 5.59) . . E
: 256 GLU B O 5.52 ( 5.02) . . E
: 257 PRO B CD 4.37 ( 5.13) . . .
: 299 SER B OG 5.63 ( 7.99) . . .
: 301 SER B OG 5.21 ( 7.27) . . .
: 304 LEU B CD1 3.32 ( 5.71) . . .
: 349 LEU B O 5.49 ( 7.61) . . H
: 350 GLU B CG 5.66 ( 4.51) . . H
: 351 SER B N 5.40 ( 5.90) . . H
: 353 HIS B NE2 4.81 ( 4.63) . . H
: 354 ALA B N 5.20 ( 6.17) . . H
| PROTEIN: 2RSP ROUS SARCOMA VIRUS (RSV) PROTEASE
|
Hev Atom conc.: 6.000 mM
Precip & conc.: 10.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M SODIUM ACTATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MILLER et.al. 1989b:1989a:
pH 5.4 Soak time = 144.00 Hours Reference number = 322.03
Site 1: 82 LEU B CD1 5.92 ( 6.56) . . E
: 84 VAL B CG2 4.11 ( 6.03) . . E
: 93 ARG B O 5.21 ( 7.36) . . E
: 95 LEU B CD1 2.10 ( 5.76) . . E
: 109 LEU B CD1 5.10 ( 7.06) . . E
: 112 ASP B O 5.73 ( 7.54) . . H
: 113 CYS B SG A 3.85 ( 3.72) . . H
: 114 LEU B N 4.88 ( 5.55) . . H
: 116 GLY B O 5.78 ( 5.42) . . H
: 117 LEU B CD1 3.20 ( 4.93) . . H
: 227 HOH B O 3.65 (-1.00) . . .
: 377 HOH B O 4.35 (-1.00) . . .
: 424 HOH B O 5.67 (-1.00) . . .
Site 2: 208 HOH B O 5.71 (-1.00) . . .
: 260 HOH B O 5.79 (-1.00) . . .
: 43 THR A OG1 4.87 ( 6.72) . . E
: 82 LEU A CD1 5.83 ( 7.59) . . E
: 95 LEU A CD1 4.43 ( 5.73) . . E
: 96 LEU A O 4.95 ( 6.44) . . E
: 97 LEU A CD1 3.46 ( 5.45) . . E
: 112 ASP A OD1 4.39 ( 4.76) . . .
: 113 CYS A SG A 2.24 ( 3.30) . . .
: 114 LEU A N 5.83 ( 7.19) . . .
: 116 GLY A N 5.89 ( 5.83) . . .
: 261 HOH B O 5.35 (-1.00) . . .
: 306 HOH B O 2.36 (-1.00) . . .
: 335 HOH B O 5.31 (-1.00) . . .
: 362 HOH B O 0.86 (-1.00) . . .
: 381 HOH B O 5.62 (-1.00) . . .
: 437 HOH B O 4.23 (-1.00) . . .
Site 3: 43 THR B OG1 4.88 ( 6.82) . . E
: 95 LEU B CD1 4.38 ( 5.75) . . E
: 96 LEU B O 4.93 ( 6.29) . . E
: 97 LEU B CD1 3.23 ( 5.53) . . E
: 110 GLY B O 5.96 ( 7.50) . . E
: 111 ARG B C 5.97 ( 7.20) . . H
: 112 ASP B OD1 4.20 ( 4.09) . . H
: 113 CYS B SG A 3.00 ( 3.23) . . H
: 114 LEU B N 5.62 ( 6.99) . . H
: 116 GLY B N 5.56 ( 5.65) . . H
: 276 HOH B O 5.38 (-1.00) . . .
: 342 HOH B O 4.79 (-1.00) . . .
: 377 HOH B O 1.52 (-1.00) . . .
: 424 HOH B O 1.77 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2YHX HEXOKINASE (YEAST) FORM BIII
|
Bound Ligands : OTG ORTHO-TOLUOYLGUCOSAMINE-SEE REMARK 7:
Hev Atom conc.: 0.500 mM
Precip & conc.: 70.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.040 M PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.000 M O-TOLUOYLGLUCOSAMINE
Comments :
Reference : ANDERSON et.al. 1978 :STEITZ et.al. 1976 :
pH 7.0 Soak time = Hours Reference number = 253.04
Site 1: 221 ASP O 5.62 ( 6.80) . . .
: 222 SER OG 3.64 ( 3.09) . . .
: 223 THR CG2 5.10 ( 4.22) . . .
: 224 UNK N 5.84 ( 7.12) . . .
: 225 ILE CD1 5.80 ( 6.39) . . .
: 227 ASP OD2 4.51 ( 6.38) . . .
: 228 ALA CB 4.75 ( 4.78) . . .
: 230 ASP O 5.67 ( 7.50) . . .
: 234 UNK CB 5.76 ( 6.95) . . .
: 236 GLY O 5.61 ( 5.74) . . .
: 237 ALA N 5.27 ( 5.49) . . .
Site 2: 205 LYS NZ 5.76 ( 5.84) . . .
: 374 ILE O 5.45 ( 7.07) . . .
: 378 CYS SG 2.21 ( 4.36) . . .
: 383 TYR CE1 5.88 ( 4.78) . . .
: 384 SER O 5.83 ( 5.99) . . .
: 385 SER O 4.53 ( 5.22) . . .
: 386 GLY O 5.08 ( 4.70) . . .
: 387 HIS O 5.92 ( 6.26) . . .
: 388 ILE CD1 3.81 ( 6.52) . . .
: 412 TYR OH 5.36 (10.70) . . .
: 424 ILE CD1 3.09 ( 5.08) . . .
Site 3: 375 UNK O 4.62 ( 5.60) . . .
: 378 CYS SG 4.56 ( 3.80) . . .
: 379 GLN OE1 5.27 ( 4.19) . . .
: 382 GLY O 5.83 ( 5.71) . . .
: 383 TYR O 2.65 ( 4.73) . . .
: 384 SER OG 5.54 ( 4.45) . . .
: 385 SER N 5.78 ( 6.66) . . .
: 412 TYR OH 1.95 ( 7.60) . . .
: 424 ILE CD1 3.79 ( 7.57) . . .