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ANALYSIS FOR SODIUM DICYANO AURATE (I) [GHC]
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Formula : NA1,AU1,C2,N2
Solution chemistry: AU1,[C1,N1]2 -1
All distances below are to the element AU [ gold ]
| PROTEIN: 1PHH P-HYDROXYBENZOATE HYDROXYLASE (PSEUDOMONAS FLUORES
|
Bound Ligands : FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE: DHB 3,4-DIHYDROXYBENZOATE:
Hev Atom conc.: 3.000 mM
Precip & conc.: 39.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.100 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.001 M P.OHBZ:FAD:EDTA
Comments :
Reference : HOL et.al. 1987 :WIERENGA et.al. 1979 :
pH 7.5 Soak time = 120.00 Hours Reference number = 155.01
Site 1: 291 VAL CG2 5.21 ( 5.68) . . .
: 292 PRO O 4.29 ( 5.06) . . .
: 293 PRO CD 4.17 ( 3.25) . . .
: 294 THR N 5.57 ( 6.90) . . .
: 297 LYS O 3.76 ( 6.10) . . .
: 298 GLY N 5.66 ( 5.12) . . .
: 1 FAD O3* 4.94 (-1.00) . . .
: 2 DHB O3 5.68 (-1.00) . . .
: 408 HOH O 1.26 (-1.00) . . .
: 470 HOH O 3.84 (-1.00) . . .
: 476 HOH O 5.20 (-1.00) . . .
Site 2: 44 ARG CG 4.87 ( 4.66) . . .
: 45 ALA O 5.12 ( 2.73) . . .
: 46 GLY N 4.57 ( 6.01) . . .
: 47 VAL O 5.89 ( 6.88) . . E
: 102 GLN OE1 4.32 ( 6.96) . . .
: 222 TYR OH 5.92 (11.83) . . E
: 293 PRO O 5.95 ( 6.19) . . .
: 297 LYS O 5.38 ( 6.96) . . .
: 299 LEU N 5.86 ( 6.36) . . .
: 1 FAD O4* 5.99 (-1.00) . . .
: 2 DHB O1* 4.84 (-1.00) . . .
: 408 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
Site 3: 267 PRO O 4.96 ( 7.35) . . .
: 268 LEU CB 5.41 ( 5.84) . . .
: 269 ARG O 5.73 ( 7.12) . . E
: 290 ILE CG2 5.79 ( 6.56) . . E
: 291 VAL O 3.49 ( 5.77) . . .
: 292 PRO O 5.08 ( 4.93) . . .
: 293 PRO CD 3.87 ( 4.09) . . .
: 297 LYS O 5.48 ( 7.83) . . .
: 1 FAD O3* 5.68 (-1.00) . . .
: 408 HOH O 2.93 (-1.00) . . .
: 426 HOH O 5.16 (-1.00) . . .
: 470 HOH O 3.94 (-1.00) . . .
: 476 HOH O 3.36 (-1.00) . . .
: 480 HOH O 5.23 (-1.00) . . .
: 588 HOH O 4.73 (-1.00) . . .
Site 4: 304 SER OG 4.48 ( 5.23) . . .
: 305 ASP O 5.52 ( 4.39) . . .
: 308 THR OG1 3.13 ( 5.12) . . .
: 328 TYR O 5.61 ( 7.19) . . H
: 331 ILE CG1 5.60 ( 4.63) . . H
: 332 CYS SG 3.11 ( 3.31) . . H
: 333 LEU N 5.62 ( 6.99) . . H
: 335 ARG NE 5.57 ( 6.45) . . H
: 390 TYR O 4.80 ( 6.71) . . .
: 391 GLU OE1 3.00 ( 5.94) . . .
: 477 HOH O 3.60 (-1.00) . . .
: 595 HOH O 5.93 (-1.00) . . .
Site 5: 182 PRO CG 5.96 ( 5.53) . . .
: 183 PHE CE2 5.43 ( 4.83) . . .
: 224 GLN NE2 3.89 ( 7.82) . . E
: 225 VAL O 5.40 ( 6.22) . . E
: 226 PRO CD 5.09 ( 4.23) . . .
: 227 LEU N 5.87 ( 7.25) . . .
: 352 ARG O 4.45 ( 6.97) . . .
: 353 PHE C 5.71 ( 5.75) . . .
: 354 PRO CD 4.38 ( 5.54) . . .
: 438 HOH O 3.84 (-1.00) . . .
: 461 HOH O 4.56 (-1.00) . . .
: 545 HOH O 4.48 (-1.00) . . .
: 560 HOH O 4.94 (-1.00) . . .
: 643 HOH O 4.70 (-1.00) . . .
Site 6: 43 ILE CD1 4.30 ( 4.81) . . .
: 44 ARG N 5.26 ( 6.24) . . .
: 45 ALA O 5.17 ( 7.13) . . .
: 101 GLY C 5.46 ( 5.14) . . .
: 102 GLN N 5.55 ( 6.35) . . .
: 103 THR OG1 5.21 ( 5.43) . . .
: 104 GLU OE1 4.06 ( 6.78) . . .
: 189 LEU CD1 5.50 ( 7.59) . . E
: 214 ARG NH1 3.95 ( 5.94) . . E
: 218 ARG CD 5.87 ( 8.86) . . E
: 533 HOH O 4.66 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 1RHD RHODANESE (BOVINE LIVER)
|
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 2.000 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : HOL et.al. 1987 :LIJK et.al. 1983 :1984 :PLOEGMAN et.al. 1978 :
pH 7.3 Soak time = 144.00 Hours Reference number = 36.04
Site 2: 181 SER OG 5.40 ( 7.04) . . E
: 247 CYS SG 3.06 ( 4.59) . . T
: 248 ARG CD 5.70 ( 3.78) . . T
: 249 LYS NZ 5.96 ( 4.12) . . T
: 250 GLY O 5.95 ( 4.69) . . T
: 251 VAL CG1 5.13 ( 4.39) . . H
: 252 THR OG1 3.63 ( 4.67) . . H
: 253 ALA N 5.38 ( 6.49) . . H
: 274 SER OG 5.09 ( 7.19) . . H
: 1 S S 1.18 (-1.00) . . .
Site 3: 292 LYS NZ 5.05 ( 9.72) . . T
: 224 SER O 5.63 ( 7.46) . . H
: 225 PRO CG 5.57 ( 3.87) . . H
: 226 GLU O 4.92 ( 4.96) . . H
: 228 LEU CD1 5.48 ( 5.35) . . H
: 229 ARG NH1 5.79 ( 3.95) . . H
: 239 LEU CD1 5.73 ( 9.25) . . T
: 259 ALA O 5.65 ( 7.89) . . H
: 262 LEU O 4.80 ( 6.31) . . H
: 263 CYS SG 2.60 ( 3.31) . . H
: 264 GLY N 5.51 ( 6.72) . . H
| PROTEIN: 2CPP CYTOCHROME P450 CAM (PSEUDOMONAS PUTIDA)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX GROUP CONTAINS FE+++: CAM CAMPHOR SUBSTRATE:
Hev Atom conc.: 100% SATURATION
Precip & conc.: 40.000 % AMMONIUM SULPHATE/POTASSIUM CHLORIDE
Buffer & conc.: 0.050 M POTASSIUM PHOSPHATE
Addict & conc.: 0.001 M CAMPHOR (2-BORNANONE)
Comments : TEMP 20 C; BACKSOAK HG FREE MOTHER LIQUOR
Reference : POULOS et.al. 1982 :1985 :1987 :
pH 7.0 Soak time = 1.00 Hours Reference number = 213.02
Site 1: 118 VAL O 5.68 ( 7.50) . . H
: 119 VAL CG1 3.99 ( 6.17) . . H
: 162 ILE O 5.96 ( 7.63) . . H
: 163 PHE CE1 1.64 ( 4.36) . . H
: 166 LEU CD1 5.20 ( 5.65) . . H
: 167 ALA CB 5.55 ( 5.92) . . H
: 219 ALA CB 5.59 ( 7.09) . . H
: 245 LEU CD1 5.59 ( 5.53) . . H
: 249 GLY N 5.46 ( 4.96) . . H
: 362 LEU CD2 4.90 ( 8.66) . . H
: 417 HEM CBC 3.87 (-1.00) . . .
: 523 HOH O 5.71 (-1.00) . . .
Site 2: 333 ALA O 5.64 ( 6.05) . . T
: 334 CYS SG 1.24 ( 3.65) . . T
: 335 PRO N 5.99 ( 7.33) . . T
: 337 HIS CD2 5.88 ( 6.85) . . T
: 510 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
: 694 HOH O 4.66 (-1.00) . . .
: 214 LYS O 5.89 ( 5.92) . . H
Site 3: 84 GLU OE1 2.70 ( 5.87) . . T
: 85 CYS SG 3.10 ( 4.34) . . T
: 90 ARG NH1 4.93 ( 6.78) . . H
: 93 GLY O 5.23 ( 6.22) . . H
: 94 GLU OE1 4.24 ( 4.96) . . H
: 300 ILE CD1 3.35 ( 6.56) . . E
: 515 HOH O 5.33 (-1.00) . . .
: 538 HOH O 5.92 (-1.00) . . .
: 583 HOH O 2.65 (-1.00) . . .
: 584 HOH O 3.63 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3CYT CYTOCHROME C (ALBACORE, OXIDIZED)
|
Bound Ligands : HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINS FE(III):
Hev Atom conc.: 1.100 mM
Precip & conc.: 90.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 10.000 % SODIUM NITRATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : DICKERSON et.al. 1981 :SWANSON et.al. 1977 :
pH 7.0 Soak time = 504.00 Hours Reference number = 142.00
Site 1: 7 LYS O O 4.86 ( 6.34) . . .
: 8 LYS O CD 5.64 ( 3.77) . . .
: 9 THR O N 5.86 ( 6.97) . . .
: 11 VAL O CG1 4.43 ( 5.46) . . .
: 12 GLN O N 5.79 ( 6.66) . . .
: 3 VAL I CG1 4.04 ( 6.50) . . T
: 97 TYR I CE1 5.16 ( 6.22) . . T
: 100 SER I OG 2.41 ( 4.51) . . T
: 101 ALA I CB 5.03 ( 4.87) . . T
Site 2: 3 VAL O CG2 4.95 ( 7.49) . . .
: 96 ALA O O 4.66 ( 6.15) . . T
: 99 LYS O CE 5.99 ( 5.54) . . T
: 100 SER O OG 4.34 ( 4.32) . . T
: 36 PHE I C 5.79 ( 6.63) . . T
: 37 GLY I O 5.40 ( 4.37) . . T
: 58 VAL I CG1 3.94 ( 6.23) . . T
: 59 TRP I O 4.46 ( 6.41) . . T [Het: HEM CGA - NE1 3.70]
: 60 ASN I OD1 5.77 ( 5.17) . . T
Site 3: 16 GLN O OE1 5.99 ( 4.72) . . . [Het: HEM CMC - CG 4.00]
: 7 LYS I NZ 4.62 ( 6.69) . . T
: 8 LYS I CD 5.53 ( 4.66) . . T
: 11 VAL I CG1 5.05 ( 6.10) . . T