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ANALYSIS FOR LEAD (II) ACETATE [DPC]
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Formula : PB1,C4,H6,O4
Solution chemistry: PB1 +2
All distances below are to the element PB [ lead ]
| PROTEIN: 1ACX ACTINOXANTHIN
|
Hev Atom conc.: 50% SATURATION
Precip & conc.: 75.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.020 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : HA SOAK:DIALYSIS 480.0 HRS
Reference : PLETNEV et.al. 1981 :1982 :
pH 4.4 Soak time = 120.00 Hours Reference number = 83.03
Site 1: 37 VAL CG1 4.50 ( 6.35) . . E [Het: HEM C4D - CD 4.20]
: 80 SER O 3.55 ( 5.95) . . E
: 81 VAL CG1 5.39 ( 4.24) . . E
: 82 ASP O 5.96 ( 5.77) . . E
: 85 THR CG2 5.31 ( 7.25) . . T
: 86 ASP OD1 2.53 ( 5.63) . . T
: 65 ARG NH1 5.50 ( 9.87) . . T
Site 2: 34 CYS SG 5.92 ( 6.89) d . E
: 41 ASP OD1 5.21 ( 6.97) . . E
: 89 ASN OD1 5.45 ( 8.50) . . E
: 91 GLY CA 5.75 ( 5.75) . . E
: 98 ASN OD1 5.85 ( 8.10) . . T [Het: HEM CHD - C 4.00]
: 101 HIS NE2 5.19 ( 6.80) . . E [Het: HEM CHC - CB 4.00]
Site 3: 91 GLY O 4.96 ( 3.80) . . E
: 92 ALA O 3.68 ( 4.22) . . E
: 93 GLY N 4.82 ( 5.35) . . E
: 98 ASN OD1 3.42 ( 4.42) . . T [Het: HEM CHD - C 4.00]
: 99 LEU O 5.98 ( 5.53) . . T [Het: HEMFE - CB 3.80]
: 100 GLY O 4.03 ( 4.54) . . T
: 101 HIS ND1 4.42 ( 5.20) . . E [Het: HEM CHC - CB 4.00]
Site 4: 66 LYS NZ 4.59 (10.46) . . T
: 106 PHE O 5.89 ( 7.59) . . T
: 107 GLY N 5.59 ( 2.51) . . T
: 59 ALA O 5.96 ( 5.10) . . T [Het: HEM CAA - CD1 3.80]
: 60 SER OG 5.27 ( 4.21) . . E
: 61 PHE N 5.28 ( 5.84) . . E
Site 5: 21 SER OG 5.13 ( 7.30) . . E
: 41 ASP OD1 2.67 ( 5.29) . . E
Site 6: 27 GLU OE1 2.61 ( 5.40) . . T
: 28 THR N 5.73 ( 6.82) . . E
Site 7: 26 GLY O 5.48 ( 7.58) . . T
: 27 GLU OE1 2.78 ( 6.50) . . T
: 94 ASN OD1 5.74 ( 8.71) . . T
: 96 GLY CA 5.53 ( 5.53) . . T
Site 8: 27 GLU OE1 3.73 ( 5.51) . . T
: 28 THR OG1 5.90 ( 5.60) . . E
: 94 ASN OD1 5.93 ( 8.19) . . T
| PROTEIN: 1RNT RIBONUCLEASE T1/GUANYLIC ACID COMPLEX
|
Bound Ligands : 2GP 2(PRIME)-GUANYLIC ACID:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 53.000 % MPD
Buffer & conc.:
Addict & conc.:
Comments :
Reference : HEINEMANN et.al. 1987 :SAENGER et.al. 1982 :
pH 4.0 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 152.00
Site 1: 24 TYR OH 4.59 ( 8.83) . . T
: 27 HIS NE2 5.40 ( 7.26) . . T
: 28 GLU CG 5.42 ( 5.16) . . T
: 82 GLU OE1 3.30 ( 5.91) . . T
: 116 HOH O 5.76 (-1.00) . . .
: 183 HOH O 2.00 (-1.00) . . .
: 43 ASN O 4.33 ( 6.33) . . T [Het: 2GP C8 - OD1 3.80]
: 44 ASN O 3.76 ( 5.53) . . T [Het: 2GP C6 - N 4.00]
: 45 TYR CE1 5.79 ( 4.08) . . T [Het: 2GP O4* - CE2 4.00]
: 46 GLU N 5.81 ( 6.81) . . T [Het: 2GP C6 - OE1 3.50]
: 47 GLY N 5.86 ( 6.03) . . T
: 133 HOH O 1.67 (-1.00) . . .
: 137 HOH O 4.45 (-1.00) . . .
: 154 HOH O 2.29 (-1.00) . . .
: 72 SER OG 5.70 ( 6.34) . . T
Site 3: 48 PHE CD1 5.66 ( 6.39) . . T
: 49 ASP O 4.86 ( 6.20) . . T
: 102 GLU CB 4.96 ( 6.47) . . E
: 191 HOH O 4.55 (-1.00) . . .
: 192 HOH O 5.99 (-1.00) . . .
: 175 HOH O 5.51 (-1.00) . . .
: 98 ASN OD1 5.42 ( 8.36) . . T [Het: 2GP O2P - ND2 3.70]
: 105 2GP O3* 5.38 (-1.00) . . .
: 179 HOH O 4.04 (-1.00) . . .
Site 4: 3 ASP OD1 4.31 ( 7.03) . . .
: 13 SER OG 3.45 ( 5.09) . . T
: 108 HOH O 4.69 (-1.00) . . .
: 29 ASP OD1 5.94 ( 6.31) . . T
: 31 GLU OE1 2.86 ( 6.21) . . T
: 178 HOH O 5.32 (-1.00) . . .
Site 5: 196 HOH O 1.84 (-1.00) . . .
: 10 CYS O 5.22 ( 7.53) d . E
: 11 TYR CD2 5.87 ( 5.65) . . E
: 12 SER OG 4.42 ( 5.86) . . E
: 14 SER OG 5.51 ( 7.01) . . T
: 15 ASP OD1 2.28 ( 5.00) . . T
: 65 GLY N 5.93 ( 5.10) . . T
: 107 HOH O 3.24 (-1.00) . . .
: 109 HOH O 3.79 (-1.00) . . .
: 111 HOH O 4.87 (-1.00) . . .
: 127 HOH O 5.19 (-1.00) . . .
: 146 HOH O 0.50 (-1.00) . . .
: 166 HOH O 2.66 (-1.00) . . .
: 170 HOH O 2.74 (-1.00) . . .
: 171 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
: 172 HOH O 4.42 (-1.00) . . .
: 181 HOH O 2.94 (-1.00) . . .
: 195 HOH O 5.52 (-1.00) . . .
: 94 GLY O 5.28 ( 5.13) . . T
: 140 HOH O 4.57 (-1.00) . . .
: 156 HOH O 5.62 (-1.00) . . .
Site 6: 93 THR OG1 4.86 ( 5.68) . . T
: 29 ASP OD1 5.50 ( 6.04) . . T
: 31 GLU OE1 2.96 ( 7.30) . . T
: 178 HOH O 4.85 (-1.00) . . .
Site 7: 2 CYS O 3.67 ( 5.93) d . .
: 3 ASP O 2.74 ( 4.36) . . .
: 4 TYR CD1 5.64 ( 4.42) . . E
: 5 THR N 4.97 ( 6.13) . . E
: 103 CYS O 5.91 ( 7.44) d . E
: 104 THR OG1 5.35 ( 4.47) . . T
: 159 HOH O 2.36 (-1.00) . . .
: 194 HOH O 2.62 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 2APR ACID PROTEINASE (RHIZOPUS CHINENSIS)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 0.000 M
Buffer & conc.: 0.000 M
Addict & conc.: 0.000 M
Comments :
Reference : SUBRAMANIAN et.al. 1976 :
pH Soak time = Hours Reference number = 56.01
Site 1: 752 HOH O 4.41 (-1.00) . . .
Site 2: 8 MET CE 5.91 ( 9.87) . . E
: 17 TYR O 5.22 ( 7.12) . . E
: 33 ASP OD1 5.96 ( 5.12) . . E
: 34 PHE CD1 4.79 ( 1.92) . . E
: 35 ASP OD2 5.15 ( 2.62) . s E
: 36 THR OG1 5.96 ( 5.19) . . T
: 123 LEU O 4.29 ( 6.23) . . E
: 125 LEU CD1 4.30 ( 6.39) . . T
: 169 TYR OH 3.46 ( 9.12) . . E
: 219 THR OG1 2.96 ( 5.15) . . T
: 220 GLY N 5.09 ( 5.53) . . T
: 513 HOH O 4.87 (-1.00) . . .
: 515 HOH O 3.38 (-1.00) . . .
Site 3: 32 LEU CD1 5.81 ( 6.15) . . E
: 33 ASP O 3.91 ( 5.67) . . E
: 34 PHE CE1 3.47 ( 2.99) . . E
: 35 ASP N 4.11 ( 5.48) . s E
: 94 LEU CD1 5.78 ( 8.94) . . E
: 122 LEU C 5.28 ( 6.15) . . E
: 123 LEU CD1 2.66 ( 3.32) . . E
: 124 GLY O 5.58 ( 5.34) . . E
: 125 LEU CD1 3.94 ( 6.01) . . T
: 169 TYR CE2 5.88 ( 8.99) . . E
: 171 PHE CZ 5.57 (10.51) . . E
Site 4: 581 HOH O 4.06 (-1.00) . . .
: 648 HOH O 2.13 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3CLN CALMODULIN (CHICKEN)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 75.000 % MPD
Buffer & conc.: 0.050 M CACODYLATE
Addict & conc.: 0.000 M
Comments : MANY ATTEMPTSTO REPLACE CA IONS BY LANTHANIDE IONS
Reference : BABU et.al. 1985 :1988 :
pH 5.6 Soak time = Hours Reference number = 148.00
Site 1: 102 ALA CB 4.20 ( 5.70) . s H
: 118 ASP OD1 2.47 ( 4.95) . . H
: 119 GLU N 5.81 ( 6.29) . . H
: 122 ASP OD1 3.05 ( 5.18) . . H
: 218 HOH O 4.66 (-1.00) . . .
: 175 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
Site 2: 19 PHE O 5.62 ( 7.42) . . .
: 20 ASP OD1 4.01 ( 4.22) . s T [Het: CACA - CA 4.10]
: 21 LYS C 5.70 ( 5.79) . s T
: 22 ASP OD1 2.69 ( 5.11) . s T [Het: CACA - CG 3.50]
: 23 GLY C 5.01 ( 5.13) . s T
: 24 ASP OD1 3.98 ( 4.55) . s T [Het: CACA - CG 3.60]
: 25 GLY O 5.97 ( 5.28) . s T
: 26 THR OG1 3.72 ( 4.00) . s E [Het: CACA - C 3.70]
: 27 ILE CG1 5.64 ( 4.55) . s E
: 28 THR OG1 5.53 ( 6.09) . s E
: 31 GLU OE1 2.77 ( 6.83) . s H [Het: CACA - CD 2.70]
: 1 CA CA 0.50 (-1.00) . . .
: 153 HOH O 2.49 (-1.00) . . .
: 175 HOH O 5.45 (-1.00) . . .
: 168 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
Site 3: 56 ASP OD1 4.15 ( 4.48) . s T [Het: CACA - CG 3.40]
: 57 ALA C 5.64 ( 5.79) . s T
: 58 ASP OD1 3.85 ( 5.13) . s T [Het: CACA - CG 3.50]
: 59 GLY C 5.26 ( 5.45) . s T
: 60 ASN OD1 2.23 ( 4.71) . s T [Het: CACA - N 4.30]
: 61 GLY C 5.19 ( 5.46) . s T
: 62 THR OG1 4.35 ( 4.23) . s E [Het: CACA - C 3.40]
: 63 ILE O 5.95 ( 4.23) . s E [Het: CACA - CA 4.30]
: 64 ASP OD1 5.07 ( 5.69) . s E
: 67 GLU OE1 2.64 ( 6.87) . s H [Het: CACA - CD 2.80]
: 2 CA CA 0.29 (-1.00) . . .
: 154 HOH O 2.40 (-1.00) . . .
: 176 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
: 200 HOH O 5.55 (-1.00) . . .
Site 4: 11 GLU OE2 5.55 ( 5.55) . . .
: 14 GLU OE1 3.62 ( 6.73) . . .
: 157 HOH O 4.63 (-1.00) . . .
: 158 HOH O 2.94 (-1.00) . . .
: 54 GLU OE1 5.38 ( 9.53) . . H
: 78 ASP OD1 4.80 ( 8.10) . . H
Site 5: 83 GLU OE1 5.75 ( 5.93) . . H
: 84 GLU N 5.76 ( 5.86) . . H
: 87 GLU OE1 2.07 ( 6.51) . . H
: 127 GLU OE1 5.79 ( 7.77) . . H
: 143 GLN O 4.82 ( 6.87) . . H
: 144 MET SD 4.69 ( 5.88) . . H
: 147 ALA O 4.06 ( 5.52) . . H
: 173 HOH O 5.92 (-1.00) . . .
: 203 HOH O 5.85 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4INS INSULIN (PORCINE 2-ZN)
|
Bound Ligands : ZN ZINC ION ON 3-FOLD CRYSTAL AXIS:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments : ZN REMOVED:SOAK EDTA -> APO ENZYME
Reference : ADAMS et.al. 1969 :DODSON et.al. 1989 :SCHLICHTKRULL et.al. 1956a:1956b:
pH 6.3 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 278.00
Site 1: 9 SER B OG 4.49 ( 6.25) . . .
: 13 GLU B OE2 4.25 ( 7.69) . s .
: 13 GLU D OE1 2.89 ( 6.00) . s T
: 18 HOH O 1.81 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 4.85 (-1.00) . . .
: 41 HOH O 5.04 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 1.43 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 3.01 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 2.77 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.07 (-1.00) . . .
: 75 HOH O 5.62 (-1.00) . . .
: 18 HOH O 3.38 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 3.82 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 5.92 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.07 (-1.00) . . .
: 10 HIS B ND1 4.62 ( 6.20) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 13 GLU B OE1 4.74 ( 6.62) . s .
: 13 GLU D OE2 4.77 ( 9.09) . s T
: 18 HOH O 4.07 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 4.82 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 4.22 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.07 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.81 (-1.00) . . .
: 652 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 4.93 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 3.39 (-1.00) . . .
: 702 HOH O 3.07 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.81 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 5.71 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.81 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.01 (-1.00) . . .
Site 1: 672 HOH O 5.78 (-1.00) . . .
Site 2: 7 CYS B O 5.98 ( 7.32) d s .
: 10 HIS B NE2 2.67 ( 6.91) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 1 ZN ZN 0.91 (-1.00) . . .
: 161 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 1.67 (-1.00) . . .
: 211 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
: 241 HOH O 5.39 (-1.00) . . .
: 244 HOH O 3.42 (-1.00) . . .
: 251 HOH O 2.40 (-1.00) . . .
: 262 HOH O 5.60 (-1.00) . . .
: 7 CYS B O 5.98 ( 7.32) d s .
: 10 HIS B NE2 2.67 ( 6.91) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 1 ZN ZN 0.91 (-1.00) . . .
: 161 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 1.67 (-1.00) . . .
: 211 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
: 241 HOH O 5.39 (-1.00) . . .
: 244 HOH O 3.42 (-1.00) . . .
: 251 HOH O 2.40 (-1.00) . . .
: 262 HOH O 5.60 (-1.00) . . .
: 7 CYS B O 5.98 ( 7.32) d s .
: 10 HIS B NE2 2.67 ( 6.91) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 1 ZN ZN 0.91 (-1.00) . . .
: 161 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 201 HOH O 1.67 (-1.00) . . .
: 211 HOH O 5.65 (-1.00) . . .
: 241 HOH O 5.39 (-1.00) . . .
: 244 HOH O 3.42 (-1.00) . . .
: 251 HOH O 2.40 (-1.00) . . .
: 262 HOH O 5.60 (-1.00) . . .
Site 3: 9 SER D OG 5.54 ( 7.11) . . T
: 10 HIS D NE2 2.12 ( 6.52) . . T [Het: ZNZN - CD2 3.10]
: 2 ZN ZN 0.09 (-1.00) . . .
: 9 SER D OG 5.54 ( 7.11) . . T
: 10 HIS D NE2 2.12 ( 6.52) . . T [Het: ZNZN - CD2 3.10]
: 2 ZN ZN 0.09 (-1.00) . . .
: 9 SER D OG 5.54 ( 7.11) . . T
: 10 HIS D NE2 2.12 ( 6.52) . . T [Het: ZNZN - CD2 3.10]
: 2 ZN ZN 0.09 (-1.00) . . .
: 462 HOH O 5.60 (-1.00) . . .
: 484 HOH O 3.67 (-1.00) . . .
: 486 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 498 HOH O 3.78 (-1.00) . . .
: 514 HOH O 4.37 (-1.00) . . .
: 513 HOH O 2.25 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 4.90 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 5.07 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
: 462 HOH O 5.60 (-1.00) . . .
: 484 HOH O 3.67 (-1.00) . . .
: 486 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 498 HOH O 3.78 (-1.00) . . .
: 514 HOH O 4.37 (-1.00) . . .
: 513 HOH O 2.25 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 4.90 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 5.07 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
: 462 HOH O 5.60 (-1.00) . . .
: 484 HOH O 3.67 (-1.00) . . .
: 486 HOH O 4.23 (-1.00) . . .
: 498 HOH O 3.78 (-1.00) . . .
Site 3: 514 HOH O 4.37 (-1.00) . . .
: 513 HOH O 2.25 (-1.00) . . .
: 551 HOH O 4.90 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 5.07 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
Site 4: 13 LEU C O 5.92 ( 7.36) . s T
: 14 TYR C OH 5.93 ( 5.74) . s T
: 17 GLU C OE1 2.53 ( 6.10) . . T
: 18 VAL D O 5.74 ( 6.78) . s T
: 11 HOH O 1.46 (-1.00) . . .
: 12 HOH O 5.40 (-1.00) . . .
: 22 HOH O 5.51 (-1.00) . . .
: 15 HOH O 4.58 (-1.00) . . .
: 42 HOH O 3.18 (-1.00) . . .
: 63 HOH O 5.03 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 4.54 (-1.00) . . .
: 76 HOH O 4.97 (-1.00) . . .
: 92 HOH O 4.14 (-1.00) . . .
: 115 HOH O 4.68 (-1.00) . . .
: 116 HOH O 4.73 (-1.00) . . .
: 155 HOH O 5.95 (-1.00) . . .
: 145 HOH O 5.43 (-1.00) . . .
: 581 HOH O 5.54 (-1.00) . . .
: 14 TYR A OH 4.65 ( 9.57) . s .
: 1 PHE B CE1 3.91 ( 3.24) . s .
: 2 VAL B N 5.61 ( 6.99) . . .
: 674 HOH O 4.85 (-1.00) . . .
: 701 HOH O 4.90 (-1.00) . . .
: 493 HOH O 5.64 (-1.00) . . .
: 521 HOH O 4.88 (-1.00) . . .
Site 5: 30 ALA B O 5.93 ( 8.06) . . T
: 374 HOH O 5.56 (-1.00) . . .
: 402 HOH O 3.22 (-1.00) . . .
: 403 HOH O 3.75 (-1.00) . . .
: 447 HOH O 3.60 (-1.00) . . .
: 491 HOH O 2.88 (-1.00) . . .
: 541 HOH O 5.22 (-1.00) . . .
: 14 TYR A CE1 4.99 ( 6.26) . s .
: 17 GLU A OE1 2.12 ( 6.08) . . .
: 1 GLY C O 5.91 ( 4.44) . s T
: 19 TYR C OH 5.69 (10.64) . s T
: 30 ALA D O 5.78 ( 6.65) . . T
Hev Atom conc.: 100.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : ADAMS et.al. 1969 :DODSON et.al. 1989 :SCHLICHTKRULL et.al. 1956a:1956b:
pH 6.3 Soak time = 24.00 Hours Reference number = 278.01
Site A: 9 SER B OG 4.51 ( 6.29) . . .
: 13 GLU B OE2 4.32 ( 7.77) . s .
: 13 GLU D OE1 2.96 ( 6.07) . s T
: 18 HOH O 1.79 (-1.00) . . .
: 13 HOH O 4.86 (-1.00) . . .
: 41 HOH O 5.08 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 1.35 (-1.00) . . .
: 61 HOH O 2.99 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 2.80 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.02 (-1.00) . . .
: 75 HOH O 5.61 (-1.00) . . .
: 18 HOH O 3.39 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 3.83 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 5.88 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.02 (-1.00) . . .
: 10 HIS B NE2 5.96 ( 6.14) . . . [Het: ZNZN - CG 4.20]
: 13 GLU B OE1 4.72 ( 6.58) . s .
: 13 GLU D OE2 4.69 ( 9.01) . s T
: 18 HOH O 4.03 (-1.00) . . .
: 51 HOH O 4.76 (-1.00) . . .
: 62 HOH O 4.13 (-1.00) . . .
: 72 HOH O 3.02 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.82 (-1.00) . . .
: 652 HOH O 4.86 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 4.99 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 3.43 (-1.00) . . .
: 702 HOH O 3.10 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.82 (-1.00) . . .
: 672 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
: 651 HOH O 4.82 (-1.00) . . .
: 653 HOH O 5.00 (-1.00) . . .
Site A: 672 HOH O 5.74 (-1.00) . . .
Site B: 13 LEU C O 5.84 ( 7.30) . s T
: 14 TYR C OH 5.76 ( 5.51) . s T
: 17 GLU C OE1 2.29 ( 6.04) . . T
: 18 VAL D CG1 5.73 ( 7.03) . s T
: 11 HOH O 1.15 (-1.00) . . .
: 12 HOH O 5.30 (-1.00) . . .
: 22 HOH O 5.35 (-1.00) . . .
: 15 HOH O 4.26 (-1.00) . . .
: 42 HOH O 3.18 (-1.00) . . .
: 63 HOH O 5.00 (-1.00) . . .
: 71 HOH O 4.77 (-1.00) . . .
: 76 HOH O 4.91 (-1.00) . . .
: 92 HOH O 4.30 (-1.00) . . .
: 115 HOH O 4.83 (-1.00) . . .
: 116 HOH O 4.82 (-1.00) . . .
: 145 HOH O 5.66 (-1.00) . . .
: 581 HOH O 5.56 (-1.00) . . .
: 14 TYR A OH 4.62 ( 9.74) . s .
: 1 PHE B CE1 3.98 ( 3.61) . s .
: 2 VAL B N 5.97 ( 7.35) . . .
: 674 HOH O 4.51 (-1.00) . . .
: 701 HOH O 4.64 (-1.00) . . .
: 493 HOH O 5.43 (-1.00) . . .
: 521 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
Site C: 29 LYS B NZ 5.01 ( 8.05) . . T
: 30 ALA B O 4.39 ( 6.49) . . T
: 344 HOH O 4.70 (-1.00) . . .
: 368 HOH O 5.73 (-1.00) . . .
: 374 HOH O 3.28 (-1.00) . . .
: 402 HOH O 0.83 (-1.00) . . .
: 403 HOH O 3.17 (-1.00) . . .
: 447 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
: 461 HOH O 5.86 (-1.00) . . .
: 491 HOH O 4.00 (-1.00) . . .
: 531 HOH O 5.97 (-1.00) . . .
: 541 HOH O 5.68 (-1.00) . . .
: 17 GLU A OE1 3.55 ( 6.49) . . .
: 22 ARG B NH2A 4.52 (10.40) . . T
: 1 GLY C O 5.16 ( 3.30) . s T
: 2 ILE C N 5.62 ( 7.01) . . T
: 4 GLU C OE2 5.13 ( 7.70) . s T
: 30 ALA D OXT 3.12 ( 4.96) . . T
Site D: 256 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 274 HOH O 4.90 (-1.00) . . .
: 287 HOH O 3.73 (-1.00) . . .
: 294 HOH O 2.68 (-1.00) . . .
: 303 HOH O 3.24 (-1.00) . . .
: 311 HOH O 3.95 (-1.00) . . .
: 314 HOH O 3.15 (-1.00) . . .
: 325 HOH O 3.96 (-1.00) . . .
: 349 HOH O 5.88 (-1.00) . . .
: 336 HOH O 5.28 (-1.00) . . .
: 359 HOH O 5.90 (-1.00) . . .
: 350 HOH O 1.79 (-1.00) . . .
: 354 HOH O 3.34 (-1.00) . . .
: 363 HOH O 5.77 (-1.00) . . .
: 372 HOH O 2.28 (-1.00) . . .
: 375 HOH O 4.51 (-1.00) . . .
: 378 HOH O 4.49 (-1.00) . . .
: 414 HOH O 4.46 (-1.00) . . .
: 415 HOH O 4.13 (-1.00) . . .
: 448 HOH O 4.80 (-1.00) . . .
: 449 HOH O 5.79 (-1.00) . . .
: 455 HOH O 5.47 (-1.00) . . .
: 459 HOH O 5.12 (-1.00) . . .
: 20 CYS C O 5.08 ( 6.30) d . T
: 21 ASN C OXT 1.19 ( 3.45) . s T
: 22 ARG D NH1A 4.26 ( 5.58) . . T
: 152 HOH O 2.79 (-1.00) . . .
: 162 HOH O 4.05 (-1.00) . . .
: 182 HOH O 5.96 (-1.00) . . .
: 223 HOH O 6.00 (-1.00) . . .
: 421 HOH O 3.92 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 5XIA D - XYLOSE ISOMERASE (ARTHROBACTER STRAIN B3728)
|
Bound Ligands : MG MAGNESIUM ++ CATION: XYL XYLITOL:
Hev Atom conc.: 5.000 mM
Precip & conc.: 3.200 M AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M TRIS / ACETATE
Addict & conc.:
Comments :
Reference : AKINS et.al. 1986 :HENRICK et.al. 1989 :
pH 6.0 Soak time = 240.00 Hours Reference number = 291.00
Site 1: 180 GLU A OE2 5.94 (10.36) . . E
: 182 LYS A NZ 4.57 ( 8.35) . . T
: 216 GLU A OE1 3.97 ( 7.12) . . E
: 219 HIS A NE2 3.43 ( 6.43) . . T
: 246 ASN A OD1 5.75 ( 7.77) . . T
: 254 ASP A OD1 5.83 ( 5.55) . . T
: 256 ASP A OD1 2.44 ( 5.16) . . T
: 292 ASP A OD1 4.71 ( 6.53) . . E
: 294 LYS A NZ 5.30 ( 8.39) . . T
: 398 HOH A O 1.44 (-1.00) . . .
: 399 MG AMG 4.99 (-1.00) . . .
: 400 XYL A O1 3.33 (-1.00) . . .
: 479 HOH A O 5.73 (-1.00) . . .
: 517 HOH A O 5.10 (-1.00) . . .
: 518 HOH A O 5.71 (-1.00) . . .
: 519 HOH A O 2.02 (-1.00) . . .
: 773 HOH B O 2.75 (-1.00) . . .
: 25 PHE B CE2 5.74 (10.24) . . T
Site 2: 180 GLU B OE2 5.68 (10.04) . . E
: 182 LYS B NZ 4.63 ( 8.37) . . T
: 216 GLU B OE1 3.92 ( 7.22) . . E
: 219 HIS B NE2 3.24 ( 6.64) . . 5
: 246 ASN B ND2 4.34 ( 8.01) . . T
: 254 ASP B OD2 3.96 ( 5.73) . . T
: 256 ASP B OD1 2.56 ( 5.34) . . T
: 292 ASP B OD1 4.89 ( 6.59) . . E
: 294 LYS B NZ 5.64 ( 8.36) . . T
: 398 HOH B O 1.45 (-1.00) . . .
: 399 MG BMG 4.93 (-1.00) . . .
: 400 XYL B O1 2.83 (-1.00) . . .
: 479 HOH B O 5.27 (-1.00) . . .
: 517 HOH B O 5.35 (-1.00) . . .
: 518 HOH B O 5.30 (-1.00) . . .
: 519 HOH B O 1.97 (-1.00) . . .
: 609 HOH B O 5.90 (-1.00) . . .
: 25 PHE A CE2 5.67 (10.05) . . T